Protein–RNA interactions for Protein: Q9UMW8

USP18, Ubl carboxyl-terminal hydrolase 18, humanhuman

Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP18Q9UMW8 OR7E116P-201ENST00000448529 957 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
USP18Q9UMW8 AL646090.1-201ENST00000449928 492 ntTSL 5 BASIC6.02□□□□□ -1.45
USP18Q9UMW8 AC233982.1-201ENST00000451247 436 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
USP18Q9UMW8 AL035407.2-201ENST00000454090 378 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
USP18Q9UMW8 ATP5J-207ENST00000457143 589 ntTSL 2 BASIC6.02□□□□□ -1.45
USP18Q9UMW8 MTND2P28-201ENST00000457540 1044 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
USP18Q9UMW8 AC069528.1-202ENST00000482888 637 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
USP18Q9UMW8 AC138866.2-201ENST00000508650 584 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
USP18Q9UMW8 LINC02117-201ENST00000513673 540 ntTSL 4 BASIC6.02□□□□□ -1.45
USP18Q9UMW8 RNA5SP228-201ENST00000516232 133 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
USP18Q9UMW8 NSMCE2-202ENST00000517315 996 ntTSL 3 BASIC6.02□□□□□ -1.45
USP18Q9UMW8 IGHV3-63-201ENST00000518422 341 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
USP18Q9UMW8 IGLV3-30-201ENST00000524362 298 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
USP18Q9UMW8 AP005230.1-201ENST00000585072 675 ntTSL 5 BASIC6.02□□□□□ -1.45
USP18Q9UMW8 NANOGP3-201ENST00000605855 286 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
USP18Q9UMW8 AL603755.1-201ENST00000619504 163 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
USP18Q9UMW8 TTN-AS1-267ENST00000628826 662 ntTSL 5 BASIC6.02□□□□□ -1.45
USP18Q9UMW8 AC103706.2-201ENST00000638080 240 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
USP18Q9UMW8 CCDC195-201ENST00000638102 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.02□□□□□ -1.45
USP18Q9UMW8 OR8B1P-202ENST00000641132 1178 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
USP18Q9UMW8 TRIM64B-201ENST00000329862 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
USP18Q9UMW8 LINC01192-202ENST00000470546 1519 ntTSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
USP18Q9UMW8 AADAT-202ENST00000353187 2101 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC6.02□□□□□ -1.45
USP18Q9UMW8 HORMAD2-202ENST00000403975 2115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.02□□□□□ -1.45
USP18Q9UMW8 SEPT7-205ENST00000432293 1362 ntTSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
USP18Q9UMW8 AC111188.2-201ENST00000529697 1387 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
USP18Q9UMW8 AC092070.2-203ENST00000598377 3644 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
USP18Q9UMW8 MACF1-232ENST00000567887 24319 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC6.02□□□□□ -1.45
USP18Q9UMW8 ZNF248-201ENST00000357328 4795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.02□□□□□ -1.45
USP18Q9UMW8 LINC01179-201ENST00000507838 2163 ntTSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
USP18Q9UMW8 ZNF736P9Y-201ENST00000439586 1345 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
USP18Q9UMW8 GPR18-201ENST00000340807 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
USP18Q9UMW8 LINC01625-201ENST00000454788 1690 ntTSL 2 BASIC6.01□□□□□ -1.45
USP18Q9UMW8 SLC1A3-215ENST00000612708 3832 ntTSL 5 BASIC6.01□□□□□ -1.45
USP18Q9UMW8 SLC4A10-202ENST00000375514 5710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC6.01□□□□□ -1.45
USP18Q9UMW8 DOPEY1-201ENST00000237163 7995 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.01□□□□□ -1.45
USP18Q9UMW8 GTDC1-201ENST00000241391 2356 ntTSL 2 BASIC6.01□□□□□ -1.45
USP18Q9UMW8 ZNF615-201ENST00000376716 4048 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC6.01□□□□□ -1.45
USP18Q9UMW8 SLMAP-208ENST00000449503 4027 ntTSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
USP18Q9UMW8 FAM72B-201ENST00000355228 1773 ntTSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
USP18Q9UMW8 TCF7L2-219ENST00000542695 4136 ntTSL 5 BASIC6.01□□□□□ -1.45
USP18Q9UMW8 FIGN-201ENST00000333129 9536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
USP18Q9UMW8 PATL1-201ENST00000300146 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
USP18Q9UMW8 ADAM18-202ENST00000379866 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
USP18Q9UMW8 RNU6-353P-201ENST00000364266 108 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
USP18Q9UMW8 OR2W4P-201ENST00000406496 926 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
USP18Q9UMW8 AL590084.1-201ENST00000407885 387 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
USP18Q9UMW8 RN7SKP125-201ENST00000410481 302 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
