Protein–RNA interactions for Protein: Q12778

FOXO1, Forkhead box protein O1, humanhuman

Predictions only

Length 655 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXO1Q12778 CTAGE5-208ENST00000553352 3441 ntTSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
FOXO1Q12778 BRCA1-203ENST00000357654 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
FOXO1Q12778 ZFYVE16-206ENST00000510158 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
FOXO1Q12778 AC018557.1-201ENST00000569274 1790 ntTSL 5 BASIC5.22□□□□□ -1.57
FOXO1Q12778 SCAPER-207ENST00000563290 5028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.22□□□□□ -1.57
FOXO1Q12778 ASNSP1-204ENST00000641977 1664 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
FOXO1Q12778 PDE7A-201ENST00000379419 2425 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.22□□□□□ -1.57
FOXO1Q12778 LRRC37A3-204ENST00000400877 3273 ntTSL 2 BASIC5.22□□□□□ -1.57
FOXO1Q12778 AP004607.3-201ENST00000530354 3915 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
FOXO1Q12778 HTN1-201ENST00000246896 580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
FOXO1Q12778 RPL9-201ENST00000295955 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
FOXO1Q12778 OR5M8-201ENST00000327216 1047 ntAPPRIS P1 BASIC5.22□□□□□ -1.57
FOXO1Q12778 DNASE2B-202ENST00000370665 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
FOXO1Q12778 BMS1P3-201ENST00000372011 932 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
FOXO1Q12778 RPL34-203ENST00000394668 853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
FOXO1Q12778 AC005323.2-201ENST00000399342 583 ntTSL 3 BASIC5.22□□□□□ -1.57
FOXO1Q12778 MTCO1P56-201ENST00000401674 224 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
FOXO1Q12778 TMSB4XP8-201ENST00000402089 135 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
FOXO1Q12778 MTCO2P31-201ENST00000402702 684 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
FOXO1Q12778 SNORA11B-201ENST00000408175 129 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
FOXO1Q12778 RN7SKP59-201ENST00000410520 314 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
FOXO1Q12778 RNU2-6P-201ENST00000411404 190 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
FOXO1Q12778 IFNAR2-206ENST00000413881 710 ntTSL 5 BASIC5.22□□□□□ -1.57
FOXO1Q12778 TMSB4XP6-201ENST00000415187 135 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
FOXO1Q12778 TMSB4XP1-201ENST00000424567 135 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
FOXO1Q12778 HIGD1AP12-201ENST00000427832 281 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
FOXO1Q12778 FAM96AP1-201ENST00000430879 482 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
FOXO1Q12778 LINC01598-201ENST00000432067 460 ntTSL 3 BASIC5.22□□□□□ -1.57
FOXO1Q12778 MTND2P5-201ENST00000432656 1006 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
FOXO1Q12778 AL391097.2-201ENST00000435057 485 ntTSL 3 BASIC5.22□□□□□ -1.57
FOXO1Q12778 RPS26P40-201ENST00000435209 294 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
FOXO1Q12778 TXNP5-201ENST00000441043 315 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
FOXO1Q12778 OR10R1P-201ENST00000441524 1141 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
FOXO1Q12778 AC114877.1-201ENST00000446601 582 ntTSL 4 BASIC5.22□□□□□ -1.57
FOXO1Q12778 EIF4A1P11-201ENST00000451239 222 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
FOXO1Q12778 TMSB4X-204ENST00000451311 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
FOXO1Q12778 OSTCP1-201ENST00000455507 450 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
FOXO1Q12778 RNU1-88P-201ENST00000459274 128 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
FOXO1Q12778 AC068633.1-202ENST00000476460 458 ntTSL 2 BASIC5.22□□□□□ -1.57
FOXO1Q12778 RPL7P6-201ENST00000480903 738 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
FOXO1Q12778 GCSAM-204ENST00000484193 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC5.22□□□□□ -1.57
FOXO1Q12778 AL365273.2-201ENST00000491114 492 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.22□□□□□ -1.57
FOXO1Q12778 LINC00518-204ENST00000491317 1228 ntTSL 2 BASIC5.22□□□□□ -1.57
FOXO1Q12778 AC118282.2-201ENST00000508739 374 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
FOXO1Q12778 LINC02201-201ENST00000508992 468 ntTSL 2 BASIC5.22□□□□□ -1.57
FOXO1Q12778 LINC00977-201ENST00000509893 1163 ntTSL 2 BASIC5.22□□□□□ -1.57
FOXO1Q12778 RNU6-416P-201ENST00000516265 103 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
FOXO1Q12778 LINC02143-201ENST00000519929 520 ntTSL 3 BASIC5.22□□□□□ -1.57
