Protein–RNA interactions for Protein: P45954

ACADSB, Short/branched chain specific acyl-CoA dehydrogenase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACADSBP45954 PARP11-201ENST00000228820 4424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
ACADSBP45954 PARP11-203ENST00000427057 4406 ntTSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
ACADSBP45954 LINC01568-202ENST00000555721 1325 ntTSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
ACADSBP45954 U3.30-201ENST00000391308 210 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
ACADSBP45954 GLS-204ENST00000409428 816 ntTSL 2 BASIC5.07□□□□□ -1.6
ACADSBP45954 VN1R37P-201ENST00000419096 748 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
ACADSBP45954 MRPL48P1-201ENST00000445390 636 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
ACADSBP45954 OR1H1P-201ENST00000448731 937 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
ACADSBP45954 RPS3AP41-201ENST00000462701 778 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
ACADSBP45954 AC022795.1-201ENST00000473808 480 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
ACADSBP45954 AC105918.1-201ENST00000474399 838 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
ACADSBP45954 RN7SL826P-201ENST00000479724 288 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
ACADSBP45954 AC098583.1-201ENST00000480875 255 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
ACADSBP45954 AC104971.1-201ENST00000495117 578 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
ACADSBP45954 AL136537.1-202ENST00000501725 430 ntTSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
ACADSBP45954 RNU1-6P-201ENST00000516290 144 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
ACADSBP45954 BRD9P1-201ENST00000529855 560 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
ACADSBP45954 OR5D15P-201ENST00000531671 942 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
ACADSBP45954 AC022882.1-201ENST00000532142 501 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
ACADSBP45954 DERA-209ENST00000532964 854 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
ACADSBP45954 AC133555.2-201ENST00000550213 292 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
ACADSBP45954 AC087636.1-201ENST00000554787 573 ntTSL 4 BASIC5.07□□□□□ -1.6
ACADSBP45954 RN7SL802P-201ENST00000577858 299 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
ACADSBP45954 MIR5699-201ENST00000578903 90 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
ACADSBP45954 AC093330.1-201ENST00000583326 568 ntTSL 4 BASIC5.07□□□□□ -1.6
ACADSBP45954 AC006116.4-201ENST00000589671 452 ntTSL 2 BASIC5.07□□□□□ -1.6
ACADSBP45954 FAM27B-201ENST00000610601 213 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
ACADSBP45954 AL591926.2-202ENST00000615199 719 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
ACADSBP45954 AL445528.2-201ENST00000620582 470 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
ACADSBP45954 PHACTR2P1-202ENST00000636592 773 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
ACADSBP45954 VCAM1-203ENST00000370115 2475 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
ACADSBP45954 CASC1-202ENST00000354189 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
ACADSBP45954 ZNF468-203ENST00000595646 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
ACADSBP45954 ANK2-202ENST00000357077 14196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
ACADSBP45954 INTS6-220ENST00000497989 3022 ntTSL 2 BASIC5.07□□□□□ -1.6
ACADSBP45954 OR14L1P-202ENST00000641545 3009 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
ACADSBP45954 GABRG2-202ENST00000361925 3767 ntTSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
ACADSBP45954 CCSER2-210ENST00000543283 5888 ntTSL 2 BASIC5.07□□□□□ -1.6
ACADSBP45954 DNAJC9-AS1-204ENST00000440197 2865 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
ACADSBP45954 NPY5R-202ENST00000506953 1418 ntAPPRIS P1 BASIC5.06□□□□□ -1.6
ACADSBP45954 CDC23-202ENST00000394886 3155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
ACADSBP45954 TM4SF1-202ENST00000472441 3115 ntTSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
ACADSBP45954 DHX9P1-201ENST00000436565 3076 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
ACADSBP45954 ZNF273-204ENST00000476120 2000 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
ACADSBP45954 SYCP1-209ENST00000613524 3034 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
ACADSBP45954 SLC1A3-216ENST00000613445 4030 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
ACADSBP45954 AL359922.3-201ENST00000624779 1670 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
ACADSBP45954 MTUS1-203ENST00000381861 3996 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
ACADSBP45954 SMAD4-202ENST00000398417 8495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
ACADSBP45954 DCX-202ENST00000358070 9405 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
