Protein–RNA interactions for Protein: Q13232

NME3, Nucleoside diphosphate kinase 3, humanhuman

Predictions only

Length 169 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME3Q13232 AC026434.1-201ENST00000511474 454 ntTSL 3 BASIC4.99□□□□□ -1.61
NME3Q13232 OR7H2P-201ENST00000513483 306 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
NME3Q13232 SEC11B-201ENST00000518383 499 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
NME3Q13232 AC090809.1-201ENST00000524132 570 ntTSL 4 BASIC4.99□□□□□ -1.61
NME3Q13232 DDHD2-219ENST00000529845 945 ntTSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
NME3Q13232 OR5D15P-201ENST00000531671 942 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
NME3Q13232 AP001775.2-201ENST00000531710 334 ntTSL 2 BASIC4.99□□□□□ -1.61
NME3Q13232 AC125612.1-201ENST00000547580 377 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
NME3Q13232 AL132712.2-201ENST00000556653 127 ntTSL 3 BASIC4.99□□□□□ -1.61
NME3Q13232 AC009268.1-201ENST00000561352 1203 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
NME3Q13232 RN7SL802P-201ENST00000577858 299 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
NME3Q13232 MIR5699-201ENST00000578903 90 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
NME3Q13232 AP000919.3-201ENST00000582591 568 ntTSL 3 BASIC4.99□□□□□ -1.61
NME3Q13232 AC007448.2-201ENST00000583452 380 ntTSL 3 BASIC4.99□□□□□ -1.61
NME3Q13232 AC079791.1-201ENST00000605356 973 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
NME3Q13232 AC010894.2-203ENST00000606406 499 ntTSL 3 BASIC4.99□□□□□ -1.61
NME3Q13232 AC015914.2-201ENST00000618167 288 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
NME3Q13232 AC091953.3-201ENST00000623220 236 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
NME3Q13232 AP001784.1-201ENST00000624107 428 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
NME3Q13232 OR51F2-202ENST00000641672 1136 ntAPPRIS P2 BASIC4.99□□□□□ -1.61
NME3Q13232 RANBP3L-201ENST00000296604 3104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
NME3Q13232 UGT2B17-201ENST00000317746 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
NME3Q13232 SLC9B1-202ENST00000394789 1735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
NME3Q13232 MAPK10-349ENST00000641767 3661 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
NME3Q13232 RPS6KA5-207ENST00000614987 26795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
NME3Q13232 CROT-204ENST00000442291 1993 ntTSL 5 BASIC4.98□□□□□ -1.61
NME3Q13232 ZNF285-205ENST00000614994 6012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
NME3Q13232 CEP192-203ENST00000506447 7960 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.98□□□□□ -1.61
NME3Q13232 DCLRE1A-201ENST00000361384 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
NME3Q13232 ALB-201ENST00000295897 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
NME3Q13232 AC087565.3-202ENST00000642085 1603 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
NME3Q13232 LINC01689-201ENST00000416218 2007 ntTSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
NME3Q13232 RNASE6-201ENST00000304677 1061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
NME3Q13232 DSCR8-201ENST00000357704 552 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC4.98□□□□□ -1.61
NME3Q13232 C1orf194-204ENST00000369949 731 ntTSL 2 BASIC4.98□□□□□ -1.61
NME3Q13232 DSCR8-202ENST00000400477 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
NME3Q13232 GLS-204ENST00000409428 816 ntTSL 2 BASIC4.98□□□□□ -1.61
NME3Q13232 GNG12-AS1-202ENST00000414904 796 ntTSL 3 BASIC4.98□□□□□ -1.61
NME3Q13232 AJ239321.1-201ENST00000424255 564 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
NME3Q13232 AL360081.1-201ENST00000428299 555 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
NME3Q13232 LINC02476-202ENST00000431071 559 ntTSL 4 BASIC4.98□□□□□ -1.61
NME3Q13232 AC004938.1-201ENST00000438468 308 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
NME3Q13232 AP000770.1-201ENST00000444123 583 ntTSL 5 BASIC4.98□□□□□ -1.61
NME3Q13232 RPS5P7-201ENST00000456664 608 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
NME3Q13232 AL358176.1-201ENST00000457477 357 ntTSL 5 BASIC4.98□□□□□ -1.61
NME3Q13232 ZIC4-AS1-201ENST00000462168 268 ntTSL 5 BASIC4.98□□□□□ -1.61
NME3Q13232 AC092324.1-201ENST00000468671 324 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
NME3Q13232 PLSCR5-203ENST00000492200 1058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.98□□□□□ -1.61
NME3Q13232 AC104971.1-201ENST00000495117 578 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
