Protein–RNA interactions for Protein: Q13562

NEUROD1, Neurogenic differentiation factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 356 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEUROD1Q13562 AC112191.2-201ENST00000522428 333 ntBASIC8.27□□□□□ -1.09
NEUROD1Q13562 AC103855.3-201ENST00000528445 606 ntTSL 5 BASIC8.27□□□□□ -1.09
NEUROD1Q13562 AL137804.1-201ENST00000528872 576 ntTSL 3 BASIC8.27□□□□□ -1.09
NEUROD1Q13562 RERGL-202ENST00000536890 367 ntTSL 3 BASIC8.27□□□□□ -1.09
NEUROD1Q13562 CCNG2P1-201ENST00000549521 1000 ntBASIC8.27□□□□□ -1.09
NEUROD1Q13562 AC092078.1-201ENST00000558370 325 ntTSL 3 BASIC8.27□□□□□ -1.09
NEUROD1Q13562 AL354943.1-201ENST00000572103 781 ntBASIC8.27□□□□□ -1.09
NEUROD1Q13562 DHFRP1-201ENST00000579682 559 ntBASIC8.27□□□□□ -1.09
NEUROD1Q13562 HCG18-243ENST00000602498 327 ntTSL 3 BASIC8.27□□□□□ -1.09
NEUROD1Q13562 AC010975.3-201ENST00000618727 978 ntBASIC8.27□□□□□ -1.09
NEUROD1Q13562 SERPINB10-204ENST00000619595 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.27□□□□□ -1.09
NEUROD1Q13562 RDM1-226ENST00000619828 687 ntTSL 1 (best) BASIC8.27□□□□□ -1.09
NEUROD1Q13562 AC091932.2-201ENST00000623014 291 ntBASIC8.27□□□□□ -1.09
NEUROD1Q13562 OR52B4-201ENST00000624801 1124 ntAPPRIS P1 BASIC8.27□□□□□ -1.09
NEUROD1Q13562 SATB1-AS1-263ENST00000630022 622 ntTSL 5 BASIC8.27□□□□□ -1.09
NEUROD1Q13562 FRG1DP-201ENST00000635586 771 ntBASIC8.27□□□□□ -1.09
NEUROD1Q13562 MIR1322-201ENST00000638013 71 ntBASIC8.27□□□□□ -1.09
NEUROD1Q13562 PIGX-210ENST00000639143 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.27□□□□□ -1.09
NEUROD1Q13562 TESPA1-203ENST00000524622 4188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.27□□□□□ -1.09
NEUROD1Q13562 ATF2-202ENST00000345739 4079 ntTSL 1 (best) BASIC8.27□□□□□ -1.09
NEUROD1Q13562 HEPHL1-201ENST00000315765 5345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.27□□□□□ -1.09
NEUROD1Q13562 ABCC9-204ENST00000538350 2672 ntTSL 2 BASIC8.26□□□□□ -1.09
NEUROD1Q13562 SMCO1-201ENST00000397537 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.26□□□□□ -1.09
NEUROD1Q13562 PUS10-203ENST00000407787 1820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.26□□□□□ -1.09
NEUROD1Q13562 VPS50-220ENST00000544910 5736 ntTSL 2 BASIC8.26□□□□□ -1.09
NEUROD1Q13562 ZNF214-204ENST00000536068 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.26□□□□□ -1.09
NEUROD1Q13562 AC012020.1-201ENST00000624541 1728 ntBASIC8.26□□□□□ -1.09
NEUROD1Q13562 LINC01553-203ENST00000521074 4329 ntTSL 1 (best) BASIC8.26□□□□□ -1.09
NEUROD1Q13562 KMT2D-201ENST00000301067 19419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.26□□□□□ -1.09
NEUROD1Q13562 WDR17-201ENST00000280190 4705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.26□□□□□ -1.09
