Protein–RNA interactions for Protein: Q13889

GTF2H3, General transcription factor IIH subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 308 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2H3Q13889 AC006539.1-201ENST00000481419 501 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
GTF2H3Q13889 LINC02147-201ENST00000509367 807 ntTSL 2 BASIC5.73□□□□□ -1.49
GTF2H3Q13889 AC008592.4-201ENST00000509999 450 ntTSL 3 BASIC5.73□□□□□ -1.49
GTF2H3Q13889 LINC02231-201ENST00000510459 447 ntTSL 3 BASIC5.73□□□□□ -1.49
GTF2H3Q13889 AC119751.5-201ENST00000514077 770 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
GTF2H3Q13889 snoU109.5-201ENST00000516231 132 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
GTF2H3Q13889 NSMCE2-202ENST00000517315 996 ntTSL 3 BASIC5.73□□□□□ -1.49
GTF2H3Q13889 IGHVIII-38-1-201ENST00000521454 282 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
GTF2H3Q13889 AC078906.1-201ENST00000523602 798 ntTSL 3 BASIC5.73□□□□□ -1.49
GTF2H3Q13889 TRIM51DP-201ENST00000529746 596 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
GTF2H3Q13889 AC023538.1-201ENST00000534576 736 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
GTF2H3Q13889 AL442163.2-201ENST00000553912 710 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
GTF2H3Q13889 AL392023.2-202ENST00000555342 494 ntTSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.49
GTF2H3Q13889 AC138305.2-201ENST00000561595 556 ntTSL 4 BASIC5.73□□□□□ -1.49
GTF2H3Q13889 MIR4310-201ENST00000582950 57 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
GTF2H3Q13889 LAMTOR5-AS1-203ENST00000585330 463 ntTSL 2 BASIC5.73□□□□□ -1.49
GTF2H3Q13889 INTS6-AS1-210ENST00000595424 301 ntTSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.49
GTF2H3Q13889 DARS-AS1-217ENST00000599279 544 ntTSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.49
GTF2H3Q13889 AC009027.1-201ENST00000604510 479 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
GTF2H3Q13889 PRKCQ-AS1-208ENST00000608453 587 ntTSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.49
GTF2H3Q13889 AC093388.1-201ENST00000609166 430 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
GTF2H3Q13889 AL162574.1-201ENST00000615702 950 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
GTF2H3Q13889 CR392039.4-201ENST00000624968 501 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
GTF2H3Q13889 LINC01359-206ENST00000634775 888 ntTSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.49
GTF2H3Q13889 LINC01837-206ENST00000636649 1056 ntTSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.49
GTF2H3Q13889 AL357060.1-201ENST00000638039 977 ntTSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.49
GTF2H3Q13889 AP001153.1-201ENST00000641024 338 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
GTF2H3Q13889 MFSD8-245ENST00000641743 948 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
GTF2H3Q13889 CEACAM1-201ENST00000161559 3519 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
GTF2H3Q13889 POSTN-204ENST00000379749 3210 ntTSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.49
GTF2H3Q13889 KMT5B-215ENST00000615954 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
GTF2H3Q13889 ABCA6-206ENST00000590645 1511 ntTSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
GTF2H3Q13889 ZBTB25-201ENST00000394715 2094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.73□□□□□ -1.49
GTF2H3Q13889 SGO1P1-201ENST00000603525 1447 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
GTF2H3Q13889 CACNB4-245ENST00000637284 2423 ntTSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.49
GTF2H3Q13889 LINC00906-206ENST00000589921 3444 ntTSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
GTF2H3Q13889 AP4S1-212ENST00000622409 4113 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.72□□□□□ -1.49
GTF2H3Q13889 ASNSP1-204ENST00000641977 1664 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
GTF2H3Q13889 LINC01152-201ENST00000472655 3578 ntTSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
GTF2H3Q13889 MECOM-217ENST00000494292 3939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
GTF2H3Q13889 RALGAPA1P1-201ENST00000443361 6232 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
GTF2H3Q13889 AC092070.2-203ENST00000598377 3644 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
GTF2H3Q13889 AC025263.3-201ENST00000622965 1396 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
GTF2H3Q13889 AC015689.2-201ENST00000528172 1738 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
GTF2H3Q13889 ZNF788-203ENST00000430298 3941 ntTSL 2 BASIC5.72□□□□□ -1.49
GTF2H3Q13889 SCGB3A2-201ENST00000296694 515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
GTF2H3Q13889 RNA5SP514-201ENST00000363717 111 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
GTF2H3Q13889 RN7SKP15-201ENST00000364742 309 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
