Protein–RNA interactions for Protein: Q147U7

SMCO1, Single-pass membrane and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 214 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMCO1Q147U7 AL391422.1-201ENST00000402155 436 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
SMCO1Q147U7 SSR1P1-201ENST00000407630 814 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
SMCO1Q147U7 MORN2-202ENST00000409077 465 ntTSL 5 BASIC3.98□□□□□ -1.77
SMCO1Q147U7 AF015720.1-201ENST00000412240 349 ntTSL 3 BASIC3.98□□□□□ -1.77
SMCO1Q147U7 MTND4LP13-201ENST00000425022 298 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
SMCO1Q147U7 FHP1-201ENST00000442741 703 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
SMCO1Q147U7 AL050338.1-201ENST00000445585 786 ntTSL 3 BASIC3.98□□□□□ -1.77
SMCO1Q147U7 PSMA2P2-201ENST00000504319 686 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
SMCO1Q147U7 AC113167.1-201ENST00000512941 570 ntTSL 4 BASIC3.98□□□□□ -1.77
SMCO1Q147U7 AC022784.4-201ENST00000518589 422 ntTSL 1 (best) BASIC3.98□□□□□ -1.77
SMCO1Q147U7 AC084768.1-201ENST00000518926 923 ntTSL 3 BASIC3.98□□□□□ -1.77
SMCO1Q147U7 AC026688.1-201ENST00000520639 1168 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
SMCO1Q147U7 AC116535.2-201ENST00000532365 441 ntTSL 5 BASIC3.98□□□□□ -1.77
SMCO1Q147U7 AC027544.3-201ENST00000535082 757 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
SMCO1Q147U7 LINC02170-201ENST00000561519 555 ntTSL 4 BASIC3.98□□□□□ -1.77
SMCO1Q147U7 LINC02131-201ENST00000563289 419 ntTSL 2 BASIC3.98□□□□□ -1.77
SMCO1Q147U7 AC092134.1-201ENST00000563690 800 ntTSL 3 BASIC3.98□□□□□ -1.77
SMCO1Q147U7 AC139099.3-202ENST00000574856 439 ntTSL 2 BASIC3.98□□□□□ -1.77
SMCO1Q147U7 AC018695.3-201ENST00000602617 408 ntTSL 2 BASIC3.98□□□□□ -1.77
SMCO1Q147U7 RDM1-215ENST00000612980 501 ntTSL 1 (best) BASIC3.98□□□□□ -1.77
SMCO1Q147U7 Metazoa_SRP.55-201ENST00000618452 275 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
SMCO1Q147U7 AC090527.3-201ENST00000619041 548 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
SMCO1Q147U7 C1orf195-202ENST00000625027 441 ntTSL 5 BASIC3.98□□□□□ -1.77
SMCO1Q147U7 LINC02342-201ENST00000627910 461 ntTSL 5 BASIC3.98□□□□□ -1.77
SMCO1Q147U7 RAPH1-203ENST00000374493 3909 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.98□□□□□ -1.77
SMCO1Q147U7 FAM26D-201ENST00000368596 1353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.98□□□□□ -1.77
SMCO1Q147U7 AC009951.1-201ENST00000623674 2614 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
SMCO1Q147U7 UBE2D3-233ENST00000618836 3472 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.98□□□□□ -1.77
SMCO1Q147U7 R3HDM1-220ENST00000628915 4325 ntTSL 5 BASIC3.98□□□□□ -1.77
SMCO1Q147U7 PHKBP1-201ENST00000450951 1951 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
SMCO1Q147U7 FAM197Y3-202ENST00000427622 2325 ntTSL 5 BASIC3.98□□□□□ -1.77
SMCO1Q147U7 FAM197Y7-202ENST00000433321 2325 ntTSL 2 BASIC3.98□□□□□ -1.77
SMCO1Q147U7 PHEX-201ENST00000379374 6172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.97□□□□□ -1.77
SMCO1Q147U7 ZNF678-202ENST00000397097 8212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.97□□□□□ -1.77
SMCO1Q147U7 WDR63-201ENST00000294664 2995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.97□□□□□ -1.77
SMCO1Q147U7 RGS5-212ENST00000618415 5812 ntTSL 4 BASIC3.97□□□□□ -1.77
SMCO1Q147U7 CAST-201ENST00000309190 4282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.97□□□□□ -1.77
SMCO1Q147U7 PUS7L-207ENST00000551923 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.97□□□□□ -1.77
SMCO1Q147U7 OR8H2-203ENST00000641311 3092 ntAPPRIS P2 BASIC3.97□□□□□ -1.77
SMCO1Q147U7 PCDH15-211ENST00000395440 3177 ntTSL 5 BASIC3.97□□□□□ -1.77
SMCO1Q147U7 PCDH15-203ENST00000373955 4230 ntTSL 1 (best) BASIC3.97□□□□□ -1.77
SMCO1Q147U7 AL136116.2-201ENST00000404020 785 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
SMCO1Q147U7 SNX10-204ENST00000409838 944 ntTSL 1 (best) BASIC3.97□□□□□ -1.77
SMCO1Q147U7 RN7SKP216-201ENST00000411050 312 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
SMCO1Q147U7 AL592402.1-201ENST00000417161 440 ntTSL 4 BASIC3.97□□□□□ -1.77
SMCO1Q147U7 CASP5-203ENST00000418434 1023 ntTSL 5 BASIC3.97□□□□□ -1.77
SMCO1Q147U7 AL158817.1-201ENST00000422310 933 ntTSL 3 BASIC3.97□□□□□ -1.77
SMCO1Q147U7 AC108075.1-201ENST00000424692 529 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
SMCO1Q147U7 AL929288.1-201ENST00000426262 746 ntTSL 3 BASIC3.97□□□□□ -1.77
SMCO1Q147U7 AC060234.3-201ENST00000430438 559 ntTSL 5 BASIC3.97□□□□□ -1.77
