Protein–RNA interactions for Protein: Q16099

GRIK4, Glutamate receptor ionotropic, kainate 4, humanhuman

Predictions only

Length 956 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK4Q16099 AC011477.2-201ENST00000590697 921 ntTSL 2 BASIC7.01□□□□□ -1.29
GRIK4Q16099 VN1R79P-201ENST00000593540 513 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
GRIK4Q16099 AL009028.1-201ENST00000604895 802 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
GRIK4Q16099 AL020991.1-201ENST00000612314 373 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
GRIK4Q16099 AC040896.1-201ENST00000613819 479 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
GRIK4Q16099 AL445647.2-201ENST00000615170 130 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
GRIK4Q16099 AL354810.1-201ENST00000618134 635 ntTSL 3 BASIC7.01□□□□□ -1.29
GRIK4Q16099 AC007389.5-201ENST00000629214 744 ntTSL 5 BASIC7.01□□□□□ -1.29
GRIK4Q16099 AL132640.3-201ENST00000630473 177 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
GRIK4Q16099 CHRM3-AS2-201ENST00000427859 2431 ntTSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
GRIK4Q16099 AC009831.5-201ENST00000624000 3189 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
GRIK4Q16099 AC106872.5-201ENST00000508856 1416 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
GRIK4Q16099 CSDE1-201ENST00000261443 3228 ntTSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
GRIK4Q16099 NBPF12-205ENST00000617614 4630 ntTSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
GRIK4Q16099 AC005332.9-201ENST00000620266 2921 ntBASIC7□□□□□ -1.29
GRIK4Q16099 ZBED3-AS1-216ENST00000515356 1987 ntTSL 2 BASIC7□□□□□ -1.29
GRIK4Q16099 ANGPT2-201ENST00000325203 5416 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
GRIK4Q16099 TLR10-207ENST00000613579 3801 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7□□□□□ -1.29
GRIK4Q16099 CLEC7A-205ENST00000353231 2446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
GRIK4Q16099 COG2-209ENST00000534989 2963 ntTSL 2 BASIC7□□□□□ -1.29
GRIK4Q16099 SMG1P4-203ENST00000517529 1589 ntTSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
GRIK4Q16099 RBM22-202ENST00000447771 1386 ntTSL 2 BASIC7□□□□□ -1.29
GRIK4Q16099 SAMM50P1-201ENST00000455403 1399 ntBASIC7□□□□□ -1.29
GRIK4Q16099 AL354854.1-201ENST00000455940 1363 ntBASIC7□□□□□ -1.29
GRIK4Q16099 LRMDA-208ENST00000496424 3923 ntTSL 2 BASIC7□□□□□ -1.29
GRIK4Q16099 TMBIM4-201ENST00000286424 989 ntTSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
GRIK4Q16099 RNU6-697P-201ENST00000363348 107 ntBASIC7□□□□□ -1.29
GRIK4Q16099 Y_RNA.402-201ENST00000383972 102 ntBASIC7□□□□□ -1.29
GRIK4Q16099 AC007068.1-201ENST00000396690 844 ntBASIC7□□□□□ -1.29
GRIK4Q16099 TEX38-202ENST00000415500 566 ntTSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
GRIK4Q16099 RPL23AP39-201ENST00000415533 405 ntBASIC7□□□□□ -1.29
GRIK4Q16099 RNGTTP1-201ENST00000420965 728 ntBASIC7□□□□□ -1.29
GRIK4Q16099 MOBP-206ENST00000428261 561 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC7□□□□□ -1.29
GRIK4Q16099 LINC01884-201ENST00000433429 440 ntTSL 3 BASIC7□□□□□ -1.29
GRIK4Q16099 HIGD1AP16-201ENST00000450986 258 ntBASIC7□□□□□ -1.29
GRIK4Q16099 RPS27AP2-201ENST00000457576 465 ntBASIC7□□□□□ -1.29
GRIK4Q16099 LSM3P4-201ENST00000502948 309 ntBASIC7□□□□□ -1.29
GRIK4Q16099 MTND6P8-201ENST00000503471 522 ntBASIC7□□□□□ -1.29
GRIK4Q16099 AC105924.1-201ENST00000504057 339 ntTSL 3 BASIC7□□□□□ -1.29
GRIK4Q16099 LINC01332-201ENST00000506612 502 ntTSL 4 BASIC7□□□□□ -1.29
GRIK4Q16099 AC079395.1-201ENST00000510981 262 ntBASIC7□□□□□ -1.29
GRIK4Q16099 snoZ278.1-201ENST00000517059 112 ntBASIC7□□□□□ -1.29
GRIK4Q16099 AC073023.1-201ENST00000522896 773 ntTSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
GRIK4Q16099 AL163932.1-201ENST00000555776 542 ntTSL 4 BASIC7□□□□□ -1.29
GRIK4Q16099 MMP2-AS1-201ENST00000565307 593 ntTSL 4 BASIC7□□□□□ -1.29
GRIK4Q16099 AC011443.1-201ENST00000599484 365 ntTSL 3 BASIC7□□□□□ -1.29
GRIK4Q16099 AC012065.4-201ENST00000602445 679 ntBASIC7□□□□□ -1.29
GRIK4Q16099 AL021368.3-201ENST00000607119 578 ntBASIC7□□□□□ -1.29
GRIK4Q16099 AL008723.3-201ENST00000608926 449 ntBASIC7□□□□□ -1.29
GRIK4Q16099 Metazoa_SRP.94-201ENST00000612609 250 ntBASIC7□□□□□ -1.29
GRIK4Q16099 FOXP1-212ENST00000491238 2250 ntTSL 2 BASIC7□□□□□ -1.29
GRIK4Q16099 AC007744.1-201ENST00000607540 2289 ntTSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