FOXO1Q12778 AC104036.1-201ENST00000523550 611 ntTSL 3 BASIC5.22□□□□□ -1.57
FOXO1Q12778 RGS4-207ENST00000527809 817 ntTSL 4 BASIC5.22□□□□□ -1.57
FOXO1Q12778 OR7E128P-201ENST00000532736 1024 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
FOXO1Q12778 AC008250.1-201ENST00000539874 522 ntTSL 3 BASIC5.22□□□□□ -1.57
FOXO1Q12778 ZNF84-212ENST00000542874 540 ntTSL 5 BASIC5.22□□□□□ -1.57
FOXO1Q12778 DPRXP4-201ENST00000578053 568 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
FOXO1Q12778 GAPLINC-202ENST00000579007 643 ntTSL 3 BASIC5.22□□□□□ -1.57
FOXO1Q12778 AC008794.2-201ENST00000587779 293 ntTSL 2 BASIC5.22□□□□□ -1.57
FOXO1Q12778 INTS6-AS1-210ENST00000595424 301 ntTSL 5 BASIC5.22□□□□□ -1.57
FOXO1Q12778 Z98949.1-203ENST00000597284 851 ntTSL 5 BASIC5.22□□□□□ -1.57
FOXO1Q12778 HCG18-243ENST00000602498 327 ntTSL 3 BASIC5.22□□□□□ -1.57
FOXO1Q12778 AL589674.2-201ENST00000604304 337 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
FOXO1Q12778 AC010998.2-201ENST00000605549 625 ntTSL 5 BASIC5.22□□□□□ -1.57
FOXO1Q12778 ASNSD1-209ENST00000607829 581 ntTSL 2 BASIC5.22□□□□□ -1.57
FOXO1Q12778 OR8H2-202ENST00000618136 1038 ntAPPRIS ALT1 BASIC5.22□□□□□ -1.57
FOXO1Q12778 VN1R7P-201ENST00000619242 903 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
FOXO1Q12778 VPS29-212ENST00000621131 1124 ntTSL 3 BASIC5.22□□□□□ -1.57
FOXO1Q12778 UBA3-213ENST00000631029 123 ntTSL 5 BASIC5.22□□□□□ -1.57
FOXO1Q12778 LINC01708-202ENST00000634316 859 ntTSL 5 BASIC5.22□□□□□ -1.57
FOXO1Q12778 OR7C1-203ENST00000641666 11711 ntAPPRIS P1 BASIC5.22□□□□□ -1.57
FOXO1Q12778 FBXO3-208ENST00000530401 7410 ntTSL 2 BASIC5.22□□□□□ -1.57
FOXO1Q12778 MFSD8-239ENST00000641590 2479 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
FOXO1Q12778 CLUL1-205ENST00000579494 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
FOXO1Q12778 PLS3-201ENST00000289290 2277 ntTSL 2 BASIC5.22□□□□□ -1.57
FOXO1Q12778 AFF2-201ENST00000286437 12280 ntTSL 2 BASIC5.22□□□□□ -1.57
FOXO1Q12778 PCA3-201ENST00000412654 3922 ntTSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
FOXO1Q12778 DMTF1-204ENST00000413276 3548 ntTSL 5 BASIC5.22□□□□□ -1.57
FOXO1Q12778 IL1RAP-205ENST00000412504 4875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
FOXO1Q12778 AC022164.1-201ENST00000568767 2673 ntBASIC5.21□□□□□ -1.57
FOXO1Q12778 CSNK1G1-204ENST00000606793 1658 ntTSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.57
FOXO1Q12778 AIG1-208ENST00000494282 3393 ntTSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.57
FOXO1Q12778 PIAS2-204ENST00000585916 11075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.57
FOXO1Q12778 PSG1-201ENST00000244296 2276 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
FOXO1Q12778 ZNF616-204ENST00000600228 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
FOXO1Q12778 NOSTRIN-206ENST00000444448 2537 ntTSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.58
FOXO1Q12778 AGBL4-201ENST00000334103 881 ntTSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.58
FOXO1Q12778 RNA5SP131-201ENST00000365452 119 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
FOXO1Q12778 RNU6-906P-201ENST00000384700 70 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
FOXO1Q12778 AP002530.1-201ENST00000405705 684 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
FOXO1Q12778 RNU2-65P-201ENST00000410162 185 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
FOXO1Q12778 RNU6-272P-201ENST00000411028 104 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
FOXO1Q12778 TRAPPC2P10-201ENST00000415662 323 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
FOXO1Q12778 AL121878.1-201ENST00000418638 859 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
FOXO1Q12778 AC000095.2-201ENST00000424407 768 ntTSL 2 BASIC5.21□□□□□ -1.58
FOXO1Q12778 C1DP1-201ENST00000426049 402 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
FOXO1Q12778 SLC36A1-202ENST00000429484 977 ntTSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
FOXO1Q12778 AP001476.3-201ENST00000429512 415 ntTSL 3 BASIC5.21□□□□□ -1.58
FOXO1Q12778 AC093157.1-204ENST00000454721 753 ntTSL 3 BASIC5.21□□□□□ -1.58
FOXO1Q12778 PTGES3P5-201ENST00000455109 434 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
FOXO1Q12778 LINC01312-202ENST00000456347 813 ntTSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
FOXO1Q12778 CEP170-216ENST00000490813 1070 ntTSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
FOXO1Q12778 RN7SL466P-201ENST00000497546 295 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 117.5 ms