Protein–RNA interactions for Protein: P53609

PGGT1B, Geranylgeranyl transferase type-1 subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1BP53609 RNU1-43P-201ENST00000365052 165 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
PGGT1BP53609 OR8V1P-201ENST00000395193 873 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
PGGT1BP53609 DPP10-AS3-201ENST00000417844 665 ntTSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
PGGT1BP53609 TEX41-203ENST00000420472 765 ntTSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
PGGT1BP53609 CHEK2P5-201ENST00000423877 246 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
PGGT1BP53609 AC244394.2-201ENST00000425109 735 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
PGGT1BP53609 RPL7P34-201ENST00000433316 712 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
PGGT1BP53609 Z82198.2-201ENST00000434741 567 ntTSL 4 BASIC5.07□□□□□ -1.6
PGGT1BP53609 AL022310.1-201ENST00000436974 690 ntTSL 2 BASIC5.07□□□□□ -1.6
PGGT1BP53609 GYPE-202ENST00000437468 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
PGGT1BP53609 LINC00969-211ENST00000438608 525 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
PGGT1BP53609 AC245047.2-201ENST00000441060 530 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
PGGT1BP53609 AL139120.1-201ENST00000443652 358 ntTSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
PGGT1BP53609 AL592431.1-201ENST00000451090 317 ntTSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
PGGT1BP53609 AL133445.1-201ENST00000467051 452 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
PGGT1BP53609 AC121764.2-201ENST00000469806 587 ntTSL 2 BASIC5.07□□□□□ -1.6
PGGT1BP53609 RN7SL174P-201ENST00000475578 289 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
PGGT1BP53609 FSBP-201ENST00000481490 1158 ntTSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
PGGT1BP53609 AC108693.1-201ENST00000496068 432 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
PGGT1BP53609 AC010374.1-201ENST00000503762 1237 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
PGGT1BP53609 ENPP7P11-201ENST00000505915 627 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
PGGT1BP53609 AC005823.2-201ENST00000505978 650 ntTSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
PGGT1BP53609 AC098869.2-201ENST00000514187 862 ntTSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
PGGT1BP53609 AC012400.1-201ENST00000518452 381 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
PGGT1BP53609 AP001207.2-201ENST00000519490 539 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
PGGT1BP53609 AC091996.1-201ENST00000522274 600 ntTSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
PGGT1BP53609 AC025437.5-201ENST00000522769 314 ntTSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
PGGT1BP53609 NAV2-AS1-201ENST00000526642 660 ntTSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
PGGT1BP53609 ANKRD49-206ENST00000540349 573 ntTSL 4 BASIC5.07□□□□□ -1.6
PGGT1BP53609 AC008147.3-201ENST00000548666 354 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
PGGT1BP53609 AC087477.3-201ENST00000559214 552 ntTSL 4 BASIC5.07□□□□□ -1.6
PGGT1BP53609 AC018554.1-201ENST00000565506 800 ntTSL 2 BASIC5.07□□□□□ -1.6
PGGT1BP53609 AC091588.1-201ENST00000578504 359 ntTSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
PGGT1BP53609 EIF1P5-201ENST00000585002 234 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
PGGT1BP53609 AC004448.4-204ENST00000585389 743 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
PGGT1BP53609 AC010503.3-201ENST00000594355 540 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
PGGT1BP53609 AC084373.1-201ENST00000603311 235 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
PGGT1BP53609 AC021851.1-201ENST00000608537 1082 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
PGGT1BP53609 STARD13-AS-235ENST00000609335 855 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
PGGT1BP53609 PAK3-213ENST00000620137 2130 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
PGGT1BP53609 AC011330.2-201ENST00000621680 635 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
PGGT1BP53609 AP002505.2-201ENST00000623585 696 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
PGGT1BP53609 AC072062.1-209ENST00000627336 772 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
PGGT1BP53609 AC018793.2-201ENST00000639584 585 ntAPPRIS P1 BASIC5.07□□□□□ -1.6
PGGT1BP53609 AC018793.3-201ENST00000640805 585 ntAPPRIS P1 BASIC5.07□□□□□ -1.6
PGGT1BP53609 CCDC169-204ENST00000379864 5944 ntTSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
PGGT1BP53609 CFH-206ENST00000630130 1658 ntTSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
PGGT1BP53609 SLAIN1-201ENST00000267219 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
PGGT1BP53609 LTN1-202ENST00000389194 7749 ntTSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
PGGT1BP53609 HEMGN-202ENST00000616898 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
