Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEK5

ZNF548, Zinc finger protein 548, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 533 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF548Q8NEK5 AL160237.3-201ENST00000604114 1013 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
ZNF548Q8NEK5 QTRT1P1-201ENST00000604344 1078 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
ZNF548Q8NEK5 OR51C1P-201ENST00000608504 942 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
ZNF548Q8NEK5 AC100847.1-201ENST00000611316 481 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
ZNF548Q8NEK5 AL512427.1-201ENST00000618593 349 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
ZNF548Q8NEK5 AC009120.7-201ENST00000623452 780 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
ZNF548Q8NEK5 AP002799.1-201ENST00000623552 423 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
ZNF548Q8NEK5 AC068620.4-201ENST00000636730 1182 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
ZNF548Q8NEK5 LINC01739-205ENST00000641890 573 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
ZNF548Q8NEK5 TNRC6B-201ENST00000301923 15958 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.27□□□□□ -1.57
ZNF548Q8NEK5 AC016576.1-201ENST00000637153 3585 ntTSL 5 BASIC5.27□□□□□ -1.57
ZNF548Q8NEK5 ITGAV-204ENST00000433736 3288 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.27□□□□□ -1.57
ZNF548Q8NEK5 BANK1-203ENST00000444316 3141 ntTSL 2 BASIC5.27□□□□□ -1.57
ZNF548Q8NEK5 STARD9-201ENST00000290607 15567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.27□□□□□ -1.57
ZNF548Q8NEK5 AL353796.1-201ENST00000561542 3241 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
ZNF548Q8NEK5 OAZ3-204ENST00000479764 3789 ntTSL 5 BASIC5.27□□□□□ -1.57
ZNF548Q8NEK5 ZNF280B-201ENST00000613655 3714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.57
ZNF548Q8NEK5 CEP295-206ENST00000531700 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.26□□□□□ -1.57
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ZNF548Q8NEK5 PATE4-201ENST00000457514 1983 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC5.26□□□□□ -1.57
ZNF548Q8NEK5 PPP1R2P3-201ENST00000522232 1991 ntAPPRIS P1 BASIC5.26□□□□□ -1.57
ZNF548Q8NEK5 NCOA4P2-201ENST00000340589 1813 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
ZNF548Q8NEK5 LRP1B-201ENST00000389484 16535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
ZNF548Q8NEK5 RAET1L-202ENST00000367341 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
ZNF548Q8NEK5 RNU6-354P-201ENST00000383862 107 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
ZNF548Q8NEK5 RNU6-610P-201ENST00000384264 107 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
ZNF548Q8NEK5 MIR585-201ENST00000384887 94 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
ZNF548Q8NEK5 Z86062.1-201ENST00000406773 777 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
ZNF548Q8NEK5 RNU6ATAC7P-201ENST00000408111 127 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
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ZNF548Q8NEK5 ZNF885P-201ENST00000420174 1098 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
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ZNF548Q8NEK5 AL136987.1-201ENST00000434300 396 ntTSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.57
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ZNF548Q8NEK5 TMEM244-202ENST00000438392 565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.57
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ZNF548Q8NEK5 AL157400.3-201ENST00000449882 1298 ntTSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.57
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ZNF548Q8NEK5 FSBP-201ENST00000481490 1158 ntTSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
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ZNF548Q8NEK5 MIPOL1-204ENST00000539062 2389 ntTSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
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ZNF548Q8NEK5 TSPAN8-201ENST00000247829 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
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ZNF548Q8NEK5 PTPRC-202ENST00000367364 1017 ntTSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
ZNF548Q8NEK5 SNORD116-2-201ENST00000384274 95 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
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ZNF548Q8NEK5 HMGB3P19-201ENST00000403971 560 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
ZNF548Q8NEK5 AL355615.1-201ENST00000406187 641 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
ZNF548Q8NEK5 RN7SKP126-201ENST00000411143 300 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
ZNF548Q8NEK5 AL669831.5-220ENST00000412115 581 ntTSL 3 BASIC5.25□□□□□ -1.57
ZNF548Q8NEK5 RANP4-201ENST00000413361 655 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
ZNF548Q8NEK5 LUZP4P1-201ENST00000415420 344 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
ZNF548Q8NEK5 LINC01589-201ENST00000422971 548 ntTSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
ZNF548Q8NEK5 TCEAL3-AS1-201ENST00000424887 361 ntTSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
ZNF548Q8NEK5 AC244394.2-201ENST00000425109 735 ntTSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
ZNF548Q8NEK5 AP000146.1-202ENST00000441666 441 ntTSL 3 BASIC5.25□□□□□ -1.57
ZNF548Q8NEK5 AC099344.3-201ENST00000454489 626 ntTSL 3 BASIC5.25□□□□□ -1.57
ZNF548Q8NEK5 AC092754.1-201ENST00000472975 479 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
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