USP18Q9UMW8 RNU4-72P-201ENST00000410754 173 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
USP18Q9UMW8 RN7SKP182-201ENST00000410772 298 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
USP18Q9UMW8 AL357752.1-201ENST00000412817 349 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
USP18Q9UMW8 MTND4P22-201ENST00000413116 1169 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
USP18Q9UMW8 TRGV6-201ENST00000417928 299 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
USP18Q9UMW8 TNPO1P1-201ENST00000423641 1138 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
USP18Q9UMW8 RPF2P1-201ENST00000424137 906 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
USP18Q9UMW8 CA1-201ENST00000431316 1232 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.01□□□□□ -1.45
USP18Q9UMW8 AC009158.1-207ENST00000432973 394 ntTSL 5 BASIC6.01□□□□□ -1.45
USP18Q9UMW8 PRKACB-213ENST00000446538 1112 ntTSL 2 BASIC6.01□□□□□ -1.45
USP18Q9UMW8 AC234781.3-201ENST00000452540 973 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
USP18Q9UMW8 AL512328.1-202ENST00000452640 850 ntTSL 3 BASIC6.01□□□□□ -1.45
USP18Q9UMW8 SCEL-AS1-201ENST00000456280 493 ntTSL 3 BASIC6.01□□□□□ -1.45
USP18Q9UMW8 RNU7-140P-201ENST00000459546 60 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
USP18Q9UMW8 AC128716.1-201ENST00000475129 166 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
USP18Q9UMW8 RAP1BP2-201ENST00000478270 544 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
USP18Q9UMW8 UBA52P7-201ENST00000486088 380 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
USP18Q9UMW8 HIGD1AP14-201ENST00000507617 282 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
USP18Q9UMW8 AC093297.2-205ENST00000508123 572 ntTSL 3 BASIC6.01□□□□□ -1.45
USP18Q9UMW8 AC008592.4-201ENST00000509999 450 ntTSL 3 BASIC6.01□□□□□ -1.45
USP18Q9UMW8 OR5BM1P-201ENST00000512021 366 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
USP18Q9UMW8 AC139365.2-201ENST00000517972 253 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
USP18Q9UMW8 RPL26L1-203ENST00000519239 679 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.01□□□□□ -1.45
USP18Q9UMW8 HIGD1AP18-201ENST00000520730 278 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
USP18Q9UMW8 LINC01947-201ENST00000523742 566 ntTSL 4 BASIC6.01□□□□□ -1.45
USP18Q9UMW8 MTCO3P15-201ENST00000526563 574 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
USP18Q9UMW8 HMGN2P36-201ENST00000529541 409 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
USP18Q9UMW8 AC023796.1-201ENST00000536131 670 ntTSL 3 BASIC6.01□□□□□ -1.45
USP18Q9UMW8 HAGLR-211ENST00000549329 609 ntTSL 4 BASIC6.01□□□□□ -1.45
USP18Q9UMW8 OR11H3P-201ENST00000554547 982 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
USP18Q9UMW8 LINS1-207ENST00000560133 1196 ntTSL 2 BASIC6.01□□□□□ -1.45
USP18Q9UMW8 AC026464.3-201ENST00000563634 564 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC6.01□□□□□ -1.45
USP18Q9UMW8 AC136944.1-201ENST00000567464 560 ntTSL 5 BASIC6.01□□□□□ -1.45
USP18Q9UMW8 ZNF971P-202ENST00000568619 461 ntTSL 3 BASIC6.01□□□□□ -1.45
USP18Q9UMW8 AC022662.1-201ENST00000580252 331 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
USP18Q9UMW8 VN1R83P-201ENST00000595685 445 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
USP18Q9UMW8 AC004862.1-203ENST00000598433 1020 ntTSL 5 BASIC6.01□□□□□ -1.45
USP18Q9UMW8 AC244517.5-201ENST00000624139 722 ntTSL 3 BASIC6.01□□□□□ -1.45
USP18Q9UMW8 LINC00850-201ENST00000629221 685 ntTSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
USP18Q9UMW8 AC007671.2-201ENST00000637344 619 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
USP18Q9UMW8 RGSL1-201ENST00000294854 3696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
USP18Q9UMW8 ZC3H12C-201ENST00000278590 8807 ntTSL 2 BASIC6.01□□□□□ -1.45
USP18Q9UMW8 KDM4C-214ENST00000536108 3406 ntTSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
USP18Q9UMW8 BX005019.1-201ENST00000561881 1810 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
USP18Q9UMW8 ABCA10-201ENST00000269081 6362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
USP18Q9UMW8 MEMO1-202ENST00000379383 1498 ntTSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
USP18Q9UMW8 GPR18-202ENST00000397470 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
USP18Q9UMW8 MSL3P1-202ENST00000440028 1468 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
USP18Q9UMW8 KIN-201ENST00000379562 6348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
USP18Q9UMW8 TESPA1-203ENST00000524622 4188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
USP18Q9UMW8 ESRRG-224ENST00000616180 5194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.01□□□□□ -1.45
USP18Q9UMW8 GPX8-201ENST00000296734 3245 ntTSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 88.6 ms