Protein–RNA interactions for Protein: Q15035

TRAM2, Translocating chain-associated membrane protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 370 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAM2Q15035 AL355860.1-201ENST00000636087 1229 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.4□□□□□ -1.71
TRAM2Q15035 RWDD2B-207ENST00000493196 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.4□□□□□ -1.71
TRAM2Q15035 MTRNR2L7-201ENST00000544824 1535 ntAPPRIS P1 BASIC4.4□□□□□ -1.71
TRAM2Q15035 AJ009632.2-202ENST00000634644 1513 ntTSL 5 BASIC4.4□□□□□ -1.71
TRAM2Q15035 FAM133A-202ENST00000332647 3159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.4□□□□□ -1.71
TRAM2Q15035 DNTTIP2-202ENST00000436063 5897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.4□□□□□ -1.71
TRAM2Q15035 ZNF486-201ENST00000335117 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.4□□□□□ -1.71
TRAM2Q15035 STON1-GTF2A1L-204ENST00000405008 3821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.4□□□□□ -1.71
TRAM2Q15035 CLVS1-205ENST00000519846 3622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.4□□□□□ -1.71
TRAM2Q15035 DNAH8-205ENST00000449981 12940 ntTSL 5 BASIC4.4□□□□□ -1.71
TRAM2Q15035 ADGRG4-201ENST00000370652 9820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.4□□□□□ -1.71
TRAM2Q15035 RANBP6-201ENST00000259569 4576 ntAPPRIS P1 BASIC4.39□□□□□ -1.71
TRAM2Q15035 ELAVL4-203ENST00000371821 3349 ntTSL 5 BASIC4.39□□□□□ -1.71
TRAM2Q15035 MTHFD2L-207ENST00000433372 1407 ntTSL 1 (best) BASIC4.39□□□□□ -1.71
TRAM2Q15035 USP29-202ENST00000598197 3284 ntAPPRIS P1 BASIC4.39□□□□□ -1.71
TRAM2Q15035 AL136164.3-201ENST00000624429 3978 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
TRAM2Q15035 TAS2R8-201ENST00000240615 1243 ntAPPRIS P1 BASIC4.39□□□□□ -1.71
TRAM2Q15035 RNASE2-201ENST00000304625 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.39□□□□□ -1.71
TRAM2Q15035 PLET1-201ENST00000338832 1215 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.39□□□□□ -1.71
TRAM2Q15035 NCSTNP1-201ENST00000406229 144 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
TRAM2Q15035 AF015720.1-201ENST00000412240 349 ntTSL 3 BASIC4.39□□□□□ -1.71
TRAM2Q15035 GTF2IP5-201ENST00000414608 731 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
TRAM2Q15035 AC012506.4-201ENST00000421563 541 ntTSL 4 BASIC4.39□□□□□ -1.71
TRAM2Q15035 AL031599.1-201ENST00000432694 808 ntTSL 3 BASIC4.39□□□□□ -1.71
TRAM2Q15035 RHOT1P3-201ENST00000436571 331 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
TRAM2Q15035 PTMAP3-201ENST00000447474 330 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
TRAM2Q15035 COPS8P2-201ENST00000473228 627 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
TRAM2Q15035 AC105918.1-201ENST00000474399 838 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
TRAM2Q15035 AC079841.1-201ENST00000481228 950 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
TRAM2Q15035 SSBP1-211ENST00000484178 676 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.39□□□□□ -1.71
TRAM2Q15035 AC010395.1-201ENST00000507627 697 ntTSL 5 BASIC4.39□□□□□ -1.71
TRAM2Q15035 AL049544.1-201ENST00000511849 673 ntTSL 3 BASIC4.39□□□□□ -1.71
TRAM2Q15035 CCNHP1-201ENST00000513311 678 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
TRAM2Q15035 AC022832.1-201ENST00000530718 645 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
TRAM2Q15035 AC130404.1-201ENST00000539362 739 ntTSL 2 BASIC4.39□□□□□ -1.71
TRAM2Q15035 AC095350.2-201ENST00000544034 201 ntTSL 5 BASIC4.39□□□□□ -1.71
TRAM2Q15035 AC034102.2-201ENST00000548861 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.39□□□□□ -1.71
TRAM2Q15035 C16orf52-205ENST00000567004 951 ntTSL 1 (best) BASIC4.39□□□□□ -1.71
TRAM2Q15035 AC009139.2-201ENST00000569032 566 ntTSL 5 BASIC4.39□□□□□ -1.71
TRAM2Q15035 AC007599.2-201ENST00000573040 493 ntTSL 5 BASIC4.39□□□□□ -1.71
TRAM2Q15035 MEMO1P5-201ENST00000604810 406 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
TRAM2Q15035 AP000864.1-201ENST00000609424 650 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
TRAM2Q15035 NF1P10-201ENST00000613227 742 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
TRAM2Q15035 AC015908.5-201ENST00000623289 343 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
TRAM2Q15035 AC011815.3-201ENST00000624194 473 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
TRAM2Q15035 OR8A1-204ENST00000642111 1145 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
TRAM2Q15035 MAPK10-353ENST00000641803 8483 ntAPPRIS P2 BASIC4.39□□□□□ -1.71
TRAM2Q15035 UBA6-AS1-203ENST00000500538 3352 ntTSL 1 (best) BASIC4.39□□□□□ -1.71
TRAM2Q15035 ZNF573-217ENST00000590414 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.39□□□□□ -1.71
TRAM2Q15035 AC018529.3-201ENST00000624212 2254 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