NME3Q13232 AC105233.1-201ENST00000498840 781 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
NME3Q13232 TIFA-202ENST00000500655 769 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.98□□□□□ -1.61
NME3Q13232 AC073358.1-201ENST00000505671 684 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
NME3Q13232 AC010226.1-203ENST00000515570 765 ntTSL 2 BASIC4.98□□□□□ -1.61
NME3Q13232 RNU6-319P-201ENST00000516025 108 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
NME3Q13232 RN7SKP276-201ENST00000516242 268 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
NME3Q13232 AP002444.1-201ENST00000534252 620 ntTSL 3 BASIC4.98□□□□□ -1.61
NME3Q13232 AC134312.3-201ENST00000566155 213 ntTSL 2 BASIC4.98□□□□□ -1.61
NME3Q13232 AC002091.1-201ENST00000578788 557 ntTSL 2 BASIC4.98□□□□□ -1.61
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NME3Q13232 MIR4443-201ENST00000585052 53 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
NME3Q13232 AC020915.5-201ENST00000596836 964 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
NME3Q13232 AL512782.1-201ENST00000603093 364 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
NME3Q13232 AL049539.1-201ENST00000611964 459 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
NME3Q13232 LINC02109-206ENST00000629527 854 ntTSL 5 BASIC4.98□□□□□ -1.61
NME3Q13232 AC006148.1-201ENST00000484322 4310 ntTSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
NME3Q13232 LINC01520-201ENST00000441457 1487 ntTSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
NME3Q13232 AC092821.1-204ENST00000518709 3552 ntTSL 5 BASIC4.98□□□□□ -1.61
NME3Q13232 OTC-201ENST00000039007 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
NME3Q13232 NECAB1-202ENST00000521366 2908 ntTSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
NME3Q13232 KIF3A-203ENST00000403231 2181 ntTSL 2 BASIC4.98□□□□□ -1.61
NME3Q13232 ITGB1-205ENST00000423113 3729 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.98□□□□□ -1.61
NME3Q13232 NXT2-201ENST00000218004 2692 ntTSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
NME3Q13232 GCSAML-206ENST00000527084 1308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
NME3Q13232 ATP13A4-203ENST00000392443 4016 ntTSL 5 BASIC4.97□□□□□ -1.61
NME3Q13232 MYO9A-209ENST00000564571 8111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
NME3Q13232 PTPN13-209ENST00000511467 8076 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC4.97□□□□□ -1.61
NME3Q13232 PCDH11X-207ENST00000406881 4156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
NME3Q13232 BRIP1-202ENST00000577598 3969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.97□□□□□ -1.61
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NME3Q13232 ARHGEF12-202ENST00000397843 9660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
NME3Q13232 PUS7L-203ENST00000431332 1873 ntTSL 2 BASIC4.97□□□□□ -1.61
NME3Q13232 AL442639.1-201ENST00000625030 1899 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
NME3Q13232 OR4N5-201ENST00000333629 927 ntAPPRIS P1 BASIC4.97□□□□□ -1.61
NME3Q13232 RPL10P10-201ENST00000403509 664 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
NME3Q13232 RNU2-22P-201ENST00000411266 212 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
NME3Q13232 TMBIM7P-201ENST00000418074 855 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
NME3Q13232 AC013470.3-201ENST00000420252 1194 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
NME3Q13232 AL645608.4-201ENST00000423619 154 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
NME3Q13232 EIF4HP2-201ENST00000424380 563 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
NME3Q13232 OR2AH1P-201ENST00000425717 928 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
NME3Q13232 NRBF2P3-201ENST00000432731 865 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
NME3Q13232 FTLP19-201ENST00000433300 394 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
NME3Q13232 AL772161.1-201ENST00000439130 476 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
NME3Q13232 AL137005.1-201ENST00000452944 719 ntTSL 5 BASIC4.97□□□□□ -1.61
NME3Q13232 SOX2-OT-216ENST00000497122 578 ntTSL 4 BASIC4.97□□□□□ -1.61
NME3Q13232 AL136537.1-202ENST00000501725 430 ntTSL 3 BASIC4.97□□□□□ -1.61
NME3Q13232 ATXN3-206ENST00000502250 1259 ntTSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
NME3Q13232 HMGB3P16-201ENST00000508037 287 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
NME3Q13232 AC083923.2-203ENST00000520512 372 ntTSL 3 BASIC4.97□□□□□ -1.61
NME3Q13232 AC044810.3-201ENST00000527565 589 ntTSL 3 BASIC4.97□□□□□ -1.61
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