ACADSBP45954 CSNK1G3-210ENST00000521364 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
ACADSBP45954 AC092821.1-201ENST00000640129 4180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
ACADSBP45954 OMG-201ENST00000247271 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
ACADSBP45954 OR4C11-201ENST00000302231 1045 ntAPPRIS P1 BASIC5.06□□□□□ -1.6
ACADSBP45954 RNU6-386P-201ENST00000362650 107 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
ACADSBP45954 RN7SKP224-201ENST00000364140 325 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
ACADSBP45954 SNORA58B-201ENST00000364259 136 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
ACADSBP45954 RNU6-670P-201ENST00000364312 104 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
ACADSBP45954 MIR550A3-201ENST00000390735 95 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
ACADSBP45954 DHFRP5-201ENST00000406944 564 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
ACADSBP45954 U3.35-201ENST00000408405 208 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
ACADSBP45954 RNA5SP113-201ENST00000410486 84 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
ACADSBP45954 LINC01507-201ENST00000417801 446 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
ACADSBP45954 RGS17P1-201ENST00000423358 553 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
ACADSBP45954 EIF4HP2-201ENST00000424380 563 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
ACADSBP45954 PA2G4P6-201ENST00000438325 1197 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
ACADSBP45954 C1DP3-201ENST00000455013 423 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
ACADSBP45954 LINC01206-203ENST00000476815 482 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
ACADSBP45954 AC090686.1-201ENST00000481577 749 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
ACADSBP45954 AC084871.1-201ENST00000508020 628 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
ACADSBP45954 HMGB3P16-201ENST00000508037 287 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
ACADSBP45954 RNA5SP464-201ENST00000516251 108 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
ACADSBP45954 AP001804.2-201ENST00000533932 910 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
ACADSBP45954 C8orf59-206ENST00000545322 491 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
ACADSBP45954 AC142086.4-201ENST00000568904 650 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
ACADSBP45954 MIR3667-201ENST00000581025 74 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
ACADSBP45954 ZNF66-203ENST00000594534 757 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
ACADSBP45954 AC233280.2-201ENST00000603917 1070 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
ACADSBP45954 AL353600.1-201ENST00000608148 251 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
ACADSBP45954 C7orf77-201ENST00000616258 548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
ACADSBP45954 AL590410.1-201ENST00000617925 333 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
ACADSBP45954 LDHA-225ENST00000625635 141 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
ACADSBP45954 AL596275.2-204ENST00000641628 552 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
ACADSBP45954 AL596275.2-206ENST00000641957 626 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
ACADSBP45954 OR10Z1-202ENST00000641002 6323 ntAPPRIS P1 BASIC5.06□□□□□ -1.6
ACADSBP45954 ATF7IP2-202ENST00000356427 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
ACADSBP45954 AC104118.1-201ENST00000607625 1589 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
ACADSBP45954 PUS7L-203ENST00000431332 1873 ntTSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
ACADSBP45954 CEP97-201ENST00000341893 8361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
ACADSBP45954 SLC24A2-202ENST00000341998 10749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
ACADSBP45954 LINC01249-201ENST00000412134 2663 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
ACADSBP45954 EHBP1-202ENST00000405015 4108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
ACADSBP45954 AC007382.1-201ENST00000624376 2618 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
ACADSBP45954 CASC19-206ENST00000641028 1430 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
ACADSBP45954 IQCG-201ENST00000265239 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
ACADSBP45954 KANSL1L-209ENST00000457374 2264 ntTSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
ACADSBP45954 DTNA-229ENST00000598142 2509 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
ACADSBP45954 KLHL4-202ENST00000373119 5818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
ACADSBP45954 SLC44A5-201ENST00000370855 4406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
ACADSBP45954 ZNF486-201ENST00000335117 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.8 ms