Protein–RNA interactions for Protein: Q13232

NME3, Nucleoside diphosphate kinase 3, humanhuman

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Length 169 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME3Q13232 AC107068.1-201ENST00000563286 4218 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
NME3Q13232 FAM204A-203ENST00000369183 13889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
NME3Q13232 GLCE-201ENST00000261858 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
NME3Q13232 SLAIN1-201ENST00000267219 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
NME3Q13232 SMC2-AS1-201ENST00000603487 7020 ntTSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
NME3Q13232 MTHFD2L-207ENST00000433372 1407 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
NME3Q13232 USP26-203ENST00000511190 3665 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.03□□□□□ -1.6
NME3Q13232 ERGIC2-201ENST00000360150 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
NME3Q13232 AL731566.1-201ENST00000620490 1937 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
NME3Q13232 SLC26A5-208ENST00000393730 2498 ntTSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
NME3Q13232 ADAM29-203ENST00000445694 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
NME3Q13232 EPS8-209ENST00000542903 1858 ntTSL 2 BASIC5.03□□□□□ -1.6
NME3Q13232 LINC00919-201ENST00000561513 1658 ntTSL 2 BASIC5.03□□□□□ -1.6
NME3Q13232 RC3H1-201ENST00000258349 10988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
NME3Q13232 AC132825.1-201ENST00000463573 2247 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
NME3Q13232 UBBP2-201ENST00000376781 231 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
NME3Q13232 DHFRP5-201ENST00000406944 564 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
NME3Q13232 RPS17P8-201ENST00000434525 335 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
NME3Q13232 MIR99AHG-205ENST00000435697 716 ntTSL 2 BASIC5.03□□□□□ -1.6
NME3Q13232 AC068491.2-201ENST00000438897 617 ntTSL 2 BASIC5.03□□□□□ -1.6
NME3Q13232 AL353764.1-201ENST00000442072 474 ntTSL 2 BASIC5.03□□□□□ -1.6
NME3Q13232 BTF3P6-201ENST00000448054 499 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
NME3Q13232 OR1H1P-201ENST00000448731 937 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
NME3Q13232 AC091685.2-201ENST00000454924 864 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
NME3Q13232 AURKAPS2-201ENST00000454983 333 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
NME3Q13232 AC000061.1-201ENST00000456270 376 ntTSL 3 BASIC5.03□□□□□ -1.6
NME3Q13232 AC090686.1-201ENST00000481577 749 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
NME3Q13232 AC016746.1-201ENST00000489557 831 ntTSL 2 BASIC5.03□□□□□ -1.6
NME3Q13232 AC139718.2-201ENST00000506068 481 ntTSL 3 BASIC5.03□□□□□ -1.6
NME3Q13232 ENPP7P9-201ENST00000514456 627 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
NME3Q13232 RNA5SP249-201ENST00000516127 99 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
NME3Q13232 AP003472.2-201ENST00000523554 639 ntTSL 3 BASIC5.03□□□□□ -1.6
NME3Q13232 LINC02443-204ENST00000544717 754 ntTSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
NME3Q13232 DUX4L52-201ENST00000549363 777 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
NME3Q13232 AC133555.2-201ENST00000550213 292 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
NME3Q13232 PCNPP1-201ENST00000552501 511 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
NME3Q13232 AC015660.2-201ENST00000561362 323 ntTSL 3 BASIC5.03□□□□□ -1.6
NME3Q13232 BGLT3-201ENST00000564523 994 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
NME3Q13232 MTATP6P25-201ENST00000574491 261 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
NME3Q13232 CYCSP40-201ENST00000575927 294 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
NME3Q13232 AC024592.1-202ENST00000590441 341 ntTSL 3 BASIC5.03□□□□□ -1.6
NME3Q13232 AC012213.4-201ENST00000606457 354 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
NME3Q13232 FAM27B-201ENST00000610601 213 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
NME3Q13232 AC087633.2-201ENST00000618611 725 ntTSL 3 BASIC5.03□□□□□ -1.6
NME3Q13232 AF117829.2-201ENST00000619538 361 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
NME3Q13232 AL359094.1-201ENST00000627944 566 ntTSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
NME3Q13232 PHACTR2P1-202ENST00000636592 773 ntTSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
NME3Q13232 AC011912.1-201ENST00000623483 5819 ntTSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
NME3Q13232 AC245407.1-201ENST00000621489 2538 ntTSL 2 BASIC5.03□□□□□ -1.6
NME3Q13232 OR4F17-202ENST00000585993 2669 ntAPPRIS P1 BASIC5.03□□□□□ -1.6
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NME3Q13232 SLC9C1-201ENST00000305815 4172 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.03□□□□□ -1.6
NME3Q13232 SLC10A7-202ENST00000394059 1730 ntTSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
NME3Q13232 AL583808.2-201ENST00000418078 1382 ntTSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
NME3Q13232 KLHL4-202ENST00000373119 5818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
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NME3Q13232 MED12L-201ENST00000273432 6401 ntTSL 2 BASIC5.02□□□□□ -1.61
NME3Q13232 OSBPL9P1-201ENST00000604744 1469 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
NME3Q13232 FMN1-202ENST00000334528 12355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
NME3Q13232 FAM135A-210ENST00000505868 5173 ntTSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
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NME3Q13232 BANF2-202ENST00000377805 444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
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NME3Q13232 TRIM60P17-201ENST00000415181 719 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
NME3Q13232 LINC01945-201ENST00000419784 840 ntTSL 2 BASIC5.02□□□□□ -1.61
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NME3Q13232 AC008072.1-201ENST00000434254 824 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
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NME3Q13232 AL592494.1-201ENST00000437523 309 ntTSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
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NME3Q13232 LINC01767-201ENST00000451914 545 ntTSL 2 BASIC5.02□□□□□ -1.61
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NME3Q13232 RN7SL591P-201ENST00000496150 292 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
NME3Q13232 ASNSP4-201ENST00000511103 447 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
NME3Q13232 SPINK13-203ENST00000512953 1022 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC5.02□□□□□ -1.61
NME3Q13232 AC016885.1-201ENST00000517796 532 ntTSL 4 BASIC5.02□□□□□ -1.61
NME3Q13232 AP001880.2-201ENST00000538233 448 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
NME3Q13232 AC093249.4-201ENST00000564755 259 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
NME3Q13232 AC027281.1-201ENST00000574178 758 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
NME3Q13232 MIR3667-201ENST00000581025 74 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
NME3Q13232 AC022726.1-201ENST00000587475 207 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
NME3Q13232 AL592494.3-201ENST00000609485 464 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
NME3Q13232 INTS6-AS1-226ENST00000610018 672 ntTSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
NME3Q13232 CR381572.2-201ENST00000624852 397 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
NME3Q13232 PINCR-201ENST00000440955 2228 ntTSL 2 BASIC5.02□□□□□ -1.61
NME3Q13232 OSGEPL1-201ENST00000264151 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
NME3Q13232 CENPE-208ENST00000611174 8260 ntTSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
NME3Q13232 GABRA2-211ENST00000514090 3401 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
NME3Q13232 C1orf112-202ENST00000359326 4002 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
NME3Q13232 VPS13D-213ENST00000613099 16245 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
NME3Q13232 DDHD2-202ENST00000517385 4113 ntTSL 2 BASIC5.02□□□□□ -1.61
NME3Q13232 MTCO1P7-201ENST00000419523 1542 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
NME3Q13232 PPEF1-202ENST00000361511 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
NME3Q13232 ZNF285-204ENST00000591679 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC5.01□□□□□ -1.61
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