Protein–RNA interactions for Protein: Q13618

CUL3, Cullin-3, humanhuman

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Length 768 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL3Q13618 FAM216B-201ENST00000313851 3243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
CUL3Q13618 LIX1-201ENST00000274382 4026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
CUL3Q13618 NCOA3-201ENST00000371997 6750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
CUL3Q13618 EXO1-208ENST00000518483 2899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
CUL3Q13618 CDH8-205ENST00000577730 8009 ntTSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
CUL3Q13618 SCARNA15-201ENST00000607520 4325 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
CUL3Q13618 SLMAP-206ENST00000428312 4132 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
CUL3Q13618 LINC02389-201ENST00000535058 3546 ntTSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
CUL3Q13618 DSCR8-201ENST00000357704 552 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
CUL3Q13618 AL034376.1-201ENST00000380106 484 ntTSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
CUL3Q13618 OR51B6-201ENST00000380219 939 ntAPPRIS P1 BASIC5□□□□□ -1.61
CUL3Q13618 SNORA67-201ENST00000384423 137 ntBASIC5□□□□□ -1.61
CUL3Q13618 DSCR8-202ENST00000400477 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
CUL3Q13618 ATG4AP1-201ENST00000416893 538 ntBASIC5□□□□□ -1.61
CUL3Q13618 AC009238.2-201ENST00000431026 355 ntBASIC5□□□□□ -1.61
CUL3Q13618 AC015923.1-201ENST00000435892 305 ntTSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
CUL3Q13618 RPL7AP61-201ENST00000443410 636 ntBASIC5□□□□□ -1.61
CUL3Q13618 AL442224.1-201ENST00000443771 391 ntTSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
CUL3Q13618 AC017067.1-201ENST00000448570 447 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
CUL3Q13618 AL161630.1-201ENST00000450938 1299 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
CUL3Q13618 CYCSP53-201ENST00000455540 265 ntBASIC5□□□□□ -1.61
CUL3Q13618 AC091976.1-201ENST00000458002 448 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
CUL3Q13618 CABYRP1-201ENST00000465493 1045 ntBASIC5□□□□□ -1.61
CUL3Q13618 RABGAP1L-214ENST00000478442 648 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
CUL3Q13618 RPS4XP20-201ENST00000505751 772 ntBASIC5□□□□□ -1.61
CUL3Q13618 LINC02480-201ENST00000511875 612 ntTSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
CUL3Q13618 MYLK-AS2-202ENST00000515464 754 ntTSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
CUL3Q13618 RNA5SP362-201ENST00000516048 118 ntBASIC5□□□□□ -1.61
CUL3Q13618 RNU6-467P-201ENST00000517027 110 ntBASIC5□□□□□ -1.61
CUL3Q13618 AC027308.1-201ENST00000517993 110 ntBASIC5□□□□□ -1.61
CUL3Q13618 AC012400.1-201ENST00000518452 381 ntBASIC5□□□□□ -1.61
CUL3Q13618 AC113423.1-201ENST00000523279 289 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
CUL3Q13618 AC144548.2-201ENST00000550231 946 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
CUL3Q13618 AGGF1P9-201ENST00000561884 913 ntBASIC5□□□□□ -1.61
CUL3Q13618 LINC01243-201ENST00000562065 721 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
CUL3Q13618 AC009113.2-201ENST00000563182 403 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
CUL3Q13618 AC069307.1-201ENST00000602820 447 ntBASIC5□□□□□ -1.61
CUL3Q13618 RPL26P30-202ENST00000602923 645 ntBASIC5□□□□□ -1.61
CUL3Q13618 AL450270.1-201ENST00000606160 391 ntBASIC5□□□□□ -1.61
CUL3Q13618 DARS-AS1-220ENST00000607985 660 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
CUL3Q13618 AC025016.1-201ENST00000616746 682 ntBASIC5□□□□□ -1.61
CUL3Q13618 AC118658.2-201ENST00000618697 459 ntBASIC5□□□□□ -1.61
CUL3Q13618 AC135068.12-201ENST00000637370 931 ntBASIC5□□□□□ -1.61
CUL3Q13618 CYP4Z2P-201ENST00000423332 1512 ntBASIC5□□□□□ -1.61
CUL3Q13618 ZBTB38-202ENST00000441582 3662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
CUL3Q13618 SPAM1-201ENST00000223028 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
CUL3Q13618 SPART-202ENST00000438666 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
CUL3Q13618 MS4A1-202ENST00000389939 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
CUL3Q13618 MTND4P26-201ENST00000415971 1359 ntBASIC5□□□□□ -1.61
CUL3Q13618 IRAK4-203ENST00000448290 1381 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
CUL3Q13618 ATF7IP-214ENST00000540793 4142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
CUL3Q13618 IRAK1BP1-204ENST00000607739 1387 ntTSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
CUL3Q13618 FAM184A-212ENST00000522284 2721 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
CUL3Q13618 GPR85-201ENST00000297146 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
CUL3Q13618 SMAD5-212ENST00000545620 6937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
CUL3Q13618 KPNA2P2-201ENST00000419546 1489 ntBASIC5□□□□□ -1.61
CUL3Q13618 FASTKD3-201ENST00000264669 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.99□□□□□ -1.61
CUL3Q13618 RUFY3-201ENST00000226328 4233 ntTSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
CUL3Q13618 AC097512.1-201ENST00000511453 1309 ntTSL 3 BASIC4.99□□□□□ -1.61
CUL3Q13618 RANBP6-201ENST00000259569 4576 ntAPPRIS P1 BASIC4.99□□□□□ -1.61
CUL3Q13618 SLCO1A2-212ENST00000458504 2008 ntTSL 2 BASIC4.99□□□□□ -1.61
CUL3Q13618 CD86-203ENST00000393627 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
CUL3Q13618 UBR1-201ENST00000290650 7761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
CUL3Q13618 ARHGAP5-210ENST00000556611 4824 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
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CUL3Q13618 AC092435.4-201ENST00000623012 4159 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
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CUL3Q13618 RNU4-7P-201ENST00000364758 141 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
CUL3Q13618 RNA5SP90-201ENST00000364801 99 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
CUL3Q13618 PAGE2B-202ENST00000374974 456 ntTSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
CUL3Q13618 RNU6-31P-201ENST00000384388 108 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
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CUL3Q13618 AL512422.1-201ENST00000407033 553 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
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CUL3Q13618 STMN1P2-201ENST00000508435 439 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
CUL3Q13618 RNA5SP249-201ENST00000516127 99 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
CUL3Q13618 AC048387.1-201ENST00000518428 494 ntTSL 3 BASIC4.99□□□□□ -1.61
CUL3Q13618 IGLVIV-64-201ENST00000518581 301 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
CUL3Q13618 AC068672.3-201ENST00000524017 824 ntTSL 3 BASIC4.99□□□□□ -1.61
CUL3Q13618 CA1-224ENST00000542576 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
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CUL3Q13618 PDZPH1P-202ENST00000602846 722 ntTSL 3 BASIC4.99□□□□□ -1.61
CUL3Q13618 AL671309.1-201ENST00000603750 544 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
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CUL3Q13618 AC090527.3-201ENST00000619041 548 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
CUL3Q13618 ALG13-230ENST00000623189 458 ntTSL 3 BASIC4.99□□□□□ -1.61
CUL3Q13618 RPL23AP61-201ENST00000623642 466 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
CUL3Q13618 AC136428.4-201ENST00000634254 1155 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
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