Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEW7

TMIE, Transmembrane inner ear expressed protein, humanhuman

Predictions only

Length 156 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMIEQ8NEW7 DCN-204ENST00000425043 1438 ntTSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.51
TMIEQ8NEW7 RARSP1-201ENST00000542842 1418 ntBASIC5.65□□□□□ -1.51
TMIEQ8NEW7 AL158152.1-201ENST00000602652 1435 ntBASIC5.65□□□□□ -1.51
TMIEQ8NEW7 NLRP8-201ENST00000291971 3934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.51
TMIEQ8NEW7 KRR1-201ENST00000229214 10118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.51
TMIEQ8NEW7 PCLO-201ENST00000333891 20329 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.64□□□□□ -1.51
TMIEQ8NEW7 AF127577.4-201ENST00000432230 5929 ntTSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
TMIEQ8NEW7 PSG1-202ENST00000312439 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
TMIEQ8NEW7 ATRX-202ENST00000395603 10218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
TMIEQ8NEW7 RANBP3L-202ENST00000502994 2278 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC5.64□□□□□ -1.51
TMIEQ8NEW7 AC015799.1-201ENST00000622996 3122 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
TMIEQ8NEW7 CASC19-281ENST00000642118 1554 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
TMIEQ8NEW7 EPC2-201ENST00000258484 3649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
TMIEQ8NEW7 EXTL2-201ENST00000370113 2835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
TMIEQ8NEW7 ZNF92-203ENST00000431504 2947 ntTSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
TMIEQ8NEW7 SENP8-202ENST00000542035 1672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.64□□□□□ -1.51
TMIEQ8NEW7 HHLA2-211ENST00000619531 2548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
TMIEQ8NEW7 OR14A16-201ENST00000357627 930 ntAPPRIS P1 BASIC5.64□□□□□ -1.51
TMIEQ8NEW7 Y_RNA.169-201ENST00000363745 96 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
TMIEQ8NEW7 BPHL-201ENST00000380368 797 ntTSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
TMIEQ8NEW7 RNU1-136P-201ENST00000384181 164 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
TMIEQ8NEW7 AL009179.1-201ENST00000406085 265 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
TMIEQ8NEW7 AL359378.2-201ENST00000415575 746 ntTSL 2 BASIC5.64□□□□□ -1.51
TMIEQ8NEW7 AL035604.1-201ENST00000416481 531 ntTSL 3 BASIC5.64□□□□□ -1.51
TMIEQ8NEW7 MORF4L1P6-201ENST00000418771 268 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
TMIEQ8NEW7 AP000221.1-201ENST00000419694 1046 ntTSL 3 BASIC5.64□□□□□ -1.51
TMIEQ8NEW7 LINC02238-201ENST00000424953 557 ntTSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
TMIEQ8NEW7 POU6F2-AS1-201ENST00000433519 381 ntTSL 3 BASIC5.64□□□□□ -1.51
TMIEQ8NEW7 AC009299.3-203ENST00000435692 1096 ntTSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
TMIEQ8NEW7 TRAPPC13P1-201ENST00000435991 1062 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
TMIEQ8NEW7 AP000365.1-201ENST00000438850 546 ntTSL 4 BASIC5.64□□□□□ -1.51
TMIEQ8NEW7 PTENP1-201ENST00000447117 1215 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
TMIEQ8NEW7 AL596266.1-201ENST00000448132 400 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
TMIEQ8NEW7 AC239798.3-201ENST00000454459 408 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
TMIEQ8NEW7 GRM7-AS3-208ENST00000455623 947 ntTSL 3 BASIC5.64□□□□□ -1.51
TMIEQ8NEW7 LINC00709-201ENST00000458168 494 ntTSL 2 BASIC5.64□□□□□ -1.51
TMIEQ8NEW7 C1orf185-202ENST00000467127 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC5.64□□□□□ -1.51
TMIEQ8NEW7 AC074386.1-201ENST00000476560 767 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
TMIEQ8NEW7 RN7SL177P-201ENST00000476596 299 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
TMIEQ8NEW7 AC069528.1-202ENST00000482888 637 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
TMIEQ8NEW7 RN7SL547P-201ENST00000490793 290 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
TMIEQ8NEW7 AC090638.1-201ENST00000498296 909 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
TMIEQ8NEW7 AC008565.1-201ENST00000509046 885 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
TMIEQ8NEW7 AC021193.1-201ENST00000511607 420 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
TMIEQ8NEW7 RPS3A-210ENST00000512690 845 ntTSL 3 BASIC5.64□□□□□ -1.51
TMIEQ8NEW7 AC027419.2-201ENST00000518439 497 ntTSL 3 BASIC5.64□□□□□ -1.51
TMIEQ8NEW7 AF117829.1-208ENST00000521996 915 ntTSL 3 BASIC5.64□□□□□ -1.51
TMIEQ8NEW7 LECT2-205ENST00000522943 574 ntTSL 3 BASIC5.64□□□□□ -1.51
TMIEQ8NEW7 MTCO1P47-201ENST00000523889 1271 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
TMIEQ8NEW7 AC068672.3-201ENST00000524017 824 ntTSL 3 BASIC5.64□□□□□ -1.51
