Protein–RNA interactions for Protein: P28827

PTPRM, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase mu, humanhuman

Predictions only

Length 1,452 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRMP28827 CDK14-201ENST00000265741 4953 ntTSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
PTPRMP28827 KIAA0586-203ENST00000423743 5339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
PTPRMP28827 CASC19-204ENST00000641001 2055 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
PTPRMP28827 R3HDM1-202ENST00000409478 4272 ntTSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
PTPRMP28827 AC133552.1-201ENST00000569988 4007 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
PTPRMP28827 SLC12A6-204ENST00000397707 4194 ntTSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
PTPRMP28827 DICER1-202ENST00000393063 10220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
PTPRMP28827 COL14A1-209ENST00000537875 3119 ntTSL 5 BASIC6.74□□□□□ -1.33
PTPRMP28827 FREM2-201ENST00000280481 16070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
PTPRMP28827 DGKB-201ENST00000399322 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.73□□□□□ -1.33
PTPRMP28827 OSER1-202ENST00000372970 1616 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.73□□□□□ -1.33
PTPRMP28827 AC004817.4-201ENST00000602396 3625 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
PTPRMP28827 NUDT6-202ENST00000339154 1065 ntTSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
PTPRMP28827 TANK-206ENST00000406287 875 ntTSL 5 BASIC6.73□□□□□ -1.33
PTPRMP28827 AC051618.1-201ENST00000414295 207 ntTSL 3 BASIC6.73□□□□□ -1.33
PTPRMP28827 PCBP1-AS1-224ENST00000429599 1045 ntTSL 5 BASIC6.73□□□□□ -1.33
PTPRMP28827 LINC01704-202ENST00000442358 649 ntTSL 3 BASIC6.73□□□□□ -1.33
PTPRMP28827 F11-205ENST00000492972 1204 ntTSL 2 BASIC6.73□□□□□ -1.33
PTPRMP28827 LINC02146-201ENST00000504244 509 ntTSL 3 BASIC6.73□□□□□ -1.33
PTPRMP28827 TRAPPC2-208ENST00000519885 561 ntTSL 3 BASIC6.73□□□□□ -1.33
PTPRMP28827 AC107373.1-201ENST00000522570 603 ntTSL 3 BASIC6.73□□□□□ -1.33
PTPRMP28827 AC013549.2-201ENST00000526953 489 ntTSL 3 BASIC6.73□□□□□ -1.33
PTPRMP28827 AP000462.1-201ENST00000535704 818 ntTSL 3 BASIC6.73□□□□□ -1.33
PTPRMP28827 RAD51AP1-213ENST00000544927 787 ntTSL 4 BASIC6.73□□□□□ -1.33
PTPRMP28827 PYM1-205ENST00000547925 499 ntTSL 3 BASIC6.73□□□□□ -1.33
PTPRMP28827 AC025035.1-201ENST00000551571 894 ntTSL 2 BASIC6.73□□□□□ -1.33
PTPRMP28827 AC113403.1-201ENST00000604910 193 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
PTPRMP28827 AC073137.1-201ENST00000605636 634 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
PTPRMP28827 VIPR1-AS1-223ENST00000627073 451 ntTSL 5 BASIC6.73□□□□□ -1.33
PTPRMP28827 CLUL1-213ENST00000620089 1947 ntTSL 5 BASIC6.73□□□□□ -1.33
PTPRMP28827 AC020656.2-201ENST00000613291 5309 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
PTPRMP28827 ING3-201ENST00000315870 3777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
PTPRMP28827 ZFP14-201ENST00000270001 7489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
PTPRMP28827 ADGRL3-205ENST00000506746 4935 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.73□□□□□ -1.33
PTPRMP28827 ANLN-202ENST00000396068 4661 ntTSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
PTPRMP28827 ATXN3-207ENST00000503767 1315 ntTSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
PTPRMP28827 RBM25-201ENST00000261973 6910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
PTPRMP28827 ABCC13-202ENST00000463099 3842 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
PTPRMP28827 ICE2P1-201ENST00000512800 1849 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
PTPRMP28827 AC073342.2-201ENST00000595842 1800 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
PTPRMP28827 CCL7-203ENST00000394630 687 ntTSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
PTPRMP28827 KLRC3-202ENST00000396439 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.73□□□□□ -1.33
PTPRMP28827 RN7SKP33-201ENST00000410942 340 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
PTPRMP28827 AL450472.1-201ENST00000439434 405 ntTSL 2 BASIC6.73□□□□□ -1.33
PTPRMP28827 AC096558.1-202ENST00000442794 561 ntTSL 4 BASIC6.73□□□□□ -1.33
PTPRMP28827 DHFRP3-201ENST00000455595 559 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
PTPRMP28827 LINC01312-202ENST00000456347 813 ntTSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
PTPRMP28827 LINC02045-201ENST00000460324 679 ntTSL 3 BASIC6.73□□□□□ -1.33
PTPRMP28827 RN7SL691P-201ENST00000494487 301 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
