Protein–RNA interactions for Protein: Q17R60

IMPG1, Interphotoreceptor matrix proteoglycan 1, humanhuman

Predictions only

Length 797 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IMPG1Q17R60 FAM27B-201ENST00000610601 213 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
IMPG1Q17R60 SNORA11.6-201ENST00000619030 128 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
IMPG1Q17R60 AC091905.4-201ENST00000623432 202 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
IMPG1Q17R60 AC084816.1-212ENST00000625240 1114 ntTSL 5 BASIC4.56□□□□□ -1.68
IMPG1Q17R60 CGA-206ENST00000630630 832 ntTSL 2 BASIC4.56□□□□□ -1.68
IMPG1Q17R60 AL596275.2-204ENST00000641628 552 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
IMPG1Q17R60 AL596275.2-206ENST00000641957 626 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
IMPG1Q17R60 CCDC178-209ENST00000579947 2925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
IMPG1Q17R60 MS4A1-201ENST00000345732 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
IMPG1Q17R60 OR8D1-202ENST00000641015 8286 ntAPPRIS P1 BASIC4.56□□□□□ -1.68
IMPG1Q17R60 OR8D1-203ENST00000641897 8285 ntAPPRIS P1 BASIC4.56□□□□□ -1.68
IMPG1Q17R60 GTDC1-203ENST00000392867 2408 ntTSL 5 BASIC4.56□□□□□ -1.68
IMPG1Q17R60 GABRB2-203ENST00000393959 7191 ntTSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
IMPG1Q17R60 DMD-207ENST00000378677 13932 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.56□□□□□ -1.68
IMPG1Q17R60 EEF1A1-211ENST00000615060 3508 ntTSL 5 BASIC4.56□□□□□ -1.68
IMPG1Q17R60 OR5H14-202ENST00000641380 7323 ntAPPRIS P1 BASIC4.56□□□□□ -1.68
IMPG1Q17R60 AC008505.1-201ENST00000637582 2025 ntTSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
IMPG1Q17R60 IKZF3-202ENST00000346243 1296 ntTSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
IMPG1Q17R60 CARD16-202ENST00000375706 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
IMPG1Q17R60 U3.30-201ENST00000391308 210 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
IMPG1Q17R60 RN7SKP213-201ENST00000410746 298 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
IMPG1Q17R60 IFNA17-201ENST00000413767 980 ntAPPRIS P1 BASIC4.55□□□□□ -1.68
IMPG1Q17R60 AL358176.3-201ENST00000420757 454 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
IMPG1Q17R60 RPL7P57-201ENST00000423238 740 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
IMPG1Q17R60 AL031599.1-201ENST00000432694 808 ntTSL 3 BASIC4.55□□□□□ -1.68
IMPG1Q17R60 ZBTB40-IT1-201ENST00000438551 273 ntTSL 3 BASIC4.55□□□□□ -1.68
IMPG1Q17R60 IKZF3-212ENST00000439016 1246 ntTSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
IMPG1Q17R60 EEF1B2P5-201ENST00000444820 548 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
IMPG1Q17R60 DARS-AS1-206ENST00000446492 488 ntTSL 3 BASIC4.55□□□□□ -1.68
IMPG1Q17R60 TMSB4X-204ENST00000451311 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
IMPG1Q17R60 AC010733.1-201ENST00000451515 401 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
IMPG1Q17R60 AC005532.2-201ENST00000467154 373 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
IMPG1Q17R60 RPL21P6-201ENST00000479171 504 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
IMPG1Q17R60 RPSAP50-201ENST00000481955 852 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
IMPG1Q17R60 ADGRL3-AS1-202ENST00000504135 542 ntTSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
IMPG1Q17R60 LINC02508-201ENST00000504165 426 ntTSL 3 BASIC4.55□□□□□ -1.68
IMPG1Q17R60 AC131254.2-201ENST00000521908 550 ntTSL 3 BASIC4.55□□□□□ -1.68
IMPG1Q17R60 AC091163.1-201ENST00000524012 605 ntTSL 4 BASIC4.55□□□□□ -1.68
IMPG1Q17R60 AL591770.1-201ENST00000554475 1131 ntTSL 3 BASIC4.55□□□□□ -1.68
IMPG1Q17R60 LINC02168-201ENST00000565327 352 ntTSL 2 BASIC4.55□□□□□ -1.68
IMPG1Q17R60 PIK3C3-207ENST00000587402 452 ntTSL 3 BASIC4.55□□□□□ -1.68
IMPG1Q17R60 AC008794.2-201ENST00000587779 293 ntTSL 2 BASIC4.55□□□□□ -1.68
IMPG1Q17R60 AC005520.3-201ENST00000602874 370 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
IMPG1Q17R60 AC073137.1-201ENST00000605636 634 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
IMPG1Q17R60 C7orf77-201ENST00000616258 548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
IMPG1Q17R60 ZNF75A-210ENST00000617839 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
IMPG1Q17R60 AC005086.4-201ENST00000623065 213 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
IMPG1Q17R60 AP002799.1-201ENST00000623552 423 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
IMPG1Q17R60 DARS-AS1-230ENST00000631306 530 ntTSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
IMPG1Q17R60 CASP1-217ENST00000640184 327 ntTSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
