Protein–RNA interactions for Protein: Q15431

SYCP1, Synaptonemal complex protein 1, humanhuman

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Length 976 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCP1Q15431 AL138767.2-201ENST00000446794 168 ntTSL 3 BASIC5.34□□□□□ -1.55
SYCP1Q15431 AL359715.2-201ENST00000452402 682 ntTSL 2 BASIC5.34□□□□□ -1.55
SYCP1Q15431 HSPE1P22-201ENST00000456856 327 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
SYCP1Q15431 RN7SL172P-201ENST00000460535 303 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
SYCP1Q15431 RPS26P28-201ENST00000470806 348 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
SYCP1Q15431 RN7SL244P-201ENST00000493405 297 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
SYCP1Q15431 AC055758.1-201ENST00000494509 569 ntTSL 3 BASIC5.34□□□□□ -1.55
SYCP1Q15431 AC008638.1-201ENST00000506035 866 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
SYCP1Q15431 COX6B1P5-201ENST00000509843 249 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
SYCP1Q15431 AC097515.1-202ENST00000511818 371 ntTSL 3 BASIC5.34□□□□□ -1.55
SYCP1Q15431 LINC00535-202ENST00000517785 264 ntTSL 3 BASIC5.34□□□□□ -1.55
SYCP1Q15431 AC018793.4-201ENST00000524542 585 ntAPPRIS P1 BASIC5.34□□□□□ -1.55
SYCP1Q15431 OR7E128P-201ENST00000532736 1024 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
SYCP1Q15431 TAS2R46-201ENST00000533467 930 ntAPPRIS P1 BASIC5.34□□□□□ -1.55
SYCP1Q15431 AL359232.1-201ENST00000556361 442 ntTSL 3 BASIC5.34□□□□□ -1.55
SYCP1Q15431 AC005324.5-201ENST00000584540 571 ntTSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.55
SYCP1Q15431 AC092683.1-203ENST00000594050 654 ntTSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.55
SYCP1Q15431 IGKV2OR2-2-201ENST00000605025 300 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
SYCP1Q15431 AC087783.2-201ENST00000605070 562 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
SYCP1Q15431 5_8S_rRNA.1-201ENST00000614365 152 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
SYCP1Q15431 AC005911.1-201ENST00000619883 456 ntTSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.55
SYCP1Q15431 ZNF479-203ENST00000620639 1239 ntTSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.55
SYCP1Q15431 AP002967.1-201ENST00000624203 539 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
SYCP1Q15431 AC018793.1-201ENST00000638166 585 ntAPPRIS P1 BASIC5.34□□□□□ -1.55
SYCP1Q15431 IPO11-202ENST00000409296 3564 ntTSL 2 BASIC5.34□□□□□ -1.55
SYCP1Q15431 CTNNA3-203ENST00000433211 10675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
SYCP1Q15431 DDX4-211ENST00000511853 1984 ntTSL 2 BASIC5.34□□□□□ -1.55
SYCP1Q15431 SOS1-203ENST00000426016 8517 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC5.34□□□□□ -1.56
SYCP1Q15431 NUP205-201ENST00000285968 6266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.56
SYCP1Q15431 OBSCN-204ENST00000366707 26772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.33□□□□□ -1.56
SYCP1Q15431 MS4A1-202ENST00000389939 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
SYCP1Q15431 OR9Q2-202ENST00000641291 3774 ntAPPRIS P1 BASIC5.33□□□□□ -1.56
SYCP1Q15431 SYCP1-209ENST00000613524 3034 ntTSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
SYCP1Q15431 CSTA-201ENST00000264474 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
SYCP1Q15431 SNURFL-201ENST00000309296 343 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
SYCP1Q15431 RNU6-1263P-201ENST00000384601 106 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
SYCP1Q15431 Z97832.1-201ENST00000402490 328 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
SYCP1Q15431 C2orf73-203ENST00000405749 576 ntTSL 4 BASIC5.33□□□□□ -1.56
SYCP1Q15431 ARSD-AS1-201ENST00000414053 816 ntTSL 2 BASIC5.33□□□□□ -1.56
SYCP1Q15431 AL603840.1-203ENST00000424357 645 ntTSL 3 BASIC5.33□□□□□ -1.56
SYCP1Q15431 DYNLL1P7-201ENST00000429273 258 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
SYCP1Q15431 AL139819.1-201ENST00000429420 471 ntTSL 3 BASIC5.33□□□□□ -1.56
SYCP1Q15431 LINC01935-201ENST00000431897 437 ntTSL 3 BASIC5.33□□□□□ -1.56
SYCP1Q15431 AC004824.1-201ENST00000439577 311 ntTSL 5 BASIC5.33□□□□□ -1.56
SYCP1Q15431 AC069285.2-201ENST00000440210 275 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
SYCP1Q15431 AC000111.2-201ENST00000448200 210 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
SYCP1Q15431 AP000472.1-201ENST00000452500 530 ntTSL 2 BASIC5.33□□□□□ -1.56
SYCP1Q15431 KIAA0895-209ENST00000453212 956 ntTSL 3 BASIC5.33□□□□□ -1.56
SYCP1Q15431 SEPT14P1-201ENST00000458703 648 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
