Protein–RNA interactions for Protein: Q12980

NPRL3, GATOR complex protein NPRL3, humanhuman

Predictions only

Length 569 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPRL3Q12980 LINC00603-201ENST00000507027 733 ntTSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
NPRL3Q12980 RPL37-204ENST00000508493 553 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
NPRL3Q12980 AC097103.2-204ENST00000510068 569 ntTSL 3 BASIC4.75□□□□□ -1.65
NPRL3Q12980 LINC00992-202ENST00000514186 564 ntTSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
NPRL3Q12980 ATP5LP3-201ENST00000514223 304 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
NPRL3Q12980 RPL23AP53-201ENST00000521854 457 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
NPRL3Q12980 AC068672.3-201ENST00000524017 824 ntTSL 3 BASIC4.75□□□□□ -1.65
NPRL3Q12980 AP002340.1-201ENST00000529298 285 ntTSL 3 BASIC4.75□□□□□ -1.65
NPRL3Q12980 LINC02366-202ENST00000541949 696 ntTSL 3 BASIC4.75□□□□□ -1.65
NPRL3Q12980 AL512310.9-201ENST00000553311 948 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
NPRL3Q12980 AL049875.1-202ENST00000556620 857 ntTSL 3 BASIC4.75□□□□□ -1.65
NPRL3Q12980 AF107885.2-202ENST00000557653 448 ntTSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
NPRL3Q12980 LINC01243-201ENST00000562065 721 ntTSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
NPRL3Q12980 AC079414.1-201ENST00000563114 488 ntTSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
NPRL3Q12980 AC018557.2-201ENST00000565082 536 ntTSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
NPRL3Q12980 RN7SL753P-201ENST00000581238 290 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
NPRL3Q12980 UBL5-207ENST00000590068 390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
NPRL3Q12980 AC073137.1-201ENST00000605636 634 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
NPRL3Q12980 AP000864.1-201ENST00000609424 650 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
NPRL3Q12980 AC007204.2-201ENST00000615022 616 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
NPRL3Q12980 MIR6826-201ENST00000617808 98 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
NPRL3Q12980 KLRF1-208ENST00000617889 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
NPRL3Q12980 AC009704.2-201ENST00000618739 483 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
NPRL3Q12980 SHMT1-211ENST00000618902 378 ntTSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
NPRL3Q12980 AL356490.1-201ENST00000623079 479 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
NPRL3Q12980 LINC01359-206ENST00000634775 888 ntTSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
NPRL3Q12980 ATF7IP-209ENST00000536444 8774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
NPRL3Q12980 CNTRL-205ENST00000373850 5824 ntTSL 2 BASIC4.75□□□□□ -1.65
NPRL3Q12980 HMMR-203ENST00000393915 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
NPRL3Q12980 MYNN-203ENST00000544106 4815 ntTSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
NPRL3Q12980 IRAK4-203ENST00000448290 1381 ntTSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
NPRL3Q12980 ZNF780B-202ENST00000434248 8665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
NPRL3Q12980 ZNF780B-207ENST00000617676 8664 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
NPRL3Q12980 AMY1C-201ENST00000370079 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
NPRL3Q12980 ZNF442-205ENST00000545749 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
NPRL3Q12980 OSBPL11-201ENST00000296220 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
NPRL3Q12980 CASC1-201ENST00000320267 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
NPRL3Q12980 CKAP2-207ENST00000490903 3395 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.74□□□□□ -1.65
NPRL3Q12980 BMPR2-201ENST00000374574 9683 ntTSL 2 BASIC4.74□□□□□ -1.65
NPRL3Q12980 LINC01020-202ENST00000508201 1800 ntTSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
NPRL3Q12980 PCDH15-214ENST00000395446 3948 ntTSL 5 BASIC4.74□□□□□ -1.65
NPRL3Q12980 GRIK2-204ENST00000369137 4272 ntTSL 5 BASIC4.74□□□□□ -1.65
NPRL3Q12980 MTFR1-203ENST00000458689 2500 ntTSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
NPRL3Q12980 FZD6-205ENST00000522566 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
NPRL3Q12980 OR10A5-201ENST00000299454 1054 ntAPPRIS P1 BASIC4.74□□□□□ -1.65
NPRL3Q12980 AL589826.1-201ENST00000340697 249 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
NPRL3Q12980 IGKV7-3-201ENST00000357453 298 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
NPRL3Q12980 DEC1-201ENST00000374016 1251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