PGGT1BP53609 SGO1-202ENST00000306698 1531 ntTSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
PGGT1BP53609 DPP8-203ENST00000341861 8699 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
PGGT1BP53609 CLEC12A-203ENST00000355690 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
PGGT1BP53609 LINC00989-201ENST00000508174 2080 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
PGGT1BP53609 ATXN3-207ENST00000503767 1315 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
PGGT1BP53609 POT1-AS1-205ENST00000453342 3252 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
PGGT1BP53609 CDC42SE2-201ENST00000360515 3591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
PGGT1BP53609 RNA5SP183-201ENST00000362452 119 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
PGGT1BP53609 LIX1L-AS1-201ENST00000366105 377 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
PGGT1BP53609 SIRPD-201ENST00000381621 823 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
PGGT1BP53609 SNORA67-201ENST00000384423 137 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
PGGT1BP53609 IGLV7-43-201ENST00000390298 385 ntAPPRIS P1 BASIC5.06□□□□□ -1.6
PGGT1BP53609 AL355615.1-201ENST00000406187 641 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
PGGT1BP53609 AL512422.1-201ENST00000407033 553 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
PGGT1BP53609 MIR1182-201ENST00000408363 97 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
PGGT1BP53609 NT5C3A-206ENST00000409787 840 ntTSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
PGGT1BP53609 RANP4-201ENST00000413361 655 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
PGGT1BP53609 AC073257.2-201ENST00000413991 528 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
PGGT1BP53609 LINC00867-202ENST00000415417 488 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
PGGT1BP53609 AC092811.1-201ENST00000428642 397 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
PGGT1BP53609 MTND5P25-201ENST00000430499 799 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
PGGT1BP53609 STXBP5-AS1-204ENST00000431143 644 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
PGGT1BP53609 TPTE2P1-203ENST00000434100 514 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
PGGT1BP53609 FOCAD-AS1-201ENST00000439876 359 ntTSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
PGGT1BP53609 AL512271.1-201ENST00000439878 434 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
PGGT1BP53609 MTCO1P53-201ENST00000441633 699 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
PGGT1BP53609 AC003991.1-205ENST00000447758 625 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
PGGT1BP53609 RPL7P55-201ENST00000450522 746 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
PGGT1BP53609 Z92846.1-201ENST00000456203 268 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
PGGT1BP53609 AL353633.1-201ENST00000458480 382 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
PGGT1BP53609 AC092957.1-201ENST00000473299 570 ntTSL 4 BASIC5.06□□□□□ -1.6
PGGT1BP53609 RN7SL101P-201ENST00000496350 279 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
PGGT1BP53609 AC008427.1-201ENST00000503102 655 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
PGGT1BP53609 AC012055.1-201ENST00000511346 1144 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
PGGT1BP53609 WDYHV1-203ENST00000518125 880 ntTSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
PGGT1BP53609 IGLVIV-64-201ENST00000518581 301 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
PGGT1BP53609 ZFAND1-208ENST00000519523 698 ntTSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
PGGT1BP53609 MAL2-208ENST00000523307 556 ntTSL 4 BASIC5.06□□□□□ -1.6
PGGT1BP53609 CCDC179-202ENST00000532798 791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
PGGT1BP53609 HNF1A-AS1-203ENST00000537361 659 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
PGGT1BP53609 PYM1-205ENST00000547925 499 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
PGGT1BP53609 AC090503.1-201ENST00000548029 729 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
PGGT1BP53609 C1GALT1P1-201ENST00000548895 1089 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
PGGT1BP53609 AC144548.2-201ENST00000550231 946 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
PGGT1BP53609 AC087897.2-201ENST00000552639 678 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
PGGT1BP53609 AC009139.2-201ENST00000569032 566 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
PGGT1BP53609 PDE6G-203ENST00000571224 526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
PGGT1BP53609 AC005951.1-201ENST00000576706 485 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
PGGT1BP53609 AC217774.1-201ENST00000578936 517 ntTSL 4 BASIC5.06□□□□□ -1.6
PGGT1BP53609 MIR4433B-201ENST00000581329 102 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.5 ms