Protein–RNA interactions for Protein: P98174

FGD1, FYVE, RhoGEF and PH domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 961 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FGD1P98174 ATP8B5P-203ENST00000430846 3962 ntTSL 2 BASIC7.3□□□□□ -1.24
FGD1P98174 ANKRD20A17P-201ENST00000511745 1330 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
FGD1P98174 AC110373.1-201ENST00000505994 3505 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
FGD1P98174 DCDC1-207ENST00000452803 1706 ntTSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
FGD1P98174 FCGR1B-209ENST00000616817 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
FGD1P98174 LINC00326-202ENST00000457339 2515 ntTSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
FGD1P98174 AL390237.1-201ENST00000404226 1415 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
FGD1P98174 HHLA2-210ENST00000491820 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
FGD1P98174 PHACTR2-207ENST00000427704 9531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
FGD1P98174 AC239868.2-201ENST00000564237 4527 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
FGD1P98174 RN7SKP187-201ENST00000365536 330 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
FGD1P98174 ZNF669-202ENST00000366500 489 ntTSL 3 BASIC7.3□□□□□ -1.24
FGD1P98174 RN7SKP151-201ENST00000410230 316 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
FGD1P98174 RNA5SP498-201ENST00000411342 120 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
FGD1P98174 ZNRF3-IT1-201ENST00000412798 674 ntTSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
FGD1P98174 LINC01442-201ENST00000414201 704 ntTSL 2 BASIC7.3□□□□□ -1.24
FGD1P98174 AC018878.1-201ENST00000419904 433 ntTSL 3 BASIC7.3□□□□□ -1.24
FGD1P98174 MTND4LP11-201ENST00000422184 280 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
FGD1P98174 OR5BE1P-201ENST00000425977 939 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
FGD1P98174 CNOT7P1-201ENST00000429006 852 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
FGD1P98174 FAM96AP1-201ENST00000430879 482 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
FGD1P98174 LCE6A-201ENST00000431011 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
FGD1P98174 AC073257.1-201ENST00000432474 523 ntTSL 4 BASIC7.3□□□□□ -1.24
FGD1P98174 LINC02013-201ENST00000438156 526 ntTSL 2 BASIC7.3□□□□□ -1.24
FGD1P98174 ARMC4P1-201ENST00000438905 707 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
FGD1P98174 RPL12P11-201ENST00000439970 501 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
FGD1P98174 AC018731.1-201ENST00000447078 576 ntTSL 4 BASIC7.3□□□□□ -1.24
FGD1P98174 LINC01952-202ENST00000450016 281 ntTSL 3 BASIC7.3□□□□□ -1.24
FGD1P98174 AC006042.4-201ENST00000451066 692 ntTSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
FGD1P98174 AC011287.2-201ENST00000456809 842 ntTSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
FGD1P98174 AC084754.1-201ENST00000463466 464 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
FGD1P98174 RPL7P40-201ENST00000481703 745 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
FGD1P98174 AC073522.1-201ENST00000483312 377 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
FGD1P98174 NCOR1P1-202ENST00000486162 291 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
FGD1P98174 RPL29P23-201ENST00000486188 442 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
FGD1P98174 OR5M10-201ENST00000526812 1052 ntAPPRIS P1 BASIC7.3□□□□□ -1.24
FGD1P98174 AP001858.2-201ENST00000536213 601 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
FGD1P98174 LINC02443-204ENST00000544717 754 ntTSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
FGD1P98174 AC125612.1-201ENST00000547580 377 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
FGD1P98174 AC090888.3-201ENST00000558917 509 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
FGD1P98174 AC007494.1-201ENST00000562293 760 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
FGD1P98174 AC104151.1-201ENST00000563764 323 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.3□□□□□ -1.24
FGD1P98174 AC090651.1-201ENST00000567865 634 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
FGD1P98174 ALOX12P2-208ENST00000574183 519 ntTSL 3 BASIC7.3□□□□□ -1.24
FGD1P98174 RBM11P1-201ENST00000604951 799 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
FGD1P98174 AL161457.2-204ENST00000609241 869 ntTSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
FGD1P98174 CKLF-CMTM1-206ENST00000616804 678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.3□□□□□ -1.24
FGD1P98174 AC245452.5-201ENST00000620649 780 ntTSL 3 BASIC7.3□□□□□ -1.24
