Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBW8

COPS7A, COP9 signalosome complex subunit 7a, humanhuman

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Length 275 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPS7AQ9UBW8 FANCD2-202ENST00000383807 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
COPS7AQ9UBW8 DNAAF4-CCPG1-201ENST00000565113 4589 ntTSL 2 BASIC4.69□□□□□ -1.66
COPS7AQ9UBW8 FAM204A-203ENST00000369183 13889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
COPS7AQ9UBW8 PRUNE2-204ENST00000376718 12584 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
COPS7AQ9UBW8 PTK2-212ENST00000519419 4439 ntTSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
COPS7AQ9UBW8 KLHL4-202ENST00000373119 5818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
COPS7AQ9UBW8 CLEC7A-203ENST00000310002 425 ntTSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
COPS7AQ9UBW8 OR10AG1-201ENST00000312345 1016 ntAPPRIS P1 BASIC4.69□□□□□ -1.66
COPS7AQ9UBW8 SNORA77-201ENST00000408716 125 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
COPS7AQ9UBW8 AC098820.3-201ENST00000414135 976 ntTSL 3 BASIC4.69□□□□□ -1.66
COPS7AQ9UBW8 GJA6P-201ENST00000415117 1042 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
COPS7AQ9UBW8 RBMY2QP-201ENST00000429799 1147 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
COPS7AQ9UBW8 NDUFA5P10-201ENST00000432147 357 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
COPS7AQ9UBW8 AL450384.1-201ENST00000433526 413 ntTSL 2 BASIC4.69□□□□□ -1.66
COPS7AQ9UBW8 PRPF38AP2-201ENST00000438179 851 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
COPS7AQ9UBW8 AC004824.1-201ENST00000439577 311 ntTSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
COPS7AQ9UBW8 MLIP-IT1-201ENST00000441845 643 ntTSL 2 BASIC4.69□□□□□ -1.66
COPS7AQ9UBW8 CASP3P1-201ENST00000446037 609 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
COPS7AQ9UBW8 TPRKBP1-201ENST00000456243 481 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
COPS7AQ9UBW8 AC073486.1-202ENST00000458437 489 ntTSL 3 BASIC4.69□□□□□ -1.66
COPS7AQ9UBW8 RN7SL610P-201ENST00000463845 291 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
COPS7AQ9UBW8 AC025181.1-201ENST00000477507 416 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
COPS7AQ9UBW8 RN7SL319P-201ENST00000480656 221 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
COPS7AQ9UBW8 RN7SL97P-201ENST00000486780 299 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
COPS7AQ9UBW8 AC005412.2-201ENST00000492004 341 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
COPS7AQ9UBW8 TM4SF1-AS1-202ENST00000496491 754 ntTSL 2 BASIC4.69□□□□□ -1.66
COPS7AQ9UBW8 HMGB1P3-201ENST00000502802 616 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
COPS7AQ9UBW8 CDH12P2-201ENST00000504393 298 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
COPS7AQ9UBW8 FGB-207ENST00000509493 1164 ntTSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
COPS7AQ9UBW8 AC114284.1-201ENST00000511422 1114 ntTSL 2 BASIC4.69□□□□□ -1.66
COPS7AQ9UBW8 AP001267.3-202ENST00000525992 448 ntTSL 3 BASIC4.69□□□□□ -1.66
COPS7AQ9UBW8 AP001978.1-201ENST00000526851 834 ntTSL 2 BASIC4.69□□□□□ -1.66
COPS7AQ9UBW8 AP000676.2-201ENST00000529711 301 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
COPS7AQ9UBW8 LDAH-211ENST00000541941 3807 ntTSL 2 BASIC4.69□□□□□ -1.66
COPS7AQ9UBW8 AC025263.2-201ENST00000550437 548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
COPS7AQ9UBW8 EDDM3DP-201ENST00000554692 434 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
COPS7AQ9UBW8 AC009562.1-202ENST00000558755 565 ntTSL 4 BASIC4.69□□□□□ -1.66
COPS7AQ9UBW8 AC020659.1-204ENST00000562920 400 ntTSL 3 BASIC4.69□□□□□ -1.66
COPS7AQ9UBW8 EIF1P5-201ENST00000585002 234 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
COPS7AQ9UBW8 MIR7515HG-254ENST00000593269 943 ntTSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
COPS7AQ9UBW8 AL021707.7-201ENST00000607991 416 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
COPS7AQ9UBW8 AC108359.1-201ENST00000616451 1211 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
COPS7AQ9UBW8 AC019206.1-201ENST00000621938 425 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
COPS7AQ9UBW8 CCL14-204ENST00000622526 472 ntTSL 3 BASIC4.69□□□□□ -1.66
COPS7AQ9UBW8 AC091905.4-201ENST00000623432 202 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
COPS7AQ9UBW8 AC007389.5-201ENST00000629214 744 ntTSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
COPS7AQ9UBW8 ZNRD1ASP-221ENST00000637794 1074 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
COPS7AQ9UBW8 FAM197Y3-202ENST00000427622 2325 ntTSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
COPS7AQ9UBW8 FAM197Y7-202ENST00000433321 2325 ntTSL 2 BASIC4.69□□□□□ -1.66
