Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0C6

CIPC, CLOCK-interacting pacemaker, humanhuman

Predictions only

Length 399 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CIPCQ9C0C6 SNRPFP2-201ENST00000440710 251 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
CIPCQ9C0C6 SETD6P1-201ENST00000444575 317 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
CIPCQ9C0C6 BBIP1-206ENST00000447005 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.47□□□□□ -1.53
CIPCQ9C0C6 AL389915.2-201ENST00000454576 441 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
CIPCQ9C0C6 OFD1P7Y-201ENST00000454643 1155 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
CIPCQ9C0C6 LINC01436-201ENST00000457157 1048 ntTSL 2 BASIC5.47□□□□□ -1.53
CIPCQ9C0C6 NAP1L1P3-201ENST00000462291 880 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
CIPCQ9C0C6 CREM-220ENST00000463314 964 ntTSL 2 BASIC5.47□□□□□ -1.53
CIPCQ9C0C6 RPL7AP6-201ENST00000477943 801 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
CIPCQ9C0C6 RPL7P40-201ENST00000481703 745 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
CIPCQ9C0C6 AC116562.1-201ENST00000485355 781 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
CIPCQ9C0C6 LINC02039-201ENST00000507428 566 ntTSL 4 BASIC5.47□□□□□ -1.53
CIPCQ9C0C6 AC093752.1-206ENST00000511823 336 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
CIPCQ9C0C6 PDZD9-203ENST00000537222 1068 ntTSL 3 BASIC5.47□□□□□ -1.53
CIPCQ9C0C6 C8orf59-206ENST00000545322 491 ntTSL 3 BASIC5.47□□□□□ -1.53
CIPCQ9C0C6 MIR4307HG-201ENST00000548170 822 ntTSL 3 BASIC5.47□□□□□ -1.53
CIPCQ9C0C6 AC009101.2-201ENST00000564293 456 ntTSL 3 BASIC5.47□□□□□ -1.53
CIPCQ9C0C6 AC087190.2-201ENST00000565648 731 ntTSL 3 BASIC5.47□□□□□ -1.53
CIPCQ9C0C6 AC008088.1-201ENST00000580993 280 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
CIPCQ9C0C6 AC090616.5-201ENST00000581225 299 ntTSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
CIPCQ9C0C6 AL360012.1-201ENST00000602813 131 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
CIPCQ9C0C6 AC002128.2-201ENST00000604161 618 ntTSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
CIPCQ9C0C6 AC064807.4-201ENST00000607201 407 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
CIPCQ9C0C6 AC009163.6-201ENST00000612367 342 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
CIPCQ9C0C6 C8orf89-201ENST00000613105 495 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
CIPCQ9C0C6 PDCD6IPP1-201ENST00000615124 579 ntTSL 2 BASIC5.47□□□□□ -1.53
CIPCQ9C0C6 RMST_10.1-201ENST00000616309 154 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
CIPCQ9C0C6 AC118658.2-201ENST00000618697 459 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
CIPCQ9C0C6 AC097495.1-201ENST00000637675 546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
CIPCQ9C0C6 MCM9-209ENST00000619706 4822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
CIPCQ9C0C6 OR8A1-203ENST00000641670 5709 ntAPPRIS P1 BASIC5.47□□□□□ -1.53
CIPCQ9C0C6 NKAIN2-204ENST00000545433 3052 ntTSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
CIPCQ9C0C6 AC079298.1-201ENST00000625026 1619 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
CIPCQ9C0C6 DNAH8-201ENST00000327475 14360 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
CIPCQ9C0C6 ESCO1-204ENST00000622333 1850 ntTSL 2 BASIC5.47□□□□□ -1.53
CIPCQ9C0C6 ANO4-202ENST00000392979 3909 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.47□□□□□ -1.53
CIPCQ9C0C6 ZFAND6-213ENST00000559835 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
CIPCQ9C0C6 FOXN2-203ENST00000616844 1414 ntTSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
CIPCQ9C0C6 AC007342.5-201ENST00000571340 2142 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
CIPCQ9C0C6 ANKS1B-216ENST00000549558 2268 ntTSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.53
CIPCQ9C0C6 PWRN2-202ENST00000567246 4295 ntTSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.53
CIPCQ9C0C6 DYNC1I2-207ENST00000410079 2159 ntTSL 2 BASIC5.46□□□□□ -1.53
CIPCQ9C0C6 PNPLA4-203ENST00000444736 2752 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC5.46□□□□□ -1.53
CIPCQ9C0C6 AC079097.1-201ENST00000512187 1399 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
CIPCQ9C0C6 CNGA1-207ENST00000514170 2837 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.54
CIPCQ9C0C6 ZNF559-201ENST00000317221 2732 ntTSL 2 BASIC5.46□□□□□ -1.54
CIPCQ9C0C6 GPATCH11-201ENST00000281932 3570 ntTSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
CIPCQ9C0C6 OR11H1-201ENST00000252835 982 ntAPPRIS P1 BASIC5.46□□□□□ -1.54
CIPCQ9C0C6 HMGB1P10-201ENST00000395823 563 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
CIPCQ9C0C6 AL603865.2-201ENST00000401679 213 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
