Protein–RNA interactions for Protein: Q14964

RAB39A, Ras-related protein Rab-39A, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB39AQ14964 AC100802.1-201ENST00000519197 1026 ntTSL 3 BASIC5.44□□□□□ -1.54
RAB39AQ14964 AC020937.1-201ENST00000519677 1013 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
RAB39AQ14964 AC011632.2-201ENST00000520696 738 ntTSL 3 BASIC5.44□□□□□ -1.54
RAB39AQ14964 AC090739.1-201ENST00000522190 708 ntTSL 3 BASIC5.44□□□□□ -1.54
RAB39AQ14964 AC025871.2-201ENST00000522589 511 ntTSL 3 BASIC5.44□□□□□ -1.54
RAB39AQ14964 AC103855.3-201ENST00000528445 606 ntTSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
RAB39AQ14964 ATPAF1-210ENST00000532925 998 ntTSL 2 BASIC5.44□□□□□ -1.54
RAB39AQ14964 AC090424.1-201ENST00000535243 736 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
RAB39AQ14964 AP000593.3-201ENST00000546065 578 ntTSL 2 BASIC5.44□□□□□ -1.54
RAB39AQ14964 AC012038.2-201ENST00000553006 256 ntTSL 3 BASIC5.44□□□□□ -1.54
RAB39AQ14964 AL356804.1-201ENST00000553791 448 ntTSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
RAB39AQ14964 TSSK4-207ENST00000556621 896 ntTSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
RAB39AQ14964 AL132989.1-201ENST00000557322 576 ntTSL 3 BASIC5.44□□□□□ -1.54
RAB39AQ14964 HMGN2P47-201ENST00000559378 272 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
RAB39AQ14964 AC087473.1-201ENST00000561320 2471 ntTSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
RAB39AQ14964 AC090751.1-201ENST00000566966 267 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
RAB39AQ14964 AC135050.4-201ENST00000568708 504 ntTSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
RAB39AQ14964 AL163952.1-202ENST00000569625 600 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
RAB39AQ14964 AC007639.1-201ENST00000577281 833 ntTSL 3 BASIC5.44□□□□□ -1.54
RAB39AQ14964 MIR4433B-201ENST00000581329 102 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
RAB39AQ14964 AC090125.1-201ENST00000581541 493 ntTSL 3 BASIC5.44□□□□□ -1.54
RAB39AQ14964 AC090312.2-201ENST00000582687 378 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
RAB39AQ14964 AC090616.2-202ENST00000584248 222 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
RAB39AQ14964 KIAA0391-209ENST00000604948 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.44□□□□□ -1.54
RAB39AQ14964 MIR6780B-201ENST00000610307 79 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
RAB39AQ14964 Metazoa_SRP.35-201ENST00000611402 288 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
RAB39AQ14964 RN7SL261P-201ENST00000613441 282 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
RAB39AQ14964 Metazoa_SRP.38-201ENST00000615981 254 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
RAB39AQ14964 MIR6721-201ENST00000617181 87 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
RAB39AQ14964 AC073530.2-201ENST00000623987 261 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
RAB39AQ14964 ITGB1-201ENST00000302278 3640 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
RAB39AQ14964 SULT1E1-201ENST00000226444 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
RAB39AQ14964 ZNF112-202ENST00000354340 3654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
RAB39AQ14964 GBP3-202ENST00000370481 3067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
RAB39AQ14964 OR5B12-202ENST00000641921 1807 ntAPPRIS P1 BASIC5.44□□□□□ -1.54
RAB39AQ14964 AP001605.1-201ENST00000420186 2603 ntTSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
RAB39AQ14964 DPP8-203ENST00000341861 8699 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC5.44□□□□□ -1.54
RAB39AQ14964 SEPT7-205ENST00000432293 1362 ntTSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
RAB39AQ14964 AP000526.1-201ENST00000603308 1388 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
RAB39AQ14964 OR8J3-204ENST00000642058 3806 ntAPPRIS P1 BASIC5.43□□□□□ -1.54
RAB39AQ14964 THAP12P9-201ENST00000503971 2360 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
RAB39AQ14964 AC104024.1-201ENST00000428142 2201 ntTSL 2 BASIC5.43□□□□□ -1.54
RAB39AQ14964 LINC01619-207ENST00000551843 2205 ntTSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
RAB39AQ14964 SMG1-201ENST00000330588 1588 ntTSL 5 BASIC5.43□□□□□ -1.54
RAB39AQ14964 NRG3-208ENST00000556918 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
RAB39AQ14964 AC005703.1-201ENST00000431343 1773 ntTSL 2 BASIC5.43□□□□□ -1.54
RAB39AQ14964 CFHR1-201ENST00000320493 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
RAB39AQ14964 MOXD1-201ENST00000336749 2950 ntTSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
RAB39AQ14964 IL6STP1-201ENST00000346911 1020 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
