Protein–RNA interactions for Protein: Q15437

SEC23B, Protein transport protein Sec23B, humanhuman

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Length 767 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC23BQ15437 AC010325.1-202ENST00000562076 279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
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SEC23BQ15437 ATP5F1P7-201ENST00000567330 760 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
SEC23BQ15437 AC009852.2-201ENST00000567898 485 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
SEC23BQ15437 AC074050.3-201ENST00000569175 441 ntTSL 4 BASIC5.16□□□□□ -1.58
SEC23BQ15437 CASC22-201ENST00000569713 386 ntTSL 5 BASIC5.16□□□□□ -1.58
SEC23BQ15437 AP001011.1-201ENST00000583546 690 ntTSL 3 BASIC5.16□□□□□ -1.58
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SEC23BQ15437 PIK3C3-207ENST00000587402 452 ntTSL 3 BASIC5.16□□□□□ -1.58
SEC23BQ15437 AC090236.2-201ENST00000587933 1101 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
SEC23BQ15437 APOC2-205ENST00000592257 444 ntTSL 3 BASIC5.16□□□□□ -1.58
SEC23BQ15437 AC125494.3-201ENST00000602759 455 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
SEC23BQ15437 AC009237.13-201ENST00000603193 276 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
SEC23BQ15437 AC108865.2-201ENST00000606881 432 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
SEC23BQ15437 AL589740.1-208ENST00000606913 812 ntTSL 5 BASIC5.16□□□□□ -1.58
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SEC23BQ15437 STMN1P1-201ENST00000617809 440 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
SEC23BQ15437 AC010975.3-201ENST00000618727 978 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
SEC23BQ15437 TATDN1-221ENST00000630259 915 ntTSL 5 BASIC5.16□□□□□ -1.58
SEC23BQ15437 AC013470.2-206ENST00000636804 771 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.16□□□□□ -1.58
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SEC23BQ15437 SEC63P2-201ENST00000503863 1939 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
SEC23BQ15437 AC022893.1-201ENST00000517664 3549 ntTSL 2 BASIC5.16□□□□□ -1.58
SEC23BQ15437 LINC00102-201ENST00000445785 1340 ntTSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
SEC23BQ15437 LINC02070-201ENST00000460586 1321 ntTSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
SEC23BQ15437 PTPRD-205ENST00000397611 8242 ntTSL 5 BASIC5.16□□□□□ -1.58
SEC23BQ15437 KBTBD8-201ENST00000417314 4680 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.16□□□□□ -1.58
SEC23BQ15437 SNRPB2-202ENST00000377943 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
SEC23BQ15437 CDK14-203ENST00000406263 5163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
SEC23BQ15437 AC021086.1-201ENST00000499025 1569 ntTSL 3 BASIC5.16□□□□□ -1.58
SEC23BQ15437 STX3-208ENST00000641815 3236 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
SEC23BQ15437 OR5AN1-203ENST00000641998 7647 ntAPPRIS P1 BASIC5.16□□□□□ -1.58
SEC23BQ15437 SLITRK4-202ENST00000356928 3074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.15□□□□□ -1.58
SEC23BQ15437 OR10G4-203ENST00000641722 3301 ntAPPRIS P1 BASIC5.15□□□□□ -1.58
SEC23BQ15437 FCRL2-203ENST00000368181 1669 ntTSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.58
SEC23BQ15437 RALYL-211ENST00000523850 1684 ntTSL 2 BASIC5.15□□□□□ -1.58
SEC23BQ15437 ITGB1-201ENST00000302278 3640 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.58
SEC23BQ15437 AC092376.2-201ENST00000622621 4116 ntBASIC5.15□□□□□ -1.58
SEC23BQ15437 NBPF10-201ENST00000583866 13042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.15□□□□□ -1.58
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SEC23BQ15437 LINC02563-201ENST00000579474 277 ntTSL 3 BASIC5.15□□□□□ -1.59
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SEC23BQ15437 MIR6793-201ENST00000612376 63 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
SEC23BQ15437 Metazoa_SRP.70-201ENST00000612622 273 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
SEC23BQ15437 AC245014.3-201ENST00000618589 347 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
SEC23BQ15437 GPR34-203ENST00000620846 1282 ntTSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.59
SEC23BQ15437 AC024595.1-201ENST00000623088 387 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
SEC23BQ15437 SATB1-AS1-266ENST00000630271 813 ntTSL 5 BASIC5.15□□□□□ -1.59
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