NPRL3Q12980 C4orf47-201ENST00000378850 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
NPRL3Q12980 RN7SKP229-201ENST00000410465 302 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
NPRL3Q12980 PSMA3-202ENST00000412908 908 ntTSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
NPRL3Q12980 NPM1P4-201ENST00000414095 812 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
NPRL3Q12980 OR13Z1P-201ENST00000416141 834 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
NPRL3Q12980 AC073136.2-201ENST00000417282 849 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
NPRL3Q12980 AC096711.3-201ENST00000420721 582 ntTSL 4 BASIC4.74□□□□□ -1.65
NPRL3Q12980 AL133325.1-201ENST00000421090 382 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
NPRL3Q12980 AC012368.2-201ENST00000423539 560 ntTSL 3 BASIC4.74□□□□□ -1.65
NPRL3Q12980 FAM204CP-201ENST00000424489 642 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
NPRL3Q12980 AL358972.1-201ENST00000434356 466 ntTSL 2 BASIC4.74□□□□□ -1.65
NPRL3Q12980 CYCSP12-201ENST00000437729 300 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
NPRL3Q12980 AC008269.1-201ENST00000438070 646 ntTSL 3 BASIC4.74□□□□□ -1.65
NPRL3Q12980 MED6P1-201ENST00000439659 713 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
NPRL3Q12980 FOCAD-AS1-201ENST00000439876 359 ntTSL 2 BASIC4.74□□□□□ -1.65
NPRL3Q12980 AL162386.2-201ENST00000442428 457 ntTSL 3 BASIC4.74□□□□□ -1.65
NPRL3Q12980 AC034195.1-203ENST00000455703 728 ntTSL 2 BASIC4.74□□□□□ -1.65
NPRL3Q12980 CABYRP1-201ENST00000465493 1045 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
NPRL3Q12980 OR2AO1P-201ENST00000476497 403 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
NPRL3Q12980 AC138956.1-201ENST00000508187 504 ntTSL 3 BASIC4.74□□□□□ -1.65
NPRL3Q12980 AC020551.1-201ENST00000512036 539 ntTSL 3 BASIC4.74□□□□□ -1.65
NPRL3Q12980 RN7SKP46-201ENST00000515942 234 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
NPRL3Q12980 RN7SKP141-201ENST00000516167 338 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
NPRL3Q12980 MSC-AS1-205ENST00000519068 569 ntTSL 3 BASIC4.74□□□□□ -1.65
NPRL3Q12980 KBTBD3-204ENST00000531482 874 ntTSL 3 BASIC4.74□□□□□ -1.65
NPRL3Q12980 PYM1-205ENST00000547925 499 ntTSL 3 BASIC4.74□□□□□ -1.65
NPRL3Q12980 AL445363.1-202ENST00000553697 545 ntTSL 3 BASIC4.74□□□□□ -1.65
NPRL3Q12980 SETP1-201ENST00000556014 845 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
NPRL3Q12980 AC090515.3-201ENST00000560431 315 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
NPRL3Q12980 AC092078.2-201ENST00000560900 581 ntTSL 4 BASIC4.74□□□□□ -1.65
NPRL3Q12980 AL031600.2-201ENST00000563223 307 ntTSL 5 BASIC4.74□□□□□ -1.65
NPRL3Q12980 TM6SF1-207ENST00000565774 1020 ntTSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
NPRL3Q12980 RBM22P1-201ENST00000578589 1214 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
NPRL3Q12980 AC023932.1-201ENST00000582726 429 ntTSL 3 BASIC4.74□□□□□ -1.65
NPRL3Q12980 VN1R84P-201ENST00000593697 235 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
NPRL3Q12980 AL157392.3-211ENST00000599378 509 ntTSL 4 BASIC4.74□□□□□ -1.65
NPRL3Q12980 LINC02340-201ENST00000610335 626 ntTSL 3 BASIC4.74□□□□□ -1.65
NPRL3Q12980 AL591926.2-202ENST00000615199 719 ntTSL 5 BASIC4.74□□□□□ -1.65
NPRL3Q12980 AC123768.4-201ENST00000616244 701 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
NPRL3Q12980 AC131238.1-201ENST00000617135 328 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
NPRL3Q12980 AC009093.5-201ENST00000620963 359 ntTSL 2 BASIC4.74□□□□□ -1.65
NPRL3Q12980 AC079298.3-203ENST00000623269 555 ntTSL 3 BASIC4.74□□□□□ -1.65
NPRL3Q12980 HSD17B11-201ENST00000358290 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
NPRL3Q12980 LINC02030-201ENST00000492683 1602 ntTSL 5 BASIC4.74□□□□□ -1.65
NPRL3Q12980 OTOGL-204ENST00000547103 8032 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.74□□□□□ -1.65
NPRL3Q12980 UBR5-204ENST00000518205 1931 ntTSL 5 BASIC4.74□□□□□ -1.65
NPRL3Q12980 MPDZ-204ENST00000381022 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.73□□□□□ -1.65
NPRL3Q12980 NLRP11-202ENST00000589824 3231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.73□□□□□ -1.65
NPRL3Q12980 SMAD4-202ENST00000398417 8495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.73□□□□□ -1.65
NPRL3Q12980 EIF2AK2-201ENST00000233057 10042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.73□□□□□ -1.65
NPRL3Q12980 AC126323.6-202ENST00000568092 3511 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
NPRL3Q12980 STAU2-220ENST00000522695 2646 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 141.5 ms