NEUROD1Q13562 SIAH1-202ENST00000380006 3352 ntAPPRIS P3 BASIC8.26□□□□□ -1.09
NEUROD1Q13562 NOS1-201ENST00000317775 12158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.26□□□□□ -1.09
NEUROD1Q13562 BICD1-204ENST00000548411 8811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.26□□□□□ -1.09
NEUROD1Q13562 TTC37-201ENST00000358746 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.26□□□□□ -1.09
NEUROD1Q13562 DEFB118-201ENST00000253381 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.26□□□□□ -1.09
NEUROD1Q13562 OR8B3-201ENST00000354597 942 ntAPPRIS P1 BASIC8.26□□□□□ -1.09
NEUROD1Q13562 SNORD113-6-201ENST00000363345 75 ntBASIC8.26□□□□□ -1.09
NEUROD1Q13562 OR13C3-201ENST00000374781 1108 ntBASIC8.26□□□□□ -1.09
NEUROD1Q13562 OR8B2-201ENST00000375013 942 ntAPPRIS P1 BASIC8.26□□□□□ -1.09
NEUROD1Q13562 AL445183.3-201ENST00000414168 502 ntBASIC8.26□□□□□ -1.09
NEUROD1Q13562 LINC01661-201ENST00000415910 708 ntTSL 3 BASIC8.26□□□□□ -1.09
NEUROD1Q13562 NENFP1-201ENST00000419476 466 ntBASIC8.26□□□□□ -1.09
NEUROD1Q13562 LINC02528-202ENST00000434437 535 ntTSL 2 BASIC8.26□□□□□ -1.09
NEUROD1Q13562 AL450472.1-201ENST00000439434 405 ntTSL 2 BASIC8.26□□□□□ -1.09
NEUROD1Q13562 AC064862.4-201ENST00000442180 334 ntBASIC8.26□□□□□ -1.09
NEUROD1Q13562 AL671855.1-201ENST00000446875 1203 ntBASIC8.26□□□□□ -1.09
NEUROD1Q13562 E2F5-204ENST00000517476 1094 ntTSL 2 BASIC8.26□□□□□ -1.09
NEUROD1Q13562 MOCS2-208ENST00000527216 707 ntTSL 3 BASIC8.26□□□□□ -1.09
NEUROD1Q13562 TAS2R43-201ENST00000531678 1027 ntAPPRIS P1 BASIC8.26□□□□□ -1.09
NEUROD1Q13562 AC006518.2-201ENST00000542513 940 ntBASIC8.26□□□□□ -1.09
NEUROD1Q13562 AC144548.2-201ENST00000550231 946 ntTSL 3 BASIC8.26□□□□□ -1.09
NEUROD1Q13562 DNAL1-206ENST00000554871 632 ntTSL 1 (best) BASIC8.26□□□□□ -1.09
NEUROD1Q13562 PSMA4-206ENST00000558341 719 ntTSL 5 BASIC8.26□□□□□ -1.09
NEUROD1Q13562 AC055874.1-201ENST00000561458 479 ntTSL 2 BASIC8.26□□□□□ -1.09
NEUROD1Q13562 AC023813.2-201ENST00000564321 469 ntBASIC8.26□□□□□ -1.09
NEUROD1Q13562 AC010601.1-202ENST00000567304 547 ntTSL 4 BASIC8.26□□□□□ -1.09
NEUROD1Q13562 AC074050.3-201ENST00000569175 441 ntTSL 4 BASIC8.26□□□□□ -1.09
NEUROD1Q13562 CASC22-201ENST00000569713 386 ntTSL 5 BASIC8.26□□□□□ -1.09
NEUROD1Q13562 CCDC178-208ENST00000579916 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.26□□□□□ -1.09
NEUROD1Q13562 AC093330.1-201ENST00000583326 568 ntTSL 4 BASIC8.26□□□□□ -1.09
NEUROD1Q13562 CBX3P2-202ENST00000583365 535 ntBASIC8.26□□□□□ -1.09
NEUROD1Q13562 RSL24D1P11-201ENST00000591045 491 ntBASIC8.26□□□□□ -1.09
NEUROD1Q13562 AL035411.2-201ENST00000604022 421 ntBASIC8.26□□□□□ -1.09
NEUROD1Q13562 RN7SL787P-201ENST00000613000 284 ntBASIC8.26□□□□□ -1.09
NEUROD1Q13562 C1orf195-202ENST00000625027 441 ntTSL 5 BASIC8.26□□□□□ -1.09
NEUROD1Q13562 AL008636.1-201ENST00000625038 1018 ntBASIC8.26□□□□□ -1.09