GRIK4Q16099 AP002833.3-201ENST00000625075 2265 ntBASIC7□□□□□ -1.29
GRIK4Q16099 SCN2A-215ENST00000637266 8610 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
GRIK4Q16099 ADAL-203ENST00000428046 3514 ntTSL 2 BASIC7□□□□□ -1.29
GRIK4Q16099 LIPA-203ENST00000371837 2513 ntTSL 2 BASIC7□□□□□ -1.29
GRIK4Q16099 CLEC12A-201ENST00000304361 1549 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
GRIK4Q16099 CNTN5-202ENST00000418526 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
GRIK4Q16099 TGFBR3-207ENST00000525962 3927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
GRIK4Q16099 CAST-202ENST00000325674 3356 ntTSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
GRIK4Q16099 AL079343.1-201ENST00000572358 1771 ntBASIC7□□□□□ -1.29
GRIK4Q16099 AL359195.2-201ENST00000623657 4412 ntBASIC7□□□□□ -1.29
GRIK4Q16099 KAT7-203ENST00000435742 3638 ntTSL 2 BASIC7□□□□□ -1.29
GRIK4Q16099 LPAL2-203ENST00000454031 2498 ntBASIC7□□□□□ -1.29
GRIK4Q16099 HIPK1-204ENST00000369555 3966 ntTSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
GRIK4Q16099 TPTE2-202ENST00000382978 1677 ntTSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
GRIK4Q16099 MAGEB16-203ENST00000399988 1682 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
GRIK4Q16099 NFX1-201ENST00000318524 3513 ntTSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
GRIK4Q16099 ATXN2-202ENST00000389153 3854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
GRIK4Q16099 ERMARD-202ENST00000366772 2003 ntTSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
GRIK4Q16099 TTLL5-217ENST00000556893 3071 ntTSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
GRIK4Q16099 TMC7-202ENST00000421369 4499 ntTSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
GRIK4Q16099 SLC25A46-206ENST00000509432 1596 ntTSL 2 BASIC6.99□□□□□ -1.29
GRIK4Q16099 LIN7C-202ENST00000524596 4290 ntTSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
GRIK4Q16099 EHBP1-203ENST00000405289 3591 ntTSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
GRIK4Q16099 KLHL2-204ENST00000506761 2169 ntTSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
GRIK4Q16099 ZNF215-205ENST00000529903 1396 ntTSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
GRIK4Q16099 BCO2-214ENST00000532593 1647 ntTSL 2 BASIC6.99□□□□□ -1.29
GRIK4Q16099 GABRB2-209ENST00000612710 2470 ntTSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
GRIK4Q16099 MT4-201ENST00000219162 294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
GRIK4Q16099 OR5I1-201ENST00000301532 945 ntAPPRIS P1 BASIC6.99□□□□□ -1.29
GRIK4Q16099 MT-ND4L-201ENST00000361335 297 ntAPPRIS P1 BASIC6.99□□□□□ -1.29
GRIK4Q16099 RNA5SP188-201ENST00000362916 129 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
GRIK4Q16099 LCN1P2-201ENST00000372030 223 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
GRIK4Q16099 CARD6-202ENST00000381677 1094 ntTSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
GRIK4Q16099 TAF9BP1-201ENST00000396646 746 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
GRIK4Q16099 DNAJC19P6-201ENST00000401853 280 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
GRIK4Q16099 RPS27AP11-201ENST00000402798 447 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
GRIK4Q16099 AC100848.1-201ENST00000417298 637 ntTSL 3 BASIC6.99□□□□□ -1.29
GRIK4Q16099 AC079760.2-203ENST00000418395 489 ntTSL 3 BASIC6.99□□□□□ -1.29
GRIK4Q16099 TMX2P1-201ENST00000436507 708 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
GRIK4Q16099 AC023141.3-201ENST00000436698 278 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
GRIK4Q16099 Z80107.2-201ENST00000445127 392 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
GRIK4Q16099 LINC01564-201ENST00000448327 566 ntTSL 3 BASIC6.99□□□□□ -1.29
GRIK4Q16099 PPIAP27-201ENST00000453800 265 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
GRIK4Q16099 PMCHL2-203ENST00000457791 237 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
GRIK4Q16099 OR52A4P-201ENST00000472867 958 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
GRIK4Q16099 AL359273.1-202ENST00000505585 905 ntTSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
GRIK4Q16099 OR5M14P-201ENST00000506803 618 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
GRIK4Q16099 AC010181.1-202ENST00000509191 798 ntTSL 3 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.2 ms