Protein–RNA interactions for Protein: Q13698

CACNA1S, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1S, humanhuman

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Length 1,873 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1SQ13698 Y_RNA.719-201ENST00000517156 106 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
CACNA1SQ13698 MTCO1P49-201ENST00000523429 802 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
CACNA1SQ13698 OR8A2P-201ENST00000528631 952 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
CACNA1SQ13698 AP003557.1-202ENST00000528978 562 ntTSL 4 BASIC5.67□□□□□ -1.5
CACNA1SQ13698 AC015660.2-201ENST00000561362 323 ntTSL 3 BASIC5.67□□□□□ -1.5
CACNA1SQ13698 AC011468.1-201ENST00000569091 675 ntTSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
CACNA1SQ13698 AC020634.1-201ENST00000608701 549 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
CACNA1SQ13698 YWHAEP7-201ENST00000617508 639 ntTSL 3 BASIC5.67□□□□□ -1.5
CACNA1SQ13698 AC140479.6-201ENST00000633535 357 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
CACNA1SQ13698 AC100778.3-201ENST00000580060 1750 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
CACNA1SQ13698 UPF2-201ENST00000356352 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
CACNA1SQ13698 SLC1A2-203ENST00000395753 11689 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC5.67□□□□□ -1.5
CACNA1SQ13698 PTER-201ENST00000298942 3448 ntTSL 5 BASIC5.67□□□□□ -1.5
CACNA1SQ13698 CNTNAP4-205ENST00000476707 4355 ntTSL 2 BASIC5.67□□□□□ -1.5
CACNA1SQ13698 MYO5A-201ENST00000356338 11971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
CACNA1SQ13698 FNIP1-201ENST00000307954 6366 ntTSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
CACNA1SQ13698 MBNL1-204ENST00000324210 5465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
CACNA1SQ13698 AC007750.1-202ENST00000418968 4098 ntTSL 5 BASIC5.67□□□□□ -1.5
CACNA1SQ13698 PLCB4-201ENST00000278655 5430 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
CACNA1SQ13698 ZNF567-203ENST00000585696 3734 ntTSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
CACNA1SQ13698 ADGRL3-217ENST00000514591 6297 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
CACNA1SQ13698 GUCA1C-201ENST00000261047 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
CACNA1SQ13698 PSD3-201ENST00000286485 6665 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
CACNA1SQ13698 AC021146.4-201ENST00000309229 279 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
CACNA1SQ13698 TRAV35-201ENST00000390462 330 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
CACNA1SQ13698 E2F6P2-201ENST00000420708 748 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
CACNA1SQ13698 RHEBP2-201ENST00000450289 600 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
CACNA1SQ13698 NDUFB2-213ENST00000476470 482 ntTSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
CACNA1SQ13698 AC073525.1-201ENST00000549762 543 ntTSL 3 BASIC5.66□□□□□ -1.5
CACNA1SQ13698 AP005901.4-201ENST00000577336 569 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
CACNA1SQ13698 AC245389.1-201ENST00000605141 529 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
CACNA1SQ13698 AC009120.7-201ENST00000623452 780 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
CACNA1SQ13698 SLC26A7-201ENST00000276609 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
CACNA1SQ13698 LINC01619-207ENST00000551843 2205 ntTSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
CACNA1SQ13698 DTNA-206ENST00000399121 6490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
CACNA1SQ13698 DMD-211ENST00000378707 7410 ntTSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
CACNA1SQ13698 Z94721.2-201ENST00000609590 5310 ntTSL 2 BASIC5.66□□□□□ -1.5
CACNA1SQ13698 ZEB1-205ENST00000446923 6267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
CACNA1SQ13698 RAD51AP1-202ENST00000352618 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
CACNA1SQ13698 AC089984.1-201ENST00000552780 1431 ntTSL 3 BASIC5.66□□□□□ -1.5
CACNA1SQ13698 CLSPN-203ENST00000373220 3977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
CACNA1SQ13698 CRYZ-203ENST00000370871 1292 ntTSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
CACNA1SQ13698 AC009237.10-201ENST00000414112 510 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
CACNA1SQ13698 AC062021.1-201ENST00000429008 557 ntTSL 4 BASIC5.66□□□□□ -1.5
CACNA1SQ13698 SCP2-206ENST00000430330 938 ntTSL 2 BASIC5.66□□□□□ -1.5
CACNA1SQ13698 FMR1-IT1-201ENST00000441414 343 ntTSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
CACNA1SQ13698 AC010476.1-201ENST00000519111 851 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
CACNA1SQ13698 AC004596.1-201ENST00000586560 528 ntTSL 3 BASIC5.66□□□□□ -1.5
CACNA1SQ13698 AL050403.2-203ENST00000603180 558 ntTSL 4 BASIC5.66□□□□□ -1.5
CACNA1SQ13698 OR2L1P-202ENST00000641567 1023 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