IMPG1Q17R60 PREPL-205ENST00000409411 4725 ntTSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
IMPG1Q17R60 CTXN2-201ENST00000417307 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
IMPG1Q17R60 LCOR-204ENST00000371103 10342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
IMPG1Q17R60 TIPARP-207ENST00000542783 3681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
IMPG1Q17R60 BBX-203ENST00000402543 3980 ntTSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
IMPG1Q17R60 CFAP47-202ENST00000313548 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
IMPG1Q17R60 PARP8-201ENST00000281631 7177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
IMPG1Q17R60 CASC8-203ENST00000502082 1420 ntTSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
IMPG1Q17R60 PPP1R9A-202ENST00000340694 9689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
IMPG1Q17R60 CEPT1-211ENST00000615636 1966 ntTSL 5 BASIC4.54□□□□□ -1.68
IMPG1Q17R60 SAMMSON-226ENST00000642089 1582 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
IMPG1Q17R60 OR5B17-201ENST00000357377 946 ntAPPRIS P1 BASIC4.54□□□□□ -1.68
IMPG1Q17R60 RNA5SP305-201ENST00000362665 119 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
IMPG1Q17R60 MIR765-201ENST00000390226 114 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
IMPG1Q17R60 AL590762.2-201ENST00000395798 571 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
IMPG1Q17R60 LINC00308-201ENST00000419431 727 ntTSL 5 BASIC4.54□□□□□ -1.68
IMPG1Q17R60 AC096711.3-201ENST00000420721 582 ntTSL 4 BASIC4.54□□□□□ -1.68
IMPG1Q17R60 OR2AM1P-201ENST00000422137 422 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
IMPG1Q17R60 NPM1P48-201ENST00000436002 853 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
IMPG1Q17R60 AL049552.1-201ENST00000444302 577 ntTSL 2 BASIC4.54□□□□□ -1.68
IMPG1Q17R60 AP000402.1-201ENST00000446404 540 ntTSL 3 BASIC4.54□□□□□ -1.68
IMPG1Q17R60 AC009365.2-201ENST00000453078 799 ntTSL 3 BASIC4.54□□□□□ -1.68
IMPG1Q17R60 LINC01150-201ENST00000455671 315 ntTSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
IMPG1Q17R60 AC005008.1-201ENST00000456151 612 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
IMPG1Q17R60 AC090142.1-201ENST00000465776 462 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
IMPG1Q17R60 RPS26P39-201ENST00000469206 341 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
IMPG1Q17R60 AC022795.1-201ENST00000473808 480 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
IMPG1Q17R60 AC025164.1-201ENST00000496249 478 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
IMPG1Q17R60 LINC02499-201ENST00000502291 763 ntTSL 3 BASIC4.54□□□□□ -1.68
IMPG1Q17R60 LINC02039-201ENST00000507428 566 ntTSL 4 BASIC4.54□□□□□ -1.68
IMPG1Q17R60 AC091868.1-201ENST00000508746 304 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
IMPG1Q17R60 AC099550.1-201ENST00000515495 871 ntTSL 3 BASIC4.54□□□□□ -1.68
IMPG1Q17R60 AC100802.1-201ENST00000519197 1026 ntTSL 3 BASIC4.54□□□□□ -1.68
IMPG1Q17R60 AC107918.3-201ENST00000533272 382 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
IMPG1Q17R60 TAS2R46-201ENST00000533467 930 ntAPPRIS P1 BASIC4.54□□□□□ -1.68
IMPG1Q17R60 AC104938.1-202ENST00000563041 630 ntTSL 3 BASIC4.54□□□□□ -1.68
IMPG1Q17R60 AL008729.2-201ENST00000606393 473 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
IMPG1Q17R60 AC026979.4-201ENST00000606555 645 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
IMPG1Q17R60 AL159169.2-201ENST00000610061 1269 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
IMPG1Q17R60 AC134980.1-203ENST00000640541 570 ntTSL 4 BASIC4.54□□□□□ -1.68
IMPG1Q17R60 NCLP2-201ENST00000416078 1462 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
IMPG1Q17R60 C4BPAP1-201ENST00000415474 1893 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
IMPG1Q17R60 DLD-204ENST00000437604 1859 ntTSL 2 BASIC4.54□□□□□ -1.68
IMPG1Q17R60 POSTN-210ENST00000541481 3113 ntTSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
IMPG1Q17R60 ZNF780B-202ENST00000434248 8665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.53□□□□□ -1.68
IMPG1Q17R60 ZNF780B-207ENST00000617676 8664 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.53□□□□□ -1.68
IMPG1Q17R60 AL355852.1-201ENST00000454081 1771 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
IMPG1Q17R60 STARD4-201ENST00000296632 4606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.53□□□□□ -1.68
IMPG1Q17R60 TPRG1-201ENST00000345063 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
IMPG1Q17R60 AC007382.1-201ENST00000624376 2618 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
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