Protein–RNA interactions for Protein: Q13698

CACNA1S, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1S, humanhuman

Predictions only

Length 1,873 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1SQ13698 AC090515.3-201ENST00000560431 315 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
CACNA1SQ13698 AC034105.4-201ENST00000568304 277 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
CACNA1SQ13698 AL157938.2-205ENST00000586290 891 ntTSL 5 BASIC5.71□□□□□ -1.5
CACNA1SQ13698 TTN-AS1-237ENST00000590743 812 ntTSL 5 BASIC5.71□□□□□ -1.5
CACNA1SQ13698 LINC00347-205ENST00000597518 868 ntTSL 5 BASIC5.71□□□□□ -1.5
CACNA1SQ13698 AC010422.4-201ENST00000601420 533 ntTSL 3 BASIC5.71□□□□□ -1.5
CACNA1SQ13698 AL133243.1-201ENST00000614487 366 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
CACNA1SQ13698 AC112200.1-201ENST00000625015 234 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
CACNA1SQ13698 LINC00976-202ENST00000628064 534 ntTSL 5 BASIC5.71□□□□□ -1.5
CACNA1SQ13698 ANGPT2-201ENST00000325203 5416 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
CACNA1SQ13698 OR7C1-204ENST00000642000 11290 ntAPPRIS P1 BASIC5.7□□□□□ -1.5
CACNA1SQ13698 LYST-202ENST00000389794 12985 ntTSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
CACNA1SQ13698 AC025031.4-201ENST00000621248 3271 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
CACNA1SQ13698 SV2B-201ENST00000330276 11202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
CACNA1SQ13698 SPRR2C-201ENST00000290702 219 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
CACNA1SQ13698 AL360227.1-201ENST00000425364 433 ntTSL 3 BASIC5.7□□□□□ -1.5
CACNA1SQ13698 NUTF2P3-201ENST00000448540 384 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
CACNA1SQ13698 EEF1A1P25-201ENST00000495704 1267 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
CACNA1SQ13698 EGFLAM-AS3-201ENST00000505267 549 ntTSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
CACNA1SQ13698 TRAPPC2-208ENST00000519885 561 ntTSL 3 BASIC5.7□□□□□ -1.5
CACNA1SQ13698 EQTN-204ENST00000537675 879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
CACNA1SQ13698 AC010197.1-201ENST00000541860 578 ntTSL 4 BASIC5.7□□□□□ -1.5
CACNA1SQ13698 AP002518.2-201ENST00000544925 393 ntTSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
CACNA1SQ13698 LINC02284-202ENST00000560924 566 ntTSL 4 BASIC5.7□□□□□ -1.5
CACNA1SQ13698 AC010547.7-201ENST00000570323 333 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
CACNA1SQ13698 AC022916.3-201ENST00000592961 742 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
CACNA1SQ13698 AC091979.2-201ENST00000607514 214 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
CACNA1SQ13698 AL031658.2-201ENST00000616850 651 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
CACNA1SQ13698 EYA4-202ENST00000355286 4317 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
CACNA1SQ13698 ACE2-202ENST00000427411 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
CACNA1SQ13698 CFAP61-201ENST00000245957 4082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
CACNA1SQ13698 RAPGEF2-201ENST00000264431 6949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
CACNA1SQ13698 NDUFA5-207ENST00000471770 5608 ntTSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
CACNA1SQ13698 KIAA1328-202ENST00000586135 1863 ntTSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
CACNA1SQ13698 RNU1-94P-201ENST00000362627 173 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
CACNA1SQ13698 RNU1-85P-201ENST00000364127 164 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
CACNA1SQ13698 RPS26P8-201ENST00000393490 348 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
CACNA1SQ13698 AL691449.1-201ENST00000426570 421 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
CACNA1SQ13698 SCARNA10-201ENST00000459255 330 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
CACNA1SQ13698 RN7SL542P-201ENST00000467147 294 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
CACNA1SQ13698 LINC02553-201ENST00000529088 734 ntTSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
CACNA1SQ13698 MS4A7-208ENST00000530234 730 ntTSL 3 BASIC5.69□□□□□ -1.5
CACNA1SQ13698 LRRC2-AS1-202ENST00000614743 633 ntTSL 3 BASIC5.69□□□□□ -1.5
CACNA1SQ13698 KIAA1328-201ENST00000280020 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
CACNA1SQ13698 PCAT19-201ENST00000588495 3472 ntTSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
CACNA1SQ13698 ANO3-204ENST00000531568 3117 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.69□□□□□ -1.5
CACNA1SQ13698 CACNB4-229ENST00000636617 5757 ntTSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
CACNA1SQ13698 PFKFB2-202ENST00000367080 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
CACNA1SQ13698 CARF-208ENST00000428585 2513 ntTSL 2 BASIC5.69□□□□□ -1.5