FGD1P98174 C3orf85-208ENST00000622536 925 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
FGD1P98174 AF067845.4-201ENST00000633198 480 ntTSL 3 BASIC7.3□□□□□ -1.24
FGD1P98174 FP325313.1-201ENST00000638228 703 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
FGD1P98174 AC010325.3-201ENST00000641084 394 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
FGD1P98174 OR5BE1P-202ENST00000641168 1176 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
FGD1P98174 FILIP1L-201ENST00000331335 4219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
FGD1P98174 TPTE2-202ENST00000382978 1677 ntTSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
FGD1P98174 GABRA3-204ENST00000535043 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
FGD1P98174 MGC4859-201ENST00000634803 3118 ntTSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
FGD1P98174 ABCA6-206ENST00000590645 1511 ntTSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
FGD1P98174 MPDZ-212ENST00000538841 3186 ntTSL 2 BASIC7.3□□□□□ -1.24
FGD1P98174 FOXP2-209ENST00000393498 2617 ntTSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
FGD1P98174 ACSL5-204ENST00000393081 3380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
FGD1P98174 HIF1AN-201ENST00000299163 13011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
FGD1P98174 VIP-201ENST00000367243 1581 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
FGD1P98174 RGS13-201ENST00000391995 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
FGD1P98174 TSPAN8-202ENST00000393330 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
FGD1P98174 HHLA2-206ENST00000467761 2379 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
FGD1P98174 TMPRSS11BNL-202ENST00000510782 3202 ntTSL 2 BASIC7.29□□□□□ -1.24
FGD1P98174 ZNF28-201ENST00000339844 650 ntTSL 4 BASIC7.29□□□□□ -1.24
FGD1P98174 RNU6-1339P-201ENST00000363574 91 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
FGD1P98174 BPIFC-202ENST00000397450 458 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
FGD1P98174 PPP1R7-203ENST00000401987 820 ntTSL 3 BASIC7.29□□□□□ -1.24
FGD1P98174 NUDT19P3-201ENST00000404698 555 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
FGD1P98174 RPS7P8-201ENST00000418311 581 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
FGD1P98174 GS1-594A7.3-201ENST00000421585 574 ntTSL 2 BASIC7.29□□□□□ -1.24
FGD1P98174 IGLV3-4-201ENST00000432300 244 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
FGD1P98174 AC002378.1-201ENST00000432360 298 ntTSL 3 BASIC7.29□□□□□ -1.24
FGD1P98174 PSMD10P2-201ENST00000432890 672 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
FGD1P98174 DEFA9P-201ENST00000433042 285 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
FGD1P98174 AC023590.1-204ENST00000434023 431 ntTSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
FGD1P98174 NMNAT1P2-201ENST00000435192 860 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
FGD1P98174 AL162726.1-201ENST00000436084 455 ntTSL 3 BASIC7.29□□□□□ -1.24
FGD1P98174 MTCYBP3-201ENST00000445588 1137 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
FGD1P98174 AL021937.3-201ENST00000446543 361 ntTSL 2 BASIC7.29□□□□□ -1.24
FGD1P98174 MTND4P18-201ENST00000447010 465 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
FGD1P98174 AC097359.1-201ENST00000447946 463 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
FGD1P98174 AC005518.1-201ENST00000448131 1116 ntTSL 2 BASIC7.29□□□□□ -1.24
FGD1P98174 RN7SL352P-201ENST00000466002 277 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
FGD1P98174 TRBV8-2-201ENST00000475637 270 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
FGD1P98174 RPL7P18-201ENST00000478965 734 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
FGD1P98174 STK26-205ENST00000496850 1186 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
FGD1P98174 AC098859.2-201ENST00000506232 563 ntTSL 4 BASIC7.29□□□□□ -1.24
FGD1P98174 MTND3P5-201ENST00000512798 333 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
FGD1P98174 AC105999.2-201ENST00000521363 881 ntTSL 2 BASIC7.29□□□□□ -1.24
FGD1P98174 AC124293.1-201ENST00000530034 493 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
FGD1P98174 AL035078.2-201ENST00000533832 326 ntTSL 3 BASIC7.29□□□□□ -1.24
FGD1P98174 AC008083.2-201ENST00000546707 476 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
FGD1P98174 AC025031.1-201ENST00000552634 562 ntTSL 4 BASIC7.29□□□□□ -1.24
FGD1P98174 AL157871.6-201ENST00000553954 206 ntTSL 2 BASIC7.29□□□□□ -1.24
FGD1P98174 AC051619.4-201ENST00000560034 292 ntTSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
FGD1P98174 AC007601.2-201ENST00000566957 502 ntTSL 3 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 106.1 ms