Protein–RNA interactions for Protein: Q13461

FOXE3, Forkhead box protein E3, humanhuman

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Length 319 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXE3Q13461 RPS3AP23-201ENST00000401762 784 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
FOXE3Q13461 METTL5-204ENST00000409340 472 ntTSL 5 BASIC5.11□□□□□ -1.59
FOXE3Q13461 RN7SKP56-201ENST00000410513 331 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
FOXE3Q13461 MAGI2-AS2-201ENST00000411616 476 ntTSL 2 BASIC5.11□□□□□ -1.59
FOXE3Q13461 AL049649.1-202ENST00000412405 414 ntTSL 3 BASIC5.11□□□□□ -1.59
FOXE3Q13461 LINC01393-201ENST00000419905 746 ntTSL 2 BASIC5.11□□□□□ -1.59
FOXE3Q13461 AL513174.1-201ENST00000423182 629 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
FOXE3Q13461 AC090505.2-201ENST00000427064 464 ntTSL 3 BASIC5.11□□□□□ -1.59
FOXE3Q13461 AL158832.1-201ENST00000429661 406 ntTSL 3 BASIC5.11□□□□□ -1.59
FOXE3Q13461 YWHAEP5-201ENST00000431545 765 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
FOXE3Q13461 AC234064.1-201ENST00000436312 247 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
FOXE3Q13461 RPL7P36-201ENST00000444633 681 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
FOXE3Q13461 AC005002.1-201ENST00000447458 540 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
FOXE3Q13461 AC099344.3-201ENST00000454489 626 ntTSL 3 BASIC5.11□□□□□ -1.59
FOXE3Q13461 AL139156.3-201ENST00000454802 394 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
FOXE3Q13461 AC096554.1-201ENST00000458182 529 ntTSL 5 BASIC5.11□□□□□ -1.59
FOXE3Q13461 RBM43P1-201ENST00000476891 1081 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
FOXE3Q13461 AC098818.1-201ENST00000478593 252 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
FOXE3Q13461 AC079841.1-201ENST00000481228 950 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
FOXE3Q13461 VPS26AP1-201ENST00000483197 979 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
FOXE3Q13461 LINC01322-202ENST00000494915 594 ntTSL 4 BASIC5.11□□□□□ -1.59
FOXE3Q13461 H3F3AP3-201ENST00000497682 407 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
FOXE3Q13461 AC114912.1-201ENST00000503394 546 ntTSL 3 BASIC5.11□□□□□ -1.59
FOXE3Q13461 AC079340.1-201ENST00000504799 552 ntTSL 4 BASIC5.11□□□□□ -1.59
FOXE3Q13461 AC106872.4-201ENST00000510050 523 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
FOXE3Q13461 AC010342.1-201ENST00000514047 877 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
FOXE3Q13461 SNORA81.2-201ENST00000516868 170 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
FOXE3Q13461 AC025434.1-201ENST00000520705 460 ntTSL 3 BASIC5.11□□□□□ -1.59
FOXE3Q13461 SKP1-210ENST00000522855 802 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC5.11□□□□□ -1.59
FOXE3Q13461 AC013509.1-201ENST00000524269 339 ntTSL 3 BASIC5.11□□□□□ -1.59
FOXE3Q13461 AC105031.3-201ENST00000524359 616 ntTSL 3 BASIC5.11□□□□□ -1.59
FOXE3Q13461 AP001992.1-204ENST00000525104 687 ntTSL 3 BASIC5.11□□□□□ -1.59
FOXE3Q13461 YWHABP2-201ENST00000540201 713 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
FOXE3Q13461 LINC02384-206ENST00000541707 904 ntTSL 3 BASIC5.11□□□□□ -1.59
FOXE3Q13461 AL157688.1-201ENST00000555990 369 ntTSL 3 BASIC5.11□□□□□ -1.59
FOXE3Q13461 AC023968.1-201ENST00000560719 475 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
FOXE3Q13461 AC091117.1-201ENST00000560967 426 ntTSL 5 BASIC5.11□□□□□ -1.59
FOXE3Q13461 MT1CP-201ENST00000567054 174 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
FOXE3Q13461 PPIAL4A-201ENST00000577856 660 ntAPPRIS P1 BASIC5.11□□□□□ -1.59
FOXE3Q13461 AL121989.1-201ENST00000585888 746 ntTSL 3 BASIC5.11□□□□□ -1.59
FOXE3Q13461 AC005498.1-201ENST00000592125 465 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
FOXE3Q13461 AC011500.1-201ENST00000601963 469 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
FOXE3Q13461 AC008555.3-201ENST00000603717 442 ntTSL 3 BASIC5.11□□□□□ -1.59
FOXE3Q13461 AC010680.3-201ENST00000604215 520 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
FOXE3Q13461 AC011891.2-201ENST00000604949 397 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
FOXE3Q13461 AC016747.2-201ENST00000605902 364 ntTSL 2 BASIC5.11□□□□□ -1.59
FOXE3Q13461 Metazoa_SRP.66-201ENST00000615609 282 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
