Protein–RNA interactions for Protein: Q13698

CACNA1S, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1S, humanhuman

Predictions only

Length 1,873 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1SQ13698 LINC02141-201ENST00000568279 6586 ntTSL 1 (best) BASIC5.61□□□□□ -1.51
CACNA1SQ13698 ENKUR-201ENST00000331161 3382 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.61□□□□□ -1.51
CACNA1SQ13698 MAK-203ENST00000474039 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.61□□□□□ -1.51
CACNA1SQ13698 OR6K3-201ENST00000368145 1844 ntAPPRIS P1 BASIC5.61□□□□□ -1.51
CACNA1SQ13698 PPIG-201ENST00000260970 6368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
CACNA1SQ13698 USP29-202ENST00000598197 3284 ntAPPRIS P1 BASIC5.6□□□□□ -1.51
CACNA1SQ13698 MIPOL1-204ENST00000539062 2389 ntTSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
CACNA1SQ13698 CASC19-206ENST00000641028 1430 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
CACNA1SQ13698 OR8H3-201ENST00000313472 939 ntAPPRIS P1 BASIC5.6□□□□□ -1.51
CACNA1SQ13698 NAP1L4P1-201ENST00000319092 1157 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
CACNA1SQ13698 C10orf120-201ENST00000329446 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
CACNA1SQ13698 AL590762.2-201ENST00000395798 571 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
CACNA1SQ13698 RPS12P10-201ENST00000427031 377 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
CACNA1SQ13698 NDUFA5P1-201ENST00000433858 341 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
CACNA1SQ13698 RPL21P89-201ENST00000444021 467 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
CACNA1SQ13698 AC006326.1-201ENST00000445465 787 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
CACNA1SQ13698 RPS27AP16-201ENST00000492222 470 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
CACNA1SQ13698 NDUFB4P12-201ENST00000513465 390 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
CACNA1SQ13698 SPTY2D1-AS1-203ENST00000542172 331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
CACNA1SQ13698 AP002373.1-201ENST00000544347 729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.6□□□□□ -1.51
CACNA1SQ13698 NELL2-211ENST00000548826 559 ntTSL 2 BASIC5.6□□□□□ -1.51
CACNA1SQ13698 AC025884.1-201ENST00000556034 378 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
CACNA1SQ13698 AC073137.1-201ENST00000605636 634 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
CACNA1SQ13698 AC008833.1-201ENST00000611633 691 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
CACNA1SQ13698 UGT2A1-203ENST00000503640 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
CACNA1SQ13698 TPTE2-205ENST00000400230 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.6□□□□□ -1.51
CACNA1SQ13698 MUC17-201ENST00000306151 14247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
CACNA1SQ13698 HYKK-206ENST00000569878 4097 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.6□□□□□ -1.51
CACNA1SQ13698 ALMS1-IT1-201ENST00000441587 2107 ntTSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
CACNA1SQ13698 ZNF532-201ENST00000336078 6696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
CACNA1SQ13698 POLR2B-203ENST00000431623 3666 ntTSL 2 BASIC5.6□□□□□ -1.51
CACNA1SQ13698 CFH-206ENST00000630130 1658 ntTSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
CACNA1SQ13698 AC010186.3-201ENST00000537616 2508 ntTSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
CACNA1SQ13698 GABRA2-211ENST00000514090 3401 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.6□□□□□ -1.51
CACNA1SQ13698 DMD-228ENST00000541735 7080 ntTSL 5 BASIC5.6□□□□□ -1.51
CACNA1SQ13698 LIX1-201ENST00000274382 4026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
CACNA1SQ13698 AL137141.1-201ENST00000624622 4836 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
CACNA1SQ13698 SEC31A-201ENST00000264405 3447 ntTSL 2 BASIC5.6□□□□□ -1.51
CACNA1SQ13698 AL590609.3-201ENST00000411815 210 ntTSL 3 BASIC5.6□□□□□ -1.51
CACNA1SQ13698 AC020890.1-201ENST00000491837 504 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
CACNA1SQ13698 AC105233.3-201ENST00000531125 744 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
CACNA1SQ13698 AP001804.2-201ENST00000533932 910 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
CACNA1SQ13698 AC053481.3-201ENST00000577881 843 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
CACNA1SQ13698 ABHD15-AS1-201ENST00000581474 187 ntTSL 5 BASIC5.6□□□□□ -1.51
CACNA1SQ13698 MIR4444-1-201ENST00000581696 74 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
CACNA1SQ13698 MIR4444-2-201ENST00000584390 74 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
CACNA1SQ13698 OR8G7P-201ENST00000616658 848 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
