Protein–RNA interactions for Protein: Q15573

TAF1A, TATA box-binding protein-associated factor RNA polymerase I subunit A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 450 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF1AQ15573 AC005520.3-201ENST00000602874 370 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
TAF1AQ15573 AC130352.1-201ENST00000602979 661 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
TAF1AQ15573 AC098935.2-201ENST00000604222 466 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
TAF1AQ15573 IMMP1LP1-201ENST00000605170 488 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
TAF1AQ15573 AL359757.1-201ENST00000623176 255 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
TAF1AQ15573 CASP1-217ENST00000640184 327 ntTSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
TAF1AQ15573 SLCO1B7-201ENST00000421593 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
TAF1AQ15573 DYTN-201ENST00000452335 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
TAF1AQ15573 CLVS1-201ENST00000325897 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
TAF1AQ15573 USP29-202ENST00000598197 3284 ntAPPRIS P1 BASIC4.68□□□□□ -1.66
TAF1AQ15573 GPR85-201ENST00000297146 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
TAF1AQ15573 BBX-206ENST00000415149 8930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
TAF1AQ15573 IL1RL1-201ENST00000233954 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
TAF1AQ15573 STAG2-204ENST00000371157 5991 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
TAF1AQ15573 OR56B2P-201ENST00000317102 954 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
TAF1AQ15573 C10orf120-201ENST00000329446 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
TAF1AQ15573 CARD16-201ENST00000375704 613 ntTSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
TAF1AQ15573 MIR1271-201ENST00000408537 86 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
TAF1AQ15573 AL354714.4-201ENST00000427339 575 ntTSL 3 BASIC4.68□□□□□ -1.66
TAF1AQ15573 AC068491.2-201ENST00000438897 617 ntTSL 2 BASIC4.68□□□□□ -1.66
TAF1AQ15573 AC108463.1-201ENST00000450258 347 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
TAF1AQ15573 AL645937.3-201ENST00000453647 936 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
TAF1AQ15573 AL445433.1-201ENST00000457507 257 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
TAF1AQ15573 RNU7-157P-201ENST00000459600 66 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
TAF1AQ15573 AC083982.1-201ENST00000485679 344 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
TAF1AQ15573 ATXN3-206ENST00000502250 1259 ntTSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
TAF1AQ15573 BMPR1B-204ENST00000502683 567 ntTSL 4 BASIC4.68□□□□□ -1.66
TAF1AQ15573 AC106864.2-201ENST00000505632 740 ntTSL 2 BASIC4.68□□□□□ -1.66
TAF1AQ15573 AC005699.1-205ENST00000510639 427 ntTSL 2 BASIC4.68□□□□□ -1.66
TAF1AQ15573 IGKV1-32-201ENST00000519290 311 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
TAF1AQ15573 AC022784.7-201ENST00000520017 651 ntTSL 3 BASIC4.68□□□□□ -1.66
TAF1AQ15573 CARD16-203ENST00000525374 503 ntTSL 3 BASIC4.68□□□□□ -1.66
TAF1AQ15573 OR5M11-201ENST00000528616 1020 ntAPPRIS P1 BASIC4.68□□□□□ -1.66
TAF1AQ15573 MRE11-209ENST00000540013 1212 ntTSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
TAF1AQ15573 DUXA-201ENST00000554048 1006 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.68□□□□□ -1.66
TAF1AQ15573 LINC00511-212ENST00000581183 657 ntTSL 3 BASIC4.68□□□□□ -1.66
TAF1AQ15573 COX6CP4-201ENST00000605798 228 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
TAF1AQ15573 FAM25E-202ENST00000608562 189 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
TAF1AQ15573 AC097505.1-201ENST00000610199 565 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
TAF1AQ15573 AL049539.1-201ENST00000611964 459 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
TAF1AQ15573 RDM1-215ENST00000612980 501 ntTSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
TAF1AQ15573 AC022106.2-201ENST00000620114 757 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
TAF1AQ15573 AL596218.1-201ENST00000634239 1140 ntTSL 5 BASIC4.68□□□□□ -1.66
TAF1AQ15573 AC092821.1-204ENST00000518709 3552 ntTSL 5 BASIC4.68□□□□□ -1.66
TAF1AQ15573 AC079062.1-203ENST00000581862 3610 ntTSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
TAF1AQ15573 PCDH15-214ENST00000395446 3948 ntTSL 5 BASIC4.68□□□□□ -1.66
TAF1AQ15573 ZNF28-204ENST00000457749 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
TAF1AQ15573 CP-201ENST00000264613 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
TAF1AQ15573 OR2H1-203ENST00000377136 3024 ntAPPRIS P1 BASIC4.67□□□□□ -1.66
