Protein–RNA interactions for Protein: Q13002

GRIK2, Glutamate receptor ionotropic, kainate 2, humanhuman

Predictions only

Length 908 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK2Q13002 RN7SL423P-201ENST00000486202 304 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
GRIK2Q13002 IGLV2-34-201ENST00000490007 283 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
GRIK2Q13002 RN7SL205P-201ENST00000490174 284 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
GRIK2Q13002 CAB39P1-201ENST00000502277 460 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
GRIK2Q13002 AC012055.1-201ENST00000511346 1144 ntTSL 3 BASIC5.21□□□□□ -1.58
GRIK2Q13002 RBPMS-207ENST00000519647 780 ntTSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.58
GRIK2Q13002 AP003102.1-201ENST00000525638 661 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
GRIK2Q13002 BNIP3P1-201ENST00000547295 580 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
GRIK2Q13002 AC025263.2-201ENST00000550437 548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.58
GRIK2Q13002 RNASE9-206ENST00000554964 1101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
GRIK2Q13002 AC112693.1-201ENST00000555297 682 ntTSL 3 BASIC5.21□□□□□ -1.58
GRIK2Q13002 AC006349.1-201ENST00000555526 235 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
GRIK2Q13002 RNASE9-208ENST00000556208 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
GRIK2Q13002 RNASE9-210ENST00000557209 1137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
GRIK2Q13002 RN7SL356P-201ENST00000582228 248 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
GRIK2Q13002 RN7SL52P-201ENST00000584271 284 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
GRIK2Q13002 AC006504.5-202ENST00000586784 656 ntTSL 2 BASIC5.21□□□□□ -1.58
GRIK2Q13002 AC105148.1-201ENST00000604961 409 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
GRIK2Q13002 RN7SL722P-201ENST00000617780 284 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
GRIK2Q13002 RN7SL565P-201ENST00000618246 284 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
GRIK2Q13002 AC022306.3-201ENST00000619930 550 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
GRIK2Q13002 AC015660.5-201ENST00000623238 564 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
GRIK2Q13002 BANCR-201ENST00000624238 473 ntTSL 2 BASIC5.21□□□□□ -1.58
GRIK2Q13002 AC134980.1-203ENST00000640541 570 ntTSL 4 BASIC5.21□□□□□ -1.58
GRIK2Q13002 CCNB3-201ENST00000276014 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
GRIK2Q13002 ARPP19-208ENST00000566423 5362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
GRIK2Q13002 DAZ4-205ENST00000440066 1891 ntTSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.58
GRIK2Q13002 DAZ1-206ENST00000620725 1891 ntTSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.58
GRIK2Q13002 GABRG2-224ENST00000640574 3150 ntTSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.58
GRIK2Q13002 UACA-211ENST00000560441 4723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.58
GRIK2Q13002 AC245100.2-201ENST00000454544 1679 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
GRIK2Q13002 CNGA1-202ENST00000402813 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
GRIK2Q13002 USP28-213ENST00000544967 3498 ntTSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
GRIK2Q13002 DNA2-201ENST00000358410 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
GRIK2Q13002 ZNF679-202ENST00000421025 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
GRIK2Q13002 PCDH11X-202ENST00000361655 4126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
GRIK2Q13002 PTPRO-204ENST00000445537 4062 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.2□□□□□ -1.58
GRIK2Q13002 KDM3B-209ENST00000542866 3634 ntTSL 2 BASIC5.2□□□□□ -1.58
GRIK2Q13002 AC092747.4-201ENST00000620519 1861 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
GRIK2Q13002 ZC3H12B-201ENST00000338957 7256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
GRIK2Q13002 A1CF-207ENST00000395495 9400 ntTSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
GRIK2Q13002 AC091045.1-201ENST00000561460 2277 ntTSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
GRIK2Q13002 GJA9-201ENST00000357771 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
GRIK2Q13002 GLYAT-201ENST00000278400 1150 ntTSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
GRIK2Q13002 RNU1-146P-201ENST00000364015 165 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
GRIK2Q13002 RNVU1-6-201ENST00000364688 164 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
GRIK2Q13002 MIR192-201ENST00000384915 110 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
GRIK2Q13002 ATP5F1P6-201ENST00000402768 767 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
