Protein–RNA interactions for Protein: Q13077

TRAF1, TNF receptor-associated factor 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF1Q13077 OR8J3-204ENST00000642058 3806 ntAPPRIS P1 BASIC5.72□□□□□ -1.49
TRAF1Q13077 ECT2L-201ENST00000367682 4343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
TRAF1Q13077 CLEC12A-205ENST00000434319 1515 ntTSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
TRAF1Q13077 RAP1GDS1-206ENST00000453712 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
TRAF1Q13077 RIF1-203ENST00000428287 7722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
TRAF1Q13077 FTX-210ENST00000603037 8347 ntTSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
TRAF1Q13077 CFI-202ENST00000394635 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.71□□□□□ -1.49
TRAF1Q13077 LIMA1-203ENST00000547825 3920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.49
TRAF1Q13077 LINC01933-204ENST00000524295 3591 ntTSL 2 BASIC5.71□□□□□ -1.49
TRAF1Q13077 DNAAF4-CCPG1-201ENST00000565113 4589 ntTSL 2 BASIC5.71□□□□□ -1.49
TRAF1Q13077 MYBPC1-202ENST00000361685 3871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
TRAF1Q13077 SCN11A-203ENST00000456224 5262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.71□□□□□ -1.5
TRAF1Q13077 AP001002.1-201ENST00000625148 1513 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
TRAF1Q13077 GNAS-202ENST00000306090 477 ntTSL 5 BASIC5.71□□□□□ -1.5
TRAF1Q13077 AC017079.1-201ENST00000333650 415 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
TRAF1Q13077 RN7SKP103-201ENST00000363848 320 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
TRAF1Q13077 LRRC37BP1-201ENST00000398851 714 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
TRAF1Q13077 PIGP-204ENST00000399102 688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
TRAF1Q13077 AHSA2-203ENST00000410073 479 ntTSL 5 BASIC5.71□□□□□ -1.5
TRAF1Q13077 LINC01359-201ENST00000415842 1157 ntTSL 2 BASIC5.71□□□□□ -1.5
TRAF1Q13077 AC092159.1-201ENST00000433724 493 ntTSL 2 BASIC5.71□□□□□ -1.5
TRAF1Q13077 PA2G4P6-201ENST00000438325 1197 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
TRAF1Q13077 AL450263.2-201ENST00000439400 589 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
TRAF1Q13077 AL137005.1-201ENST00000452944 719 ntTSL 5 BASIC5.71□□□□□ -1.5
TRAF1Q13077 RPS3AP53-201ENST00000454716 778 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
TRAF1Q13077 AC018742.1-202ENST00000457901 504 ntTSL 3 BASIC5.71□□□□□ -1.5
TRAF1Q13077 RNA5SP103-201ENST00000459503 118 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
TRAF1Q13077 AC116562.1-201ENST00000485355 781 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
TRAF1Q13077 AC073073.1-201ENST00000493920 463 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
TRAF1Q13077 HOMER1-204ENST00000508576 815 ntTSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
TRAF1Q13077 AC025768.1-201ENST00000510057 267 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
TRAF1Q13077 RNU6-760P-201ENST00000516078 97 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
TRAF1Q13077 AC069113.2-201ENST00000517735 359 ntTSL 3 BASIC5.71□□□□□ -1.5
TRAF1Q13077 AC012613.1-201ENST00000522685 387 ntTSL 2 BASIC5.71□□□□□ -1.5
TRAF1Q13077 EIF4A2P5-201ENST00000529914 499 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
TRAF1Q13077 AP000753.2-201ENST00000540307 423 ntTSL 3 BASIC5.71□□□□□ -1.5
TRAF1Q13077 AC090680.2-201ENST00000550279 742 ntTSL 3 BASIC5.71□□□□□ -1.5
TRAF1Q13077 LINC02313-201ENST00000553330 550 ntTSL 2 BASIC5.71□□□□□ -1.5
TRAF1Q13077 AC020661.4-201ENST00000561388 500 ntTSL 3 BASIC5.71□□□□□ -1.5
TRAF1Q13077 AC116553.2-201ENST00000564203 463 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
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TRAF1Q13077 LINC02335-201ENST00000616578 659 ntTSL 3 BASIC5.71□□□□□ -1.5
TRAF1Q13077 AC010872.1-201ENST00000624225 675 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
TRAF1Q13077 AC002384.2-201ENST00000636036 790 ntTSL 3 BASIC5.71□□□□□ -1.5
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TRAF1Q13077 CLSPN-206ENST00000520551 4010 ntTSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
TRAF1Q13077 APAF1-209ENST00000550527 6581 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
TRAF1Q13077 POF1B-201ENST00000262753 3941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
TRAF1Q13077 AL583808.2-201ENST00000418078 1382 ntTSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
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TRAF1Q13077 LINC01361-202ENST00000452834 1526 ntTSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
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TRAF1Q13077 AC109462.4-201ENST00000637882 581 ntTSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
TRAF1Q13077 SMG1P4-204ENST00000523028 4131 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
TRAF1Q13077 AMY2B-201ENST00000361355 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
TRAF1Q13077 PIGN-242ENST00000640145 4505 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
TRAF1Q13077 MTND4P9-201ENST00000507819 1346 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
TRAF1Q13077 CLVS1-205ENST00000519846 3622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
TRAF1Q13077 CASC1-204ENST00000395990 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
TRAF1Q13077 SCN3A-202ENST00000360093 9123 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
TRAF1Q13077 SPOCK3-225ENST00000535728 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
TRAF1Q13077 PROM1-220ENST00000540805 3908 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
TRAF1Q13077 C10orf120-201ENST00000329446 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
TRAF1Q13077 RNU6-386P-201ENST00000362650 107 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
TRAF1Q13077 RNA5SP87-201ENST00000384155 118 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
TRAF1Q13077 BMS1P17-201ENST00000413661 723 ntTSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
TRAF1Q13077 GTF2IP5-201ENST00000414608 731 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
TRAF1Q13077 GNG12-AS1-202ENST00000414904 796 ntTSL 3 BASIC5.69□□□□□ -1.5
TRAF1Q13077 AL136368.1-201ENST00000416249 401 ntTSL 2 BASIC5.69□□□□□ -1.5
TRAF1Q13077 AC004415.1-201ENST00000422697 449 ntTSL 3 BASIC5.69□□□□□ -1.5
TRAF1Q13077 MTND4LP14-201ENST00000429447 288 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
TRAF1Q13077 TMX2P1-201ENST00000436507 708 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
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