TAF1AQ15573 KIF21A-201ENST00000361418 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
TAF1AQ15573 AC245100.2-201ENST00000454544 1679 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
TAF1AQ15573 LINC01361-202ENST00000452834 1526 ntTSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
TAF1AQ15573 EIF2AK2-201ENST00000233057 10042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.67□□□□□ -1.66
TAF1AQ15573 MAPK10-286ENST00000641208 8747 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
TAF1AQ15573 ING3-205ENST00000445699 1723 ntTSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
TAF1AQ15573 CASC8-203ENST00000502082 1420 ntTSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
TAF1AQ15573 MAPK10-320ENST00000641462 6696 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
TAF1AQ15573 CKS1B-201ENST00000308987 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
TAF1AQ15573 NUDT6-202ENST00000339154 1065 ntTSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
TAF1AQ15573 RN7SKP115-201ENST00000363177 317 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
TAF1AQ15573 OR51I1-201ENST00000380211 945 ntAPPRIS P1 BASIC4.67□□□□□ -1.66
TAF1AQ15573 OR51A2-201ENST00000380371 942 ntAPPRIS P1 BASIC4.67□□□□□ -1.66
TAF1AQ15573 AC007068.1-201ENST00000396690 844 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
TAF1AQ15573 Z98745.1-201ENST00000402553 494 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
TAF1AQ15573 AL133270.1-201ENST00000402635 279 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
TAF1AQ15573 AL020993.1-201ENST00000420172 297 ntTSL 3 BASIC4.67□□□□□ -1.66
TAF1AQ15573 AL132796.1-201ENST00000421617 479 ntTSL 3 BASIC4.67□□□□□ -1.66
TAF1AQ15573 AL034379.1-201ENST00000423216 253 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
TAF1AQ15573 AC012519.1-201ENST00000424588 610 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
TAF1AQ15573 LINC01350-201ENST00000436955 642 ntTSL 3 BASIC4.67□□□□□ -1.66
TAF1AQ15573 LINC01150-201ENST00000455671 315 ntTSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
TAF1AQ15573 AP000942.1-201ENST00000463969 747 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
TAF1AQ15573 RPL7AP10-201ENST00000481016 791 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
TAF1AQ15573 RPL36AP41-201ENST00000493820 306 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
TAF1AQ15573 AC098799.3-201ENST00000506095 438 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
TAF1AQ15573 AL033397.2-201ENST00000508884 547 ntTSL 2 BASIC4.67□□□□□ -1.66
TAF1AQ15573 LINC02234-202ENST00000513288 705 ntTSL 5 BASIC4.67□□□□□ -1.66
TAF1AQ15573 OR7H2P-201ENST00000513483 306 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
TAF1AQ15573 G2E3-AS1-201ENST00000548631 579 ntTSL 3 BASIC4.67□□□□□ -1.66
TAF1AQ15573 AC025035.1-201ENST00000551571 894 ntTSL 2 BASIC4.67□□□□□ -1.66
TAF1AQ15573 AC104002.2-201ENST00000553919 318 ntTSL 5 BASIC4.67□□□□□ -1.66
TAF1AQ15573 AC103876.1-201ENST00000568634 418 ntTSL 3 BASIC4.67□□□□□ -1.66
TAF1AQ15573 AC015912.2-201ENST00000571053 181 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
TAF1AQ15573 AP001005.3-201ENST00000622049 129 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
TAF1AQ15573 PRKCQ-AS1-218ENST00000624974 1132 ntTSL 5 BASIC4.67□□□□□ -1.66
TAF1AQ15573 LINC02085-201ENST00000465215 2051 ntTSL 2 BASIC4.67□□□□□ -1.66
TAF1AQ15573 POLR2B-203ENST00000431623 3666 ntTSL 2 BASIC4.67□□□□□ -1.66
TAF1AQ15573 ADNP-201ENST00000349014 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
TAF1AQ15573 PTCD2-202ENST00000380639 11151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.67□□□□□ -1.66
TAF1AQ15573 LIMA1-214ENST00000552783 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
TAF1AQ15573 NAIP-210ENST00000523981 4543 ntTSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
TAF1AQ15573 USP44-201ENST00000258499 4022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
TAF1AQ15573 SLC44A5-201ENST00000370855 4406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.66□□□□□ -1.66
TAF1AQ15573 CLEC1B-204ENST00000428126 3054 ntTSL 1 (best) BASIC4.66□□□□□ -1.66
TAF1AQ15573 NECAB1-202ENST00000521366 2908 ntTSL 1 (best) BASIC4.66□□□□□ -1.66
TAF1AQ15573 ZNF445-201ENST00000396077 18299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.66□□□□□ -1.66
TAF1AQ15573 CEP192-203ENST00000506447 7960 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.66□□□□□ -1.66
TAF1AQ15573 PTPN13-201ENST00000316707 7546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.66□□□□□ -1.66
TAF1AQ15573 MAPK10-349ENST00000641767 3661 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
TAF1AQ15573 AC135352.1-201ENST00000506173 1418 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 109.2 ms