Protein–RNA interactions for Protein: Q8N9B4

ANKRD42, Ankyrin repeat domain-containing protein 42, humanhuman

Predictions only

Length 389 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD42Q8N9B4 RN7SKP35-201ENST00000517210 151 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
ANKRD42Q8N9B4 AC060775.1-201ENST00000518241 520 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
ANKRD42Q8N9B4 AC025423.4-201ENST00000553141 785 ntTSL 3 BASIC5.46□□□□□ -1.54
ANKRD42Q8N9B4 AL133279.2-201ENST00000556546 428 ntTSL 3 BASIC5.46□□□□□ -1.54
ANKRD42Q8N9B4 LINC00933-205ENST00000560917 449 ntTSL 3 BASIC5.46□□□□□ -1.54
ANKRD42Q8N9B4 AC009120.4-201ENST00000564455 513 ntTSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.54
ANKRD42Q8N9B4 MTCO1P40-201ENST00000574371 625 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
ANKRD42Q8N9B4 TRIM37-212ENST00000584889 353 ntTSL 2 BASIC5.46□□□□□ -1.54
ANKRD42Q8N9B4 AC092070.2-201ENST00000597550 545 ntTSL 4 BASIC5.46□□□□□ -1.54
ANKRD42Q8N9B4 BNIP3P39-201ENST00000601077 554 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
ANKRD42Q8N9B4 AL353811.1-201ENST00000602851 736 ntTSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.54
ANKRD42Q8N9B4 AC093673.2-201ENST00000609674 331 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
ANKRD42Q8N9B4 IL21-202ENST00000611104 707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
ANKRD42Q8N9B4 Metazoa_SRP.70-201ENST00000612622 273 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
ANKRD42Q8N9B4 CCL4-202ENST00000615863 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
ANKRD42Q8N9B4 AC037198.3-201ENST00000616754 526 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
ANKRD42Q8N9B4 CCL4L2-215ENST00000620055 537 ntTSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
ANKRD42Q8N9B4 FP236315.3-201ENST00000623587 307 ntTSL 2 BASIC5.46□□□□□ -1.54
ANKRD42Q8N9B4 AF067845.5-201ENST00000633906 437 ntTSL 3 BASIC5.46□□□□□ -1.54
ANKRD42Q8N9B4 SGO1-AS1-206ENST00000635369 442 ntTSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.54
ANKRD42Q8N9B4 KCNJ1-204ENST00000392665 4074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
ANKRD42Q8N9B4 GALNT11-203ENST00000422997 2371 ntTSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.54
ANKRD42Q8N9B4 USP28-213ENST00000544967 3498 ntTSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
ANKRD42Q8N9B4 PANDAR-201ENST00000629595 1506 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
ANKRD42Q8N9B4 OR2AP1-202ENST00000641114 1548 ntAPPRIS P1 BASIC5.46□□□□□ -1.54
ANKRD42Q8N9B4 GJA9-201ENST00000357771 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
ANKRD42Q8N9B4 IQCG-201ENST00000265239 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
ANKRD42Q8N9B4 EHBP1-202ENST00000405015 4108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.46□□□□□ -1.54
ANKRD42Q8N9B4 USP16-201ENST00000334352 3004 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.54
ANKRD42Q8N9B4 LINC02070-201ENST00000460586 1321 ntTSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
ANKRD42Q8N9B4 NLRC4-203ENST00000402280 3355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
ANKRD42Q8N9B4 CRISP1-201ENST00000329411 1709 ntTSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
ANKRD42Q8N9B4 EMB-205ENST00000514111 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.45□□□□□ -1.54
ANKRD42Q8N9B4 IL1RAPL1-202ENST00000378993 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
ANKRD42Q8N9B4 SCN1A-201ENST00000303395 8533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
ANKRD42Q8N9B4 PLCB1-210ENST00000612075 6576 ntTSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
ANKRD42Q8N9B4 MRPS36-201ENST00000256441 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
ANKRD42Q8N9B4 AGBL4-201ENST00000334103 881 ntTSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
ANKRD42Q8N9B4 RNU4-44P-201ENST00000363050 141 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
ANKRD42Q8N9B4 RNU6-353P-201ENST00000364266 108 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
ANKRD42Q8N9B4 TRAV13-1-201ENST00000390436 360 ntAPPRIS P1 BASIC5.45□□□□□ -1.54
ANKRD42Q8N9B4 CCL8-201ENST00000394620 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
ANKRD42Q8N9B4 AGR3-202ENST00000402239 563 ntTSL 2 BASIC5.45□□□□□ -1.54
ANKRD42Q8N9B4 AC009965.1-201ENST00000411436 570 ntTSL 4 BASIC5.45□□□□□ -1.54
ANKRD42Q8N9B4 LIPT1P1-201ENST00000415870 1186 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
ANKRD42Q8N9B4 AC078883.1-203ENST00000416080 654 ntTSL 3 BASIC5.45□□□□□ -1.54
ANKRD42Q8N9B4 TAF13P2-201ENST00000416876 286 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
ANKRD42Q8N9B4 AC023347.1-202ENST00000419223 440 ntTSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
ANKRD42Q8N9B4 LINC01731-201ENST00000428035 420 ntTSL 3 BASIC5.45□□□□□ -1.54