FOXE3Q13461 AC138649.3-201ENST00000622154 254 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
FOXE3Q13461 AC124864.2-201ENST00000624736 186 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
FOXE3Q13461 AC073488.9-201ENST00000631601 754 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
FOXE3Q13461 AF067845.5-201ENST00000633906 437 ntTSL 3 BASIC5.11□□□□□ -1.59
FOXE3Q13461 OR52B5P-202ENST00000641118 1110 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
FOXE3Q13461 OR5T1-201ENST00000641368 1118 ntAPPRIS P1 BASIC5.11□□□□□ -1.59
FOXE3Q13461 HTR2A-202ENST00000542664 5429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
FOXE3Q13461 GABPB1-204ENST00000396464 1401 ntTSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
FOXE3Q13461 AC092111.2-201ENST00000611627 1414 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
FOXE3Q13461 TTC3-201ENST00000354749 9084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
FOXE3Q13461 URI1-201ENST00000360605 1579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
FOXE3Q13461 GOLT1B-201ENST00000229314 3227 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
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FOXE3Q13461 PIGN-217ENST00000591238 1622 ntTSL 5 BASIC5.11□□□□□ -1.59
FOXE3Q13461 DNAL1-202ENST00000553645 8404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
FOXE3Q13461 MID1-206ENST00000380787 5973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
FOXE3Q13461 SOHLH2-202ENST00000379881 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
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FOXE3Q13461 STIL-203ENST00000371877 5009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
FOXE3Q13461 ZNF566-202ENST00000424129 2644 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.1□□□□□ -1.59
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FOXE3Q13461 ANKRD31-203ENST00000506364 6207 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.1□□□□□ -1.59
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FOXE3Q13461 OR2AP1-201ENST00000321688 930 ntAPPRIS P1 BASIC5.1□□□□□ -1.59
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FOXE3Q13461 RN7SKP250-201ENST00000363924 321 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
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FOXE3Q13461 Y_RNA.372-201ENST00000365599 102 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
FOXE3Q13461 PRPS1-202ENST00000372419 628 ntTSL 2 BASIC5.1□□□□□ -1.59
FOXE3Q13461 MT-TD-201ENST00000387419 68 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
FOXE3Q13461 PRELID1P1-201ENST00000403549 660 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
FOXE3Q13461 RPL5P20-201ENST00000403848 896 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
FOXE3Q13461 FCF1P10-201ENST00000407590 479 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
FOXE3Q13461 RNU6-575P-201ENST00000411326 105 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
FOXE3Q13461 LINC01347-201ENST00000417964 355 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
FOXE3Q13461 AL139184.1-202ENST00000422303 222 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
FOXE3Q13461 FABP7P1-201ENST00000424004 391 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
FOXE3Q13461 TANC2-202ENST00000424789 11721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
FOXE3Q13461 ALKBH8-205ENST00000428149 4079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
FOXE3Q13461 LINC00392-201ENST00000430033 557 ntTSL 3 BASIC5.1□□□□□ -1.59
FOXE3Q13461 RPSAP32-201ENST00000432681 526 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
FOXE3Q13461 MTND4LP10-201ENST00000435146 291 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
FOXE3Q13461 AP000365.1-201ENST00000438850 546 ntTSL 4 BASIC5.1□□□□□ -1.59
FOXE3Q13461 MTND4P19-201ENST00000446659 478 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
FOXE3Q13461 RPS4XP12-201ENST00000461747 709 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
FOXE3Q13461 RPL30P9-201ENST00000465586 330 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
FOXE3Q13461 ALG13-211ENST00000473389 693 ntTSL 2 BASIC5.1□□□□□ -1.59
FOXE3Q13461 H3F3AP5-201ENST00000475267 429 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
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