Protein–RNA interactions for Protein: Q13326

SGCG, Gamma-sarcoglycan, humanhuman

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Length 291 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCGQ13326 PTPRD-213ENST00000537002 8224 ntTSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
SGCGQ13326 PIGK-203ENST00000445065 4318 ntTSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
SGCGQ13326 AL450345.1-202ENST00000605741 3881 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
SGCGQ13326 AC103591.2-201ENST00000265259 766 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
SGCGQ13326 OR8K1-201ENST00000279783 1087 ntAPPRIS P1 BASIC5.07□□□□□ -1.6
SGCGQ13326 RN7SKP104-201ENST00000362605 328 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
SGCGQ13326 RNA5SP428-201ENST00000365129 132 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
SGCGQ13326 MIR585-201ENST00000384887 94 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
SGCGQ13326 RNA5SP241-201ENST00000391326 114 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
SGCGQ13326 AP002530.1-201ENST00000405705 684 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
SGCGQ13326 AL139039.2-201ENST00000407436 479 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
SGCGQ13326 CHEK2P3-201ENST00000416118 248 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
SGCGQ13326 AL645465.1-201ENST00000417765 642 ntTSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
SGCGQ13326 AL158073.1-201ENST00000426848 1104 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
SGCGQ13326 RPS26P47-201ENST00000427219 348 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
SGCGQ13326 AC004824.1-201ENST00000439577 311 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
SGCGQ13326 AC008080.4-202ENST00000440034 1005 ntTSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
SGCGQ13326 AL137845.2-201ENST00000444292 988 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
SGCGQ13326 AP003774.4-201ENST00000447028 672 ntTSL 2 BASIC5.07□□□□□ -1.6
SGCGQ13326 AL354714.3-201ENST00000447284 493 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
SGCGQ13326 RPL31P44-201ENST00000447680 377 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
SGCGQ13326 AL512328.1-202ENST00000452640 850 ntTSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
SGCGQ13326 AP001439.1-201ENST00000455275 392 ntTSL 2 BASIC5.07□□□□□ -1.6
SGCGQ13326 CLEC2A-202ENST00000455827 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
SGCGQ13326 RPS3AP41-201ENST00000462701 778 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
SGCGQ13326 RPL21P6-201ENST00000479171 504 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
SGCGQ13326 LARP7P4-201ENST00000481075 878 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
SGCGQ13326 AC083982.1-201ENST00000485679 344 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
SGCGQ13326 AC010350.1-201ENST00000504908 231 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
SGCGQ13326 IGHV3-63-201ENST00000518422 341 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
SGCGQ13326 AC062004.1-201ENST00000518706 686 ntTSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
SGCGQ13326 AC132219.1-201ENST00000524337 478 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
SGCGQ13326 AP001267.3-204ENST00000528578 423 ntTSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
SGCGQ13326 AL049875.1-201ENST00000554328 582 ntTSL 4 BASIC5.07□□□□□ -1.6
SGCGQ13326 AC022196.1-202ENST00000559570 462 ntTSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
SGCGQ13326 AC107926.1-201ENST00000581673 621 ntTSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
SGCGQ13326 MIR4480-201ENST00000582492 71 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
SGCGQ13326 AC007448.2-201ENST00000583452 380 ntTSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
SGCGQ13326 AL023583.1-201ENST00000607518 1143 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
SGCGQ13326 AC104307.1-201ENST00000616142 196 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
SGCGQ13326 AC112694.2-201ENST00000623697 768 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
SGCGQ13326 AL034549.2-201ENST00000618285 3373 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
SGCGQ13326 OR2L3-202ENST00000641161 2830 ntAPPRIS P1 BASIC5.07□□□□□ -1.6
SGCGQ13326 OR2L3-203ENST00000641649 2846 ntAPPRIS P1 BASIC5.07□□□□□ -1.6
SGCGQ13326 R3HDM1-201ENST00000264160 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
SGCGQ13326 PRPF4B-201ENST00000337659 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
SGCGQ13326 DNA2-201ENST00000358410 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
SGCGQ13326 AC021205.3-201ENST00000609680 1709 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
