Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZN3

EHD3, EH domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 535 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EHD3Q9NZN3 AC004990.1-201ENST00000431722 564 ntTSL 4 BASIC5.41□□□□□ -1.54
EHD3Q9NZN3 TEX41-206ENST00000432608 661 ntTSL 3 BASIC5.41□□□□□ -1.54
EHD3Q9NZN3 AL137186.1-201ENST00000440436 480 ntTSL 3 BASIC5.41□□□□□ -1.54
EHD3Q9NZN3 AC019330.1-202ENST00000440609 504 ntTSL 4 BASIC5.41□□□□□ -1.54
EHD3Q9NZN3 DCN-205ENST00000441303 519 ntTSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
EHD3Q9NZN3 MED28P3-201ENST00000444288 531 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
EHD3Q9NZN3 HMGB3P6-201ENST00000444896 598 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
EHD3Q9NZN3 OTX2P1-201ENST00000450956 354 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
EHD3Q9NZN3 TPTE2P6-203ENST00000450973 649 ntTSL 5 BASIC5.41□□□□□ -1.54
EHD3Q9NZN3 DCN-206ENST00000456569 228 ntTSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
EHD3Q9NZN3 AC004930.1-201ENST00000470677 254 ntTSL 2 BASIC5.41□□□□□ -1.54
EHD3Q9NZN3 DUBR-205ENST00000495228 411 ntTSL 2 BASIC5.41□□□□□ -1.54
EHD3Q9NZN3 GYPA-203ENST00000503627 318 ntTSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
EHD3Q9NZN3 TMEM161B-AS1-208ENST00000507736 630 ntTSL 3 BASIC5.41□□□□□ -1.54
EHD3Q9NZN3 AC084871.1-201ENST00000508020 628 ntTSL 3 BASIC5.41□□□□□ -1.54
EHD3Q9NZN3 AC097535.1-201ENST00000515263 332 ntTSL 3 BASIC5.41□□□□□ -1.54
EHD3Q9NZN3 GAPDHP62-201ENST00000515313 990 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
EHD3Q9NZN3 AC025434.1-201ENST00000520705 460 ntTSL 3 BASIC5.41□□□□□ -1.54
EHD3Q9NZN3 ZFAND1-217ENST00000521895 885 ntTSL 3 BASIC5.41□□□□□ -1.54
EHD3Q9NZN3 AP000926.4-201ENST00000527351 454 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
EHD3Q9NZN3 AP003557.1-202ENST00000528978 562 ntTSL 4 BASIC5.41□□□□□ -1.54
EHD3Q9NZN3 AC087276.4-201ENST00000530042 444 ntTSL 3 BASIC5.41□□□□□ -1.54
EHD3Q9NZN3 LINC01493-201ENST00000530102 460 ntTSL 5 BASIC5.41□□□□□ -1.54
EHD3Q9NZN3 OR52E8-201ENST00000537935 1061 ntAPPRIS P1 BASIC5.41□□□□□ -1.54
EHD3Q9NZN3 GCSHP4-201ENST00000538792 439 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
EHD3Q9NZN3 SNHG1-218ENST00000541615 748 ntTSL 5 BASIC5.41□□□□□ -1.54
EHD3Q9NZN3 CPSF7-220ENST00000541963 549 ntTSL 4 BASIC5.41□□□□□ -1.54
EHD3Q9NZN3 AC006518.2-201ENST00000542513 940 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
EHD3Q9NZN3 LINC02411-203ENST00000546180 959 ntTSL 4 BASIC5.41□□□□□ -1.54
EHD3Q9NZN3 AC004551.1-201ENST00000552784 575 ntTSL 4 BASIC5.41□□□□□ -1.54
EHD3Q9NZN3 AL355076.2-201ENST00000555736 544 ntTSL 5 BASIC5.41□□□□□ -1.54
EHD3Q9NZN3 PSMA4-206ENST00000558341 719 ntTSL 5 BASIC5.41□□□□□ -1.54
EHD3Q9NZN3 AC009120.4-201ENST00000564455 513 ntTSL 5 BASIC5.41□□□□□ -1.54
EHD3Q9NZN3 MIR762HG-201ENST00000564901 648 ntTSL 2 BASIC5.41□□□□□ -1.54
EHD3Q9NZN3 AC016134.1-201ENST00000565259 701 ntTSL 3 BASIC5.41□□□□□ -1.54
EHD3Q9NZN3 ZNF971P-202ENST00000568619 461 ntTSL 3 BASIC5.41□□□□□ -1.54
EHD3Q9NZN3 AC015688.2-201ENST00000584523 262 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
EHD3Q9NZN3 AC018761.4-201ENST00000585742 272 ntTSL 3 BASIC5.41□□□□□ -1.54
EHD3Q9NZN3 AC012557.1-201ENST00000607115 611 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
EHD3Q9NZN3 AL096712.1-201ENST00000614561 159 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
EHD3Q9NZN3 PRDM2-206ENST00000413440 6175 ntTSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
EHD3Q9NZN3 MYBPC1-216ENST00000550270 3426 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.41□□□□□ -1.54
EHD3Q9NZN3 ODAM-201ENST00000396094 1319 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.41□□□□□ -1.54
EHD3Q9NZN3 RABGAP1L-205ENST00000367687 1849 ntTSL 2 BASIC5.41□□□□□ -1.54
EHD3Q9NZN3 OR5B12-202ENST00000641921 1807 ntAPPRIS P1 BASIC5.41□□□□□ -1.54
EHD3Q9NZN3 CFL2-201ENST00000298159 6747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
EHD3Q9NZN3 LRRC49-223ENST00000560369 2586 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC5.41□□□□□ -1.54
EHD3Q9NZN3 C3orf35-203ENST00000425564 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
EHD3Q9NZN3 CCT6B-203ENST00000436961 1639 ntTSL 2 BASIC5.41□□□□□ -1.54
EHD3Q9NZN3 DDHD2-202ENST00000517385 4113 ntTSL 2 BASIC5.41□□□□□ -1.54
EHD3Q9NZN3 EEF1A1P33-201ENST00000554413 1362 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
EHD3Q9NZN3 SLC26A7-208ENST00000523719 2902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.41□□□□□ -1.54