CACNA1SQ13698 RYR3-212ENST00000634891 15591 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
CACNA1SQ13698 DGKB-202ENST00000402815 5595 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.6□□□□□ -1.51
CACNA1SQ13698 FBXO38-218ENST00000513826 3585 ntTSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
CACNA1SQ13698 CDH10-201ENST00000264463 3438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
CACNA1SQ13698 TDRD3-204ENST00000377894 2484 ntTSL 2 BASIC5.59□□□□□ -1.51
CACNA1SQ13698 AP000473.2-201ENST00000602659 1537 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
CACNA1SQ13698 AL031595.2-201ENST00000624215 19071 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
CACNA1SQ13698 MYO3B-202ENST00000408978 5529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
CACNA1SQ13698 AC110597.3-202ENST00000583493 3289 ntTSL 5 BASIC5.59□□□□□ -1.51
CACNA1SQ13698 MLH3-202ENST00000380968 7819 ntTSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
CACNA1SQ13698 ARIH1-201ENST00000379887 21681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
CACNA1SQ13698 ADAM29-214ENST00000618444 2949 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC5.59□□□□□ -1.51
CACNA1SQ13698 AC092447.5-201ENST00000429367 2741 ntTSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
CACNA1SQ13698 SAMD12-202ENST00000409003 8866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.59□□□□□ -1.51
CACNA1SQ13698 OR8D1-201ENST00000357821 1026 ntAPPRIS P1 BASIC5.59□□□□□ -1.51
CACNA1SQ13698 GTSF1L-201ENST00000373003 835 ntAPPRIS P3 BASIC5.59□□□□□ -1.51
CACNA1SQ13698 SCP2-205ENST00000408941 1298 ntTSL 2 BASIC5.59□□□□□ -1.51
CACNA1SQ13698 SNRPFP1-201ENST00000414761 252 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
CACNA1SQ13698 RAB9AP4-201ENST00000415230 609 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
CACNA1SQ13698 AC010163.2-201ENST00000416341 381 ntTSL 2 BASIC5.59□□□□□ -1.51
CACNA1SQ13698 BTF3P10-201ENST00000433415 495 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
CACNA1SQ13698 AC105940.1-201ENST00000434265 353 ntTSL 3 BASIC5.59□□□□□ -1.51
CACNA1SQ13698 AL354754.1-201ENST00000449730 625 ntTSL 3 BASIC5.59□□□□□ -1.51
CACNA1SQ13698 APOA2-207ENST00000470459 416 ntTSL 5 BASIC5.59□□□□□ -1.51
CACNA1SQ13698 RN7SL810P-201ENST00000493031 276 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
CACNA1SQ13698 AC133634.1-201ENST00000517695 566 ntTSL 3 BASIC5.59□□□□□ -1.51
CACNA1SQ13698 LINC02290-201ENST00000554187 608 ntTSL 4 BASIC5.59□□□□□ -1.51
CACNA1SQ13698 AC004160.1-202ENST00000599917 578 ntTSL 5 BASIC5.59□□□□□ -1.51
CACNA1SQ13698 AP005019.3-201ENST00000620418 560 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
CACNA1SQ13698 LGI1-209ENST00000627699 664 ntTSL 3 BASIC5.59□□□□□ -1.51
CACNA1SQ13698 FCHSD2-208ENST00000458644 2215 ntTSL 2 BASIC5.59□□□□□ -1.51
CACNA1SQ13698 AL445487.1-201ENST00000415694 1580 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
CACNA1SQ13698 SMNDC1-202ENST00000369603 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.52
CACNA1SQ13698 XPNPEP3-201ENST00000357137 7988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.52
CACNA1SQ13698 PHLDB2-214ENST00000495180 4159 ntTSL 2 BASIC5.59□□□□□ -1.52
CACNA1SQ13698 CDH19-201ENST00000262150 6341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
CACNA1SQ13698 HELZ-207ENST00000580168 6279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
CACNA1SQ13698 AC245407.1-201ENST00000621489 2538 ntTSL 2 BASIC5.58□□□□□ -1.52
CACNA1SQ13698 PPIAP31-201ENST00000405422 495 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
CACNA1SQ13698 CR769775.2-201ENST00000417850 891 ntTSL 3 BASIC5.58□□□□□ -1.52
CACNA1SQ13698 RPL23AP38-201ENST00000423801 469 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
CACNA1SQ13698 RPL35P6-201ENST00000490024 372 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
CACNA1SQ13698 AC023136.1-201ENST00000513093 1105 ntTSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
CACNA1SQ13698 LINC00254-201ENST00000563416 662 ntTSL 3 BASIC5.58□□□□□ -1.52
CACNA1SQ13698 AL022238.2-202ENST00000607915 658 ntTSL 5 BASIC5.58□□□□□ -1.52
CACNA1SQ13698 RFC1-201ENST00000349703 4859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
CACNA1SQ13698 RFC1-202ENST00000381897 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
CACNA1SQ13698 KTN1-202ENST00000395308 4134 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
CACNA1SQ13698 NAT1-210ENST00000545197 1827 ntTSL 5 BASIC5.58□□□□□ -1.52
CACNA1SQ13698 YES1-203ENST00000577961 4554 ntTSL 5 BASIC5.58□□□□□ -1.52
CACNA1SQ13698 FGL1-209ENST00000522444 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
CACNA1SQ13698 GABRG2-228ENST00000640985 3086 ntTSL 5 BASIC5.58□□□□□ -1.52
CACNA1SQ13698 PGBD4-201ENST00000397766 6612 ntAPPRIS P1 BASIC5.58□□□□□ -1.52
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