Protein–RNA interactions for Protein: Q15475

SIX1, Homeobox protein SIX1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 284 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIX1Q15475 AL645927.1-201ENST00000396783 406 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
SIX1Q15475 RSU1P3-201ENST00000412878 835 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
SIX1Q15475 CEACAMP8-201ENST00000413902 580 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
SIX1Q15475 AC009237.10-201ENST00000414112 510 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
SIX1Q15475 CPB2-AS1-201ENST00000415033 747 ntTSL 3 BASIC4.81□□□□□ -1.64
SIX1Q15475 NPM1P22-201ENST00000427761 952 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
SIX1Q15475 PCBP1-AS1-224ENST00000429599 1045 ntTSL 5 BASIC4.81□□□□□ -1.64
SIX1Q15475 AC092647.3-201ENST00000443044 633 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
SIX1Q15475 LINC00189-203ENST00000447125 783 ntTSL 3 BASIC4.81□□□□□ -1.64
SIX1Q15475 AL513343.1-201ENST00000451818 792 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
SIX1Q15475 TPRKBP1-201ENST00000456243 481 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
SIX1Q15475 AC090142.1-201ENST00000465776 462 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
SIX1Q15475 AC104257.1-202ENST00000524275 884 ntTSL 3 BASIC4.81□□□□□ -1.64
SIX1Q15475 AC008033.2-201ENST00000542626 177 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
SIX1Q15475 LINC02446-201ENST00000544591 868 ntTSL 2 BASIC4.81□□□□□ -1.64
SIX1Q15475 AC004801.3-201ENST00000547602 962 ntTSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
SIX1Q15475 LINC01619-209ENST00000552277 571 ntTSL 4 BASIC4.81□□□□□ -1.64
SIX1Q15475 LINC00644-201ENST00000555156 295 ntTSL 2 BASIC4.81□□□□□ -1.64
SIX1Q15475 AL132712.2-201ENST00000556653 127 ntTSL 3 BASIC4.81□□□□□ -1.64
SIX1Q15475 MIR7515HG-226ENST00000588330 1055 ntTSL 5 BASIC4.81□□□□□ -1.64
SIX1Q15475 AL121890.2-201ENST00000617644 465 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
SIX1Q15475 AC006213.5-201ENST00000619673 288 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
SIX1Q15475 AL139254.3-201ENST00000641097 674 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
SIX1Q15475 CLCA1-201ENST00000234701 3310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
SIX1Q15475 CNTN5-209ENST00000528682 3800 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC4.81□□□□□ -1.64
SIX1Q15475 ENOX2-202ENST00000370927 3788 ntTSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
SIX1Q15475 CTAGE5-208ENST00000553352 3441 ntTSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
SIX1Q15475 PIGN-242ENST00000640145 4505 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
SIX1Q15475 TRIM36-209ENST00000514154 1952 ntTSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
SIX1Q15475 AC068870.3-201ENST00000625077 2536 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
SIX1Q15475 PMCHL1-201ENST00000418902 1917 ntTSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
SIX1Q15475 TPRG1-201ENST00000345063 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
SIX1Q15475 FILIP1-201ENST00000237172 4580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
SIX1Q15475 Z95331.1-201ENST00000623075 23112 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
SIX1Q15475 NFIB-203ENST00000380934 2142 ntTSL 2 BASIC4.8□□□□□ -1.64
SIX1Q15475 EI24P3-201ENST00000399046 1062 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
SIX1Q15475 RNA5SP146-201ENST00000410743 123 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
SIX1Q15475 AL353764.1-201ENST00000442072 474 ntTSL 2 BASIC4.8□□□□□ -1.64
SIX1Q15475 AC073850.1-201ENST00000449243 255 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
SIX1Q15475 AL645937.3-201ENST00000453647 936 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
SIX1Q15475 LINC01206-203ENST00000476815 482 ntTSL 3 BASIC4.8□□□□□ -1.64
SIX1Q15475 AC090013.1-201ENST00000485147 480 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
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SIX1Q15475 AC025741.1-201ENST00000506100 544 ntTSL 4 BASIC4.8□□□□□ -1.64
SIX1Q15475 LINC01332-201ENST00000506612 502 ntTSL 4 BASIC4.8□□□□□ -1.64
SIX1Q15475 AC026434.1-201ENST00000511474 454 ntTSL 3 BASIC4.8□□□□□ -1.64
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SIX1Q15475 AL133485.1-201ENST00000555966 392 ntTSL 2 BASIC4.8□□□□□ -1.64
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SIX1Q15475 AC027455.1-201ENST00000574104 594 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
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SIX1Q15475 AC092364.1-202ENST00000593824 565 ntTSL 4 BASIC4.8□□□□□ -1.64
SIX1Q15475 AC090181.2-201ENST00000602975 672 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
SIX1Q15475 AP002360.3-201ENST00000607673 710 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
SIX1Q15475 AL162574.2-201ENST00000614618 657 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
SIX1Q15475 CARF-203ENST00000414439 2099 ntTSL 2 BASIC4.8□□□□□ -1.64
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SIX1Q15475 UBR1-201ENST00000290650 7761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
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SIX1Q15475 LINC02389-201ENST00000535058 3546 ntTSL 2 BASIC4.8□□□□□ -1.64
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SIX1Q15475 DLG1-216ENST00000450955 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.79□□□□□ -1.64
SIX1Q15475 ERBIN-208ENST00000506030 4386 ntTSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
SIX1Q15475 BCLAF1-207ENST00000527759 4373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
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SIX1Q15475 DCN-201ENST00000052754 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
SIX1Q15475 PLS3-209ENST00000539310 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
SIX1Q15475 PHF11-215ENST00000488958 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
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SIX1Q15475 WDR7-201ENST00000254442 14083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
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SIX1Q15475 RNA5SP123-201ENST00000363244 119 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
SIX1Q15475 ZC3H7A-202ENST00000396516 3845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
SIX1Q15475 MIR937-201ENST00000401271 86 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
SIX1Q15475 AL607077.1-201ENST00000401718 499 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
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SIX1Q15475 RPL36AP41-201ENST00000493820 306 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
SIX1Q15475 AC010425.1-201ENST00000511734 554 ntTSL 4 BASIC4.79□□□□□ -1.64
SIX1Q15475 AC109830.1-202ENST00000515491 860 ntTSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
SIX1Q15475 AC090151.1-201ENST00000520784 730 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
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SIX1Q15475 MTND2P17-201ENST00000550281 688 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
SIX1Q15475 AP000873.2-201ENST00000602381 406 ntTSL 2 BASIC4.79□□□□□ -1.64
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SIX1Q15475 KATNBL1P1-201ENST00000605192 748 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
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SIX1Q15475 EIF3FP1-201ENST00000613970 806 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
SIX1Q15475 AC003001.2-201ENST00000616294 831 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
SIX1Q15475 AC068870.2-201ENST00000620635 389 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
SIX1Q15475 IRF5P1-201ENST00000504852 2164 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
SIX1Q15475 XIRP2-203ENST00000409195 12675 ntTSL 5 BASIC4.79□□□□□ -1.64
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