GTF2H3Q13889 RNU1-74P-201ENST00000384108 171 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
GTF2H3Q13889 RNU6-413P-201ENST00000384115 107 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
GTF2H3Q13889 TRAJ25-201ENST00000390512 60 ntAPPRIS P1 BASIC5.72□□□□□ -1.49
GTF2H3Q13889 RPL11P3-201ENST00000395256 523 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
GTF2H3Q13889 RPL7P58-201ENST00000402913 758 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
GTF2H3Q13889 GSTA8P-201ENST00000404253 637 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
GTF2H3Q13889 FCF1P5-201ENST00000406490 482 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
GTF2H3Q13889 RNU6-575P-201ENST00000411326 105 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
GTF2H3Q13889 NPM1P40-201ENST00000412758 733 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
GTF2H3Q13889 OR2AT2P-201ENST00000413438 905 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
GTF2H3Q13889 IFNAR2-206ENST00000413881 710 ntTSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
GTF2H3Q13889 AL359633.2-201ENST00000415787 622 ntTSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
GTF2H3Q13889 GPC5-AS2-201ENST00000417589 401 ntTSL 3 BASIC5.72□□□□□ -1.49
GTF2H3Q13889 AL353608.1-201ENST00000419576 416 ntTSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
GTF2H3Q13889 ZDHHC20P2-201ENST00000424108 429 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
GTF2H3Q13889 VN1R21P-201ENST00000426703 765 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
GTF2H3Q13889 NANOGP4-201ENST00000427230 913 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
GTF2H3Q13889 HIGD1AP4-201ENST00000430194 280 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
GTF2H3Q13889 AL391097.2-201ENST00000435057 485 ntTSL 3 BASIC5.72□□□□□ -1.49
GTF2H3Q13889 AC073410.1-201ENST00000435125 589 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
GTF2H3Q13889 LINC01688-201ENST00000435492 259 ntTSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
GTF2H3Q13889 AL121957.1-202ENST00000437040 329 ntTSL 3 BASIC5.72□□□□□ -1.49
GTF2H3Q13889 AL162385.2-201ENST00000437864 285 ntTSL 3 BASIC5.72□□□□□ -1.49
GTF2H3Q13889 ELOCP10-201ENST00000440624 327 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
GTF2H3Q13889 MTND2P22-201ENST00000444325 1033 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
GTF2H3Q13889 OR7E116P-201ENST00000448529 957 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
GTF2H3Q13889 AC144530.1-201ENST00000452862 555 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
GTF2H3Q13889 USP9YP25-201ENST00000457708 443 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
GTF2H3Q13889 SOX2-OT-207ENST00000476964 606 ntTSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
GTF2H3Q13889 SETSIP-201ENST00000485873 879 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.72□□□□□ -1.49
GTF2H3Q13889 RHOBTB3-204ENST00000504179 883 ntTSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
GTF2H3Q13889 SCGB3A2-202ENST00000504320 440 ntTSL 3 BASIC5.72□□□□□ -1.49
GTF2H3Q13889 AC105384.2-201ENST00000508433 640 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
GTF2H3Q13889 AC109481.1-201ENST00000509173 282 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
GTF2H3Q13889 AC074255.1-201ENST00000511259 501 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
GTF2H3Q13889 SCARNA6.1-201ENST00000516989 238 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
GTF2H3Q13889 TATDN1-202ENST00000517678 815 ntTSL 3 BASIC5.72□□□□□ -1.49
GTF2H3Q13889 NAV2-AS1-201ENST00000526642 660 ntTSL 3 BASIC5.72□□□□□ -1.49
GTF2H3Q13889 MITF-217ENST00000531774 1074 ntTSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
GTF2H3Q13889 G2E3-AS1-201ENST00000548631 579 ntTSL 3 BASIC5.72□□□□□ -1.49
GTF2H3Q13889 AC137800.1-201ENST00000562976 573 ntTSL 4 BASIC5.72□□□□□ -1.49
GTF2H3Q13889 AC005412.1-201ENST00000580812 1049 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
GTF2H3Q13889 AP001357.1-201ENST00000586304 1053 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
GTF2H3Q13889 AC007673.1-201ENST00000590604 1100 ntTSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
GTF2H3Q13889 SOX2-OT-224ENST00000595313 716 ntTSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
GTF2H3Q13889 AC006115.2-201ENST00000596823 202 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
GTF2H3Q13889 ZNF208-204ENST00000599916 740 ntTSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
GTF2H3Q13889 ELOCP34-201ENST00000604436 327 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
GTF2H3Q13889 AC007349.4-201ENST00000608114 532 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
GTF2H3Q13889 AP005137.2-201ENST00000609238 400 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
GTF2H3Q13889 AC112493.1-201ENST00000609836 303 ntTSL 3 BASIC5.72□□□□□ -1.49
GTF2H3Q13889 AC244131.2-201ENST00000612592 512 ntTSL 3 BASIC5.72□□□□□ -1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80.6 ms