Protein–RNA interactions for Protein: P18433

PTPRA, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase alpha, humanhuman

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Length 802 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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PTPRAP18433 RNF14-202ENST00000356143 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
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PTPRAP18433 FOPNL-201ENST00000255759 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
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PTPRAP18433 COLCA1-205ENST00000620864 8098 ntTSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
PTPRAP18433 MAK-202ENST00000354489 3941 ntTSL 5 BASIC7.07□□□□□ -1.28
PTPRAP18433 ZEB1-201ENST00000320985 5423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
PTPRAP18433 ALS2CR12-203ENST00000405148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
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PTPRAP18433 MUSK-206ENST00000416899 3344 ntTSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
PTPRAP18433 DICER1-201ENST00000343455 10277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
PTPRAP18433 ELAVL4-202ENST00000371819 2467 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC7.06□□□□□ -1.28
PTPRAP18433 LGI1-212ENST00000630184 2936 ntTSL 2 BASIC7.06□□□□□ -1.28
PTPRAP18433 MTND5P26-201ENST00000426018 1752 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
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