Protein–RNA interactions for Protein: Q13461

FOXE3, Forkhead box protein E3, humanhuman

Predictions only

Length 319 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXE3Q13461 L3MBTL3-209ENST00000533560 3165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
FOXE3Q13461 DICER1-202ENST00000393063 10220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
FOXE3Q13461 AP002001.2-201ENST00000529025 1469 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
FOXE3Q13461 AC093909.5-201ENST00000621839 1799 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
FOXE3Q13461 ACOD1-202ENST00000449753 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC5.14□□□□□ -1.59
FOXE3Q13461 KIAA0895-201ENST00000297063 4153 ntTSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
FOXE3Q13461 IQCM-205ENST00000636414 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
FOXE3Q13461 BNIP2-202ENST00000415213 1509 ntTSL 2 BASIC5.14□□□□□ -1.59
FOXE3Q13461 DNM1L-201ENST00000266481 3101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
FOXE3Q13461 ZNF793-202ENST00000542455 4073 ntTSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
FOXE3Q13461 LINC01011-204ENST00000605901 1573 ntTSL 2 BASIC5.14□□□□□ -1.59
FOXE3Q13461 IMMTP1-201ENST00000435590 2219 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
FOXE3Q13461 EDDM3A-201ENST00000326842 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
FOXE3Q13461 SNORA64.3-201ENST00000365647 134 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
FOXE3Q13461 DAOA-202ENST00000375936 742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
FOXE3Q13461 IGHV6-1-201ENST00000390593 415 ntAPPRIS P1 BASIC5.14□□□□□ -1.59
FOXE3Q13461 AC245036.1-201ENST00000391727 309 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
FOXE3Q13461 GGA1-205ENST00000405147 575 ntTSL 4 BASIC5.14□□□□□ -1.59
FOXE3Q13461 RPL12P23-201ENST00000405880 490 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
FOXE3Q13461 CCNG1P1-201ENST00000406783 885 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
FOXE3Q13461 AL451081.1-201ENST00000413159 245 ntTSL 3 BASIC5.14□□□□□ -1.59
FOXE3Q13461 LINC01934-201ENST00000414750 391 ntTSL 3 BASIC5.14□□□□□ -1.59
FOXE3Q13461 RAD23B-202ENST00000416373 3835 ntTSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
FOXE3Q13461 AC019050.1-201ENST00000418508 492 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
FOXE3Q13461 LINC01676-201ENST00000420901 410 ntTSL 3 BASIC5.14□□□□□ -1.59
FOXE3Q13461 AL031846.1-202ENST00000424436 592 ntTSL 2 BASIC5.14□□□□□ -1.59
FOXE3Q13461 LINC00352-201ENST00000425800 552 ntTSL 3 BASIC5.14□□□□□ -1.59
FOXE3Q13461 AP006216.1-201ENST00000439104 419 ntTSL 3 BASIC5.14□□□□□ -1.59
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FOXE3Q13461 AL354936.1-201ENST00000441521 649 ntTSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
FOXE3Q13461 AC092601.1-201ENST00000444526 383 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
FOXE3Q13461 ANKRD30BP3-201ENST00000444850 1070 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
FOXE3Q13461 LINC01831-201ENST00000449772 493 ntTSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
FOXE3Q13461 AL034345.2-203ENST00000453417 383 ntTSL 3 BASIC5.14□□□□□ -1.59
FOXE3Q13461 AL157373.1-201ENST00000456036 276 ntTSL 3 BASIC5.14□□□□□ -1.59
FOXE3Q13461 CDKN3-205ENST00000458126 845 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
FOXE3Q13461 AC013267.1-201ENST00000458227 267 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
FOXE3Q13461 RN7SL561P-201ENST00000488553 281 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
FOXE3Q13461 AC063943.2-201ENST00000495697 534 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
FOXE3Q13461 RPL19P11-201ENST00000495944 589 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
FOXE3Q13461 AC105252.1-201ENST00000503089 286 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
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FOXE3Q13461 AL133163.3-201ENST00000556448 504 ntTSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
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FOXE3Q13461 UPF2-201ENST00000356352 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
FOXE3Q13461 MKL2-202ENST00000571589 8799 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.14□□□□□ -1.59
FOXE3Q13461 OR5A2-202ENST00000641361 6655 ntAPPRIS P1 BASIC5.14□□□□□ -1.59
FOXE3Q13461 AP002004.1-203ENST00000531091 1768 ntTSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
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FOXE3Q13461 EXD1-202ENST00000458580 2177 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.14□□□□□ -1.59
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FOXE3Q13461 GIF-201ENST00000257248 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
FOXE3Q13461 BIN2P1-201ENST00000504996 1530 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
FOXE3Q13461 RGS13-204ENST00000543215 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
FOXE3Q13461 TCF7L2-210ENST00000369397 3802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
FOXE3Q13461 AL133284.1-201ENST00000423715 4996 ntTSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
FOXE3Q13461 ITCH-201ENST00000262650 3089 ntTSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
FOXE3Q13461 CDKL5-205ENST00000623535 12533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
FOXE3Q13461 TMEM209-201ENST00000397622 3545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
FOXE3Q13461 NBPF11-204ENST00000614785 4343 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
FOXE3Q13461 CACNA1E-210ENST00000621791 16171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
FOXE3Q13461 VPS35-201ENST00000299138 6790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
FOXE3Q13461 PABPC1P9-201ENST00000426076 1612 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
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