COPS7AQ9UBW8 ING3-201ENST00000315870 3777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
COPS7AQ9UBW8 RGS4-202ENST00000367908 2606 ntTSL 2 BASIC4.69□□□□□ -1.66
COPS7AQ9UBW8 PCDH9-201ENST00000377861 28227 ntTSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
COPS7AQ9UBW8 SCN1A-202ENST00000375405 8097 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
COPS7AQ9UBW8 PPP2R2A-201ENST00000315985 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC4.69□□□□□ -1.66
COPS7AQ9UBW8 AC007996.1-201ENST00000620414 2821 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
COPS7AQ9UBW8 DTNA-231ENST00000598774 2418 ntTSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
COPS7AQ9UBW8 SCN11A-202ENST00000444237 5729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.68□□□□□ -1.66
COPS7AQ9UBW8 DENND4A-201ENST00000431932 5875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
COPS7AQ9UBW8 VDAC3-201ENST00000022615 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
COPS7AQ9UBW8 FAM114A2-210ENST00000520313 1394 ntTSL 2 BASIC4.68□□□□□ -1.66
COPS7AQ9UBW8 SENP1-205ENST00000549595 1932 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.68□□□□□ -1.66
COPS7AQ9UBW8 GABRA3-201ENST00000370314 3712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
COPS7AQ9UBW8 GART-205ENST00000381839 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
COPS7AQ9UBW8 ZNF573-217ENST00000590414 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
COPS7AQ9UBW8 RNF145-201ENST00000274542 3364 ntTSL 2 BASIC4.68□□□□□ -1.66
COPS7AQ9UBW8 RGS10-201ENST00000369101 738 ntTSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
COPS7AQ9UBW8 SNORA70.10-201ENST00000384515 134 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
COPS7AQ9UBW8 VDAC2P1-201ENST00000399358 958 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
COPS7AQ9UBW8 AP002530.1-201ENST00000405705 684 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
COPS7AQ9UBW8 RN7SKP222-201ENST00000410651 315 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
COPS7AQ9UBW8 LINC00161-201ENST00000412526 870 ntTSL 2 BASIC4.68□□□□□ -1.66
COPS7AQ9UBW8 COX5BP7-201ENST00000414780 274 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
COPS7AQ9UBW8 CR848007.2-201ENST00000424918 787 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
COPS7AQ9UBW8 LINC01878-201ENST00000434559 769 ntTSL 3 BASIC4.68□□□□□ -1.66
COPS7AQ9UBW8 CLEC5A-203ENST00000439991 501 ntTSL 3 BASIC4.68□□□□□ -1.66
COPS7AQ9UBW8 RPS29P9-201ENST00000440360 171 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
COPS7AQ9UBW8 LINC01704-202ENST00000442358 649 ntTSL 3 BASIC4.68□□□□□ -1.66
COPS7AQ9UBW8 AC009487.1-201ENST00000444164 403 ntTSL 3 BASIC4.68□□□□□ -1.66
COPS7AQ9UBW8 AL591363.1-201ENST00000450091 483 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
COPS7AQ9UBW8 IGHV5-78-201ENST00000450948 295 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
COPS7AQ9UBW8 snoU13.20-201ENST00000459180 104 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
COPS7AQ9UBW8 HESX1-202ENST00000473921 757 ntTSL 5 BASIC4.68□□□□□ -1.66
COPS7AQ9UBW8 BX284632.1-201ENST00000478218 541 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
COPS7AQ9UBW8 FO393419.2-201ENST00000492975 428 ntTSL 3 BASIC4.68□□□□□ -1.66
COPS7AQ9UBW8 RN7SL808P-201ENST00000496066 299 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
COPS7AQ9UBW8 AC140172.1-201ENST00000502928 141 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
COPS7AQ9UBW8 MYL12BP2-201ENST00000503948 512 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
COPS7AQ9UBW8 RNA5SP43-201ENST00000516559 110 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
COPS7AQ9UBW8 AC025434.1-201ENST00000520705 460 ntTSL 3 BASIC4.68□□□□□ -1.66
COPS7AQ9UBW8 AC138360.1-201ENST00000552332 386 ntTSL 3 BASIC4.68□□□□□ -1.66
COPS7AQ9UBW8 AC055874.1-201ENST00000561458 479 ntTSL 2 BASIC4.68□□□□□ -1.66
COPS7AQ9UBW8 AP005059.1-201ENST00000578391 456 ntTSL 2 BASIC4.68□□□□□ -1.66
COPS7AQ9UBW8 MIR4646-201ENST00000580775 63 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
COPS7AQ9UBW8 MIR4691-201ENST00000583764 85 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
COPS7AQ9UBW8 AC005324.5-201ENST00000584540 571 ntTSL 5 BASIC4.68□□□□□ -1.66
COPS7AQ9UBW8 AC011487.3-201ENST00000593607 453 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
COPS7AQ9UBW8 AL445222.1-201ENST00000607259 628 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
COPS7AQ9UBW8 AC104307.1-201ENST00000616142 196 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
COPS7AQ9UBW8 AL162233.1-201ENST00000620014 944 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
COPS7AQ9UBW8 AP001005.3-201ENST00000622049 129 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
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