Protein–RNA interactions for Protein: Q15116

PDCD1, Programmed cell death protein 1, humanhuman

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Length 288 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCD1Q15116 AC245407.1-201ENST00000621489 2538 ntTSL 2 BASIC5.41□□□□□ -1.54
PDCD1Q15116 RUNX1T1-234ENST00000521553 1346 ntTSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
PDCD1Q15116 AC019072.1-201ENST00000604535 1551 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
PDCD1Q15116 PTPN3-202ENST00000374541 6703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.41□□□□□ -1.54
PDCD1Q15116 NOVA1-206ENST00000539517 3912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
PDCD1Q15116 ABCB11-201ENST00000263817 4775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.54
PDCD1Q15116 CD164-207ENST00000504373 1402 ntTSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.54
PDCD1Q15116 PARP8-212ENST00000505697 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.54
PDCD1Q15116 ASPN-201ENST00000375543 2237 ntTSL 2 BASIC5.4□□□□□ -1.54
PDCD1Q15116 ZNF436-201ENST00000314011 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.54
PDCD1Q15116 AC087516.2-201ENST00000558963 3042 ntTSL 3 BASIC5.4□□□□□ -1.54
PDCD1Q15116 CLEC9A-201ENST00000355819 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.54
PDCD1Q15116 SH3D19-201ENST00000304527 5273 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.4□□□□□ -1.54
PDCD1Q15116 FAT4-202ENST00000394329 16123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.4□□□□□ -1.54
PDCD1Q15116 AC090017.1-201ENST00000548612 1779 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
PDCD1Q15116 AL079343.1-201ENST00000572358 1771 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
PDCD1Q15116 GRIK1-201ENST00000327783 3179 ntTSL 5 BASIC5.4□□□□□ -1.54
PDCD1Q15116 HEATR1-203ENST00000366582 8447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.4□□□□□ -1.54
PDCD1Q15116 TXK-201ENST00000264316 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.54
PDCD1Q15116 C8orf59-201ENST00000321777 325 ntTSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.54
PDCD1Q15116 RPL21P132-201ENST00000331267 462 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
PDCD1Q15116 SCGB1D4-201ENST00000358585 439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.54
PDCD1Q15116 RNA5SP88-201ENST00000365560 109 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
PDCD1Q15116 CUBN-201ENST00000377823 705 ntTSL 3 BASIC5.4□□□□□ -1.54
PDCD1Q15116 MIR92A2-201ENST00000385299 75 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
PDCD1Q15116 SNORA11.3-201ENST00000408471 128 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
PDCD1Q15116 RN7SKP86-201ENST00000410454 332 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
PDCD1Q15116 Y_RNA.599-201ENST00000410489 109 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
PDCD1Q15116 RN7SKP142-201ENST00000411236 328 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
PDCD1Q15116 AL663109.1-201ENST00000411498 844 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
PDCD1Q15116 AC116036.1-201ENST00000412199 367 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
PDCD1Q15116 TMBIM7P-201ENST00000418074 855 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
PDCD1Q15116 LINC00701-201ENST00000418295 742 ntTSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.54
PDCD1Q15116 MTCO2P34-201ENST00000421994 607 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
PDCD1Q15116 AL021026.1-201ENST00000422841 658 ntTSL 3 BASIC5.4□□□□□ -1.54
PDCD1Q15116 AL139158.1-201ENST00000424719 340 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
PDCD1Q15116 TTC3-AS1-201ENST00000424733 1097 ntTSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.54
PDCD1Q15116 RPL7P56-201ENST00000429441 717 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
PDCD1Q15116 MTCO1P19-201ENST00000443487 500 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
PDCD1Q15116 AP000936.2-201ENST00000447151 681 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
PDCD1Q15116 NPM1P39-201ENST00000449818 867 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
PDCD1Q15116 RPS15AP1-201ENST00000457423 391 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
PDCD1Q15116 PLSCR5-AS1-201ENST00000473817 450 ntTSL 3 BASIC5.4□□□□□ -1.54
PDCD1Q15116 AC079841.1-201ENST00000481228 950 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
PDCD1Q15116 AC013828.1-201ENST00000481845 158 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
PDCD1Q15116 AC090013.1-201ENST00000485147 480 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
PDCD1Q15116 AC096746.1-201ENST00000501965 1042 ntTSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.54
PDCD1Q15116 AC108866.1-204ENST00000508362 558 ntTSL 4 BASIC5.4□□□□□ -1.54