TMIEQ8NEW7 AP001267.3-202ENST00000525992 448 ntTSL 3 BASIC5.64□□□□□ -1.51
TMIEQ8NEW7 OR4A2P-201ENST00000527276 913 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
TMIEQ8NEW7 AC108471.2-203ENST00000532680 517 ntTSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
TMIEQ8NEW7 AC009509.1-201ENST00000536317 1110 ntTSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
TMIEQ8NEW7 AC022511.1-201ENST00000544089 476 ntTSL 2 BASIC5.64□□□□□ -1.51
TMIEQ8NEW7 AC008126.1-201ENST00000549019 480 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
TMIEQ8NEW7 OR11H3P-201ENST00000554547 982 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
TMIEQ8NEW7 NPM1P42-201ENST00000560329 862 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
TMIEQ8NEW7 AC018557.2-201ENST00000565082 536 ntTSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
TMIEQ8NEW7 AL157402.2-201ENST00000566394 416 ntTSL 3 BASIC5.64□□□□□ -1.51
TMIEQ8NEW7 PDE6G-203ENST00000571224 526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
TMIEQ8NEW7 SNORD39.2-201ENST00000579995 76 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
TMIEQ8NEW7 DYNAP-202ENST00000585973 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC5.64□□□□□ -1.51
TMIEQ8NEW7 AC016229.1-201ENST00000589242 487 ntTSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
TMIEQ8NEW7 AC005757.1-201ENST00000591432 472 ntTSL 4 BASIC5.64□□□□□ -1.51
TMIEQ8NEW7 AC110760.3-201ENST00000598794 467 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
TMIEQ8NEW7 AC013468.1-201ENST00000608680 598 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
TMIEQ8NEW7 AC105402.3-203ENST00000608822 885 ntTSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
TMIEQ8NEW7 AL445423.1-201ENST00000609941 536 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
TMIEQ8NEW7 AC025574.2-201ENST00000615621 514 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
TMIEQ8NEW7 DUXB-201ENST00000633875 1079 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.64□□□□□ -1.51
TMIEQ8NEW7 AL355306.2-208ENST00000634868 1251 ntTSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
TMIEQ8NEW7 AC073869.7-201ENST00000640874 297 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
TMIEQ8NEW7 LINC01808-202ENST00000641680 1116 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
TMIEQ8NEW7 LINC02211-204ENST00000642024 1070 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
TMIEQ8NEW7 KIAA0391-209ENST00000604948 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.64□□□□□ -1.51
TMIEQ8NEW7 AL513185.3-201ENST00000433335 1300 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
TMIEQ8NEW7 NPHP1-204ENST00000417665 2246 ntTSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
TMIEQ8NEW7 ZMAT1-201ENST00000372782 3185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
TMIEQ8NEW7 ZNF215-205ENST00000529903 1396 ntTSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
TMIEQ8NEW7 LRRK2-201ENST00000298910 9158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
TMIEQ8NEW7 DDX4-202ENST00000354991 2324 ntTSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
TMIEQ8NEW7 MROH2B-201ENST00000399564 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
TMIEQ8NEW7 ZNF248-201ENST00000357328 4795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.64□□□□□ -1.51
TMIEQ8NEW7 CCPG1-202ENST00000425574 1945 ntTSL 2 BASIC5.64□□□□□ -1.51
TMIEQ8NEW7 RFX4-201ENST00000229387 3378 ntTSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
TMIEQ8NEW7 RFC1-201ENST00000349703 4859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
TMIEQ8NEW7 RNF20-202ENST00000389120 3940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
TMIEQ8NEW7 CPXCR1-203ENST00000614120 1485 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.64□□□□□ -1.51
TMIEQ8NEW7 GABRG1-201ENST00000295452 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
TMIEQ8NEW7 ARFGEF2-201ENST00000371917 8852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
TMIEQ8NEW7 CD69-201ENST00000228434 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
TMIEQ8NEW7 KIAA1841-205ENST00000453873 4294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
TMIEQ8NEW7 CACNB4-243ENST00000637217 8188 ntTSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
TMIEQ8NEW7 TTI1-203ENST00000449821 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.63□□□□□ -1.51
TMIEQ8NEW7 METTL21EP-201ENST00000298105 713 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
TMIEQ8NEW7 OR14A2-201ENST00000366485 945 ntAPPRIS P1 BASIC5.63□□□□□ -1.51
TMIEQ8NEW7 PLG-203ENST00000366924 1166 ntTSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
TMIEQ8NEW7 AL008987.1-201ENST00000415528 237 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
TMIEQ8NEW7 Z93019.1-201ENST00000416450 973 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 100.6 ms