Protein–RNA interactions for Protein: Q2M243

CCDC27, Coiled-coil domain-containing protein 27, humanhuman

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Length 656 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC27Q2M243 AC005840.5-201ENST00000619166 599 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
CCDC27Q2M243 MIR4278-201ENST00000636094 69 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
CCDC27Q2M243 AF001550.2-201ENST00000636643 217 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
CCDC27Q2M243 SLC39A12-201ENST00000377369 2808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
CCDC27Q2M243 POSTN-204ENST00000379749 3210 ntTSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
CCDC27Q2M243 Z98755.1-201ENST00000407015 1384 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
CCDC27Q2M243 DCX-211ENST00000637570 6162 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
CCDC27Q2M243 MFSD8-201ENST00000296468 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
CCDC27Q2M243 AL355852.1-201ENST00000454081 1771 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
CCDC27Q2M243 ATP13A4-202ENST00000342695 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
CCDC27Q2M243 SH3YL1-203ENST00000403657 3540 ntTSL 2 BASIC7.56□□□□□ -1.2
CCDC27Q2M243 ZNF253-203ENST00000589717 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
CCDC27Q2M243 C4orf17-201ENST00000326581 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
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CCDC27Q2M243 AL355488.2-201ENST00000609909 2850 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
CCDC27Q2M243 CCAR1-217ENST00000543719 3521 ntTSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
CCDC27Q2M243 UGT2B11-201ENST00000446444 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
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CCDC27Q2M243 AL049737.1-201ENST00000413920 1403 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
CCDC27Q2M243 MAPK10-370ENST00000641943 4117 ntAPPRIS P2 BASIC7.55□□□□□ -1.2
CCDC27Q2M243 TPTE2-202ENST00000382978 1677 ntTSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
CCDC27Q2M243 OR52B3P-201ENST00000314715 928 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
CCDC27Q2M243 RNU4-4P-201ENST00000364588 130 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
CCDC27Q2M243 MIR130A-201ENST00000385274 89 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
CCDC27Q2M243 RSL24D1P4-201ENST00000400938 484 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
CCDC27Q2M243 NRBF2P2-201ENST00000413087 861 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
CCDC27Q2M243 RAD23B-202ENST00000416373 3835 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
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CCDC27Q2M243 AL354714.4-201ENST00000427339 575 ntTSL 3 BASIC7.55□□□□□ -1.2
CCDC27Q2M243 AL590399.2-201ENST00000427536 309 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
CCDC27Q2M243 AC099060.1-201ENST00000427806 448 ntTSL 3 BASIC7.55□□□□□ -1.2
CCDC27Q2M243 RPL7P4-203ENST00000430239 730 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
CCDC27Q2M243 LINC02528-202ENST00000434437 535 ntTSL 2 BASIC7.55□□□□□ -1.2
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CCDC27Q2M243 AL117351.1-201ENST00000438864 766 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
CCDC27Q2M243 CBX1P4-201ENST00000439415 457 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
CCDC27Q2M243 AC019330.1-202ENST00000440609 504 ntTSL 4 BASIC7.55□□□□□ -1.2
CCDC27Q2M243 AL050303.1-201ENST00000444356 458 ntTSL 2 BASIC7.55□□□□□ -1.2
CCDC27Q2M243 AL139275.1-201ENST00000447315 824 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
CCDC27Q2M243 LINC01344-202ENST00000449842 571 ntTSL 3 BASIC7.55□□□□□ -1.2
CCDC27Q2M243 AL035409.1-201ENST00000454305 497 ntTSL 2 BASIC7.55□□□□□ -1.2
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CCDC27Q2M243 AP004609.2-201ENST00000532177 190 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
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CCDC27Q2M243 ANLN-202ENST00000396068 4661 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
CCDC27Q2M243 MDM4-216ENST00000616250 9597 ntTSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
CCDC27Q2M243 LINC00690-201ENST00000429949 1365 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
CCDC27Q2M243 MRE11P1-201ENST00000464884 2127 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
CCDC27Q2M243 AC232271.1-201ENST00000602455 2715 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
CCDC27Q2M243 UTP15-208ENST00000543251 4922 ntTSL 2 BASIC7.55□□□□□ -1.2
CCDC27Q2M243 TXK-201ENST00000264316 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
CCDC27Q2M243 OR5B12-202ENST00000641921 1807 ntAPPRIS P1 BASIC7.55□□□□□ -1.2
CCDC27Q2M243 RAD51AP1-201ENST00000228843 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
CCDC27Q2M243 LINC01963-201ENST00000562038 3148 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
CCDC27Q2M243 MECOM-201ENST00000264674 4900 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
CCDC27Q2M243 SELENOI-205ENST00000613142 8126 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
CCDC27Q2M243 MRE11-203ENST00000393241 2604 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
CCDC27Q2M243 FRK-201ENST00000606080 13230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
CCDC27Q2M243 KCNAB1-205ENST00000471742 3301 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
CCDC27Q2M243 RUFY3-202ENST00000381006 3098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
CCDC27Q2M243 NRDC-213ENST00000539524 3417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
CCDC27Q2M243 MYBPC1-216ENST00000550270 3426 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
CCDC27Q2M243 AC016745.2-201ENST00000608834 3443 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
CCDC27Q2M243 MAP3K2-201ENST00000344908 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
CCDC27Q2M243 TMED3-202ENST00000424155 16555 ntTSL 3 BASIC7.54□□□□□ -1.2
CCDC27Q2M243 WDR95P-201ENST00000425638 1542 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
CCDC27Q2M243 AMY1B-201ENST00000330330 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
CCDC27Q2M243 NOL4-202ENST00000535384 1853 ntTSL 2 BASIC7.54□□□□□ -1.2
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