Protein–RNA interactions for Protein: P49454

CENPF, Centromere protein F, humanhuman

Predictions only

Length 3,210 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPFP49454 LST1-207ENST00000376092 285 ntTSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
CENPFP49454 AP000580.1-201ENST00000404439 358 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
CENPFP49454 AL449983.1-201ENST00000430640 414 ntTSL 2 BASIC4.97□□□□□ -1.61
CENPFP49454 AL049830.4-201ENST00000555149 351 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
CENPFP49454 MIR3653-201ENST00000625572 110 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
CENPFP49454 CLIC2-202ENST00000369449 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
CENPFP49454 EYA3-203ENST00000373871 6085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
CENPFP49454 LINC00919-201ENST00000561513 1658 ntTSL 2 BASIC4.97□□□□□ -1.61
CENPFP49454 CACNA1E-209ENST00000621551 14886 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.97□□□□□ -1.61
CENPFP49454 ABCA1-202ENST00000374736 10494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
CENPFP49454 ETF1-203ENST00000503014 1736 ntTSL 2 BASIC4.97□□□□□ -1.61
CENPFP49454 STMN2-201ENST00000220876 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
CENPFP49454 FGD4-202ENST00000427716 8242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.97□□□□□ -1.61
CENPFP49454 CPHL1P-201ENST00000461341 3407 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
CENPFP49454 ZNF402P-201ENST00000404435 3100 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
CENPFP49454 AC013472.2-201ENST00000416226 306 ntTSL 3 BASIC4.97□□□□□ -1.61
CENPFP49454 SYF2P2-201ENST00000417620 583 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
CENPFP49454 AL451139.1-201ENST00000434718 346 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
CENPFP49454 CYCSP32-201ENST00000440548 321 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
CENPFP49454 AC010460.1-201ENST00000507087 466 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
CENPFP49454 AC117383.1-201ENST00000507698 422 ntTSL 3 BASIC4.97□□□□□ -1.61
CENPFP49454 RN7SKP67-201ENST00000515905 235 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
CENPFP49454 AC011595.3-201ENST00000546699 632 ntTSL 3 BASIC4.97□□□□□ -1.61
CENPFP49454 AC012229.1-201ENST00000558699 499 ntTSL 4 BASIC4.97□□□□□ -1.61
CENPFP49454 AL451086.1-201ENST00000605596 223 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
CENPFP49454 AL391261.4-201ENST00000616012 481 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
CENPFP49454 AC005618.4-201ENST00000625053 554 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
CENPFP49454 MRRF-208ENST00000394315 1501 ntTSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
CENPFP49454 NCKAP1L-201ENST00000293373 9016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
CENPFP49454 RN7SKP235-201ENST00000410662 305 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
CENPFP49454 AC112715.1-201ENST00000445534 350 ntTSL 3 BASIC4.97□□□□□ -1.61
CENPFP49454 TRAPPC2-208ENST00000519885 561 ntTSL 3 BASIC4.97□□□□□ -1.61
CENPFP49454 AC007342.8-201ENST00000623278 678 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
CENPFP49454 AC000095.2-202ENST00000637415 154 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
CENPFP49454 AL596275.2-208ENST00000641192 594 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
CENPFP49454 C6orf10-203ENST00000442822 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
CENPFP49454 AP003972.1-201ENST00000625192 5446 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
CENPFP49454 AC092821.1-204ENST00000518709 3552 ntTSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.61
CENPFP49454 ITSN2-213ENST00000622089 5805 ntTSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.61
CENPFP49454 TSC1-208ENST00000545250 8310 ntTSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.61
CENPFP49454 OSER1-202ENST00000372970 1616 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.96□□□□□ -1.61
CENPFP49454 IGF2R-201ENST00000356956 14044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.61
CENPFP49454 IFRD1-217ENST00000621379 3232 ntTSL 2 BASIC4.96□□□□□ -1.62
CENPFP49454 PCDH15-214ENST00000395446 3948 ntTSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.62
CENPFP49454 GDNF-AS1-202ENST00000510986 1941 ntTSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
CENPFP49454 AC006042.3-201ENST00000454684 1469 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
CENPFP49454 SNORA73.2-201ENST00000364946 201 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
CENPFP49454 U8.11-201ENST00000384699 133 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
