Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0C4

SEMA4C, Semaphorin-4C, humanhuman

Predictions only

Length 833 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA4CQ9C0C4 C8orf22-201ENST00000303202 1499 ntTSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
SEMA4CQ9C0C4 LIPF-203ENST00000394375 1470 ntTSL 2 BASIC5.36□□□□□ -1.55
SEMA4CQ9C0C4 CEP85L-201ENST00000360290 1736 ntTSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
SEMA4CQ9C0C4 CYP2C8-210ENST00000535898 1799 ntTSL 2 BASIC5.36□□□□□ -1.55
SEMA4CQ9C0C4 TMEM99-201ENST00000301665 2058 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC5.36□□□□□ -1.55
SEMA4CQ9C0C4 SON-204ENST00000381692 2463 ntTSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
SEMA4CQ9C0C4 GPHN-204ENST00000543237 2459 ntTSL 2 BASIC5.36□□□□□ -1.55
SEMA4CQ9C0C4 MFSD8-219ENST00000641228 2559 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
SEMA4CQ9C0C4 MYBPC1-207ENST00000545503 3569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
SEMA4CQ9C0C4 AL034546.1-201ENST00000623740 3693 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
SEMA4CQ9C0C4 OR7A5-201ENST00000322301 4216 ntAPPRIS P1 BASIC5.36□□□□□ -1.55
SEMA4CQ9C0C4 CDC5L-201ENST00000371477 6423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
SEMA4CQ9C0C4 SLC12A1-205ENST00000558405 3426 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
SEMA4CQ9C0C4 SCN2A-207ENST00000631182 8430 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
SEMA4CQ9C0C4 MRE11-203ENST00000393241 2604 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
SEMA4CQ9C0C4 AC026951.1-201ENST00000559530 2459 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
SEMA4CQ9C0C4 AC112255.1-201ENST00000624070 2493 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
SEMA4CQ9C0C4 MFSD8-239ENST00000641590 2479 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
SEMA4CQ9C0C4 ADAM24P-201ENST00000398655 2101 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
SEMA4CQ9C0C4 MTX3-204ENST00000617335 6155 ntTSL 2 BASIC5.35□□□□□ -1.55
SEMA4CQ9C0C4 PEX26-201ENST00000329627 18445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
SEMA4CQ9C0C4 MTERF1-201ENST00000351870 1997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
SEMA4CQ9C0C4 CDC27P2-201ENST00000425026 1922 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
SEMA4CQ9C0C4 WDPCP-203ENST00000409120 5408 ntTSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
SEMA4CQ9C0C4 ALG2-202ENST00000319033 1627 ntTSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
SEMA4CQ9C0C4 AL158152.1-201ENST00000602652 1435 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
SEMA4CQ9C0C4 BNIP3L-202ENST00000518611 1352 ntTSL 2 BASIC5.35□□□□□ -1.55
SEMA4CQ9C0C4 TCF7L2-206ENST00000355995 4073 ntTSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
SEMA4CQ9C0C4 SUCLA2P2-201ENST00000417269 1309 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
SEMA4CQ9C0C4 OR6C3-202ENST00000641364 1341 ntAPPRIS P1 BASIC5.35□□□□□ -1.55
SEMA4CQ9C0C4 RAD1P1-201ENST00000231383 813 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
SEMA4CQ9C0C4 OR8I2-201ENST00000302124 1010 ntAPPRIS P1 BASIC5.35□□□□□ -1.55
SEMA4CQ9C0C4 C11orf74-201ENST00000334307 863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
SEMA4CQ9C0C4 AL159987.1-201ENST00000347911 293 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
SEMA4CQ9C0C4 RNU4-28P-201ENST00000364739 141 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
SEMA4CQ9C0C4 PLG-203ENST00000366924 1166 ntTSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
SEMA4CQ9C0C4 AC234772.1-201ENST00000377927 937 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
SEMA4CQ9C0C4 Y_RNA.436-201ENST00000384097 102 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
SEMA4CQ9C0C4 CYB5AP4-201ENST00000396692 399 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
SEMA4CQ9C0C4 HMGB3P19-201ENST00000403971 560 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
SEMA4CQ9C0C4 HIST1H3PS1-201ENST00000404612 417 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
SEMA4CQ9C0C4 Z86062.1-201ENST00000406773 777 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
SEMA4CQ9C0C4 LSM5-206ENST00000409987 504 ntTSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
SEMA4CQ9C0C4 AL596247.1-201ENST00000416076 442 ntTSL 3 BASIC5.35□□□□□ -1.55
SEMA4CQ9C0C4 RPS24P7-201ENST00000416921 246 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
SEMA4CQ9C0C4 OR5M12P-201ENST00000423388 929 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
SEMA4CQ9C0C4 TCEAL3-AS1-201ENST00000424887 361 ntTSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
SEMA4CQ9C0C4 AC008568.1-203ENST00000433406 765 ntTSL 3 BASIC5.35□□□□□ -1.55
SEMA4CQ9C0C4 USP24P1-201ENST00000433802 779 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
