Protein–RNA interactions for Protein: Q13889

GTF2H3, General transcription factor IIH subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 308 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2H3Q13889 AC090607.5-201ENST00000615692 224 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
GTF2H3Q13889 AL035661.1-201ENST00000620459 1144 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
GTF2H3Q13889 PCDHB2-203ENST00000624874 565 ntTSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
GTF2H3Q13889 ATM-229ENST00000639953 587 ntTSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
GTF2H3Q13889 AC087565.3-203ENST00000641018 837 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
GTF2H3Q13889 UPRT-207ENST00000530743 1636 ntTSL 2 BASIC5.72□□□□□ -1.49
GTF2H3Q13889 AMY1B-201ENST00000330330 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
GTF2H3Q13889 GVINP1-202ENST00000531871 7271 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
GTF2H3Q13889 BBX-201ENST00000325805 3517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
GTF2H3Q13889 ZNF721-201ENST00000338977 4492 ntTSL 2 BASIC5.72□□□□□ -1.49
GTF2H3Q13889 AC011604.2-201ENST00000381541 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.72□□□□□ -1.49
GTF2H3Q13889 AASDH-210ENST00000602986 3480 ntTSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
GTF2H3Q13889 MAPK10-297ENST00000641287 3725 ntAPPRIS P2 BASIC5.72□□□□□ -1.49
GTF2H3Q13889 CACNB4-243ENST00000637217 8188 ntTSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
GTF2H3Q13889 AC091305.2-201ENST00000624049 1576 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
GTF2H3Q13889 C15orf41-201ENST00000338183 2578 ntTSL 5 BASIC5.71□□□□□ -1.49
GTF2H3Q13889 ZNF876P-202ENST00000398732 1485 ntBASIC5.71□□□□□ -1.49
GTF2H3Q13889 RPGRIP1L-212ENST00000621565 6038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.49
GTF2H3Q13889 LRRN3-204ENST00000451085 3725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.71□□□□□ -1.49
GTF2H3Q13889 OR7A5-201ENST00000322301 4216 ntAPPRIS P1 BASIC5.71□□□□□ -1.49
GTF2H3Q13889 CXCL11-201ENST00000306621 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
GTF2H3Q13889 MTND4P8-201ENST00000514997 1362 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
GTF2H3Q13889 TRIM51GP-201ENST00000534741 1350 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
GTF2H3Q13889 AGO3-203ENST00000373191 19687 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.71□□□□□ -1.5
GTF2H3Q13889 LRRC49-201ENST00000260382 2784 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
GTF2H3Q13889 AGTR1-205ENST00000461609 1545 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.71□□□□□ -1.5
GTF2H3Q13889 LYPD6B-201ENST00000280115 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.71□□□□□ -1.5
GTF2H3Q13889 USMG5-201ENST00000309579 364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
GTF2H3Q13889 MIR16-1-201ENST00000385271 89 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
GTF2H3Q13889 RNU11-201ENST00000387069 134 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
GTF2H3Q13889 SNORA40.2-201ENST00000390847 128 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
GTF2H3Q13889 AL138749.1-201ENST00000397864 791 ntTSL 5 BASIC5.71□□□□□ -1.5
GTF2H3Q13889 RN7SKP278-201ENST00000410504 342 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
GTF2H3Q13889 AL355300.1-201ENST00000412439 187 ntTSL 3 BASIC5.71□□□□□ -1.5
GTF2H3Q13889 AL357752.1-201ENST00000412817 349 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
GTF2H3Q13889 AC009965.2-201ENST00000425328 970 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
GTF2H3Q13889 AL159174.1-202ENST00000425588 442 ntTSL 3 BASIC5.71□□□□□ -1.5
GTF2H3Q13889 AC073283.2-202ENST00000426892 591 ntTSL 4 BASIC5.71□□□□□ -1.5
GTF2H3Q13889 CRIP1P1-201ENST00000427567 185 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
GTF2H3Q13889 NPM1P24-201ENST00000428039 894 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
GTF2H3Q13889 CNOT7P1-201ENST00000429006 852 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
GTF2H3Q13889 AL022331.1-201ENST00000429025 477 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
GTF2H3Q13889 AC005008.2-201ENST00000431501 715 ntTSL 3 BASIC5.71□□□□□ -1.5
GTF2H3Q13889 RPS29P14-201ENST00000431518 171 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
GTF2H3Q13889 USP24P1-201ENST00000433802 779 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
GTF2H3Q13889 LINC01052-201ENST00000437777 496 ntTSL 3 BASIC5.71□□□□□ -1.5
GTF2H3Q13889 AC092013.1-201ENST00000438795 332 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
GTF2H3Q13889 LINC00380-201ENST00000442478 353 ntTSL 2 BASIC5.71□□□□□ -1.5
GTF2H3Q13889 AL591848.2-201ENST00000442712 522 ntTSL 3 BASIC5.71□□□□□ -1.5