SGCGQ13326 IRAK4-203ENST00000448290 1381 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
SGCGQ13326 SAMSN1-206ENST00000619120 2028 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
SGCGQ13326 AP000808.1-201ENST00000512200 3252 ntTSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
SGCGQ13326 ZNF569-203ENST00000392150 1918 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
SGCGQ13326 LINC00507-201ENST00000540882 1935 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
SGCGQ13326 OR8H1-201ENST00000313022 1038 ntAPPRIS P2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
SGCGQ13326 RNU6-1251P-201ENST00000364502 107 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
SGCGQ13326 AL021331.1-201ENST00000402817 582 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
SGCGQ13326 AL390316.1-201ENST00000406279 553 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
SGCGQ13326 RPL37P18-201ENST00000411602 243 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
SGCGQ13326 AC017048.1-201ENST00000412153 495 ntTSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
SGCGQ13326 TRAPPC2P10-201ENST00000415662 323 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
SGCGQ13326 ARPP21-AS1-201ENST00000415706 542 ntTSL 4 BASIC5.06□□□□□ -1.6
SGCGQ13326 COX6B1P1-201ENST00000415962 213 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
SGCGQ13326 OR13Z1P-201ENST00000416141 834 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
SGCGQ13326 AC073333.1-201ENST00000418907 648 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
SGCGQ13326 AC104837.2-201ENST00000427236 424 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
SGCGQ13326 VTI1BP4-201ENST00000427516 527 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
SGCGQ13326 AC009238.2-201ENST00000431026 355 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
SGCGQ13326 GABRG3-AS1-201ENST00000439938 970 ntTSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
SGCGQ13326 HMGB3P9-201ENST00000441799 583 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
SGCGQ13326 OR7E125P-201ENST00000443450 846 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
SGCGQ13326 AC004980.3-201ENST00000447046 365 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
SGCGQ13326 AC090804.1-201ENST00000448870 490 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
SGCGQ13326 GAPDHP14-201ENST00000450472 937 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
SGCGQ13326 BX842559.2-201ENST00000451418 605 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
SGCGQ13326 RPS3AP53-201ENST00000454716 778 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
SGCGQ13326 LINC00601-201ENST00000456514 1168 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
SGCGQ13326 RPL7P16-201ENST00000479738 738 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
SGCGQ13326 RN7SL591P-201ENST00000496150 292 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
SGCGQ13326 AC093763.1-201ENST00000512464 699 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
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SGCGQ13326 AB015752.1-201ENST00000521975 578 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
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SGCGQ13326 LINC02402-201ENST00000550337 1212 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
SGCGQ13326 AC138360.1-201ENST00000552332 386 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
SGCGQ13326 LINC00871-201ENST00000555246 408 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
SGCGQ13326 AL731537.2-201ENST00000561565 951 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
SGCGQ13326 AC123786.2-201ENST00000603459 275 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
SGCGQ13326 AC015802.5-201ENST00000607478 399 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
SGCGQ13326 AC116447.1-201ENST00000613153 453 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
SGCGQ13326 LINC01338-201ENST00000627179 632 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
SGCGQ13326 AC074387.1-201ENST00000632044 823 ntTSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
SGCGQ13326 CCDC195-201ENST00000638102 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
SGCGQ13326 AL138828.1-203ENST00000419926 1570 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
SGCGQ13326 KCNH7-205ENST00000621889 1893 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
SGCGQ13326 ZNF765-201ENST00000396408 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
SGCGQ13326 AC010132.3-201ENST00000442788 2430 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
SGCGQ13326 TMEM99-201ENST00000301665 2058 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
SGCGQ13326 LINC01847-202ENST00000523311 1762 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
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