Protein–RNA interactions for Protein: Q15116

PDCD1, Programmed cell death protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 288 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCD1Q15116 AL138899.2-201ENST00000439139 499 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
PDCD1Q15116 COL11A2P1-205ENST00000441798 676 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
PDCD1Q15116 RAB11AP1-201ENST00000442978 646 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
PDCD1Q15116 AC092601.1-201ENST00000444526 383 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
PDCD1Q15116 AL021937.4-201ENST00000444848 444 ntTSL 3 BASIC5.44□□□□□ -1.54
PDCD1Q15116 AC234771.2-201ENST00000445718 597 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
PDCD1Q15116 AC005518.1-201ENST00000448131 1116 ntTSL 2 BASIC5.44□□□□□ -1.54
PDCD1Q15116 MOB4-207ENST00000448447 1021 ntTSL 2 BASIC5.44□□□□□ -1.54
PDCD1Q15116 AC074286.1-201ENST00000452002 544 ntTSL 4 BASIC5.44□□□□□ -1.54
PDCD1Q15116 AL603882.1-201ENST00000463059 681 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
PDCD1Q15116 RPL24-206ENST00000495401 478 ntTSL 2 BASIC5.44□□□□□ -1.54
PDCD1Q15116 EEF1A1P25-201ENST00000495704 1267 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
PDCD1Q15116 AC090071.1-201ENST00000507713 644 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
PDCD1Q15116 RNU2-30P-201ENST00000516209 141 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
PDCD1Q15116 RN7SKP96-201ENST00000516948 297 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
PDCD1Q15116 ATP6V0E1-202ENST00000517669 502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
PDCD1Q15116 AP003354.2-201ENST00000517983 563 ntTSL 4 BASIC5.44□□□□□ -1.54
PDCD1Q15116 AC239860.2-201ENST00000525886 270 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
PDCD1Q15116 TPRXL-210ENST00000532753 478 ntTSL 4 BASIC5.44□□□□□ -1.54
PDCD1Q15116 LRTOMT-215ENST00000538478 814 ntTSL 2 BASIC5.44□□□□□ -1.54
PDCD1Q15116 MRPL42-203ENST00000547098 701 ntTSL 3 BASIC5.44□□□□□ -1.54
PDCD1Q15116 AC144548.2-201ENST00000550231 946 ntTSL 3 BASIC5.44□□□□□ -1.54
PDCD1Q15116 SLC7A7-210ENST00000554517 1158 ntTSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
PDCD1Q15116 AC026956.1-201ENST00000558741 396 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
PDCD1Q15116 AC003009.1-201ENST00000571611 686 ntTSL 3 BASIC5.44□□□□□ -1.54
PDCD1Q15116 MIR3154-201ENST00000577829 84 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
PDCD1Q15116 SYPL1P2-201ENST00000582878 727 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
PDCD1Q15116 AC008507.1-201ENST00000587506 734 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
PDCD1Q15116 MIR7515HG-235ENST00000590865 918 ntTSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
PDCD1Q15116 MIR7515HG-239ENST00000591053 1113 ntTSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
PDCD1Q15116 AC010271.1-201ENST00000599050 558 ntTSL 4 BASIC5.44□□□□□ -1.54
PDCD1Q15116 RNU6-88P-201ENST00000606801 100 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
PDCD1Q15116 AL139286.2-201ENST00000606838 396 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
PDCD1Q15116 C5orf63-207ENST00000606937 607 ntTSL 2 BASIC5.44□□□□□ -1.54
PDCD1Q15116 AC104073.3-201ENST00000610942 955 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
PDCD1Q15116 AL354810.1-201ENST00000618134 635 ntTSL 3 BASIC5.44□□□□□ -1.54
PDCD1Q15116 AL591926.1-201ENST00000620542 217 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
PDCD1Q15116 AL590240.3-201ENST00000621416 943 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
PDCD1Q15116 SUPT3H-206ENST00000637763 498 ntTSL 3 BASIC5.44□□□□□ -1.54
PDCD1Q15116 EIF4E-203ENST00000450253 11523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
PDCD1Q15116 TRPM6-202ENST00000360774 8425 ntTSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
PDCD1Q15116 NRDC-213ENST00000539524 3417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
PDCD1Q15116 GIGYF2-246ENST00000629305 7878 ntTSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
PDCD1Q15116 MID1-209ENST00000453318 6393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
PDCD1Q15116 SP110-204ENST00000392048 1937 ntTSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
PDCD1Q15116 SLC10A7-204ENST00000502607 1638 ntTSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
PDCD1Q15116 CDC7-201ENST00000234626 3173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
PDCD1Q15116 IARS-213ENST00000627121 4587 ntTSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
PDCD1Q15116 OR1E1-201ENST00000322608 1307 ntAPPRIS P1 BASIC5.44□□□□□ -1.54
PDCD1Q15116 SLC7A11-201ENST00000280612 9645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