CIPCQ9C0C6 AL049545.1-201ENST00000401856 572 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
CIPCQ9C0C6 ATF1P1-201ENST00000406040 927 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
CIPCQ9C0C6 RN7SKP126-201ENST00000411143 300 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
CIPCQ9C0C6 AL449283.1-202ENST00000418249 604 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
CIPCQ9C0C6 AC004543.1-201ENST00000418764 369 ntTSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.54
CIPCQ9C0C6 USP9YP21-201ENST00000420603 432 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
CIPCQ9C0C6 Z97206.2-201ENST00000423489 589 ntTSL 3 BASIC5.46□□□□□ -1.54
CIPCQ9C0C6 PNRC2P1-201ENST00000423940 420 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
CIPCQ9C0C6 AL391832.1-201ENST00000423963 423 ntTSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.54
CIPCQ9C0C6 AL161640.1-201ENST00000429507 390 ntTSL 2 BASIC5.46□□□□□ -1.54
CIPCQ9C0C6 BX276092.6-201ENST00000430476 250 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
CIPCQ9C0C6 FSIP2-AS1-202ENST00000436557 689 ntTSL 3 BASIC5.46□□□□□ -1.54
CIPCQ9C0C6 AC000041.1-201ENST00000439655 175 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
CIPCQ9C0C6 CEACAMP7-201ENST00000444105 496 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
CIPCQ9C0C6 AC023271.1-201ENST00000445936 1090 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
CIPCQ9C0C6 AC004022.1-201ENST00000447766 1066 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
CIPCQ9C0C6 LRRC69-202ENST00000448384 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.54
CIPCQ9C0C6 AC008280.2-201ENST00000455473 307 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
CIPCQ9C0C6 BX276092.8-201ENST00000455722 250 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
CIPCQ9C0C6 RN7SL329P-201ENST00000467740 299 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
CIPCQ9C0C6 RN7SL826P-201ENST00000479724 288 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
CIPCQ9C0C6 RPL7P6-201ENST00000480903 738 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
CIPCQ9C0C6 CCDC39-AS1-201ENST00000495357 283 ntTSL 3 BASIC5.46□□□□□ -1.54
CIPCQ9C0C6 PCAT1-201ENST00000519319 734 ntTSL 2 BASIC5.46□□□□□ -1.54
CIPCQ9C0C6 SNHG1-204ENST00000537068 629 ntTSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.54
CIPCQ9C0C6 YWHABP2-201ENST00000540201 713 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
CIPCQ9C0C6 AC135279.1-201ENST00000543493 504 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
CIPCQ9C0C6 AL357172.1-201ENST00000556016 593 ntTSL 3 BASIC5.46□□□□□ -1.54
CIPCQ9C0C6 OR11H2-201ENST00000556246 948 ntAPPRIS P1 BASIC5.46□□□□□ -1.54
CIPCQ9C0C6 USP3-AS1-202ENST00000559357 455 ntTSL 2 BASIC5.46□□□□□ -1.54
CIPCQ9C0C6 AC012170.3-201ENST00000560159 297 ntTSL 2 BASIC5.46□□□□□ -1.54
CIPCQ9C0C6 AC009117.3-202ENST00000563825 557 ntTSL 4 BASIC5.46□□□□□ -1.54
CIPCQ9C0C6 AC106729.1-201ENST00000567777 466 ntTSL 3 BASIC5.46□□□□□ -1.54
CIPCQ9C0C6 TEX41-222ENST00000597173 1134 ntTSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
CIPCQ9C0C6 LINC01198-207ENST00000598084 881 ntTSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.54
CIPCQ9C0C6 AC087763.1-201ENST00000603391 286 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
CIPCQ9C0C6 LINC00397-202ENST00000606785 409 ntTSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.54
CIPCQ9C0C6 AL139124.1-201ENST00000609123 421 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
CIPCQ9C0C6 NCRUPAR_2.1-201ENST00000616308 99 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
CIPCQ9C0C6 AC090510.2-201ENST00000617465 629 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
CIPCQ9C0C6 AC022079.2-201ENST00000619739 566 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
CIPCQ9C0C6 AL136084.2-203ENST00000630758 690 ntTSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.54
CIPCQ9C0C6 AC068137.4-201ENST00000638485 296 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
CIPCQ9C0C6 ZNF280B-201ENST00000613655 3714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.54
CIPCQ9C0C6 ERCC6L-201ENST00000334463 4243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
CIPCQ9C0C6 KAT6B-201ENST00000287239 8287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
CIPCQ9C0C6 GAPT-202ENST00000396776 3016 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.46□□□□□ -1.54
CIPCQ9C0C6 ANK3-201ENST00000280772 16874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
CIPCQ9C0C6 AC025428.2-201ENST00000435367 2672 ntTSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
CIPCQ9C0C6 ABCC13-202ENST00000463099 3842 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
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