CACNA1SQ13698 ZNF546-201ENST00000347077 7987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
CACNA1SQ13698 AL391684.1-202ENST00000641293 1636 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
CACNA1SQ13698 COPB2-205ENST00000507777 3034 ntTSL 2 BASIC5.65□□□□□ -1.5
CACNA1SQ13698 BX322639.1-201ENST00000609841 6590 ntTSL 4 BASIC5.65□□□□□ -1.5
CACNA1SQ13698 SLC4A4-202ENST00000340595 7640 ntTSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
CACNA1SQ13698 AC011755.1-201ENST00000623763 2049 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
CACNA1SQ13698 WDR12-201ENST00000261015 8100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
CACNA1SQ13698 FTO-203ENST00000460382 1517 ntTSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.5
CACNA1SQ13698 RN7SKP224-201ENST00000364140 325 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
CACNA1SQ13698 RN7SKP280-201ENST00000364196 304 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
CACNA1SQ13698 RNA5SP187-201ENST00000384400 119 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
CACNA1SQ13698 ATP5F1P2-201ENST00000398143 760 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
CACNA1SQ13698 AC012506.4-201ENST00000421563 541 ntTSL 4 BASIC5.65□□□□□ -1.5
CACNA1SQ13698 AC239803.1-202ENST00000432038 590 ntTSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
CACNA1SQ13698 AC068756.1-201ENST00000482003 403 ntTSL 2 BASIC5.65□□□□□ -1.5
CACNA1SQ13698 SAP18P1-201ENST00000512058 390 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
CACNA1SQ13698 NPM1P41-201ENST00000512920 831 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
CACNA1SQ13698 AC090286.3-201ENST00000573133 187 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
CACNA1SQ13698 AL356056.1-205ENST00000608904 651 ntTSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.5
CACNA1SQ13698 DARS-AS1-225ENST00000615163 824 ntTSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.5
CACNA1SQ13698 ZYXP1-201ENST00000617638 118 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
CACNA1SQ13698 ARHGAP20-204ENST00000528829 5880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
CACNA1SQ13698 MPHOSPH9-220ENST00000606320 6351 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.51
CACNA1SQ13698 EIF3H-209ENST00000521861 3959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.51
CACNA1SQ13698 ZNF726-205ENST00000575986 1522 ntTSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.51
CACNA1SQ13698 SNORD46.1-201ENST00000364139 104 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
CACNA1SQ13698 RNA5SP283-201ENST00000365604 119 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
CACNA1SQ13698 COX6CP15-201ENST00000426313 211 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
CACNA1SQ13698 RPL23AP52-201ENST00000439311 478 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
CACNA1SQ13698 KCND3-IT1-201ENST00000439736 376 ntTSL 3 BASIC5.64□□□□□ -1.51
CACNA1SQ13698 HSFY6P-201ENST00000445573 403 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
CACNA1SQ13698 snoU13.22-201ENST00000459428 104 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
CACNA1SQ13698 AC022140.1-201ENST00000511029 565 ntTSL 3 BASIC5.64□□□□□ -1.51
CACNA1SQ13698 LINC02443-204ENST00000544717 754 ntTSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
CACNA1SQ13698 AL355096.1-201ENST00000553561 447 ntTSL 3 BASIC5.64□□□□□ -1.51
CACNA1SQ13698 LINC00911-201ENST00000555272 546 ntTSL 2 BASIC5.64□□□□□ -1.51
CACNA1SQ13698 C6orf10-210ENST00000617061 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
CACNA1SQ13698 GABRG2-202ENST00000361925 3767 ntTSL 3 BASIC5.64□□□□□ -1.51
CACNA1SQ13698 BBOX1-202ENST00000525090 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
CACNA1SQ13698 AC108467.2-201ENST00000617640 1597 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
CACNA1SQ13698 AL031119.1-201ENST00000404707 1879 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
CACNA1SQ13698 MYBPC1-202ENST00000361685 3871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
CACNA1SQ13698 IFIT2-203ENST00000638108 3703 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
CACNA1SQ13698 PEX5L-202ENST00000392649 8540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
CACNA1SQ13698 GPR174-201ENST00000276077 1258 ntAPPRIS P1 BASIC5.64□□□□□ -1.51
CACNA1SQ13698 RPS27AP11-201ENST00000402798 447 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
CACNA1SQ13698 CEACAMP8-201ENST00000413902 580 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
CACNA1SQ13698 TMBIM7P-201ENST00000418074 855 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
CACNA1SQ13698 AL451062.2-201ENST00000427515 271 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
CACNA1SQ13698 TCEA1P3-201ENST00000443005 880 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
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