Protein–RNA interactions for Protein: Q15906

VPS72, Vacuolar protein sorting-associated protein 72 homolog, humanhuman

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Length 364 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS72Q15906 NAP1L1-227ENST00000618691 13505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
VPS72Q15906 HMMR-204ENST00000432118 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.73□□□□□ -1.33
VPS72Q15906 NCOA7-202ENST00000368357 5521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
VPS72Q15906 PLCB4-201ENST00000278655 5430 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
VPS72Q15906 AL033543.1-201ENST00000623440 13454 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
VPS72Q15906 LMO3-235ENST00000616247 3227 ntTSL 5 BASIC6.73□□□□□ -1.33
VPS72Q15906 OR6C4-203ENST00000641851 4989 ntAPPRIS P1 BASIC6.73□□□□□ -1.33
VPS72Q15906 UGT2B26P-201ENST00000508672 1613 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
VPS72Q15906 IKZF2-210ENST00000451136 9344 ntTSL 5 BASIC6.73□□□□□ -1.33
VPS72Q15906 ITCH-207ENST00000535650 2940 ntTSL 2 BASIC6.73□□□□□ -1.33
VPS72Q15906 HIST1H1A-201ENST00000244573 648 ntAPPRIS P1 BASIC6.73□□□□□ -1.33
VPS72Q15906 OR4K17-201ENST00000315543 1032 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
VPS72Q15906 DNAH14-203ENST00000366848 929 ntTSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
VPS72Q15906 UBE2U-201ENST00000371076 1136 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
VPS72Q15906 RNU6-40P-201ENST00000384254 107 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
VPS72Q15906 AL136131.1-201ENST00000406079 803 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
VPS72Q15906 AC003092.2-201ENST00000411946 446 ntTSL 2 BASIC6.73□□□□□ -1.33
VPS72Q15906 AL354726.1-201ENST00000411981 402 ntTSL 2 BASIC6.73□□□□□ -1.33
VPS72Q15906 LINC00463-201ENST00000413501 1147 ntTSL 3 BASIC6.73□□□□□ -1.33
VPS72Q15906 FAM53B-AS1-201ENST00000432699 558 ntTSL 2 BASIC6.73□□□□□ -1.33
VPS72Q15906 BMS1P19-201ENST00000433925 393 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
VPS72Q15906 AL161722.2-201ENST00000434731 981 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
VPS72Q15906 NPM1P33-201ENST00000438918 872 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
VPS72Q15906 AL161912.1-201ENST00000448475 524 ntTSL 3 BASIC6.73□□□□□ -1.33
VPS72Q15906 PLSCR5-203ENST00000492200 1058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.73□□□□□ -1.33
VPS72Q15906 MTCO1P31-201ENST00000506355 492 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
VPS72Q15906 AC025674.1-201ENST00000507074 324 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
VPS72Q15906 AC091912.1-201ENST00000511351 248 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
VPS72Q15906 LINC01216-201ENST00000515728 824 ntTSL 5 BASIC6.73□□□□□ -1.33
VPS72Q15906 MTND2P32-201ENST00000521584 1038 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
VPS72Q15906 AC131254.2-201ENST00000521908 550 ntTSL 3 BASIC6.73□□□□□ -1.33
VPS72Q15906 AC012339.2-201ENST00000523996 453 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
VPS72Q15906 AP001978.1-201ENST00000526851 834 ntTSL 2 BASIC6.73□□□□□ -1.33
VPS72Q15906 OR5M2P-201ENST00000529003 936 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
VPS72Q15906 GLRXP2-201ENST00000555594 321 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
VPS72Q15906 AL162872.1-201ENST00000557709 448 ntTSL 3 BASIC6.73□□□□□ -1.33
VPS72Q15906 AC122134.1-201ENST00000565664 1104 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
VPS72Q15906 LINC02185-202ENST00000576797 568 ntTSL 3 BASIC6.73□□□□□ -1.33
VPS72Q15906 DAB1-AS1-208ENST00000586465 748 ntTSL 5 BASIC6.73□□□□□ -1.33
VPS72Q15906 AL163051.2-201ENST00000618976 735 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
VPS72Q15906 MIR6853-201ENST00000619642 74 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
VPS72Q15906 AC068787.1-201ENST00000623908 691 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
VPS72Q15906 AC120349.3-201ENST00000624377 529 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
VPS72Q15906 AC004808.1-201ENST00000627671 721 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
VPS72Q15906 NEK3-211ENST00000629912 141 ntTSL 5 BASIC6.73□□□□□ -1.33
VPS72Q15906 AC013437.2-201ENST00000639587 677 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
VPS72Q15906 LINC01422-201ENST00000434868 6043 ntTSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
VPS72Q15906 CYP2C8-201ENST00000371270 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