PDCD1Q15116 AC093599.1-201ENST00000515232 562 ntTSL 4 BASIC5.4□□□□□ -1.54
PDCD1Q15116 RPS27AP18-201ENST00000515536 459 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
PDCD1Q15116 LACTB2-AS1-203ENST00000518553 817 ntTSL 5 BASIC5.4□□□□□ -1.54
PDCD1Q15116 SOD1P3-201ENST00000518682 454 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
PDCD1Q15116 PTH-202ENST00000529816 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.4□□□□□ -1.54
PDCD1Q15116 LDHC-203ENST00000535809 757 ntTSL 5 BASIC5.4□□□□□ -1.54
PDCD1Q15116 LDHC-205ENST00000537486 583 ntTSL 5 BASIC5.4□□□□□ -1.54
PDCD1Q15116 OLR1-209ENST00000543993 822 ntTSL 2 BASIC5.4□□□□□ -1.54
PDCD1Q15116 AC025035.1-201ENST00000551571 894 ntTSL 2 BASIC5.4□□□□□ -1.54
PDCD1Q15116 AGGF1P4-201ENST00000568249 801 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
PDCD1Q15116 LINC01916-201ENST00000582028 559 ntTSL 4 BASIC5.4□□□□□ -1.54
PDCD1Q15116 RN7SL475P-201ENST00000583379 298 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
PDCD1Q15116 MIR3611-201ENST00000584484 83 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
PDCD1Q15116 AC087752.4-201ENST00000605911 462 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
PDCD1Q15116 AC068726.1-201ENST00000610993 341 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
PDCD1Q15116 AL352984.2-202ENST00000613699 155 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
PDCD1Q15116 SNORA11.6-201ENST00000619030 128 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
PDCD1Q15116 C8orf59-213ENST00000619594 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.54
PDCD1Q15116 LINC02033-202ENST00000623312 492 ntTSL 3 BASIC5.4□□□□□ -1.54
PDCD1Q15116 AC079228.1-201ENST00000624774 1049 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
PDCD1Q15116 AC099654.6-201ENST00000636487 512 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
PDCD1Q15116 ADH6-202ENST00000394897 3337 ntTSL 2 BASIC5.4□□□□□ -1.55
PDCD1Q15116 ZC3H14-201ENST00000251038 18281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.55
PDCD1Q15116 CLCA1-202ENST00000394711 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.55
PDCD1Q15116 AC019080.1-201ENST00000397057 5202 ntTSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.55
PDCD1Q15116 GUCY1B2-204ENST00000531898 1979 ntBASIC5.4□□□□□ -1.55
PDCD1Q15116 HSPD1P8-201ENST00000400121 1658 ntBASIC5.4□□□□□ -1.55
PDCD1Q15116 MTND4P26-201ENST00000415971 1359 ntBASIC5.4□□□□□ -1.55
PDCD1Q15116 SULT1C2-205ENST00000437390 1359 ntTSL 2 BASIC5.4□□□□□ -1.55
PDCD1Q15116 AC005725.1-201ENST00000577346 2607 ntBASIC5.4□□□□□ -1.55
PDCD1Q15116 FASTKD1-204ENST00000453153 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.55
PDCD1Q15116 AC092104.1-201ENST00000497346 1441 ntBASIC5.4□□□□□ -1.55
PDCD1Q15116 RIMS1-219ENST00000523963 3097 ntTSL 2 BASIC5.39□□□□□ -1.55
PDCD1Q15116 MPDZ-219ENST00000546205 6342 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
PDCD1Q15116 LEPR-205ENST00000371060 5135 ntTSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
PDCD1Q15116 ZNF836-201ENST00000322146 2811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
PDCD1Q15116 FRK-201ENST00000606080 13230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
PDCD1Q15116 TBC1D5-201ENST00000253692 7854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
PDCD1Q15116 DTNA-227ENST00000597599 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.39□□□□□ -1.55
PDCD1Q15116 PCGF5-204ENST00000543648 7144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.39□□□□□ -1.55
PDCD1Q15116 ADAM21-201ENST00000603540 2658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.39□□□□□ -1.55
PDCD1Q15116 CSNK1G3-205ENST00000510842 1979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.39□□□□□ -1.55
PDCD1Q15116 SNORD8-201ENST00000363915 110 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
PDCD1Q15116 MANSC4-201ENST00000381273 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
PDCD1Q15116 RNU6-444P-201ENST00000383988 108 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
PDCD1Q15116 AL589647.1-201ENST00000402485 466 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
PDCD1Q15116 PRELID1P1-201ENST00000403549 660 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
PDCD1Q15116 PRRC2CP1-201ENST00000404428 159 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
PDCD1Q15116 RN7SKP129-201ENST00000410288 299 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
PDCD1Q15116 RNU4-64P-201ENST00000410795 131 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
PDCD1Q15116 PGBD4P8-201ENST00000412993 562 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
PDCD1Q15116 UBE2V1P14-201ENST00000415815 558 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
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