Protein–RNA interactions for Protein: P42166

TMPO, Lamina-associated polypeptide 2, isoform alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 694 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMPOP42166 OR56B2P-202ENST00000641377 2453 ntBASIC6□□□□□ -1.45
TMPOP42166 FTX-210ENST00000603037 8347 ntTSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
TMPOP42166 HDAC9-204ENST00000406451 9705 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
TMPOP42166 TRIM51-201ENST00000244891 1329 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
TMPOP42166 AC089984.1-201ENST00000552780 1431 ntTSL 3 BASIC5.99□□□□□ -1.45
TMPOP42166 VNN3-203ENST00000392393 1603 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
TMPOP42166 OR6K3-201ENST00000368145 1844 ntAPPRIS P1 BASIC5.99□□□□□ -1.45
TMPOP42166 RPGRIP1-201ENST00000382933 2004 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
TMPOP42166 RAD17P1-201ENST00000418130 2042 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
TMPOP42166 AC015813.1-203ENST00000585065 4722 ntTSL 2 BASIC5.99□□□□□ -1.45
TMPOP42166 SUPT3H-203ENST00000371460 2389 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
TMPOP42166 SGO1-205ENST00000419233 1582 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
TMPOP42166 AC107068.1-201ENST00000563286 4218 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
TMPOP42166 PRR4-201ENST00000228811 563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
TMPOP42166 CKS1B-201ENST00000308987 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
TMPOP42166 TRAV21-201ENST00000390449 343 ntAPPRIS P1 BASIC5.99□□□□□ -1.45
TMPOP42166 RPL7AP25-201ENST00000423357 805 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
TMPOP42166 CENPIP1-201ENST00000425713 902 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
TMPOP42166 RSL24D1P8-201ENST00000434442 492 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
TMPOP42166 AL162591.2-201ENST00000449634 317 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
TMPOP42166 AC024681.2-201ENST00000523525 204 ntTSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
TMPOP42166 AC104036.1-201ENST00000523550 611 ntTSL 3 BASIC5.99□□□□□ -1.45
TMPOP42166 AP003168.1-201ENST00000530091 307 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
TMPOP42166 TEX12-202ENST00000530752 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
TMPOP42166 PRR4-206ENST00000540107 388 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC5.99□□□□□ -1.45
TMPOP42166 AC024224.2-201ENST00000544225 782 ntTSL 3 BASIC5.99□□□□□ -1.45
TMPOP42166 MIR4715-201ENST00000584117 79 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
TMPOP42166 AC093765.1-201ENST00000603758 881 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
TMPOP42166 COX6CP4-201ENST00000605798 228 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
TMPOP42166 AL133243.1-201ENST00000614487 366 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
TMPOP42166 AP003400.2-201ENST00000624036 666 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
TMPOP42166 AL118508.4-201ENST00000624142 1176 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
TMPOP42166 SCN3A-203ENST00000409101 6599 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
TMPOP42166 ARFGEF2-201ENST00000371917 8852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
TMPOP42166 EYA1-205ENST00000388742 3907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
TMPOP42166 ECM2-202ENST00000375540 1606 ntTSL 2 BASIC5.99□□□□□ -1.45
TMPOP42166 AL133268.1-201ENST00000405676 1401 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
TMPOP42166 MYBPC1-202ENST00000361685 3871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
TMPOP42166 ATP2C1-212ENST00000507488 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.98□□□□□ -1.45
TMPOP42166 DDHD2-202ENST00000517385 4113 ntTSL 2 BASIC5.98□□□□□ -1.45
TMPOP42166 NBPF14-206ENST00000614999 10080 ntTSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
TMPOP42166 CPHL1P-201ENST00000461341 3407 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
TMPOP42166 AC021074.3-201ENST00000476385 1825 ntTSL 2 BASIC5.98□□□□□ -1.45
TMPOP42166 RNU1-32P-201ENST00000363937 159 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
TMPOP42166 SDHCP2-201ENST00000398565 501 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
TMPOP42166 AL807761.1-201ENST00000417622 171 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
TMPOP42166 AL158837.1-201ENST00000417644 452 ntTSL 2 BASIC5.98□□□□□ -1.45
TMPOP42166 AF230666.1-201ENST00000429151 786 ntTSL 2 BASIC5.98□□□□□ -1.45
TMPOP42166 AC108751.2-201ENST00000469993 231 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
