Protein–RNA interactions for Protein: Q13099

IFT88, Intraflagellar transport protein 88 homolog, humanhuman

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Length 833 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT88Q13099 AMELX-202ENST00000380712 835 ntTSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
IFT88Q13099 AMELX-203ENST00000380714 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
IFT88Q13099 AC009804.1-201ENST00000400949 179 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
IFT88Q13099 AL390774.1-201ENST00000411924 246 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
IFT88Q13099 AC009498.1-201ENST00000419860 541 ntTSL 4 BASIC5.03□□□□□ -1.6
IFT88Q13099 AC068599.1-201ENST00000422558 567 ntTSL 4 BASIC5.03□□□□□ -1.6
IFT88Q13099 AC073069.1-201ENST00000428657 441 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
IFT88Q13099 RPS6P12-201ENST00000432491 726 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
IFT88Q13099 RPS29P10-201ENST00000439197 166 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
IFT88Q13099 LINC01133-202ENST00000443364 1266 ntTSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
IFT88Q13099 KCNMB2-AS1-205ENST00000451742 844 ntTSL 4 BASIC5.03□□□□□ -1.6
IFT88Q13099 AL645939.1-201ENST00000453429 797 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
IFT88Q13099 FGF7P3-201ENST00000454645 303 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
IFT88Q13099 RPS27L-205ENST00000462430 681 ntTSL 2 BASIC5.03□□□□□ -1.6
IFT88Q13099 RN7SL717P-201ENST00000478343 297 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
IFT88Q13099 RN7SL817P-201ENST00000480777 288 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
IFT88Q13099 SSBP1-211ENST00000484178 676 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.03□□□□□ -1.6
IFT88Q13099 STMN1P2-201ENST00000508435 439 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
IFT88Q13099 AC025524.2-206ENST00000517953 439 ntTSL 3 BASIC5.03□□□□□ -1.6
IFT88Q13099 NPM1P35-201ENST00000533043 868 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
IFT88Q13099 TRDN-204ENST00000542443 1294 ntTSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
IFT88Q13099 PPFIA2-AS1-210ENST00000553197 875 ntTSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
IFT88Q13099 AC131532.1-201ENST00000555596 519 ntTSL 4 BASIC5.03□□□□□ -1.6
IFT88Q13099 NDUFB4P11-201ENST00000560510 395 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
IFT88Q13099 LINC00663-202ENST00000586816 306 ntTSL 2 BASIC5.03□□□□□ -1.6
IFT88Q13099 UBL5-207ENST00000590068 390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
IFT88Q13099 AL589674.2-201ENST00000604304 337 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
IFT88Q13099 AC010200.2-201ENST00000605098 235 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
IFT88Q13099 ZNF630-AS1-201ENST00000614448 397 ntTSL 3 BASIC5.03□□□□□ -1.6
IFT88Q13099 AC026368.1-201ENST00000614934 690 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
IFT88Q13099 AL035461.2-201ENST00000619201 524 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
IFT88Q13099 POU2F2-219ENST00000625670 371 ntTSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
IFT88Q13099 PNPLA8-204ENST00000426128 4268 ntTSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
IFT88Q13099 NKRF-202ENST00000371527 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
IFT88Q13099 LINC00507-201ENST00000540882 1935 ntTSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
IFT88Q13099 IRAK4-203ENST00000448290 1381 ntTSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
IFT88Q13099 OTOGL-204ENST00000547103 8032 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
IFT88Q13099 AC007342.7-201ENST00000624610 2337 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
IFT88Q13099 HACD3-211ENST00000569894 1471 ntTSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
IFT88Q13099 LINC01289-201ENST00000519550 3712 ntTSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
IFT88Q13099 CNTRL-201ENST00000238341 7431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
IFT88Q13099 CYP4Z1-201ENST00000334194 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
IFT88Q13099 OR5H1-201ENST00000354565 942 ntAPPRIS P1 BASIC5.02□□□□□ -1.61
IFT88Q13099 RNU1-83P-201ENST00000363426 164 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
IFT88Q13099 RNA5SP28-201ENST00000363841 119 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
IFT88Q13099 DEFB136-201ENST00000382209 237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
IFT88Q13099 SNORA66-201ENST00000384792 133 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
IFT88Q13099 IGLJ6-201ENST00000390328 70 ntAPPRIS P1 BASIC5.02□□□□□ -1.61
