Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q05

TRAPPC9, Trafficking protein particle complex subunit 9, humanhuman

Predictions only

Length 1,148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC9Q96Q05 TRAV14DV4-201ENST00000390440 425 ntAPPRIS P1 BASIC5.43□□□□□ -1.54
TRAPPC9Q96Q05 TRAJ4-201ENST00000390533 63 ntAPPRIS P1 BASIC5.43□□□□□ -1.54
TRAPPC9Q96Q05 RNU6-932P-201ENST00000391108 106 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
TRAPPC9Q96Q05 HMGB3P18-201ENST00000406327 590 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
TRAPPC9Q96Q05 GAPDHP42-201ENST00000406848 981 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
TRAPPC9Q96Q05 MTCO2P8-201ENST00000412213 658 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
TRAPPC9Q96Q05 AC013472.2-201ENST00000416226 306 ntTSL 3 BASIC5.43□□□□□ -1.54
TRAPPC9Q96Q05 DAB1-AS1-201ENST00000416598 1262 ntTSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
TRAPPC9Q96Q05 AP000221.1-201ENST00000419694 1046 ntTSL 3 BASIC5.43□□□□□ -1.54
TRAPPC9Q96Q05 AL133173.1-201ENST00000423458 397 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
TRAPPC9Q96Q05 ANAPC1P1-201ENST00000426186 2145 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
TRAPPC9Q96Q05 NANOGP4-201ENST00000427230 913 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
TRAPPC9Q96Q05 AL354714.4-201ENST00000427339 575 ntTSL 3 BASIC5.43□□□□□ -1.54
TRAPPC9Q96Q05 NPM1P22-201ENST00000427761 952 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
TRAPPC9Q96Q05 GTF3AP5-201ENST00000442645 697 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
TRAPPC9Q96Q05 HSFY3P-201ENST00000444242 1191 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
TRAPPC9Q96Q05 EIF4A1P6-201ENST00000448133 1210 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
TRAPPC9Q96Q05 AL035407.2-201ENST00000454090 378 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
TRAPPC9Q96Q05 CCNB1IP1P3-201ENST00000454702 829 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
TRAPPC9Q96Q05 SNORD125-201ENST00000459538 96 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
TRAPPC9Q96Q05 AP000942.1-201ENST00000463969 747 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
TRAPPC9Q96Q05 AC026414.1-201ENST00000504046 698 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
TRAPPC9Q96Q05 LINC02147-201ENST00000509367 807 ntTSL 2 BASIC5.43□□□□□ -1.54
TRAPPC9Q96Q05 AC108471.1-201ENST00000513977 287 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
TRAPPC9Q96Q05 AC140125.1-201ENST00000515739 684 ntTSL 5 BASIC5.43□□□□□ -1.54
TRAPPC9Q96Q05 IGKV2D-10-201ENST00000520194 281 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
TRAPPC9Q96Q05 IGKV2-18-201ENST00000522607 343 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
TRAPPC9Q96Q05 AL158801.3-201ENST00000555514 363 ntTSL 3 BASIC5.43□□□□□ -1.54
TRAPPC9Q96Q05 AC092078.1-201ENST00000558370 325 ntTSL 3 BASIC5.43□□□□□ -1.54
TRAPPC9Q96Q05 AGGF1P7-201ENST00000562369 913 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
TRAPPC9Q96Q05 RN7SL290P-201ENST00000578661 300 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
TRAPPC9Q96Q05 AC022884.3-201ENST00000579571 248 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
TRAPPC9Q96Q05 AC068408.2-201ENST00000584566 439 ntTSL 3 BASIC5.43□□□□□ -1.54
TRAPPC9Q96Q05 TTN-AS1-217ENST00000585625 945 ntTSL 5 BASIC5.43□□□□□ -1.54
TRAPPC9Q96Q05 ZNF667-AS1-207ENST00000592146 668 ntTSL 5 BASIC5.43□□□□□ -1.54
TRAPPC9Q96Q05 DARS-AS1-211ENST00000595061 720 ntTSL 5 BASIC5.43□□□□□ -1.54
TRAPPC9Q96Q05 AL022067.1-201ENST00000602426 454 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
TRAPPC9Q96Q05 AC093673.2-201ENST00000609674 331 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
TRAPPC9Q96Q05 AC096586.1-201ENST00000610267 561 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
TRAPPC9Q96Q05 Metazoa_SRP.170-201ENST00000616060 254 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
TRAPPC9Q96Q05 AL035661.1-201ENST00000620459 1144 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
TRAPPC9Q96Q05 ZNF479-203ENST00000620639 1239 ntTSL 5 BASIC5.43□□□□□ -1.54
TRAPPC9Q96Q05 AP003497.2-201ENST00000624220 967 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
TRAPPC9Q96Q05 SAMMSON-209ENST00000641222 1100 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
TRAPPC9Q96Q05 ZFPM2-203ENST00000517361 3300 ntTSL 2 BASIC5.43□□□□□ -1.54
TRAPPC9Q96Q05 CCNB3-201ENST00000276014 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
TRAPPC9Q96Q05 RFC3-202ENST00000434425 1461 ntTSL 5 BASIC5.43□□□□□ -1.54
TRAPPC9Q96Q05 IQCH-214ENST00000629425 1822 ntTSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
TRAPPC9Q96Q05 KAT6B-201ENST00000287239 8287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