SEMA4CQ9C0C4 AL162385.2-201ENST00000437864 285 ntTSL 3 BASIC5.35□□□□□ -1.55
SEMA4CQ9C0C4 AC004022.1-201ENST00000447766 1066 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
SEMA4CQ9C0C4 ART2BP-201ENST00000453501 499 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
SEMA4CQ9C0C4 AC005304.1-201ENST00000457609 405 ntTSL 3 BASIC5.35□□□□□ -1.55
SEMA4CQ9C0C4 SETP6-201ENST00000479329 568 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
SEMA4CQ9C0C4 AC073610.1-201ENST00000489971 396 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
SEMA4CQ9C0C4 RN7SL346P-201ENST00000491561 294 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
SEMA4CQ9C0C4 LNX1-AS2-201ENST00000502410 347 ntTSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
SEMA4CQ9C0C4 MSMO1-203ENST00000504317 1026 ntTSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
SEMA4CQ9C0C4 AC112184.1-201ENST00000505179 312 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
SEMA4CQ9C0C4 AC019133.1-201ENST00000508292 420 ntTSL 3 BASIC5.35□□□□□ -1.55
SEMA4CQ9C0C4 AC093752.1-206ENST00000511823 336 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
SEMA4CQ9C0C4 LNX1-AS1-204ENST00000514364 495 ntTSL 3 BASIC5.35□□□□□ -1.55
SEMA4CQ9C0C4 NSMCE2-202ENST00000517315 996 ntTSL 3 BASIC5.35□□□□□ -1.55
SEMA4CQ9C0C4 AF117829.1-208ENST00000521996 915 ntTSL 3 BASIC5.35□□□□□ -1.55
SEMA4CQ9C0C4 AC136777.2-201ENST00000522979 358 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
SEMA4CQ9C0C4 RRAS2-205ENST00000529237 1278 ntTSL 2 BASIC5.35□□□□□ -1.55
SEMA4CQ9C0C4 AC100763.1-201ENST00000532735 522 ntTSL 3 BASIC5.35□□□□□ -1.55
SEMA4CQ9C0C4 AP003049.2-202ENST00000532929 803 ntTSL 3 BASIC5.35□□□□□ -1.55
SEMA4CQ9C0C4 AC090607.1-201ENST00000560057 449 ntTSL 3 BASIC5.35□□□□□ -1.55
SEMA4CQ9C0C4 AC019322.1-201ENST00000571869 389 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
SEMA4CQ9C0C4 LINC00511-212ENST00000581183 657 ntTSL 3 BASIC5.35□□□□□ -1.55
SEMA4CQ9C0C4 AC004448.4-204ENST00000585389 743 ntTSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
SEMA4CQ9C0C4 NANOGP3-201ENST00000605855 286 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
SEMA4CQ9C0C4 AC092902.2-219ENST00000608488 822 ntTSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
SEMA4CQ9C0C4 AC093673.2-201ENST00000609674 331 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
SEMA4CQ9C0C4 AL034549.1-201ENST00000615120 578 ntTSL 2 BASIC5.35□□□□□ -1.55
SEMA4CQ9C0C4 LINC01709-202ENST00000635702 1204 ntTSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
SEMA4CQ9C0C4 CCDC195-201ENST00000638102 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
SEMA4CQ9C0C4 ZNF432-202ENST00000594154 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
SEMA4CQ9C0C4 TAX1BP1-203ENST00000409980 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
SEMA4CQ9C0C4 LRRC8B-201ENST00000330947 7593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
SEMA4CQ9C0C4 NAMPTP1-201ENST00000440465 2514 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
SEMA4CQ9C0C4 AADAT-202ENST00000353187 2101 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.35□□□□□ -1.55
SEMA4CQ9C0C4 SRGAP1-201ENST00000355086 23331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
SEMA4CQ9C0C4 SUPT3H-202ENST00000371459 2091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
SEMA4CQ9C0C4 NTRK3-205ENST00000394480 19984 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
SEMA4CQ9C0C4 GTPBP10-201ENST00000222511 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
SEMA4CQ9C0C4 IPCEF1-203ENST00000422970 3267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
SEMA4CQ9C0C4 AL355306.2-206ENST00000635233 1903 ntTSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
SEMA4CQ9C0C4 AC006484.1-201ENST00000435086 1884 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
SEMA4CQ9C0C4 GABRG1-201ENST00000295452 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
SEMA4CQ9C0C4 FILIP1L-201ENST00000331335 4219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
SEMA4CQ9C0C4 PHLDB2-214ENST00000495180 4159 ntTSL 2 BASIC5.34□□□□□ -1.55
SEMA4CQ9C0C4 RABGAP1L-203ENST00000347255 1744 ntTSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
SEMA4CQ9C0C4 ADAM21-201ENST00000603540 2658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.34□□□□□ -1.55
SEMA4CQ9C0C4 AC011503.2-201ENST00000594230 1500 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
SEMA4CQ9C0C4 CCR5-201ENST00000292303 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
SEMA4CQ9C0C4 USP50-205ENST00000616326 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.55
SEMA4CQ9C0C4 OR52A5-201ENST00000307388 3973 ntAPPRIS P1 BASIC5.34□□□□□ -1.55
SEMA4CQ9C0C4 OR52A5-202ENST00000642125 3993 ntAPPRIS P1 BASIC5.34□□□□□ -1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 103.9 ms