PTPRMP28827 LINC02110-201ENST00000503870 546 ntTSL 3 BASIC6.73□□□□□ -1.33
PTPRMP28827 EDNRA-204ENST00000506066 1032 ntTSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
PTPRMP28827 AC068775.2-201ENST00000539033 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
PTPRMP28827 LINC02402-201ENST00000550337 1212 ntTSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
PTPRMP28827 AC009137.1-201ENST00000562790 260 ntTSL 3 BASIC6.73□□□□□ -1.33
PTPRMP28827 SNORA74C-1-201ENST00000580726 201 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
PTPRMP28827 THRA1/BTR-203ENST00000604191 571 ntTSL 4 BASIC6.73□□□□□ -1.33
PTPRMP28827 PLSCR2-207ENST00000613069 1208 ntTSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
PTPRMP28827 AC108467.2-201ENST00000617640 1597 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
PTPRMP28827 AC073346.2-201ENST00000624724 2058 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
PTPRMP28827 UTS2B-201ENST00000340524 2395 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.72□□□□□ -1.33
PTPRMP28827 PCLO-203ENST00000423517 17147 ntTSL 5 BASIC6.72□□□□□ -1.33
PTPRMP28827 GABRB2-201ENST00000274547 7409 ntTSL 5 BASIC6.72□□□□□ -1.33
PTPRMP28827 UBR5-204ENST00000518205 1931 ntTSL 5 BASIC6.72□□□□□ -1.33
PTPRMP28827 GPALPP1-201ENST00000357537 5368 ntTSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
PTPRMP28827 KIAA1328-201ENST00000280020 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
PTPRMP28827 CUL4B-204ENST00000404115 3264 ntTSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
PTPRMP28827 PYHIN1-203ENST00000368140 2083 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
PTPRMP28827 LINC01844-201ENST00000432677 2237 ntTSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
PTPRMP28827 PTMAP5-201ENST00000393073 333 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
PTPRMP28827 SDHCP2-201ENST00000398565 501 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
PTPRMP28827 HYKK-202ENST00000408962 847 ntTSL 5 BASIC6.72□□□□□ -1.33
PTPRMP28827 QRSL1P2-201ENST00000418582 964 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
PTPRMP28827 TMX2P1-201ENST00000436507 708 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
PTPRMP28827 RN7SL517P-201ENST00000462240 305 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
PTPRMP28827 AC108751.4-201ENST00000462931 1001 ntTSL 2 BASIC6.72□□□□□ -1.33
PTPRMP28827 AC053481.1-201ENST00000467217 306 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
PTPRMP28827 ACTR3BP4-201ENST00000503033 1244 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
PTPRMP28827 RNU6-709P-201ENST00000517257 104 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
PTPRMP28827 IGHV4OR15-8-201ENST00000557788 353 ntAPPRIS P1 BASIC6.72□□□□□ -1.33
PTPRMP28827 HYKK-203ENST00000563233 734 ntTSL 2 BASIC6.72□□□□□ -1.33
PTPRMP28827 AL355376.2-201ENST00000603866 267 ntTSL 5 BASIC6.72□□□□□ -1.33
PTPRMP28827 AC244196.2-201ENST00000621184 411 ntAPPRIS P1 BASIC6.72□□□□□ -1.33
PTPRMP28827 AC135068.2-201ENST00000622410 353 ntAPPRIS P1 BASIC6.72□□□□□ -1.33
PTPRMP28827 THOC1-221ENST00000631280 2011 ntTSL 5 BASIC6.72□□□□□ -1.33
PTPRMP28827 SCN1A-204ENST00000423058 8191 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
PTPRMP28827 MRRF-208ENST00000394315 1501 ntTSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.33
PTPRMP28827 AP1G1-207ENST00000564155 2723 ntTSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.33
PTPRMP28827 ZNF93-201ENST00000343769 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.33
PTPRMP28827 PARD3B-214ENST00000622699 7442 ntTSL 5 BASIC6.71□□□□□ -1.33
PTPRMP28827 MAK-203ENST00000474039 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
PTPRMP28827 NSD3-206ENST00000527502 4471 ntTSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
PTPRMP28827 MIR218-2-201ENST00000385006 110 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
PTPRMP28827 ARL4AP5-201ENST00000404372 599 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
PTPRMP28827 AL121872.1-202ENST00000435867 308 ntTSL 5 BASIC6.71□□□□□ -1.34
PTPRMP28827 AL672167.1-201ENST00000441381 464 ntTSL 3 BASIC6.71□□□□□ -1.34
PTPRMP28827 OR52E3P-201ENST00000452083 936 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
PTPRMP28827 RPL29-203ENST00000475248 551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.71□□□□□ -1.34
PTPRMP28827 AC025164.1-201ENST00000496249 478 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
PTPRMP28827 LINC02005-201ENST00000498832 782 ntTSL 3 BASIC6.71□□□□□ -1.34
PTPRMP28827 AC006206.2-202ENST00000537714 648 ntTSL 5 BASIC6.71□□□□□ -1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 97.3 ms