TRAPPC9Q96Q05 MYBPC1-216ENST00000550270 3426 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.43□□□□□ -1.54
TRAPPC9Q96Q05 ZNF92-203ENST00000431504 2947 ntTSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
TRAPPC9Q96Q05 FANCD2-202ENST00000383807 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
TRAPPC9Q96Q05 MAPK6PS2-201ENST00000379571 2060 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
TRAPPC9Q96Q05 SLCO1C1-201ENST00000266509 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
TRAPPC9Q96Q05 LINC00624-202ENST00000621316 3372 ntTSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
TRAPPC9Q96Q05 AC068870.1-201ENST00000563737 2455 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
TRAPPC9Q96Q05 AC005703.1-201ENST00000431343 1773 ntTSL 2 BASIC5.42□□□□□ -1.54
TRAPPC9Q96Q05 PREPL-201ENST00000260648 3672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
TRAPPC9Q96Q05 ANK2-202ENST00000357077 14196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
TRAPPC9Q96Q05 C3orf67-AS1-202ENST00000482372 2203 ntTSL 2 BASIC5.42□□□□□ -1.54
TRAPPC9Q96Q05 PTPRO-210ENST00000544244 3978 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.42□□□□□ -1.54
TRAPPC9Q96Q05 AC097461.1-201ENST00000568928 2821 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
TRAPPC9Q96Q05 RN7SKP160-201ENST00000363804 340 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
TRAPPC9Q96Q05 RNA5SP132-201ENST00000364725 118 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
TRAPPC9Q96Q05 RNA5SP241-201ENST00000391326 114 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
TRAPPC9Q96Q05 ZSCAN12P1-201ENST00000406489 419 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
TRAPPC9Q96Q05 SLC19A3-202ENST00000409287 644 ntTSL 3 BASIC5.42□□□□□ -1.54
TRAPPC9Q96Q05 COX5BP7-201ENST00000414780 274 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
TRAPPC9Q96Q05 LINC01881-201ENST00000416103 412 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
TRAPPC9Q96Q05 AL451107.1-201ENST00000416310 408 ntTSL 2 BASIC5.42□□□□□ -1.54
TRAPPC9Q96Q05 ALG13-AS1-201ENST00000430794 195 ntTSL 5 BASIC5.42□□□□□ -1.54
TRAPPC9Q96Q05 AL080316.1-201ENST00000432438 499 ntTSL 2 BASIC5.42□□□□□ -1.54
TRAPPC9Q96Q05 FTH1P16-201ENST00000435241 552 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
TRAPPC9Q96Q05 AC006335.2-201ENST00000437993 330 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
TRAPPC9Q96Q05 AP001604.1-201ENST00000447384 954 ntTSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
TRAPPC9Q96Q05 CD200R1L-202ENST00000448932 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.42□□□□□ -1.54
TRAPPC9Q96Q05 LINC01911-201ENST00000450667 806 ntTSL 5 BASIC5.42□□□□□ -1.54
TRAPPC9Q96Q05 AL450023.1-201ENST00000450868 751 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
TRAPPC9Q96Q05 PRPF38AP1-201ENST00000451976 933 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
TRAPPC9Q96Q05 RPS7P6-201ENST00000485777 579 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
TRAPPC9Q96Q05 LINC02325-201ENST00000499910 1115 ntTSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
TRAPPC9Q96Q05 DUTP7-201ENST00000507982 486 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
TRAPPC9Q96Q05 AC012625.1-201ENST00000515153 625 ntTSL 5 BASIC5.42□□□□□ -1.54
TRAPPC9Q96Q05 AC111149.1-201ENST00000522560 343 ntTSL 3 BASIC5.42□□□□□ -1.54
TRAPPC9Q96Q05 AP001372.4-201ENST00000524889 472 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
TRAPPC9Q96Q05 AP002518.2-201ENST00000544925 393 ntTSL 5 BASIC5.42□□□□□ -1.54
TRAPPC9Q96Q05 LINC02399-201ENST00000547094 400 ntTSL 2 BASIC5.42□□□□□ -1.54
TRAPPC9Q96Q05 AC091231.1-201ENST00000558443 391 ntTSL 5 BASIC5.42□□□□□ -1.54
TRAPPC9Q96Q05 LINC00933-205ENST00000560917 449 ntTSL 3 BASIC5.42□□□□□ -1.54
TRAPPC9Q96Q05 LINC02168-201ENST00000565327 352 ntTSL 2 BASIC5.42□□□□□ -1.54
TRAPPC9Q96Q05 MRPS21P7-201ENST00000566937 238 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
TRAPPC9Q96Q05 AC005537.1-201ENST00000588324 1238 ntTSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
TRAPPC9Q96Q05 OR7E18P-201ENST00000592589 702 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
TRAPPC9Q96Q05 LINC02343-201ENST00000605909 573 ntTSL 4 BASIC5.42□□□□□ -1.54
TRAPPC9Q96Q05 LINC01358-205ENST00000625548 874 ntTSL 5 BASIC5.42□□□□□ -1.54
TRAPPC9Q96Q05 AC005972.4-201ENST00000636248 1131 ntTSL 5 BASIC5.42□□□□□ -1.54
TRAPPC9Q96Q05 CPXCR1-203ENST00000614120 1485 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.42□□□□□ -1.54
TRAPPC9Q96Q05 AC067956.1-201ENST00000414512 2062 ntTSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
TRAPPC9Q96Q05 LIMA1-215ENST00000552823 3254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.42□□□□□ -1.54
TRAPPC9Q96Q05 KCNJ1-206ENST00000440599 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 113.5 ms