Protein–RNA interactions for Protein: Q96LT4

SAMD8, Sphingomyelin synthase-related protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 415 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAMD8Q96LT4 AC011447.7-201ENST00000624228 1590 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
SAMD8Q96LT4 C11orf65-208ENST00000615746 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.67
SAMD8Q96LT4 AC007681.1-201ENST00000604271 3438 ntTSL 4 BASIC4.65□□□□□ -1.67
SAMD8Q96LT4 CASC19-221ENST00000641309 1382 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
SAMD8Q96LT4 FILIP1-203ENST00000393004 7807 ntTSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.67
SAMD8Q96LT4 OR6B1-202ENST00000641698 5153 ntAPPRIS P1 BASIC4.64□□□□□ -1.67
SAMD8Q96LT4 TMEM30A-202ENST00000370050 3775 ntTSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
SAMD8Q96LT4 CYP1D1P-201ENST00000416662 1433 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
SAMD8Q96LT4 STAU2-220ENST00000522695 2646 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
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SAMD8Q96LT4 PDE4D-205ENST00000360047 3122 ntTSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
SAMD8Q96LT4 ZNF117-201ENST00000282869 9080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
SAMD8Q96LT4 ACTR3BP5-201ENST00000448440 1479 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
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SAMD8Q96LT4 ZNF273-204ENST00000476120 2000 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.64□□□□□ -1.67
SAMD8Q96LT4 MTCO1P11-201ENST00000429111 1528 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
SAMD8Q96LT4 CENPW-203ENST00000368328 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
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SAMD8Q96LT4 COX6CP13-201ENST00000428703 226 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
SAMD8Q96LT4 FAM96AP1-201ENST00000430879 482 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
SAMD8Q96LT4 AC010890.1-202ENST00000432414 535 ntTSL 3 BASIC4.64□□□□□ -1.67
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SAMD8Q96LT4 AC008269.1-201ENST00000438070 646 ntTSL 3 BASIC4.64□□□□□ -1.67
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SAMD8Q96LT4 AL355592.1-201ENST00000450292 386 ntTSL 2 BASIC4.64□□□□□ -1.67
SAMD8Q96LT4 AL161630.1-201ENST00000450938 1299 ntTSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
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SAMD8Q96LT4 AP000942.1-201ENST00000463969 747 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
SAMD8Q96LT4 LINC02383-201ENST00000508563 582 ntTSL 3 BASIC4.64□□□□□ -1.67
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SAMD8Q96LT4 HDAC2-AS2-217ENST00000523087 493 ntTSL 3 BASIC4.64□□□□□ -1.67
SAMD8Q96LT4 AC113386.1-201ENST00000523584 381 ntTSL 5 BASIC4.64□□□□□ -1.67
SAMD8Q96LT4 AC103681.1-202ENST00000534342 449 ntTSL 3 BASIC4.64□□□□□ -1.67
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SAMD8Q96LT4 TEX49-202ENST00000548380 573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
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SAMD8Q96LT4 RABGAP1L-202ENST00000325589 1880 ntTSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
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SAMD8Q96LT4 APAF1-209ENST00000550527 6581 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
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SAMD8Q96LT4 ABCA6-206ENST00000590645 1511 ntTSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
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SAMD8Q96LT4 ESCO1-204ENST00000622333 1850 ntTSL 2 BASIC4.63□□□□□ -1.67
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SAMD8Q96LT4 MPDZ-204ENST00000381022 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.63□□□□□ -1.67
SAMD8Q96LT4 IPO5-201ENST00000261574 6003 ntTSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
SAMD8Q96LT4 DEC1-201ENST00000374016 1251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
SAMD8Q96LT4 ZNF788-202ENST00000397759 777 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.63□□□□□ -1.67
SAMD8Q96LT4 NPM1P10-201ENST00000398310 865 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
SAMD8Q96LT4 RNU6ATAC18P-201ENST00000408413 101 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
SAMD8Q96LT4 RN7SKP97-201ENST00000410966 333 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
SAMD8Q96LT4 AL390774.1-201ENST00000411924 246 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
SAMD8Q96LT4 AP000233.1-201ENST00000426609 291 ntTSL 3 BASIC4.63□□□□□ -1.67
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SAMD8Q96LT4 MTND4LP14-201ENST00000429447 288 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
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SAMD8Q96LT4 AL356981.1-201ENST00000454879 684 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
SAMD8Q96LT4 AC093166.2-201ENST00000455969 1017 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
SAMD8Q96LT4 AL133445.1-201ENST00000467051 452 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
SAMD8Q96LT4 OR2AO1P-201ENST00000476497 403 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
SAMD8Q96LT4 AC116562.1-201ENST00000485355 781 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
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