Protein–RNA interactions for Protein: Q13099

IFT88, Intraflagellar transport protein 88 homolog, humanhuman

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Length 833 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT88Q13099 AL603766.1-201ENST00000407763 664 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
IFT88Q13099 SLC19A3-202ENST00000409287 644 ntTSL 3 BASIC5.01□□□□□ -1.61
IFT88Q13099 RPL7P57-201ENST00000423238 740 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
IFT88Q13099 LINC01740-201ENST00000423842 332 ntTSL 2 BASIC5.01□□□□□ -1.61
IFT88Q13099 GTF2IP2-201ENST00000424290 697 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
IFT88Q13099 AC093655.2-201ENST00000425735 631 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
IFT88Q13099 AC079807.1-201ENST00000429993 481 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
IFT88Q13099 AL049749.1-201ENST00000430281 632 ntTSL 2 BASIC5.01□□□□□ -1.61
IFT88Q13099 AL031599.1-201ENST00000432694 808 ntTSL 3 BASIC5.01□□□□□ -1.61
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IFT88Q13099 RNF219-AS1-202ENST00000444769 590 ntTSL 4 BASIC5.01□□□□□ -1.61
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IFT88Q13099 AC018638.3-201ENST00000461273 132 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
IFT88Q13099 RN7SL184P-201ENST00000488308 297 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
IFT88Q13099 AC011405.1-202ENST00000504658 803 ntTSL 3 BASIC5.01□□□□□ -1.61
IFT88Q13099 LINC02430-201ENST00000504755 476 ntTSL 3 BASIC5.01□□□□□ -1.61
IFT88Q13099 LINC02505-202ENST00000510597 776 ntTSL 3 BASIC5.01□□□□□ -1.61
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IFT88Q13099 AC018797.3-201ENST00000513388 1241 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
IFT88Q13099 RNU2-30P-201ENST00000516209 141 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
IFT88Q13099 AC018616.1-201ENST00000524085 546 ntTSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
IFT88Q13099 MS4A6A-210ENST00000529054 1160 ntTSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
IFT88Q13099 MS4A3-208ENST00000534744 507 ntTSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
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IFT88Q13099 AC126177.5-201ENST00000549599 178 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
IFT88Q13099 GLRXP2-201ENST00000555594 321 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
IFT88Q13099 PDCD6IPP2-207ENST00000566321 1069 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
IFT88Q13099 AP005121.1-201ENST00000578243 469 ntTSL 3 BASIC5.01□□□□□ -1.61
IFT88Q13099 MIR4716-201ENST00000579628 84 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
IFT88Q13099 DSCR9-205ENST00000585273 751 ntTSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
IFT88Q13099 AC022031.2-203ENST00000587346 565 ntTSL 4 BASIC5.01□□□□□ -1.61
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IFT88Q13099 AL049844.2-201ENST00000604280 628 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
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IFT88Q13099 AC234782.5-201ENST00000617723 324 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
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IFT88Q13099 SPTY2D1-AS1-204ENST00000634992 373 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
IFT88Q13099 CYP4F35P-202ENST00000636121 390 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
IFT88Q13099 PANDAR-201ENST00000629595 1506 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
IFT88Q13099 FGF12-204ENST00000445105 5406 ntTSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
IFT88Q13099 LRIT3-201ENST00000327908 3781 ntTSL 2 BASIC5.01□□□□□ -1.61
IFT88Q13099 IL6ST-212ENST00000522633 1878 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
IFT88Q13099 DDX18P5-201ENST00000534547 1306 ntBASIC5□□□□□ -1.61
IFT88Q13099 XIRP2-207ENST00000628543 12182 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
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IFT88Q13099 AC000123.2-201ENST00000623124 461 ntBASIC5□□□□□ -1.61
IFT88Q13099 CDH8-205ENST00000577730 8009 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
IFT88Q13099 IPCEF1-210ENST00000519344 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
IFT88Q13099 BCAP29-203ENST00000379119 5773 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
IFT88Q13099 OSBPL11-201ENST00000296220 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
IFT88Q13099 CAST-201ENST00000309190 4282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
IFT88Q13099 PCDH15-211ENST00000395440 3177 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
IFT88Q13099 OR10Z1-202ENST00000641002 6323 ntAPPRIS P1 BASIC5□□□□□ -1.61
IFT88Q13099 OR10A3-202ENST00000642047 2650 ntAPPRIS P1 BASIC5□□□□□ -1.61
IFT88Q13099 STIL-204ENST00000396221 4558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
IFT88Q13099 ZNF28-203ENST00000438150 5171 ntTSL 2 BASIC4.99□□□□□ -1.61
IFT88Q13099 PGM3-211ENST00000512866 2013 ntTSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
IFT88Q13099 DHX9P1-201ENST00000436565 3076 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
IFT88Q13099 CYP4Z2P-201ENST00000423332 1512 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
IFT88Q13099 CKAP2-207ENST00000490903 3395 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.99□□□□□ -1.61
IFT88Q13099 BCL2A1-201ENST00000267953 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
IFT88Q13099 PLSCR2-201ENST00000336685 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
IFT88Q13099 U3.3-201ENST00000362986 216 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
IFT88Q13099 MIR143-201ENST00000385300 106 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
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