Protein–RNA interactions for Protein: Q16610

ECM1, Extracellular matrix protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 540 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECM1Q16610 BPESC1-201ENST00000418282 3522 ntTSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
ECM1Q16610 ANK2-212ENST00000506722 8051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
ECM1Q16610 OSBPL9-203ENST00000428468 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
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ECM1Q16610 AC008080.4-201ENST00000420185 1589 ntTSL 2 BASIC7.05□□□□□ -1.28
ECM1Q16610 GALNT13-202ENST00000409237 2591 ntTSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
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ECM1Q16610 SULT1C2-204ENST00000409880 1206 ntTSL 3 BASIC7.05□□□□□ -1.28
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ECM1Q16610 AL034345.2-203ENST00000453417 383 ntTSL 3 BASIC7.05□□□□□ -1.28
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ECM1Q16610 AC022022.1-201ENST00000430304 178 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
ECM1Q16610 ZRANB2-AS2-204ENST00000430605 213 ntTSL 2 BASIC7.04□□□□□ -1.28
ECM1Q16610 AC092598.1-201ENST00000431708 797 ntTSL 3 BASIC7.04□□□□□ -1.28
ECM1Q16610 AL049594.1-201ENST00000432834 805 ntTSL 3 BASIC7.04□□□□□ -1.28
ECM1Q16610 LINC01884-201ENST00000433429 440 ntTSL 3 BASIC7.04□□□□□ -1.28
ECM1Q16610 UBE2V1P8-201ENST00000437166 265 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
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