CACNA1SQ13698 TCF4-284ENST00000637169 7553 ntTSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
CACNA1SQ13698 FRMD6-205ENST00000554167 4176 ntTSL 2 BASIC5.69□□□□□ -1.5
CACNA1SQ13698 CPA3-201ENST00000296046 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
CACNA1SQ13698 MANEA-201ENST00000358812 4575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
CACNA1SQ13698 KDM3B-209ENST00000542866 3634 ntTSL 2 BASIC5.69□□□□□ -1.5
CACNA1SQ13698 OR8G1-201ENST00000341493 936 ntAPPRIS P1 BASIC5.68□□□□□ -1.5
CACNA1SQ13698 OR2M5-201ENST00000366476 939 ntAPPRIS P1 BASIC5.68□□□□□ -1.5
CACNA1SQ13698 OR8G2P-201ENST00000412796 908 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
CACNA1SQ13698 DAB1-AS1-201ENST00000416598 1262 ntTSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
CACNA1SQ13698 AC013429.2-201ENST00000418798 781 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
CACNA1SQ13698 RPL35AP21-201ENST00000437667 333 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
CACNA1SQ13698 AC093815.1-201ENST00000508637 280 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
CACNA1SQ13698 C14orf2-211ENST00000557040 472 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.68□□□□□ -1.5
CACNA1SQ13698 AC127024.5-201ENST00000580085 462 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
CACNA1SQ13698 AC139769.2-201ENST00000599944 2291 ntTSL 2 BASIC5.68□□□□□ -1.5
CACNA1SQ13698 VCAN-201ENST00000265077 12625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
CACNA1SQ13698 RASA1-203ENST00000506290 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.68□□□□□ -1.5
CACNA1SQ13698 OR2L13-201ENST00000358120 1942 ntAPPRIS P1 BASIC5.68□□□□□ -1.5
CACNA1SQ13698 SEC31A-237ENST00000513858 3687 ntTSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
CACNA1SQ13698 LINC00919-201ENST00000561513 1658 ntTSL 2 BASIC5.68□□□□□ -1.5
CACNA1SQ13698 GTSF1L-202ENST00000373005 459 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC5.68□□□□□ -1.5
CACNA1SQ13698 PMS1-202ENST00000374826 948 ntTSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
CACNA1SQ13698 RPS3AP25-201ENST00000411660 793 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
CACNA1SQ13698 BMS1P19-201ENST00000433925 393 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
CACNA1SQ13698 AC093166.2-201ENST00000455969 1017 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
CACNA1SQ13698 AC091976.1-201ENST00000458002 448 ntTSL 3 BASIC5.68□□□□□ -1.5
CACNA1SQ13698 CREM-230ENST00000474931 626 ntTSL 2 BASIC5.68□□□□□ -1.5
CACNA1SQ13698 AC034234.1-201ENST00000502993 465 ntTSL 3 BASIC5.68□□□□□ -1.5
CACNA1SQ13698 PRH1-206ENST00000543626 710 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.68□□□□□ -1.5
CACNA1SQ13698 AC005392.3-201ENST00000607109 459 ntTSL 2 BASIC5.68□□□□□ -1.5
CACNA1SQ13698 AL035461.2-201ENST00000619201 524 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
CACNA1SQ13698 AC063952.1-203ENST00000634410 658 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
CACNA1SQ13698 AL158163.1-201ENST00000603915 1649 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
CACNA1SQ13698 DLG1-217ENST00000452595 3053 ntTSL 2 BASIC5.68□□□□□ -1.5
CACNA1SQ13698 OR2M3-202ENST00000641626 9913 ntAPPRIS P1 BASIC5.68□□□□□ -1.5
CACNA1SQ13698 IRAK1BP1-204ENST00000607739 1387 ntTSL 2 BASIC5.67□□□□□ -1.5
CACNA1SQ13698 DNAJC16-210ENST00000616884 5882 ntTSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
CACNA1SQ13698 OR2A7-202ENST00000641841 2062 ntAPPRIS P1 BASIC5.67□□□□□ -1.5
CACNA1SQ13698 SCGB2A2-202ENST00000525380 1305 ntTSL 2 BASIC5.67□□□□□ -1.5
CACNA1SQ13698 VCAM1-203ENST00000370115 2475 ntTSL 5 BASIC5.67□□□□□ -1.5
CACNA1SQ13698 AC008549.2-201ENST00000333482 706 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
CACNA1SQ13698 RNA5SP366-201ENST00000365454 123 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
CACNA1SQ13698 RNA5SP44-201ENST00000410446 133 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
CACNA1SQ13698 EIF4A1P3-201ENST00000411521 244 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
CACNA1SQ13698 RPL23AP26-201ENST00000412728 464 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
CACNA1SQ13698 AC092162.1-201ENST00000432828 434 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
CACNA1SQ13698 AC011998.1-201ENST00000433403 117 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
CACNA1SQ13698 AL157385.1-201ENST00000446973 268 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
CACNA1SQ13698 AL162591.2-201ENST00000449634 317 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
CACNA1SQ13698 RPL5P12-201ENST00000477071 851 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
CACNA1SQ13698 RNA5SP230-201ENST00000517039 122 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.1 ms