VPS72Q15906 UNC79-203ENST00000553484 9100 ntTSL 5 BASIC6.73□□□□□ -1.33
VPS72Q15906 CCT8P1-201ENST00000413611 1657 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
VPS72Q15906 ST8SIA4-201ENST00000231461 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
VPS72Q15906 SAMD13-201ENST00000370668 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
VPS72Q15906 NRCAM-202ENST00000379022 3900 ntTSL 5 BASIC6.73□□□□□ -1.33
VPS72Q15906 FOXP2-209ENST00000393498 2617 ntTSL 5 BASIC6.73□□□□□ -1.33
VPS72Q15906 AC005725.1-201ENST00000577346 2607 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
VPS72Q15906 TTC6-202ENST00000382320 1972 ntTSL 2 BASIC6.73□□□□□ -1.33
VPS72Q15906 FAM135A-202ENST00000361499 5042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
VPS72Q15906 AL359538.1-201ENST00000453498 1710 ntTSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
VPS72Q15906 AC239809.3-214ENST00000496508 2513 ntTSL 2 BASIC6.73□□□□□ -1.33
VPS72Q15906 WDHD1-201ENST00000360586 5996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
VPS72Q15906 TBC1D23-201ENST00000344949 3656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
VPS72Q15906 AC020656.2-201ENST00000613291 5309 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
VPS72Q15906 GLRA2-204ENST00000443437 3182 ntTSL 2 BASIC6.72□□□□□ -1.33
VPS72Q15906 DCC-203ENST00000442544 10206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
VPS72Q15906 EED-203ENST00000351625 1696 ntTSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
VPS72Q15906 FAM216B-201ENST00000313851 3243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
VPS72Q15906 OR6C74-201ENST00000343870 1105 ntAPPRIS P1 BASIC6.72□□□□□ -1.33
VPS72Q15906 DSCR8-201ENST00000357704 552 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC6.72□□□□□ -1.33
VPS72Q15906 RNA5SP447-201ENST00000363749 119 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
VPS72Q15906 RNU1-74P-201ENST00000384108 171 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
VPS72Q15906 DSCR8-202ENST00000400477 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
VPS72Q15906 AC002064.2-201ENST00000420245 289 ntTSL 3 BASIC6.72□□□□□ -1.33
VPS72Q15906 AC106053.1-201ENST00000431697 368 ntTSL 3 BASIC6.72□□□□□ -1.33
VPS72Q15906 CETN4P-201ENST00000432407 469 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
VPS72Q15906 BX323845.1-201ENST00000432417 179 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
VPS72Q15906 AC004854.1-201ENST00000440356 349 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
VPS72Q15906 AL049552.1-201ENST00000444302 577 ntTSL 2 BASIC6.72□□□□□ -1.33
VPS72Q15906 AC114814.3-201ENST00000449362 663 ntTSL 2 BASIC6.72□□□□□ -1.33
VPS72Q15906 AC083899.1-201ENST00000454465 3819 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
VPS72Q15906 AC096543.1-201ENST00000455038 823 ntTSL 3 BASIC6.72□□□□□ -1.33
VPS72Q15906 AC073636.1-202ENST00000457756 558 ntTSL 4 BASIC6.72□□□□□ -1.33
VPS72Q15906 MME-AS1-201ENST00000484721 828 ntTSL 2 BASIC6.72□□□□□ -1.33
VPS72Q15906 NIP7P2-201ENST00000485801 544 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
VPS72Q15906 AC021146.5-201ENST00000503544 545 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
VPS72Q15906 LINC01339-201ENST00000505712 440 ntTSL 2 BASIC6.72□□□□□ -1.33
VPS72Q15906 AC011396.2-202ENST00000511390 375 ntTSL 3 BASIC6.72□□□□□ -1.33
VPS72Q15906 LINC01060-205ENST00000512839 716 ntTSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
VPS72Q15906 MTCYBP19-201ENST00000517463 1124 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
VPS72Q15906 AL451137.1-201ENST00000523363 443 ntTSL 3 BASIC6.72□□□□□ -1.33
VPS72Q15906 AC013644.1-201ENST00000523724 555 ntTSL 4 BASIC6.72□□□□□ -1.33
VPS72Q15906 AC104009.1-203ENST00000531304 571 ntTSL 4 BASIC6.72□□□□□ -1.33
VPS72Q15906 ATPAF1-210ENST00000532925 998 ntTSL 2 BASIC6.72□□□□□ -1.33
VPS72Q15906 AAGAB-203ENST00000542650 1015 ntTSL 2 BASIC6.72□□□□□ -1.33
VPS72Q15906 LINC02156-201ENST00000552320 483 ntTSL 2 BASIC6.72□□□□□ -1.33
VPS72Q15906 AC110023.1-201ENST00000554318 457 ntTSL 3 BASIC6.72□□□□□ -1.33
VPS72Q15906 CKS1BP1-201ENST00000555221 240 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
VPS72Q15906 AL442163.1-201ENST00000557251 515 ntTSL 5 BASIC6.72□□□□□ -1.33
VPS72Q15906 AC015911.9-201ENST00000591634 185 ntTSL 5 BASIC6.72□□□□□ -1.33
VPS72Q15906 AC068020.1-201ENST00000594215 661 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
VPS72Q15906 AC091057.3-201ENST00000602684 733 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
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