TMPOP42166 SLC9A9-AS1-201ENST00000479030 518 ntTSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
TMPOP42166 AL133372.1-201ENST00000493565 745 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
TMPOP42166 ARHGEF3-AS1-202ENST00000495939 336 ntTSL 3 BASIC5.98□□□□□ -1.45
TMPOP42166 RNA5SP446-201ENST00000515955 82 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
TMPOP42166 OR8G5-201ENST00000524943 1041 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
TMPOP42166 AP000827.1-201ENST00000527814 258 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
TMPOP42166 AC008250.1-201ENST00000539874 522 ntTSL 3 BASIC5.98□□□□□ -1.45
TMPOP42166 AL355075.3-201ENST00000554678 492 ntTSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
TMPOP42166 AC103739.1-201ENST00000558389 474 ntTSL 3 BASIC5.98□□□□□ -1.45
TMPOP42166 TM6SF1-207ENST00000565774 1020 ntTSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
TMPOP42166 AC011507.1-201ENST00000585364 567 ntTSL 4 BASIC5.98□□□□□ -1.45
TMPOP42166 STARD13-AS-208ENST00000589472 859 ntTSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
TMPOP42166 AC023762.1-201ENST00000603280 584 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
TMPOP42166 AC005229.3-201ENST00000603438 323 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
TMPOP42166 BNIP3P7-201ENST00000605641 516 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
TMPOP42166 AC012467.1-201ENST00000607740 256 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
TMPOP42166 LAMTOR5-AS1-217ENST00000608152 407 ntTSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
TMPOP42166 LAMTOR5-AS1-227ENST00000609653 457 ntTSL 2 BASIC5.98□□□□□ -1.45
TMPOP42166 DAOA-AS1_1.1-201ENST00000613021 201 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
TMPOP42166 AL162574.2-201ENST00000614618 657 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
TMPOP42166 OR2L1P-202ENST00000641567 1023 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
TMPOP42166 PIK3CB-214ENST00000544716 3181 ntTSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
TMPOP42166 AL137100.1-201ENST00000556703 1620 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
TMPOP42166 LINC01289-201ENST00000519550 3712 ntTSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
TMPOP42166 GBA3-205ENST00000511446 2018 ntTSL 2 BASIC5.98□□□□□ -1.45
TMPOP42166 CACNB4-243ENST00000637217 8188 ntTSL 5 BASIC5.97□□□□□ -1.45
TMPOP42166 CLUL1-213ENST00000620089 1947 ntTSL 5 BASIC5.97□□□□□ -1.45
TMPOP42166 RAG2-209ENST00000618712 2818 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC5.97□□□□□ -1.45
TMPOP42166 OR8H2-203ENST00000641311 3092 ntAPPRIS P2 BASIC5.97□□□□□ -1.45
TMPOP42166 HIST1H2BD-201ENST00000289316 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
TMPOP42166 RNA5-8SP7-201ENST00000363443 155 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
TMPOP42166 RNA5SP151-201ENST00000365632 117 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
TMPOP42166 RPL23AP59-201ENST00000399415 461 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
TMPOP42166 ARL4A-205ENST00000404894 840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.97□□□□□ -1.45
TMPOP42166 RN7SKP216-201ENST00000411050 312 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
TMPOP42166 RANP7-201ENST00000418085 644 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
TMPOP42166 RAD23BP1-201ENST00000421404 1227 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
TMPOP42166 MED4-AS1-201ENST00000422483 542 ntTSL 2 BASIC5.97□□□□□ -1.45
TMPOP42166 RPS26P2-201ENST00000440331 348 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
TMPOP42166 H2AFZP6-201ENST00000444403 394 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
TMPOP42166 RPL23AP43-201ENST00000446445 471 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
TMPOP42166 AL031668.1-201ENST00000451556 603 ntTSL 3 BASIC5.97□□□□□ -1.45
TMPOP42166 AC073218.1-201ENST00000458413 171 ntTSL 5 BASIC5.97□□□□□ -1.45
TMPOP42166 HESX1-202ENST00000473921 757 ntTSL 5 BASIC5.97□□□□□ -1.45
TMPOP42166 RPL7AP10-201ENST00000481016 791 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
TMPOP42166 RN7SL346P-201ENST00000491561 294 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
TMPOP42166 MORF4L2P1-201ENST00000503761 858 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
TMPOP42166 AP001960.1-201ENST00000506494 658 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
TMPOP42166 AP002981.1-201ENST00000517692 975 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
TMPOP42166 AC008641.1-201ENST00000523781 248 ntTSL 3 BASIC5.97□□□□□ -1.45
TMPOP42166 AC079917.1-201ENST00000527828 584 ntTSL 3 BASIC5.97□□□□□ -1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 105.2 ms