CENPFP49454 U8.12-201ENST00000384701 133 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
CENPFP49454 AC007068.1-201ENST00000396690 844 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
CENPFP49454 UBE2Q2P12-201ENST00000414573 204 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
CENPFP49454 SNRPFP1-201ENST00000414761 252 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
CENPFP49454 AL035246.1-201ENST00000433554 1255 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
CENPFP49454 U8.18-201ENST00000459285 133 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
CENPFP49454 AC068756.1-201ENST00000482003 403 ntTSL 2 BASIC4.96□□□□□ -1.62
CENPFP49454 AC010401.3-201ENST00000576600 582 ntTSL 4 BASIC4.96□□□□□ -1.62
CENPFP49454 ZNF66-203ENST00000594534 757 ntTSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.62
CENPFP49454 AC239809.3-206ENST00000596091 741 ntTSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.62
CENPFP49454 MIR6891-201ENST00000618788 93 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
CENPFP49454 AL589740.1-204ENST00000634677 630 ntTSL 4 BASIC4.96□□□□□ -1.62
CENPFP49454 AC092451.3-201ENST00000625067 1343 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
CENPFP49454 FGFR1OP-202ENST00000366847 14166 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
CENPFP49454 GANC-201ENST00000318010 7781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
CENPFP49454 CDC16-202ENST00000252458 1991 ntTSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
CENPFP49454 SCIN-201ENST00000297029 9713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
CENPFP49454 ZNF833P-201ENST00000424938 1494 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
CENPFP49454 OFD1P5Y-201ENST00000447585 2590 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
CENPFP49454 BICRAL-202ENST00000394168 6515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
CENPFP49454 EIF2S1-202ENST00000466499 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
CENPFP49454 ADTRP-201ENST00000229583 891 ntTSL 2 BASIC4.96□□□□□ -1.62
CENPFP49454 RNA5SP36-201ENST00000410197 133 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
CENPFP49454 ARHGEF7-AS1-201ENST00000435037 321 ntTSL 3 BASIC4.96□□□□□ -1.62
CENPFP49454 AL353681.1-201ENST00000435828 731 ntTSL 3 BASIC4.96□□□□□ -1.62
CENPFP49454 NR1H4-204ENST00000546380 565 ntTSL 3 BASIC4.96□□□□□ -1.62
CENPFP49454 LINC01933-204ENST00000524295 3591 ntTSL 2 BASIC4.96□□□□□ -1.62
CENPFP49454 EMSY-204ENST00000524490 4015 ntTSL 2 BASIC4.96□□□□□ -1.62
CENPFP49454 OR10K1-203ENST00000641432 3775 ntAPPRIS P1 BASIC4.96□□□□□ -1.62
CENPFP49454 USP8-201ENST00000307179 4243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
CENPFP49454 GTDC1-207ENST00000409298 2209 ntTSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
CENPFP49454 MFSD13B-201ENST00000420133 1290 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
CENPFP49454 KCND3-IT1-201ENST00000439736 376 ntTSL 3 BASIC4.95□□□□□ -1.62
CENPFP49454 AC016746.1-201ENST00000489557 831 ntTSL 2 BASIC4.95□□□□□ -1.62
CENPFP49454 Y_RNA.719-201ENST00000517156 106 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
CENPFP49454 AC048387.1-201ENST00000518428 494 ntTSL 3 BASIC4.95□□□□□ -1.62
CENPFP49454 AC018695.5-201ENST00000605872 315 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
CENPFP49454 ZNF345-216ENST00000640438 963 ntTSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
CENPFP49454 TRIP12-204ENST00000389045 5355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
CENPFP49454 DYTN-201ENST00000452335 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
CENPFP49454 FRMD7-202ENST00000370879 2864 ntTSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
CENPFP49454 AC093297.3-201ENST00000607056 2517 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
CENPFP49454 SF3B3-201ENST00000302516 9720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
CENPFP49454 LINC00474-201ENST00000374014 769 ntTSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
CENPFP49454 HRH4-202ENST00000426880 909 ntTSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
CENPFP49454 COX6B1P7-201ENST00000430845 235 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
CENPFP49454 AC007655.1-201ENST00000444324 357 ntTSL 3 BASIC4.95□□□□□ -1.62
CENPFP49454 RPL35P6-201ENST00000490024 372 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
CENPFP49454 AC007991.1-201ENST00000522680 631 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
CENPFP49454 MYBPC1-204ENST00000452455 3861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.95□□□□□ -1.62
CENPFP49454 ZNF43-205ENST00000594012 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.95□□□□□ -1.62
CENPFP49454 ASXL2-201ENST00000336112 8889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 92.4 ms