GRIK2Q13002 LINC00161-201ENST00000412526 870 ntTSL 2 BASIC5.2□□□□□ -1.58
GRIK2Q13002 SMIM2-IT1-201ENST00000415082 478 ntTSL 3 BASIC5.2□□□□□ -1.58
GRIK2Q13002 AC092811.1-201ENST00000428642 397 ntTSL 3 BASIC5.2□□□□□ -1.58
GRIK2Q13002 AL139819.1-201ENST00000429420 471 ntTSL 3 BASIC5.2□□□□□ -1.58
GRIK2Q13002 AL450992.2-201ENST00000434182 506 ntTSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
GRIK2Q13002 AL139120.1-201ENST00000443652 358 ntTSL 3 BASIC5.2□□□□□ -1.58
GRIK2Q13002 AC092637.1-201ENST00000444745 510 ntTSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
GRIK2Q13002 CYCSP24-201ENST00000445119 316 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
GRIK2Q13002 TRBV2-201ENST00000455382 421 ntAPPRIS P1 BASIC5.2□□□□□ -1.58
GRIK2Q13002 TMEM212-IT1-201ENST00000456146 470 ntTSL 3 BASIC5.2□□□□□ -1.58
GRIK2Q13002 RPL7P16-201ENST00000479738 738 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
GRIK2Q13002 MTCO2P9-201ENST00000503214 694 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
GRIK2Q13002 LINC01060-205ENST00000512839 716 ntTSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
GRIK2Q13002 AP003696.1-201ENST00000519337 770 ntTSL 3 BASIC5.2□□□□□ -1.58
GRIK2Q13002 AC100784.1-201ENST00000522790 310 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
GRIK2Q13002 AP000942.2-201ENST00000526310 628 ntTSL 3 BASIC5.2□□□□□ -1.58
GRIK2Q13002 AC079089.1-204ENST00000530194 572 ntTSL 2 BASIC5.2□□□□□ -1.58
GRIK2Q13002 KBTBD3-204ENST00000531482 874 ntTSL 3 BASIC5.2□□□□□ -1.58
GRIK2Q13002 PPFIA2-AS1-202ENST00000549161 1080 ntTSL 3 BASIC5.2□□□□□ -1.58
GRIK2Q13002 AL929601.2-201ENST00000549951 381 ntTSL 4 BASIC5.2□□□□□ -1.58
GRIK2Q13002 AC011524.2-201ENST00000589198 399 ntTSL 3 BASIC5.2□□□□□ -1.58
GRIK2Q13002 ZNF836-203ENST00000597065 808 ntTSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
GRIK2Q13002 MTCO2P22-201ENST00000603246 681 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
GRIK2Q13002 AC005252.1-201ENST00000604518 1063 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
GRIK2Q13002 AC112694.2-201ENST00000623697 768 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
GRIK2Q13002 AC092159.4-201ENST00000624944 550 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
GRIK2Q13002 LINC01002-236ENST00000634022 378 ntTSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
GRIK2Q13002 AC099654.6-201ENST00000636487 512 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
GRIK2Q13002 C5orf42-201ENST00000425232 11199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
GRIK2Q13002 KAT6B-201ENST00000287239 8287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
GRIK2Q13002 HMMR-202ENST00000358715 2988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
GRIK2Q13002 NPY6R-202ENST00000510937 2988 ntTSL 3 BASIC5.2□□□□□ -1.58
GRIK2Q13002 POF1B-201ENST00000262753 3941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
GRIK2Q13002 SMARCA2-206ENST00000382185 1584 ntTSL 2 BASIC5.2□□□□□ -1.58
GRIK2Q13002 BMPR1APS1-201ENST00000403332 1598 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
GRIK2Q13002 AC019072.1-201ENST00000604535 1551 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
GRIK2Q13002 SUPT3H-203ENST00000371460 2389 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
GRIK2Q13002 GLRA2-202ENST00000355020 1730 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
GRIK2Q13002 LRP1B-201ENST00000389484 16535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
GRIK2Q13002 ERVFRD-3-201ENST00000578561 1617 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
GRIK2Q13002 CRISP1-204ENST00000507853 1793 ntTSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
GRIK2Q13002 DSE-204ENST00000452085 10586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
GRIK2Q13002 LCLAT1-203ENST00000379509 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
GRIK2Q13002 AL031595.2-201ENST00000624215 19071 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
GRIK2Q13002 PROS2P-201ENST00000474651 1951 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
GRIK2Q13002 AC007996.1-201ENST00000620414 2821 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
GRIK2Q13002 TENM1-202ENST00000422452 12891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
GRIK2Q13002 IL3-201ENST00000296870 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
GRIK2Q13002 OR9G4-201ENST00000302957 984 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
GRIK2Q13002 GNAS-202ENST00000306090 477 ntTSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
GRIK2Q13002 AC017079.1-201ENST00000333650 415 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
GRIK2Q13002 RNA5SP455-201ENST00000365190 119 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
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