PDCD1Q15116 CPS1-204ENST00000451903 4770 ntTSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
PDCD1Q15116 AP005212.5-201ENST00000577614 3505 ntTSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
PDCD1Q15116 APBB2-230ENST00000543538 6992 ntTSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
PDCD1Q15116 TTC6-202ENST00000382320 1972 ntTSL 2 BASIC5.44□□□□□ -1.54
PDCD1Q15116 AC011933.2-201ENST00000578539 2790 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
PDCD1Q15116 CHD8-202ENST00000430710 7420 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
PDCD1Q15116 TAF7L-203ENST00000372907 2341 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
PDCD1Q15116 AL162425.1-201ENST00000423637 1525 ntTSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
PDCD1Q15116 RANBP3L-204ENST00000515759 1532 ntTSL 2 BASIC5.43□□□□□ -1.54
PDCD1Q15116 LINC01981-201ENST00000432163 2833 ntTSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
PDCD1Q15116 PPBPP2-201ENST00000513150 1362 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
PDCD1Q15116 AC119674.1-213ENST00000641177 1386 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
PDCD1Q15116 CLRN1-AS1-201ENST00000465576 2045 ntTSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
PDCD1Q15116 VPS13B-202ENST00000357162 14019 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
PDCD1Q15116 RALGAPA2-201ENST00000202677 6152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.43□□□□□ -1.54
PDCD1Q15116 C9-201ENST00000263408 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
PDCD1Q15116 AC011369.2-201ENST00000624423 1567 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
PDCD1Q15116 MMAA-205ENST00000541599 1437 ntTSL 5 BASIC5.43□□□□□ -1.54
PDCD1Q15116 ALB-219ENST00000621085 1418 ntTSL 5 BASIC5.43□□□□□ -1.54
PDCD1Q15116 BPIFA2-201ENST00000253362 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
PDCD1Q15116 XAGE3-201ENST00000346279 497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
PDCD1Q15116 BPIFA2-202ENST00000354932 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
PDCD1Q15116 TEX43-201ENST00000357147 464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
PDCD1Q15116 RNU6-251P-201ENST00000363235 104 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
PDCD1Q15116 SNORD35A-201ENST00000363389 86 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
PDCD1Q15116 RAET1L-202ENST00000367341 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
PDCD1Q15116 MRPS6P2-201ENST00000381143 370 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
PDCD1Q15116 SPRR2A-201ENST00000392653 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
PDCD1Q15116 EI24P3-201ENST00000399046 1062 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
PDCD1Q15116 AGR3-202ENST00000402239 563 ntTSL 2 BASIC5.43□□□□□ -1.54
PDCD1Q15116 SYCE3-202ENST00000406915 448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.43□□□□□ -1.54
PDCD1Q15116 TPMTP3-201ENST00000411928 735 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
PDCD1Q15116 ALDH7A1P4-201ENST00000412255 178 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
PDCD1Q15116 MTCYBP38-201ENST00000417160 1123 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
PDCD1Q15116 MRPS21P5-201ENST00000417885 231 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
PDCD1Q15116 AL020993.1-201ENST00000420172 297 ntTSL 3 BASIC5.43□□□□□ -1.54
PDCD1Q15116 NME1P1-201ENST00000420914 382 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
PDCD1Q15116 AC006366.1-201ENST00000422002 759 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
PDCD1Q15116 IPPKP1-201ENST00000422501 768 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
PDCD1Q15116 AC104777.1-203ENST00000423428 554 ntTSL 3 BASIC5.43□□□□□ -1.54
PDCD1Q15116 LINC00352-201ENST00000425800 552 ntTSL 3 BASIC5.43□□□□□ -1.54
PDCD1Q15116 MGAT2P2-201ENST00000427194 797 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
PDCD1Q15116 AL451070.1-201ENST00000430143 439 ntTSL 5 BASIC5.43□□□□□ -1.54
PDCD1Q15116 AC003989.1-201ENST00000434569 565 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
PDCD1Q15116 AL122017.1-201ENST00000435858 784 ntTSL 2 BASIC5.43□□□□□ -1.54
PDCD1Q15116 AL139220.2-214ENST00000437643 614 ntTSL 3 BASIC5.43□□□□□ -1.54
PDCD1Q15116 EEF1B2P3-201ENST00000447718 678 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
PDCD1Q15116 LINC01809-201ENST00000448431 303 ntTSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
PDCD1Q15116 AC092967.1-201ENST00000449016 481 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
PDCD1Q15116 VN1R38P-201ENST00000450265 887 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
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