NEUROD1Q13562 AC005618.4-201ENST00000625053 554 ntBASIC8.26□□□□□ -1.09
NEUROD1Q13562 AL592430.2-201ENST00000633779 486 ntTSL 5 BASIC8.26□□□□□ -1.09
NEUROD1Q13562 OR13C3-202ENST00000641090 1108 ntAPPRIS P1 BASIC8.26□□□□□ -1.09
NEUROD1Q13562 MRRFP1-201ENST00000435941 1675 ntBASIC8.26□□□□□ -1.09
NEUROD1Q13562 NAT1-210ENST00000545197 1827 ntTSL 5 BASIC8.26□□□□□ -1.09
NEUROD1Q13562 ZNF347-202ENST00000452676 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.26□□□□□ -1.09
NEUROD1Q13562 LARP4-203ENST00000398473 6427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.26□□□□□ -1.09
NEUROD1Q13562 AC004656.1-201ENST00000568479 4951 ntBASIC8.25□□□□□ -1.09
NEUROD1Q13562 AC125336.1-201ENST00000508893 2827 ntBASIC8.25□□□□□ -1.09
NEUROD1Q13562 SEMA3A-201ENST00000265362 8225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
NEUROD1Q13562 LINC01958-201ENST00000637749 1941 ntTSL 5 BASIC8.25□□□□□ -1.09
NEUROD1Q13562 ALCAM-205ENST00000472644 4189 ntTSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
NEUROD1Q13562 ZNF788-203ENST00000430298 3941 ntTSL 2 BASIC8.25□□□□□ -1.09
NEUROD1Q13562 MRPS36-201ENST00000256441 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
NEUROD1Q13562 S100A10-201ENST00000368809 616 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.25□□□□□ -1.09
NEUROD1Q13562 SNORD116-12-201ENST00000384468 92 ntBASIC8.25□□□□□ -1.09
NEUROD1Q13562 AL021331.1-201ENST00000402817 582 ntBASIC8.25□□□□□ -1.09
NEUROD1Q13562 LSM5-206ENST00000409987 504 ntTSL 5 BASIC8.25□□□□□ -1.09
NEUROD1Q13562 AL355339.1-202ENST00000417542 458 ntTSL 2 BASIC8.25□□□□□ -1.09
NEUROD1Q13562 AC093155.2-201ENST00000420734 937 ntBASIC8.25□□□□□ -1.09
NEUROD1Q13562 VN1R42P-201ENST00000424651 344 ntBASIC8.25□□□□□ -1.09
NEUROD1Q13562 AL583785.1-201ENST00000428006 512 ntTSL 2 BASIC8.25□□□□□ -1.09
NEUROD1Q13562 AL022331.1-201ENST00000429025 477 ntBASIC8.25□□□□□ -1.09
NEUROD1Q13562 AL389925.1-201ENST00000432257 728 ntBASIC8.25□□□□□ -1.09
NEUROD1Q13562 AL355339.1-201ENST00000434386 435 ntTSL 2 BASIC8.25□□□□□ -1.09
NEUROD1Q13562 GTF2IP7-202ENST00000436677 309 ntBASIC8.25□□□□□ -1.09
NEUROD1Q13562 RNF219-AS1-202ENST00000444769 590 ntTSL 4 BASIC8.25□□□□□ -1.09
NEUROD1Q13562 AC079117.1-201ENST00000445178 1000 ntTSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
NEUROD1Q13562 RPL31P15-201ENST00000449770 338 ntBASIC8.25□□□□□ -1.09
NEUROD1Q13562 RPL7P41-201ENST00000485823 957 ntBASIC8.25□□□□□ -1.09
NEUROD1Q13562 DUTP7-201ENST00000507982 486 ntBASIC8.25□□□□□ -1.09
NEUROD1Q13562 AC008565.1-201ENST00000509046 885 ntBASIC8.25□□□□□ -1.09
NEUROD1Q13562 HMGB1P47-201ENST00000511281 589 ntBASIC8.25□□□□□ -1.09
NEUROD1Q13562 AC026780.1-201ENST00000512237 952 ntTSL 3 BASIC8.25□□□□□ -1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 168.1 ms