TRAM2Q15035 MYCT1-201ENST00000367245 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.39□□□□□ -1.71
TRAM2Q15035 PABPC1P6-201ENST00000445594 1829 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
TRAM2Q15035 CDH18-210ENST00000511273 2318 ntTSL 5 BASIC4.39□□□□□ -1.71
TRAM2Q15035 LUZP2-207ENST00000533227 5016 ntTSL 1 (best) BASIC4.39□□□□□ -1.71
TRAM2Q15035 ADGRL2-203ENST00000370713 5382 ntTSL 1 (best) BASIC4.39□□□□□ -1.71
TRAM2Q15035 AC079062.1-203ENST00000581862 3610 ntTSL 1 (best) BASIC4.39□□□□□ -1.71
TRAM2Q15035 AKAP11-201ENST00000025301 9920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.39□□□□□ -1.71
TRAM2Q15035 HIPK3-204ENST00000525975 3668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.39□□□□□ -1.71
TRAM2Q15035 SCN1A-202ENST00000375405 8097 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.38□□□□□ -1.71
TRAM2Q15035 HHLA2-210ENST00000491820 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.38□□□□□ -1.71
TRAM2Q15035 AC099654.2-201ENST00000433031 1980 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
TRAM2Q15035 DDX18P4-201ENST00000511690 1966 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
TRAM2Q15035 SLC9B1-202ENST00000394789 1735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.38□□□□□ -1.71
TRAM2Q15035 CLCA1-201ENST00000234701 3310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.38□□□□□ -1.71
TRAM2Q15035 R3HDM1-203ENST00000409606 3673 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC4.38□□□□□ -1.71
TRAM2Q15035 ALS2CR12-201ENST00000286190 1769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.38□□□□□ -1.71
TRAM2Q15035 MAPK10-208ENST00000395169 4049 ntTSL 1 (best) BASIC4.38□□□□□ -1.71
TRAM2Q15035 OR4C11-201ENST00000302231 1045 ntAPPRIS P1 BASIC4.38□□□□□ -1.71
TRAM2Q15035 S100A9-201ENST00000368738 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.38□□□□□ -1.71
TRAM2Q15035 RNA5SP105-201ENST00000391123 113 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
TRAM2Q15035 ARL4AP5-201ENST00000404372 599 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
TRAM2Q15035 AP002530.1-201ENST00000405705 684 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
TRAM2Q15035 SYCE3-202ENST00000406915 448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.38□□□□□ -1.71
TRAM2Q15035 AP000534.2-201ENST00000412729 568 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
TRAM2Q15035 SRGAP3-AS1-201ENST00000414633 428 ntTSL 2 BASIC4.38□□□□□ -1.71
TRAM2Q15035 AC093158.1-201ENST00000415549 791 ntTSL 3 BASIC4.38□□□□□ -1.71
TRAM2Q15035 AC087380.1-202ENST00000415970 1163 ntTSL 2 BASIC4.38□□□□□ -1.71
TRAM2Q15035 LINC00993-201ENST00000420453 540 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
TRAM2Q15035 RPS12P5-201ENST00000423449 371 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
TRAM2Q15035 AL445644.1-201ENST00000436524 751 ntTSL 2 BASIC4.38□□□□□ -1.71
TRAM2Q15035 AC099063.2-201ENST00000446360 662 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
TRAM2Q15035 AURKAPS1-201ENST00000451805 1212 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
TRAM2Q15035 AC090114.3-201ENST00000479267 829 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
TRAM2Q15035 RPL23AP37-201ENST00000479658 549 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
TRAM2Q15035 AC104971.1-201ENST00000495117 578 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
TRAM2Q15035 RPS4XP18-201ENST00000495480 763 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
TRAM2Q15035 AP000926.3-201ENST00000497201 299 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
TRAM2Q15035 ATP5LP3-201ENST00000514223 304 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
TRAM2Q15035 RNA5SP392-201ENST00000516905 112 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
TRAM2Q15035 AC025857.1-201ENST00000525252 377 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
TRAM2Q15035 AC093249.4-201ENST00000564755 259 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
TRAM2Q15035 AJ003147.1-201ENST00000576762 454 ntTSL 3 BASIC4.38□□□□□ -1.71
TRAM2Q15035 AP005901.4-201ENST00000577336 569 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
TRAM2Q15035 AC005702.2-201ENST00000591035 481 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.38□□□□□ -1.71
TRAM2Q15035 ZNF682-204ENST00000593468 581 ntTSL 4 BASIC4.38□□□□□ -1.71
TRAM2Q15035 AC130352.1-201ENST00000602979 661 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
TRAM2Q15035 AC093799.2-201ENST00000610062 578 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
TRAM2Q15035 RDM1-215ENST00000612980 501 ntTSL 1 (best) BASIC4.38□□□□□ -1.71
TRAM2Q15035 AC009704.2-201ENST00000618739 483 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
TRAM2Q15035 CR381572.2-201ENST00000624852 397 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 98.1 ms