RAB39AQ14964 LINC01967-201ENST00000356047 755 ntTSL 5 BASIC5.43□□□□□ -1.54
RAB39AQ14964 RNU1-49P-201ENST00000363468 159 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
RAB39AQ14964 PKIB-203ENST00000368446 556 ntTSL 2 BASIC5.43□□□□□ -1.54
RAB39AQ14964 SPRR2B-201ENST00000368755 617 ntAPPRIS P1 BASIC5.43□□□□□ -1.54
RAB39AQ14964 DEFB126-201ENST00000382398 655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
RAB39AQ14964 RPL11P3-201ENST00000395256 523 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
RAB39AQ14964 YWHAZP6-201ENST00000399764 738 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
RAB39AQ14964 OR7E156P-201ENST00000400303 464 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
RAB39AQ14964 AL139805.1-201ENST00000407837 289 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
RAB39AQ14964 RNA5SP431-201ENST00000410312 120 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
RAB39AQ14964 RNA5SP198-201ENST00000410376 127 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
RAB39AQ14964 RNA5SP80-201ENST00000410475 111 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
RAB39AQ14964 RN7SKP144-201ENST00000411108 279 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
RAB39AQ14964 SETP15-201ENST00000412724 337 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
RAB39AQ14964 AL596448.1-201ENST00000415024 392 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
RAB39AQ14964 AC078960.1-201ENST00000422160 177 ntTSL 5 BASIC5.43□□□□□ -1.54
RAB39AQ14964 AL354714.4-201ENST00000427339 575 ntTSL 3 BASIC5.43□□□□□ -1.54
RAB39AQ14964 CRIP1P1-201ENST00000427567 185 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
RAB39AQ14964 AC137630.2-202ENST00000429681 555 ntTSL 3 BASIC5.43□□□□□ -1.54
RAB39AQ14964 AC108479.1-201ENST00000431142 427 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
RAB39AQ14964 SEPT7P5-201ENST00000434048 306 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
RAB39AQ14964 GAPDHP59-201ENST00000435908 267 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
RAB39AQ14964 TXNP5-201ENST00000441043 315 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
RAB39AQ14964 AC092809.1-201ENST00000441469 474 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
RAB39AQ14964 TIMM8BP2-201ENST00000445940 251 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
RAB39AQ14964 HIGD1AP16-201ENST00000450986 258 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
RAB39AQ14964 RPS27AP8-201ENST00000452665 445 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
RAB39AQ14964 AL122008.1-201ENST00000456078 452 ntTSL 3 BASIC5.43□□□□□ -1.54
RAB39AQ14964 TPTE2P5-203ENST00000458118 728 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
RAB39AQ14964 RPL31P3-201ENST00000458430 332 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
RAB39AQ14964 TRAPPC2-204ENST00000458511 678 ntTSL 5 BASIC5.43□□□□□ -1.54
RAB39AQ14964 AC117394.1-201ENST00000477323 567 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
RAB39AQ14964 RN7SL741P-201ENST00000482473 289 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
RAB39AQ14964 RPL12P30-201ENST00000488389 499 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
RAB39AQ14964 RN7SL362P-201ENST00000494228 267 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
RAB39AQ14964 EIF3LP3-201ENST00000495197 822 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
RAB39AQ14964 LINC02462-201ENST00000503009 430 ntTSL 5 BASIC5.43□□□□□ -1.54
RAB39AQ14964 WBP1LP4-201ENST00000505043 344 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
RAB39AQ14964 AC079921.1-201ENST00000509449 946 ntTSL 3 BASIC5.43□□□□□ -1.54
RAB39AQ14964 APOBEC3AP1-201ENST00000511396 287 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
RAB39AQ14964 Y_RNA.710-201ENST00000516975 110 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
RAB39AQ14964 ASB8-202ENST00000535055 657 ntTSL 2 BASIC5.43□□□□□ -1.54
RAB39AQ14964 AP001858.2-201ENST00000536213 601 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
RAB39AQ14964 AC117377.1-201ENST00000547633 1038 ntTSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
RAB39AQ14964 AC123567.2-202ENST00000550759 446 ntTSL 3 BASIC5.43□□□□□ -1.54
RAB39AQ14964 AC079907.1-201ENST00000552707 374 ntTSL 3 BASIC5.43□□□□□ -1.54
RAB39AQ14964 AC012050.1-201ENST00000558185 472 ntTSL 3 BASIC5.43□□□□□ -1.54
RAB39AQ14964 NDUFAF4P1-201ENST00000559425 519 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
RAB39AQ14964 AC022523.1-201ENST00000560360 364 ntTSL 5 BASIC5.43□□□□□ -1.54
RAB39AQ14964 AC009139.2-201ENST00000569032 566 ntTSL 5 BASIC5.43□□□□□ -1.54
RAB39AQ14964 AC005951.1-201ENST00000576706 485 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 152.3 ms