SMCO1Q147U7 FTH1P6-201ENST00000430768 320 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
SMCO1Q147U7 NAP1L4P3-201ENST00000432820 1147 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
SMCO1Q147U7 AL451139.1-201ENST00000434718 346 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
SMCO1Q147U7 FAM237A-201ENST00000441223 773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.97□□□□□ -1.77
SMCO1Q147U7 EXTL2P1-201ENST00000446218 416 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
SMCO1Q147U7 TCEA1P1-201ENST00000449716 880 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
SMCO1Q147U7 FABP3P2-201ENST00000453169 399 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
SMCO1Q147U7 LINC01780-202ENST00000457683 391 ntTSL 3 BASIC3.97□□□□□ -1.77
SMCO1Q147U7 AL122019.1-202ENST00000458070 546 ntTSL 5 BASIC3.97□□□□□ -1.77
SMCO1Q147U7 PSMC1P13-201ENST00000458195 985 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
SMCO1Q147U7 AC007998.1-201ENST00000474156 672 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
SMCO1Q147U7 RN7SL547P-201ENST00000490793 290 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
SMCO1Q147U7 AC092045.1-201ENST00000495716 1231 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
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SMCO1Q147U7 AC104071.1-201ENST00000505636 602 ntTSL 3 BASIC3.97□□□□□ -1.77
SMCO1Q147U7 AL592156.1-201ENST00000508758 304 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
SMCO1Q147U7 AC104350.1-201ENST00000518750 877 ntTSL 3 BASIC3.97□□□□□ -1.77
SMCO1Q147U7 LINC02326-201ENST00000552028 540 ntTSL 3 BASIC3.97□□□□□ -1.77
SMCO1Q147U7 DNAL1-205ENST00000554339 548 ntTSL 5 BASIC3.97□□□□□ -1.77
SMCO1Q147U7 SNORD39.2-201ENST00000579995 76 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
SMCO1Q147U7 AC008738.1-201ENST00000590117 375 ntTSL 5 BASIC3.97□□□□□ -1.77
SMCO1Q147U7 AC027243.2-201ENST00000602530 724 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
SMCO1Q147U7 AC005520.3-201ENST00000602874 370 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
SMCO1Q147U7 AC130352.1-201ENST00000602979 661 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
SMCO1Q147U7 DARS-AS1-220ENST00000607985 660 ntTSL 5 BASIC3.97□□□□□ -1.77
SMCO1Q147U7 MIR6889-201ENST00000613185 59 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
SMCO1Q147U7 MIR6071-201ENST00000616741 78 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
SMCO1Q147U7 AC011815.3-201ENST00000624194 473 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
SMCO1Q147U7 LINC00976-202ENST00000628064 534 ntTSL 5 BASIC3.97□□□□□ -1.77
SMCO1Q147U7 AC095050.2-201ENST00000510748 1458 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
SMCO1Q147U7 USH2A-202ENST00000366942 6320 ntTSL 1 (best) BASIC3.97□□□□□ -1.77
SMCO1Q147U7 PRUNE2-201ENST00000223609 2697 ntTSL 2 BASIC3.97□□□□□ -1.77
SMCO1Q147U7 AL589745.1-201ENST00000421190 3336 ntTSL 5 BASIC3.96□□□□□ -1.77
SMCO1Q147U7 EMSY-207ENST00000525919 4074 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.96□□□□□ -1.77
SMCO1Q147U7 PREPL-207ENST00000409957 4703 ntTSL 5 BASIC3.96□□□□□ -1.77
SMCO1Q147U7 FAM69A-202ENST00000613047 2646 ntTSL 4 BASIC3.96□□□□□ -1.77
SMCO1Q147U7 DDX60L-201ENST00000260184 6754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.96□□□□□ -1.77
SMCO1Q147U7 ZPLD1-202ENST00000466937 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.96□□□□□ -1.78
SMCO1Q147U7 IQCB2P-201ENST00000401788 1633 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
SMCO1Q147U7 ZMYND11-209ENST00000402736 3950 ntTSL 5 BASIC3.96□□□□□ -1.78
SMCO1Q147U7 FAM169A-201ENST00000389156 5990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.96□□□□□ -1.78
SMCO1Q147U7 FAM162A-201ENST00000232125 801 ntTSL 2 BASIC3.96□□□□□ -1.78
SMCO1Q147U7 SNORD74.4-201ENST00000364129 80 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
SMCO1Q147U7 GSTM3P2-201ENST00000412746 530 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
SMCO1Q147U7 VN1R37P-201ENST00000419096 748 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
SMCO1Q147U7 DYNLL1P7-201ENST00000429273 258 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
SMCO1Q147U7 AF127577.2-201ENST00000436429 824 ntTSL 3 BASIC3.96□□□□□ -1.78
SMCO1Q147U7 AC009948.1-206ENST00000436616 1020 ntTSL 3 BASIC3.96□□□□□ -1.78
SMCO1Q147U7 AC092637.1-201ENST00000444745 510 ntTSL 5 BASIC3.96□□□□□ -1.78
SMCO1Q147U7 AL035551.1-201ENST00000446931 348 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
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