GTF2H3Q13889 AC007327.1-201ENST00000447461 264 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
GTF2H3Q13889 AC005518.1-201ENST00000448131 1116 ntTSL 2 BASIC5.71□□□□□ -1.5
GTF2H3Q13889 AC115989.1-202ENST00000452153 1150 ntTSL 2 BASIC5.71□□□□□ -1.5
GTF2H3Q13889 AL158069.1-201ENST00000454131 455 ntTSL 5 BASIC5.71□□□□□ -1.5
GTF2H3Q13889 RPS23P2-201ENST00000463671 415 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
GTF2H3Q13889 RPL35AP19-201ENST00000469425 329 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
GTF2H3Q13889 AC007998.1-201ENST00000474156 672 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
GTF2H3Q13889 SLC9A9-AS2-201ENST00000490153 327 ntTSL 5 BASIC5.71□□□□□ -1.5
GTF2H3Q13889 OR7E157P-201ENST00000494376 911 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
GTF2H3Q13889 RPL7L1P4-201ENST00000513004 707 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
GTF2H3Q13889 SNORD46.2-201ENST00000516021 102 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
GTF2H3Q13889 AC020937.1-201ENST00000519677 1013 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
GTF2H3Q13889 AC078899.1-201ENST00000521432 1185 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
GTF2H3Q13889 OSGEPL1-AS1-203ENST00000523895 567 ntTSL 4 BASIC5.71□□□□□ -1.5
GTF2H3Q13889 ARL6IP1P3-201ENST00000524544 560 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
GTF2H3Q13889 CCDC179-202ENST00000532798 791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.71□□□□□ -1.5
GTF2H3Q13889 NAV2-AS3-201ENST00000534036 598 ntTSL 3 BASIC5.71□□□□□ -1.5
GTF2H3Q13889 AC092747.2-201ENST00000545069 983 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
GTF2H3Q13889 GNG2-208ENST00000554875 430 ntTSL 5 BASIC5.71□□□□□ -1.5
GTF2H3Q13889 AC020891.3-201ENST00000560011 363 ntTSL 3 BASIC5.71□□□□□ -1.5
GTF2H3Q13889 AC009097.1-201ENST00000567077 406 ntTSL 3 BASIC5.71□□□□□ -1.5
GTF2H3Q13889 AP001269.3-201ENST00000588718 329 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
GTF2H3Q13889 AC008751.2-201ENST00000597885 980 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
GTF2H3Q13889 AC068790.7-201ENST00000602347 528 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
GTF2H3Q13889 AL513327.3-201ENST00000602618 469 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
GTF2H3Q13889 AL360012.1-201ENST00000602813 131 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
GTF2H3Q13889 AP002791.1-201ENST00000623291 381 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
GTF2H3Q13889 LINC01125-249ENST00000627399 1067 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.71□□□□□ -1.5
GTF2H3Q13889 AJ009632.2-207ENST00000634659 527 ntTSL 5 BASIC5.71□□□□□ -1.5
GTF2H3Q13889 DYNC1I2-207ENST00000410079 2159 ntTSL 2 BASIC5.71□□□□□ -1.5
GTF2H3Q13889 LINC01619-203ENST00000549802 2169 ntTSL 2 BASIC5.71□□□□□ -1.5
GTF2H3Q13889 AC027228.2-201ENST00000567141 2154 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
GTF2H3Q13889 FILIP1-203ENST00000393004 7807 ntTSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
GTF2H3Q13889 ADGRG2-203ENST00000356606 4630 ntTSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
GTF2H3Q13889 PEX5L-202ENST00000392649 8540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.71□□□□□ -1.5
GTF2H3Q13889 PTPRB-202ENST00000334414 12316 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
GTF2H3Q13889 DAB2-209ENST00000509337 2740 ntTSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
GTF2H3Q13889 NPHP1-204ENST00000417665 2246 ntTSL 5 BASIC5.71□□□□□ -1.5
GTF2H3Q13889 ZNF701-202ENST00000391785 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
GTF2H3Q13889 ALB-209ENST00000503124 1741 ntTSL 5 BASIC5.71□□□□□ -1.5
GTF2H3Q13889 ATF2-212ENST00000426833 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
GTF2H3Q13889 PPP2R5E-202ENST00000422769 3478 ntTSL 2 BASIC5.71□□□□□ -1.5
GTF2H3Q13889 ZNF195-201ENST00000005082 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
GTF2H3Q13889 XRN1-201ENST00000264951 10143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
GTF2H3Q13889 AC022031.1-201ENST00000585985 2593 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
GTF2H3Q13889 AP000756.2-201ENST00000624168 2567 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
GTF2H3Q13889 FHL1-218ENST00000543669 2878 ntTSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
GTF2H3Q13889 PTPRO-210ENST00000544244 3978 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.7□□□□□ -1.5
GTF2H3Q13889 AQP9-201ENST00000219919 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
GTF2H3Q13889 MBNL1-203ENST00000324196 5225 ntTSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
GTF2H3Q13889 MCM9-209ENST00000619706 4822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 150.5 ms