SYCP1Q15431 AC007000.3-201ENST00000459742 617 ntTSL 3 BASIC5.33□□□□□ -1.56
SYCP1Q15431 RPS18P6-201ENST00000476880 458 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
SYCP1Q15431 AC025445.1-201ENST00000502728 300 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
SYCP1Q15431 MOCS2-205ENST00000508922 1210 ntTSL 5 BASIC5.33□□□□□ -1.56
SYCP1Q15431 IGLV2-28-201ENST00000520681 304 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
SYCP1Q15431 AC079209.1-202ENST00000521953 522 ntTSL 3 BASIC5.33□□□□□ -1.56
SYCP1Q15431 AC114550.3-201ENST00000524073 579 ntTSL 4 BASIC5.33□□□□□ -1.56
SYCP1Q15431 BMPR1APS2-201ENST00000527904 1012 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
SYCP1Q15431 AP001775.2-201ENST00000531710 334 ntTSL 2 BASIC5.33□□□□□ -1.56
SYCP1Q15431 AC108471.2-203ENST00000532680 517 ntTSL 5 BASIC5.33□□□□□ -1.56
SYCP1Q15431 GMDS-AS1-212ENST00000534160 720 ntTSL 3 BASIC5.33□□□□□ -1.56
SYCP1Q15431 TEX49-202ENST00000548380 573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
SYCP1Q15431 AC025263.2-201ENST00000550437 548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.33□□□□□ -1.56
SYCP1Q15431 AC087477.6-201ENST00000559595 843 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
SYCP1Q15431 AC016180.1-201ENST00000567945 403 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
SYCP1Q15431 MOCS2-209ENST00000582677 741 ntTSL 5 BASIC5.33□□□□□ -1.56
SYCP1Q15431 RPL27-207ENST00000590864 569 ntTSL 2 BASIC5.33□□□□□ -1.56
SYCP1Q15431 AC008536.1-201ENST00000602872 669 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
SYCP1Q15431 AC044839.1-205ENST00000614989 542 ntTSL 5 BASIC5.33□□□□□ -1.56
SYCP1Q15431 AL669942.2-201ENST00000620352 697 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
SYCP1Q15431 AC107021.2-201ENST00000567714 2095 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
SYCP1Q15431 AKAP4-201ENST00000358526 2881 ntTSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
SYCP1Q15431 UTP20-201ENST00000261637 9025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
SYCP1Q15431 AL672167.1-203ENST00000641299 2975 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
SYCP1Q15431 IL13RA2-201ENST00000243213 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
SYCP1Q15431 ERICH3-AS1-202ENST00000612390 4874 ntTSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
SYCP1Q15431 SDCBP-213ENST00000630925 2076 ntTSL 5 BASIC5.32□□□□□ -1.56
SYCP1Q15431 ZFHX4-207ENST00000521891 14019 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.32□□□□□ -1.56
SYCP1Q15431 CCDC169-202ENST00000239860 716 ntTSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
SYCP1Q15431 HMGB3P7-201ENST00000400214 611 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
SYCP1Q15431 GLS-204ENST00000409428 816 ntTSL 2 BASIC5.32□□□□□ -1.56
SYCP1Q15431 GSTM3P2-201ENST00000412746 530 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
SYCP1Q15431 ARPP21-AS1-201ENST00000415706 542 ntTSL 4 BASIC5.32□□□□□ -1.56
SYCP1Q15431 TBCAP2-201ENST00000416175 326 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
SYCP1Q15431 BMS1P13-201ENST00000417301 885 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
SYCP1Q15431 AF186996.5-201ENST00000418098 904 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
SYCP1Q15431 LINC01034-201ENST00000448806 277 ntTSL 3 BASIC5.32□□□□□ -1.56
SYCP1Q15431 AP000302.1-201ENST00000450928 666 ntTSL 2 BASIC5.32□□□□□ -1.56
SYCP1Q15431 AURKAPS1-201ENST00000451805 1212 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
SYCP1Q15431 AC115618.2-201ENST00000453810 450 ntTSL 3 BASIC5.32□□□□□ -1.56
SYCP1Q15431 CYP4F62P-203ENST00000455215 552 ntTSL 4 BASIC5.32□□□□□ -1.56
SYCP1Q15431 ATP5G1P3-201ENST00000463301 410 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
SYCP1Q15431 TSACC-207ENST00000470342 601 ntTSL 2 BASIC5.32□□□□□ -1.56
SYCP1Q15431 AC000372.1-201ENST00000488818 646 ntTSL 2 BASIC5.32□□□□□ -1.56
SYCP1Q15431 AC072052.1-201ENST00000496556 306 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
SYCP1Q15431 ZCCHC10-210ENST00000513848 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.32□□□□□ -1.56
SYCP1Q15431 AC062004.1-201ENST00000518706 686 ntTSL 3 BASIC5.32□□□□□ -1.56
SYCP1Q15431 LINC00535-203ENST00000520096 790 ntTSL 3 BASIC5.32□□□□□ -1.56
SYCP1Q15431 SRD5A3-AS1-204ENST00000592823 542 ntTSL 5 BASIC5.32□□□□□ -1.56
SYCP1Q15431 AC010998.2-201ENST00000605549 625 ntTSL 5 BASIC5.32□□□□□ -1.56
SYCP1Q15431 COX6CP4-201ENST00000605798 228 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
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