IFT88Q13099 AL161457.1-201ENST00000434656 905 ntTSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
IFT88Q13099 AC008278.2-201ENST00000438178 409 ntTSL 3 BASIC5.02□□□□□ -1.61
IFT88Q13099 SUMO2P1-206ENST00000445436 284 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
IFT88Q13099 AC007386.1-201ENST00000455212 582 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
IFT88Q13099 OSMR-AS1-201ENST00000506463 800 ntTSL 3 BASIC5.02□□□□□ -1.61
IFT88Q13099 MOCS2-205ENST00000508922 1210 ntTSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
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IFT88Q13099 RNA5SP373-201ENST00000517271 95 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
IFT88Q13099 AC113386.1-201ENST00000523584 381 ntTSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
IFT88Q13099 AC079089.1-204ENST00000530194 572 ntTSL 2 BASIC5.02□□□□□ -1.61
IFT88Q13099 KCTD21-AS1-206ENST00000532831 856 ntTSL 2 BASIC5.02□□□□□ -1.61
IFT88Q13099 LINC01489-201ENST00000542689 605 ntTSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
IFT88Q13099 LINC02444-201ENST00000550723 1256 ntTSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
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IFT88Q13099 ULK4P2-204ENST00000569682 798 ntTSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
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IFT88Q13099 AL356056.1-205ENST00000608904 651 ntTSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
IFT88Q13099 AC244131.2-201ENST00000612592 512 ntTSL 3 BASIC5.02□□□□□ -1.61
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IFT88Q13099 SNX18P1Y-201ENST00000616231 511 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
IFT88Q13099 AC135068.12-201ENST00000637370 931 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
IFT88Q13099 ASB5-201ENST00000296525 3031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
IFT88Q13099 EIF4EBP2-201ENST00000373218 7257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
IFT88Q13099 CNTN1-201ENST00000347616 5507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
IFT88Q13099 C1orf112-203ENST00000413811 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
IFT88Q13099 GLCE-201ENST00000261858 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
IFT88Q13099 DYNAP-201ENST00000321600 2027 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.02□□□□□ -1.61
IFT88Q13099 FAM216B-201ENST00000313851 3243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
IFT88Q13099 KCNU1-201ENST00000399881 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.02□□□□□ -1.61
IFT88Q13099 SOS1-203ENST00000426016 8517 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC5.02□□□□□ -1.61
IFT88Q13099 NRG1-220ENST00000539990 2401 ntTSL 2 BASIC5.02□□□□□ -1.61
IFT88Q13099 CFL2-202ENST00000341223 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
IFT88Q13099 ZNF700-202ENST00000482090 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.01□□□□□ -1.61
IFT88Q13099 TPTE2-205ENST00000400230 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
IFT88Q13099 CDKL3-209ENST00000523054 1775 ntTSL 2 BASIC5.01□□□□□ -1.61
IFT88Q13099 SPART-201ENST00000355182 4820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
IFT88Q13099 BCLAF1-207ENST00000527759 4373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
IFT88Q13099 ZNF83-204ENST00000545872 2633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.01□□□□□ -1.61
IFT88Q13099 UBE2D3-233ENST00000618836 3472 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
IFT88Q13099 MUM1L1-202ENST00000357175 4173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.01□□□□□ -1.61
IFT88Q13099 CNGA1-209ENST00000544810 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
IFT88Q13099 C21orf91-201ENST00000284881 5433 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC5.01□□□□□ -1.61
IFT88Q13099 ITGB3BP-201ENST00000271002 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
IFT88Q13099 MIR323A-201ENST00000362199 86 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
IFT88Q13099 RNA5SP90-201ENST00000364801 99 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
IFT88Q13099 RNU6-304P-201ENST00000364855 107 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
IFT88Q13099 LINC01317-201ENST00000366209 779 ntTSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
IFT88Q13099 OR51B6-201ENST00000380219 939 ntAPPRIS P1 BASIC5.01□□□□□ -1.61
IFT88Q13099 SNORA67-201ENST00000384423 137 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
IFT88Q13099 TRAV9-1-201ENST00000390431 338 ntAPPRIS P1 BASIC5.01□□□□□ -1.61
IFT88Q13099 HDGFP1-201ENST00000405943 252 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
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