Protein–RNA interactions for Protein: Q12974

PTP4A2, Protein tyrosine phosphatase type IVA 2, humanhuman

Predictions only

Length 167 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTP4A2Q12974 AC011891.1-201ENST00000437088 432 ntTSL 3 BASIC5.38□□□□□ -1.55
PTP4A2Q12974 HSFY8P-201ENST00000437934 318 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
PTP4A2Q12974 AC069540.1-201ENST00000446320 988 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
PTP4A2Q12974 AC092685.1-201ENST00000447960 1243 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
PTP4A2Q12974 CYCSP42-201ENST00000450823 238 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
PTP4A2Q12974 HMGB1P26-201ENST00000452520 628 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
PTP4A2Q12974 AC092647.2-201ENST00000452998 253 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
PTP4A2Q12974 HSFY5P-201ENST00000453726 309 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
PTP4A2Q12974 AL592161.1-201ENST00000456389 861 ntTSL 3 BASIC5.38□□□□□ -1.55
PTP4A2Q12974 TM4SF1-AS1-202ENST00000496491 754 ntTSL 2 BASIC5.38□□□□□ -1.55
PTP4A2Q12974 PPM1AP1-201ENST00000502740 1135 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
PTP4A2Q12974 C1GALT1P2-201ENST00000510813 1104 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
PTP4A2Q12974 AC022166.1-201ENST00000567851 581 ntTSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
PTP4A2Q12974 AC068408.2-201ENST00000584566 439 ntTSL 3 BASIC5.38□□□□□ -1.55
PTP4A2Q12974 SLC14A2-AS1-201ENST00000585759 494 ntTSL 3 BASIC5.38□□□□□ -1.55
PTP4A2Q12974 AL391834.1-201ENST00000609609 560 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
PTP4A2Q12974 AC126915.2-201ENST00000610957 190 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
PTP4A2Q12974 AC010435.1-201ENST00000623353 1177 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
PTP4A2Q12974 AC024023.1-201ENST00000624530 922 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
PTP4A2Q12974 RBMS3-AS3-202ENST00000635847 738 ntTSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
PTP4A2Q12974 METTL8-219ENST00000640734 726 ntTSL 2 BASIC5.38□□□□□ -1.55
PTP4A2Q12974 OR9G1-202ENST00000642097 3611 ntAPPRIS P1 BASIC5.38□□□□□ -1.55
PTP4A2Q12974 PCDH15-207ENST00000395430 7002 ntTSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
PTP4A2Q12974 AL158835.1-203ENST00000415305 3149 ntTSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
PTP4A2Q12974 STAG2-203ENST00000371145 4393 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
PTP4A2Q12974 FKBP7-204ENST00000424785 2834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
PTP4A2Q12974 DOCK10-202ENST00000409592 7288 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
PTP4A2Q12974 ACE2-202ENST00000427411 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
PTP4A2Q12974 AL445623.2-201ENST00000640307 4805 ntTSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
PTP4A2Q12974 NSD1-204ENST00000439151 12892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
PTP4A2Q12974 CPSF2-201ENST00000298875 13035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
PTP4A2Q12974 EDA2R-203ENST00000396050 3429 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
PTP4A2Q12974 UBR5-204ENST00000518205 1931 ntTSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
PTP4A2Q12974 PIK3C3-217ENST00000639914 2722 ntTSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
PTP4A2Q12974 SLCO1A2-212ENST00000458504 2008 ntTSL 2 BASIC5.37□□□□□ -1.55
PTP4A2Q12974 FAM19A1-201ENST00000478136 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
PTP4A2Q12974 POLK-210ENST00000508526 2019 ntTSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
PTP4A2Q12974 HIST1H1A-201ENST00000244573 648 ntAPPRIS P1 BASIC5.37□□□□□ -1.55
PTP4A2Q12974 RNU6-1176P-201ENST00000390955 107 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
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PTP4A2Q12974 ATP6V1G1P7-201ENST00000415853 349 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
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PTP4A2Q12974 AL390879.2-204ENST00000438602 582 ntTSL 3 BASIC5.37□□□□□ -1.55
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PTP4A2Q12974 INPP4B-206ENST00000506217 673 ntTSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
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PTP4A2Q12974 UOX-205ENST00000640983 544 ntTSL 4 BASIC5.37□□□□□ -1.55
PTP4A2Q12974 GTF2IRD2P1-202ENST00000618962 3055 ntTSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
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PTP4A2Q12974 HTR1F-201ENST00000319595 3140 ntAPPRIS P1 BASIC5.37□□□□□ -1.55
PTP4A2Q12974 PSG1-201ENST00000244296 2276 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
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PTP4A2Q12974 LIPF-203ENST00000394375 1470 ntTSL 2 BASIC5.37□□□□□ -1.55
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PTP4A2Q12974 CDKL3-210ENST00000523832 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
PTP4A2Q12974 ZNF850-203ENST00000614887 7625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
PTP4A2Q12974 GOLPH3L-201ENST00000271732 2999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
PTP4A2Q12974 MED13-201ENST00000397786 10465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
PTP4A2Q12974 CNTN1-202ENST00000348761 3328 ntTSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
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PTP4A2Q12974 SLFN5-201ENST00000299977 10591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
PTP4A2Q12974 SLAIN1-202ENST00000314070 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.36□□□□□ -1.55
PTP4A2Q12974 RAPGEF2-201ENST00000264431 6949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
PTP4A2Q12974 FASTKD3-201ENST00000264669 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.36□□□□□ -1.55
PTP4A2Q12974 WDHD1-201ENST00000360586 5996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
PTP4A2Q12974 C5-201ENST00000223642 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
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