ANKRD42Q8N9B4 ZEB2-AS1-203ENST00000428623 436 ntTSL 2 BASIC5.45□□□□□ -1.54
ANKRD42Q8N9B4 AL513348.1-201ENST00000435554 440 ntTSL 3 BASIC5.45□□□□□ -1.54
ANKRD42Q8N9B4 GAPDHP59-201ENST00000435908 267 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
ANKRD42Q8N9B4 AC006335.2-201ENST00000437993 330 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
ANKRD42Q8N9B4 AP000281.1-201ENST00000444036 316 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
ANKRD42Q8N9B4 NDUFAF4P2-201ENST00000445374 520 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
ANKRD42Q8N9B4 AL357514.1-201ENST00000446322 488 ntTSL 3 BASIC5.45□□□□□ -1.54
ANKRD42Q8N9B4 AC012512.1-201ENST00000446594 718 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
ANKRD42Q8N9B4 HMGB1P7-201ENST00000450921 612 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
ANKRD42Q8N9B4 IFNWP4-201ENST00000453148 294 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
ANKRD42Q8N9B4 AC117394.1-201ENST00000477323 567 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
ANKRD42Q8N9B4 AC091959.2-201ENST00000477363 321 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
ANKRD42Q8N9B4 ST20-201ENST00000478497 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
ANKRD42Q8N9B4 EIF1P7-201ENST00000487533 337 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
ANKRD42Q8N9B4 RPS12P31-201ENST00000491419 398 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
ANKRD42Q8N9B4 OSMR-AS1-201ENST00000506463 800 ntTSL 3 BASIC5.45□□□□□ -1.54
ANKRD42Q8N9B4 ZCCHC10-207ENST00000509437 1070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
ANKRD42Q8N9B4 AC109464.3-201ENST00000509456 204 ntTSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
ANKRD42Q8N9B4 AC008728.1-201ENST00000512730 691 ntTSL 2 BASIC5.45□□□□□ -1.54
ANKRD42Q8N9B4 WDYHV1-203ENST00000518125 880 ntTSL 2 BASIC5.45□□□□□ -1.54
ANKRD42Q8N9B4 MORF4L1P3-201ENST00000525966 950 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
ANKRD42Q8N9B4 AP001360.2-201ENST00000534423 562 ntTSL 4 BASIC5.45□□□□□ -1.54
ANKRD42Q8N9B4 RPA2P1-201ENST00000556557 721 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
ANKRD42Q8N9B4 HMGN1P26-201ENST00000558737 303 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
ANKRD42Q8N9B4 AC009562.1-202ENST00000558755 565 ntTSL 4 BASIC5.45□□□□□ -1.54
ANKRD42Q8N9B4 AL356801.1-201ENST00000559320 294 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
ANKRD42Q8N9B4 LINC00511-212ENST00000581183 657 ntTSL 3 BASIC5.45□□□□□ -1.54
ANKRD42Q8N9B4 C17orf80-208ENST00000582793 531 ntTSL 2 BASIC5.45□□□□□ -1.54
ANKRD42Q8N9B4 AC090403.1-204ENST00000582893 572 ntTSL 4 BASIC5.45□□□□□ -1.54
ANKRD42Q8N9B4 OR1AB1P-201ENST00000585564 761 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
ANKRD42Q8N9B4 AC011477.5-201ENST00000586571 259 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
ANKRD42Q8N9B4 LINC01676-204ENST00000595309 871 ntTSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
ANKRD42Q8N9B4 AC005377.1-201ENST00000605126 456 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
ANKRD42Q8N9B4 LINC01440-205ENST00000608080 737 ntTSL 3 BASIC5.45□□□□□ -1.54
ANKRD42Q8N9B4 AC083798.2-201ENST00000608756 1152 ntTSL 4 BASIC5.45□□□□□ -1.54
ANKRD42Q8N9B4 AC108673.3-201ENST00000609183 335 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
ANKRD42Q8N9B4 Metazoa_SRP.35-201ENST00000611402 288 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
ANKRD42Q8N9B4 AC244107.2-201ENST00000611773 76 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
ANKRD42Q8N9B4 AL445984.1-201ENST00000637834 659 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
ANKRD42Q8N9B4 BX649567.1-201ENST00000642071 1134 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
ANKRD42Q8N9B4 MYB-226ENST00000528774 2277 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
ANKRD42Q8N9B4 OR8A1-203ENST00000641670 5709 ntAPPRIS P1 BASIC5.45□□□□□ -1.54
ANKRD42Q8N9B4 TMLHE-AS1-201ENST00000433624 1702 ntTSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
ANKRD42Q8N9B4 DPP8-210ENST00000559233 2953 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC5.45□□□□□ -1.54
ANKRD42Q8N9B4 MLH3-210ENST00000556257 4229 ntTSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
ANKRD42Q8N9B4 ZNF442-205ENST00000545749 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
ANKRD42Q8N9B4 ZNF429-209ENST00000618549 1889 ntTSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
ANKRD42Q8N9B4 OR1E1-201ENST00000322608 1307 ntAPPRIS P1 BASIC5.45□□□□□ -1.54
ANKRD42Q8N9B4 DNAJC9-AS1-204ENST00000440197 2865 ntTSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
ANKRD42Q8N9B4 STXBP4-202ENST00000398391 2160 ntTSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
ANKRD42Q8N9B4 SLC2A3P1-201ENST00000519666 1451 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 119.5 ms