EHD3Q9NZN3 SMC2-AS1-201ENST00000603487 7020 ntTSL 2 BASIC5.4□□□□□ -1.54
EHD3Q9NZN3 ZNF492-201ENST00000456783 4245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.54
EHD3Q9NZN3 SULF1-204ENST00000458141 5551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.54
EHD3Q9NZN3 KTN1-223ENST00000555573 1712 ntTSL 2 BASIC5.4□□□□□ -1.54
EHD3Q9NZN3 WDR12-201ENST00000261015 8100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.54
EHD3Q9NZN3 OR5AN1-203ENST00000641998 7647 ntAPPRIS P1 BASIC5.4□□□□□ -1.54
EHD3Q9NZN3 ZNF260-204ENST00000592282 5055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.54
EHD3Q9NZN3 DOCK10-202ENST00000409592 7288 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.54
EHD3Q9NZN3 DBT-201ENST00000370131 1521 ntTSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.54
EHD3Q9NZN3 CDC42BPA-204ENST00000366767 9320 ntTSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.54
EHD3Q9NZN3 SAMD9L-204ENST00000437805 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.54
EHD3Q9NZN3 SCGB3A2-201ENST00000296694 515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.54
EHD3Q9NZN3 USMG5-201ENST00000309579 364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.54
EHD3Q9NZN3 ANKRD36P1-201ENST00000344424 659 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
EHD3Q9NZN3 FETUB-203ENST00000382136 1040 ntTSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.54
EHD3Q9NZN3 SNORD65C-201ENST00000390962 71 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
EHD3Q9NZN3 HIST1H3PS1-201ENST00000404612 417 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
EHD3Q9NZN3 AL356131.1-201ENST00000405826 414 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
EHD3Q9NZN3 RPS7P9-201ENST00000414704 586 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
EHD3Q9NZN3 AL591468.1-201ENST00000417932 573 ntTSL 3 BASIC5.4□□□□□ -1.54
EHD3Q9NZN3 KCNMA1-AS3-201ENST00000418515 701 ntTSL 3 BASIC5.4□□□□□ -1.54
EHD3Q9NZN3 QRSL1P2-201ENST00000418582 964 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
EHD3Q9NZN3 MFSD13B-201ENST00000420133 1290 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
EHD3Q9NZN3 BX470102.1-201ENST00000420695 531 ntTSL 2 BASIC5.4□□□□□ -1.54
EHD3Q9NZN3 C1DP1-201ENST00000426049 402 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
EHD3Q9NZN3 RPP40P1-201ENST00000426762 456 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
EHD3Q9NZN3 NPM1P22-201ENST00000427761 952 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
EHD3Q9NZN3 AL122010.1-201ENST00000429293 720 ntTSL 2 BASIC5.4□□□□□ -1.54
EHD3Q9NZN3 AC006369.2-201ENST00000431712 384 ntTSL 3 BASIC5.4□□□□□ -1.54
EHD3Q9NZN3 GAPDHP34-201ENST00000432112 823 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
EHD3Q9NZN3 MAJIN-202ENST00000432175 838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.54
EHD3Q9NZN3 MIR99AHG-205ENST00000435697 716 ntTSL 2 BASIC5.4□□□□□ -1.54
EHD3Q9NZN3 TRAPPC13P1-201ENST00000435991 1062 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
EHD3Q9NZN3 AC073143.1-201ENST00000436316 395 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
EHD3Q9NZN3 GAPDHP48-201ENST00000436626 961 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
EHD3Q9NZN3 AL008629.1-201ENST00000438615 184 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
EHD3Q9NZN3 LINC01309-201ENST00000444795 492 ntTSL 3 BASIC5.4□□□□□ -1.54
EHD3Q9NZN3 AC093157.1-204ENST00000454721 753 ntTSL 3 BASIC5.4□□□□□ -1.54
EHD3Q9NZN3 RPL7P32-201ENST00000457119 744 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
EHD3Q9NZN3 RN7SL197P-201ENST00000466981 299 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
EHD3Q9NZN3 AC094085.1-201ENST00000468914 584 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
EHD3Q9NZN3 AC117394.1-201ENST00000477323 567 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
EHD3Q9NZN3 AC126121.1-201ENST00000482313 553 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
EHD3Q9NZN3 ATP5LP5-201ENST00000483050 299 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
EHD3Q9NZN3 AC073610.1-201ENST00000489971 396 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
EHD3Q9NZN3 AC023050.1-201ENST00000498198 304 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
EHD3Q9NZN3 SCGB3A2-202ENST00000504320 440 ntTSL 3 BASIC5.4□□□□□ -1.54
EHD3Q9NZN3 AC098859.2-201ENST00000506232 563 ntTSL 4 BASIC5.4□□□□□ -1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 113.1 ms